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Marie-Claude Laferrière
1 février 2016
Recherche d’articles scientifiques PubMed et Cochrane
PHT-U001 Introduction à la recherche clinique
appliquée à la physiothérapie manuelle orthopédique
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2BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Plan de la présentation
Les opérateurs booléens
Méthodes de recherche
> Mots-clés et Descripteurs
Interroger PubMed et Cochrane Library
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3BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Les opérateurs booléens
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4BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Les opérateurs booléens
• Définissent les relations entre les termes ou les groupes de termes.
• Très utiles afin de raffiner une requête : inclusion ou exclusion d’éléments précis.
Rappel
AND OR NOT
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5BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Les opérateurs booléens
Rappel
AND (ET)
Limite la recherche à
l’intersection des
concepts
OR (OU)
Unit les différents
concepts
NOT(SAUF)
Exclut un ou plusieurs
concepts non souhaités
Précise la recherche,
mais ATTENTION
Exercices Activité
physique
AdultesPersonnes
âgées
Cancer Douleur
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6BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Méthodes de recherche• Mots-clés • Descripteurs
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7BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche par mots-clés
Rappel
• Peut s’effectuer dans tous les mots ou expressions de la notice d’un article scientifique.
• Lors d’une recherche par sujet, il est recommandé de limiter celle-ci au titre et au résumé.
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8BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche sujet ou par descripteurs
Rappel
• S’effectue uniquement dans les mots ou les expressions inscrits dans le champ Sujets de la notice d’un article scientifique.
• Les termes ou les expressions présents dans le champ Sujets sont choisis à partir d’une liste préétablie de termes (thésaurus).– Plusieurs descripteurs par référence.– Peu importe le vocabulaire utilisé par les auteurs, les
descripteurs attribués pour les mêmes sujets sont identiques.
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9BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche sujet ou par descripteurs
Rappel
• La plupart des bases de données publient un thésaurus qui est intégré au logiciel de la base.
Medline
MeSH (MedicalSubject
Headings)
CINAHL
Descripteurs CINAHL
Cochrane
MeSH (même que
Medline)
SPORTDiscus
Sports Thesaurus
PsycINFO
Thesaurus (sous
l’onglet « Term
Finder »)
Embase
Emtree
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Interroger PubMed
et Cochrane Library
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11BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
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12BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Accès
Clic sur PubMed
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13BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Medline
• Dépouille et indexe plus de 5 600 revues biomédicales provenant d’environ 80 pays pour un total de plus de 25 millions de références d’articles.
• Références des années 1940 à aujourd’hui.
• Documents principalement en anglais (environ 40 langues).
• Interrogation uniquement en anglais
– Titres, résumés et descripteurs toujours en anglais, même si l’article est en langue étrangère.
Base de données bibliographiques
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14BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
PubMed vs Medline
• Medline (articles avec les MeSH).
+
• Articles publiés dans les périodiques qui n’ont pas encore été acceptés dans Medline (As supplied by publisher).
• Articles en prépublication qui ne sont pas encore indexés ou publiés (PubMed in-process).
• Articles provenant de revues indexées sans toutefois couvrir un sujet en santé (ex. : astrophysique).
• Articles provenant de journaux faisant partie de PubMedCentral, mais sans être inclus dans Medline.
PubMed comprend Medline et bien plus
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15BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Trouver et traduire du vocabulaire
• Portail Terminologique de Santé (CiSMeF)
• Grand dictionnaire terminologique (OQLF)
• TERMIUM Plus (Gouvernement du Canada)
Dictionnaires
• Notes de cours
• Manuels
• Articles scientifiques
Autre documentation
Vous!
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16BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Règles d’écriture dans PubMed
• Par défaut, accentuations supprimées.
• Les opérateurs booléens en anglais et en majuscules.
– Deux ou plusieurs termes séparés d’une espace = AND.
– Utiliser OR pour rechercher des synonymes et NOT pour exclure des termes.
• Expression exacte encadrée de guillemets anglais = « cystic fibrosis ».
• Tronquer (*) un terme pour repérer l’ensemble de ses variantes = child* child, children, childhood, etc..
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17BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Raffiner la requête
• Grâce aux filters (à gauche de la liste de résultats)– Date de publication
– Type d’articles
– Langues
– Âge
– Genre
– Etc.
2016
2016
20002010
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18BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
1. Recherche simple
Recherche par termes ou expressions dans toute la notice
(donne souvent beaucoup trop de résultats)
2. Recherche avancée
Recherche par auteur, journal, date de publication, etc.
3. Recherche par le MeSH Database
Recherche à partir des descripteurs MeSH assignés à
chaque article
4. Clinical Queries
Interface spécialement désignée pour la recherche d’études
sur le pronostic et le diagnostic
Modes d’interrogation
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19BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche simple
Vous cherchez des articles sur l’étourdissement chez les adolescents.
Dans la boîte de recherche simple, écrire Dizziness et cliquer
sur la limite Adolescent: 13-18 years.
Attention ! Regardez en bas à droite la boîte Search Details
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20BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche simple - Exercice
Combien trouvez-vous de méta-analyses sur
le syndrome du canal carpien?
49
Boîte de recherche : "carpal tunnel syndrome"
Article types : meta-analysis
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21BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche avancée
Vous cherchez des articles de l’auteur B.E. Gibson parus dans
Physiotherapy Canada.
Rechercher la revue Physiotherapy Canada dans le champ Journal et l’auteur Gibson BE dans le champ Auteur.
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22BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche avancée - Exercice
Combien trouvez-vous d’articles publiés dans
le Journal of bodywork and movement
therapies en 2015?
99 Journal : Journal of bodywork and movement therapies
AND
Filter Publication Dates : From 2015/01/01 to 2015/12/31
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23BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche MeSH
• Recherche uniquement dans le champ MeSH.
• Utilise le vocabulaire contrôlé de la base de données.
• Recherche plus précise et résultats plus pertinents.
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24BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Définition
Subdivisions
(qualifier un MeSH)
Transformation du MeSH
en concept majeur
Explosion du MeSH par défaut
(inclusion des MeSH plus précis)
Synonymes
Recherche MeSH
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25BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche MeSHStructure arborescente
« explosée »
MeSH plus généraux
MeSH plus spécifiques
Suggestion de MeSH
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26BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche MeSH - Exemple
Vous cherchez des articles dont le sujet principal est la
chirurgie de la spondylose.
1
2
34
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27BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Dans la notice les MeSH s’affichent:
MeSH suivi d’un astérisque → Concept majeur
Terme suivant une barre oblique
après un MeSH → subdivision
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28BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche MeSH - Exemple
Vous cherchez des articles dont le sujet porte sur la
réadaptation des patients atteints de parésie.
1
23
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29BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche MeSH - Exercices
Combien trouvez-vous de revues
systématiques sur la chirurgie de
l’épicondylite latérale?4
MeSH : Tennis Elbow
Subheading : Surgery
Article types : Systematic Reviews
Combien trouvez-vous d’articles dont le
sujet est l’utilisation de l’électrothérapie
pour traiter les douleurs abdominales?
51
MeSH : Abdominal Pain AND
MeSH : Electric Stimulation Therapy
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30BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Clinical Queries
Un ensemble de stratégies de recherche conçues par PubMed pour les
questions touchant le diagnostic, la thérapeutique, le pronostic et l'étiologie.
Très utile pour ceux qui ont besoin d'identifier des articles portant sur la
médecine factuelle (Evidence-Based Medicine).
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31BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Clinical Queries
Une seule recherche, trois listes de résultats
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32BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Clinical Queries
Critères de sensibilité et spécificité :
• Narrow / specific search : recherche étroite, seuls les
articles les plus pertinents sont retenus
OU
• Broad / sensitive search: recherche plus large, les
articles pertinents et articles connexes
Équations de recherche (ou Filters) réalisées et
utilisées par PubMed pour interroger la base
selon la catégorie de recherche clinique
désirée.
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33BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Clinical Queries - Exemple
Vous cherchez des articles (narrow) portant sur la thérapie
des fractures du crâne.
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34BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Clinical Queries - Exercice
Combien trouvez-vous d’articles
(narrow) sur le diagnostic d’une
dislocation de l’épaule?
"shoulder dislocation" : 62 résultats
shoulder dislocation : 73 résultats
shoulder* AND dislocat* : 83 résultats
Plus d’une possibilité!
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35BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Obtenir le texte de l’article
Le bouton permet de vérifier si un document est disponible à l’Université Laval.
• Ce dernier est visible avec le Display Settings: Abstract ou si vous cliquez sur le titre de la notice.
Si la Bibliothèque n’est pas abonnée à la revue recherchée, on peut alors faire une recherche avec Google Scholar pour voir si l’article est disponible gratuitement sur le Web.
Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques (PEB) au coût de 5$.
Possibilité de configurer Google Scholar : Obtenir@ULaval
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36BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Gestion des résultatsSend to (sur la page de résultats) permet plusieurs options:
File : enregistrer les notices sélectionnées.
E-mail : envoyer les notices par courriel.
Clipboard : permet de rassembler plusieurs notices sélectionnées. Peut contenir jusqu’à 500 notices.
Les options File et E-mail sont aussi disponibles dans le Clipboard.
ATTENTION: les notices mises sur le Clipboard seront effacées après 8 heures d’inactivité.
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37BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Sauvegarde vos stratégies de recherche
Avec Search details : possibilité d’enregistrer vos requêtes ou stratégies de recherche sous forme d’URL permanente (adresse internet) et les mettre en bookmark (favoris).
Avec un fil de votre recherche.
Avec My NCBI : service de veille de PubMed.• Permet de sauvegarder des stratégies de recherche.
• Permet d’obtenir des alertes par courriel.
• Permet de personnalisé l’interface de PubMed.
• Service simple et gratuit, mais nécessité de s’inscrire et de définir des codes d’accès.
Créez votre compte My NCBI
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38BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Pour plus d’information!
• PubMed
– Tutoriel : http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Medline/player.htm
– Guide d’utilisation : • PubMed : http://www.bibl.ulaval.ca/mieux/ref-rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline
• MeSH : http://www.bibl.ulaval.ca/mieux/ref-rc/chercher/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh
– PubMed help – Guide exhaustif de la NLM http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query/static/help/pmhelp.html
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39BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
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40BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
The Cochrane Library
• Ressource à privilégier dans la recherche de revues systématiques et de méta-analyses.
– Producteur : Initiative du groupe Cochrane (regroupement de chercheurs provenant de partout dans le monde).
– Objectif : Aider les professionnels de la santé à prendre de bonnes décisions lors de leurs interventions cliniques.
– Contenu : Six bases de données différentes, la plus importante étant la Cochrane Database of SystematicReviews (Cochrane Reviews).
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41BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Contenu
Nom de la base ContenuNombre d’articles
Cochrane Database of Systematic ReviewsLes revues systématiques produites par un
groupe Cochrane (texte intégral).9 143
Database of Abstracts of Reviews of EffectsLes revues systématiques autres que Cochrane
(Surtout DARE).36 795
Cochrane Central Register of Controlled TrialsLes études cliniques à la base des revues
systématiques.901 197
*The Cochrane Methodology Register(pas de nouveauté depuis juillet 2012)
Les études sur les méthodologies employées pour les revues systématiques.
15 764
Health Technology Assessment DatabaseLes études sur l’évaluation de la technologie
médicale.15 417
The NHS Economic Evaluation DatabaseLes études sur le coût/avantage des
interventions cliniques.15 015
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42BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
1. Parcourir
Permet de bouquiner pour un article par sujet, par groupe
Cochrane ou par base de données.
2. Recherche simple
Recherche dans toutes les bases de données de la
Cochrane Library.
3. Recherche avancée (Advanced Search)
Recherche par auteur, titre, résumé, etc.
4. Recherche MeSH
Recherche à partir des descripteurs MeSH assignés à
chaque article.
Modes d’interrogation
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43BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Parcourir
• Vous pouvez naviguer dans les menus pour trouver un article par sujet, par groupe Cochrane ou par base de données.
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44BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche simple
Une boîte de recherche.
Recherche dans toutes les bases de données Cochrane.
Troncature et guillemets anglais fonctionnent.
Écrire les termes en anglais.
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45BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche avancée
• Semblable à la recherche simple sauf qu’il est possible de:– sélectionner un champ de recherche spécifique dans le menu
déroulant;– ajouter des boîtes de recherche et de les relier avec les opérateurs
booléens.• Limitation selon la base de données se fait une fois les résultats
obtenus, tout comme pour la recherche simple.
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46BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche MeSH
Accès par la recherche avancée
Le vocabulaire contrôlé est celui des MeSH, comme dans Medline.
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47BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Recherche MeSH
Explosion du MeSH Résultats par base de données
Combinaison de recherches
Définition
Liste de
résultats
de MeSH
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48BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Search Manager
L’historique de recherche n’est pas automatique dans Cochrane. Les recherches doivent être ajoutées au SearchManager (Add to Search Manager).
Permet de combiner plusieurs recherches.
• Ex: (#1 and (#2 OR #3))
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49BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Notice détaillée
MeSH
Titre
Résumé
Tableaux
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50BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Est-ce que la physiothérapie est bonne pour les personnes souffrant
de fatigue chronique?
« Les patients atteints de syndrome de fatigue chronique peuvent généralement bénéficier d'une thérapie par l'exercice et se sentir moins fatigués après celle-ci, et
rien n'indique que la thérapie par l'exercice pourrait aggraver leurs résultats ».
Référence: Exercise therapy for chronic fatigue syndrome, Février 2015
Quel type de physiothérapie a un meilleur rapport coût-efficacité pour
réduire la lombalgie chronique?
“All three interventions for low back pain improved quality of life, time off work, and
health service utilisation. However, from the perspective of the National Health Service (NHS), pain management is likely to be the most cost‐effective strategy because of a
marginally greater effectiveness and lower health care costs”.
Référence: Effectiveness and cost‐effectiveness of three types of physiotherapy used to reduce chronic low back pain disability: a pragmatic randomized trial
with economic evaluation, 2007
Trouvez un Cochrane Review. Trouvez une Economic Evaluation.
Recherche Cochrane - Exercices
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51BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Marie-Claude LaferrièreConseillère à la documentationBibliothèque scientifiqueBureau 1018-C418 656-2131, poste [email protected]
Il est préférable de prendre un rendez-vous pour vérifier ma disponibilité.
Service de clavardage de la BibliothèqueOffert aux heures d'ouverture du service d'aide à la recherche.
Obtenir de l’aide
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52BIBLIOTHÈQUE DE L’UNIVERSITÉ LAVAL
Merci!