reaxys fueling discovery – driving innovation

Reaxys Fueling Discovery – Driving Innovation

陳建丞Trainer, Elsevier Taiwan

大綱

•前言

•搜尋頁面簡述

•Rapamycin 搜尋

•自訂帳號

•相關資訊

二〇二三年四月十九日 Slide 2

前言


找尋化學相關資訊搜尋與閱讀花時間


需要找資料• 老師出作業• 做實驗前 /

後• 書報討論• 寫論文

Time

資料哪裡找• 期刊• 書籍• 專利• 網路…

從搜尋結果中再抽取需要的資訊

Time

較容易的搜尋方式 – Reaxys


•流程化的工作方式•快速提供驗證過的詳細實驗步驟及數據•完整列出被測試過的化合物各項性質•減少建構合成流程的時間

•直觀的介面•易於使用的網路介面，不必安裝軟體•由化學家所設計

•任何時間及任何地點 ( 校內 ) 皆可使用•不受人數限制

豐富的內涵


Chemical Spider?


Reaction

Substance

Patent/Article

Spectroscopy

Ecotoxic

Bioactivity

Product or Reactant?

Drug or Poison?

Application?

Identified?

Effect on environment?

Physical Data

Bioactivity Data

Spectra

Natural Product

Physical Data

Spectra

Bioactivity Data

Natural Product

Reaxys

Reaxys 如何建立 ? – 將 journal articles and patents 抽絲剝繭

23 March 2010 ‹6›

發展方向


* 紙本的歷史累積

* 電子化的開端* 語言與搜尋方式的改變

* 簡易的介面* 資料庫的擴容* 搜尋方式再進化

搜尋頁面簡述


搜尋頁面介紹 (Reactions)


1

2

3搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分

兩種輸入方式


四種文字輸入方式：化學名 /InChi-Key/CAS-No/Smiles

繪圖程式選擇：MarvinSketch/ChemDraw

條件限定 (Conditions(Form-based))


可以利用不同敘述得到更好的搜尋結果文字清單說明各文章

的不同用語

搜尋頁面介紹 (Substance and Properties)


1

2

3搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分

條件限定 (Properties(Form-based))


五大分類： ( 自訂 )/ 基本資料 / 物性 / 光譜 / 生物活性 / 環境毒性

條件限定Properties(advanced)

Reaction type

搜尋頁面介紹 (Text, Authors and more)


在文字搜尋頁面中，另外提供了輸入專利號及專利出處的選項

Rapamycin 搜尋


Rapamycin

•Start a search ： mTOR inhibitor


在腫瘤細胞中，抑制 mTOR 基因來進行標靶治療是目前的研究目標。最早的發現是由 Rapamycin 的藥理研究而來，研究指出其具有抗生素、免疫抑制及抗腫瘤的作用，以下將以 Rapamycin 為例，利用 Reaxys 進行搜尋。


如果要手動畫分子結構，可以在空白處點兩下，會跳出繪圖程式。

也可以利用 ” Generate structure from name” 鍵入化學名以產生分子。

現在要以 Rapamycin 開始進行搜尋。

rapamycin

mtor


搜尋結果為 11 個化合物在 461 篇文章出現。

若是想先看結構而非文字時，可以選擇 ” Substance(Grid)” 以進行結果檢視。


以下這些聯結表示對於此分子在 Reaxys 內所有的可用數據。

利用左側的 Filter 可以指定結果中出現您所需要的數據或性質。

點擊“ e” 會連結至 emolecules website ，此頁面包含的該分子的來源廠商及價格資訊


點擊會出現進階選項及” View related markush” ，可提供您專利相關資訊。

點擊，可以以 3D 模式檢視分子。

使用” Filter” 中的” Sub-structure” ，可以再加入某個官能基將結果範圍縮小。


使用” Filter” 中的” Bioactivity” ，其中提供多項選擇可以將結果範圍縮小至相關資訊。

在” Filter” 中所顯示的數字代表著該項數據所包含的資料筆數。


上方的” Breadcrumbs” 讓您隨時注意自己進行到哪一個步驟，點擊其中一個可回到該步驟。

“No of preparations” 讓您知道關於此化合物的製備方法數及參與反應數。

若有特別指定，搜尋結果會以” Hit Data” 顯示。


Reaxys 的 Output 提供多種輸出功能。1.資料輸出種類： Substance Grid 、 Substance Details Table 、 Substance Citation Table2.資料輸出格式： PDF 、 Word 、 Excel….3.資料輸出範圍4.資料輸出選擇


Reaxys 提供” Synthesis Plan” 的功能，讓您在查詢資料的同時，也能建構自己的合成流程圖。

點擊“ Synthesize” ，會自動跳轉到” Synthesis Plan” 的頁面，此頁顯示的是” Synthesis Plan” 頁面上半

部。


此頁顯示的是” Synthesis Plan” 頁面下半部。Reaxys 會將所有可能路徑列出供使用者參考選擇，除此之外，還可以藉由排序或” Filter” 的方式來找尋所需之反應。


反應圖中若有出現“ View Scheme” ，表示該反應為多步反應，點擊可觀看其流程圖。此流程圖下方會顯示此反應的詳細步驟。點下 Output 可以將合成圖及合成細節輸出；或是點擊 save ，可以將結果存成檔案，供下次使用。


反應圖中若有出現“ Show Experimental Procedure” ，表示可直接觀看該反應的詳細實驗內容，點擊後會直接顯示在下方。

點擊” Title/Abstract” ，下方會出現其篇名及摘要。

點擊每一篇的 Show Details ，可以觀看該篇詳細內容，包含該篇所提及的化合物及反應。

點擊” Title/Abstract” ，下方會出現其篇名及摘要。

自訂帳號


自訂帳號


設定帳號後：

1.可自訂預設繪圖程式

2.可留下搜尋歷史紀錄

3.可設定新知通報

* 帳號只在同一所校內有效

改變分子繪圖程式


相關資訊


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如有相關問題請連絡：

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流 )

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