rna ve mirna
DESCRIPTION
RNA ve miRNA. Merve YÜRÜK ERCİYES ÜNİVERSİTESİ PARAZİTOLOJİ AD. Post- transkripsiyonel kontrrol mekanizması: interferens RNA. Kodlanan RNA Kodlanmayan RNA (ncRNA). Non-Coding RNA : önceleri hurda diye bilinirdi!!!. siRNA nedir?. Küçük kodlama yapmayan , çift zincirli RNA - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
![Page 1: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/1.jpg)
RNA ve miRNA
Merve YÜRÜKERCİYES ÜNİVERSİTESİ
PARAZİTOLOJİ AD.
![Page 2: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/2.jpg)
Post-transkripsiyonel kontrrol mekanizması:
interferens RNA
![Page 3: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/3.jpg)
Kodlanan RNAKodlanmayan RNA (ncRNA)
![Page 4: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/4.jpg)
Non-Coding RNA: önceleri hurda diye bilinirdi!!!
![Page 5: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/5.jpg)
![Page 6: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/6.jpg)
![Page 7: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/7.jpg)
siRNA nedir?
• Küçük kodlama yapmayan , çift zincirli RNA• 20-25 nt uzunluğunda• 3’ uçta 2 nt’ lik çıkıntı• Virüslerde bulunur, memeliler için eksojen
kaynaklı• Primer siRNA, sekonder siRNA, tasiRNA,
natsiRNA
![Page 8: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/8.jpg)
miRNA nedir?
Küçük kodlama yapmayan , çift zincirli shRNA19-20 nt uzunluğundaKomplementeri olan iplikle aktifleşme Omurgalı ve omurgasızlar arasında
korunmuşlardırKurt, mantar, bitki ve memeli….
![Page 9: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/9.jpg)
miRNA ile siRNA arasındaki fark?
miRNA siRNAHairpin ssRNA dsRNA orjinli
Endojen Eksojen
Yerli RNA Yabancı RNA
Mükemmel uyum Tam uyum
Translasyonel represyon RNA kesimi
![Page 10: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/10.jpg)
miRNA avantaj ve dezavantajlarıAvantajlar:– RNA ile çalışmaya gerek yoktur– DNA taşıma ve dağıtım yöntemleri iyi bilinmektedir– Geçici veya sabit ifade– Uzun vadeli denemeler için uygun maliyetli– İndüklenebilir ekspresyon sistemleri mevcuttur– havuz taramak mümkündür
Dezavantajlar:– Klonlama ve doğrulama eklemeye ihtiyaç duyar – Vektör hazırlama ve transfeksiyon deney sürecinde zaman gerektirir– genom içine entegrasyon kısımları içerir
![Page 11: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/11.jpg)
siRNA avantaj ve dezavantajlarıAvantajları:– Kullanmak için hazır reaktifler mevcuttur,araştırmacılar için fazla zaman
tutmaz,spesifik bir geni knock down etmenin en hızlı yoludur– siRNAs etiketli olabilir– genellikle oldukça kolay transfeksiyon– vektör ile sürüm yaklaşımına göre siRNA miktarının kontrolü daha doğru ve kesindir– hedef dışı ve nonspesifik etkiler minimize edilmiştir– kimyasal değişimlerle stabiliteyi arttırmak mümkündür
Dezavantajları:– Daha büyük deneyler için pahalıdır– İndüklenemeyen ifade– Sadece kısa dönem, geçici knock down – Uzun süreli çalışmalar için kullanışlı değildir
![Page 12: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/12.jpg)
Mekanizmayı uyaran nedir?
![Page 13: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/13.jpg)
![Page 14: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/14.jpg)
• Birincil miRNA nükleusta ifade edilir ve genellikle birkaç kb uzunluğunda,
• 5’ cap ve poli A kuyruğu işlenmiştir.
Pri-miRNA
![Page 15: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/15.jpg)
•Nükleusta Drocha enzimi ile kesilerek 70 nt lik saç tokası transkriptleri oluşturulur.
![Page 16: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/16.jpg)
Dicer enziminin domain yapısı
![Page 17: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/17.jpg)
1. Nükleusta 2. sitoplasmada
![Page 18: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/18.jpg)
Tanınmayı sağlayan uçlar
![Page 19: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/19.jpg)
![Page 20: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/20.jpg)
Argonaute proteininin domain yapısı
• N terminal,• PAZ; domaini rehber zincirin 3´ ucuna bağlanmada
• MID; stabil olan zincirin tanınması
• PIWI; hedef mRNA’nın kesiminde
![Page 21: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/21.jpg)
Argonaute proteininin domain yapısı
![Page 22: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/22.jpg)
Gen ifadesinin engellenmesi
![Page 23: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/23.jpg)
![Page 24: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/24.jpg)
Sonuç olarak;RNA interferans, transkripsiyon sonrası gen
ekspresyonunun susturulması/baskılanması için etkili bir metotdur.
Bu mekanizma doğada var olan bir mekanizma olup, aynı zamanda moleküler biyolojide gen-protein işlevi analizinde, fonksiyonel genomik araştırmalarında ve
Gen tedavisinde geniş bir uygulama alanına
sahiptir.
![Page 25: RNA ve miRNA](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081418/56814627550346895db336f6/html5/thumbnails/25.jpg)
Teşekkürler…