sap biokimia fkip biologi 2013
TRANSCRIPT
SATUAN ACARA PERKULIAHAN
MATA KULIAH : BIOKIMIA KODE MATA KULIAH : KKM 314SKS : 3 SKS (2-1)WAKTU PERTEMUAN : 17 x (2 x 50 MENIT)
OlehTim Biokimia
Dr. Ir. Yandri A.S., M.S.NIP 19560905 199203 1001
PROGRAM STUDI BIOLOGIFAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
UNIVERSITAS LAMPUNG2013
1
SATUAN ACARA PERKULIAHAN
1. Identitas Mata Kuliaha. Mata Kuliah : Biokimia b. Kode Mata Kuliah : KKM 314c. SKS : 3 SKS (2-1)d. Semester : Genap (dua)
2. Dosen pengasuha. Nama : Dr. Ir. Yandri A.S., M.S.
b. NIP : 19560905 199203 1001
c. Bidang Keilmuan : Biologi/Biokimiad. Program Studi : Biologie. Fakultas : Keguruan dan Ilmu Pendidikan
Bandar Lampung, Februari 2013
Dosen Penanggung Jawab MK,Menyetujui,Ketua PS Biologi
Pramudiyanti S.Si, M.Si. Dr. Ir. Yandri A.S., M.S.NIP 19730310 199802 2001 NIP 19560905 199203 1001
Mengetahui,Ketua Jurusan PMIPA
Dr. Caswita, M.Si. NIP 196710041993031004
2
Deskripsi Mata Kuliah
Biokimia , KKM 314 (2-1)SKS
Status Mata Kuliah
Biokimia merupakan mata kuliah wajib yang ditempuh pada semester 2 (genap) dengan prasyarat telah mengikuti mata kuliah Kimia Dasar.
Fungsi/Manfaat Mata Kuliah
Biokimia, merupakan mata kuliah yang membahas tentang ilmu biokimia dan zat hidup yang banyak terlibat dalam reaksi-reaksi biokimia. Dalam biokimia ini juga dibahas zat-zat yang berperan dalam metabolisme yang terjadi dalam tubuh serta fungsi dari masing-masing senyawa tersebut. Dengan mempelajari mata kuliah ini kita dapat mengetahui pentingnya mempelajari reaksi-reaksi kimia yang terjadi dalam makhluk hidup.
Tujuan Pembelajaran
Setelah mengikuti mata kuliah ini, mahasiswa akan dapat menerapkan pengetahuannya menyangkut proses-proses atau reaksi-reaksi kimia yang terjadi dalam zat hidup dan fungsi dari senyawa-senyawa yang terlibat dalam reaksi-reaksi tersebut.
Silabus
Pendahuluan dan filsafat ilmu biokimia, asam amino, protein, asam deoksiribonukleat (DNA), Enzim, ,asam ribonukleat (RNA), metabolisme karbohidrat, metabolism lemak.
Referensi
1. Lehninger, A.L., Biochemistry, Worth Pub. Inc., New York, 1987.2. Devlin, T.M., Textbook of biochemistry with clinical correlation, John Wiley & Sons. 1998.3. Murray, R.K., D.K., Granner, A Lange medical book Harper’s biochemistry, 20004.Wirahadikusumah, M.,. 1985. Biokimia, Metabolisme Energi, Karbohidrat, dan Lipid, ITB Bandung.5.Lehninger, A.L.,., 1982. Principle of biochemistry, Worth Publisher Inc.
3
Media Pembelajaran
OHP dan beningan, LCD, papan tulis, dan spidol.
Penilaian
Penilaian hasil belajar mahasiswa dilakukan dengan cara memberi quiz, ujian, dan tugas, dengan bobot sebagai berikut.
Hal yang dinilai BobotQuiz 2 xTugasUjian Tengah SemesterUjian Akhir Semester
30 % 10 % 25 % 35 %
Nilai Total 100 %
Mahsiswa dianggap berhasil jika telah mendapat nilai sekurang-kurangnya C. Penilaian dengan PAP. Apabila nilai rata-rata kelas < 50 digunakan penilaian metode ranting-daun.
4
Kuliah Minggu ke 1
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:1. Menjelaskan ciri zat hidup2. Menjelaskan pengertian biokimia dalam zat hidup3. Menjelaskan biomolekul4. Menjelaskan fungsi biomolekul dalam sel5. Menjelaskan sel hidup6. Menjelaskan hirarki organisasi molekul dalam sel7. Menjelaskan transformasi energi
B. Pokok BahasanPengantar dan filsafat biokimia
C.Sub Pokok Bahasan
1. Ciri zat hidup2. Pengertian biokimia dalam zat hidup3. Biomolekul4. Fungsi biomolekul dalam sel5. Sel hidup6. Hirarki organisasi molekul dalam sel7. Transformasi energi
D. Proses PembelajaranNo. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
5
Kuliah Minggu ke 2
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan ciri molekul protein2. Menjelaskan dan menggambarkan asam amino3. Menjelaskan klasifikasi asam amino4. Menjelaskan sifat asam dan basa asam amino5. Menjelaskan stereokimia asam amino6. Menjelaskan dan menuliskan reaksi kimia asam amino7. Menjelaskan analisis asam amino
B. Pokok BahasanProtein
C. Sub Pokok Bahasan
1. Ciri molekul protein 2. Asam amino
1. Klasifikasi asam amino2. Sifat asam dan basa asam amino3. Stereokimia asam amino4. Reaksi kimia asam amino5. Analisis asam amino
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi
1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
6
Kuliah Minggu ke 3
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan peptida2. Menjelaskan analisis asam amino pada peptida3. Menjelaskan dan menuliskan reaksi penentuan asam amino N-ujung4. Menjelaskan penentuan asam amino C-ujung5. Menjelaskan penentuan urutan asam amino dalam polipeptida6. Menjelaskan dan menuliskan reaksi sintesis rantai polipeptida
B. Pokok BahasanProtein (lanjutan)
A. Sub Pokok Bahasan
1. Peptida2. Analisis asam amino pada peptida3. Penentuan asam amino N-ujung4. Penentuan asam amino C-ujung5. Penentuan urutan asam amino dalam polipeptida6. Sintesis rantai polipeptida
D.Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
Pertemuan ke 4
Quiz pertama
7
Kuliah Minggu ke 5
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan klasifikasi protein2. Menjelaskan organisasi struktur protein3. Menjelaskan dan menggambarkan struktur primer4. Menjelaskan dan menggambarkan struktur sekunder5. Menjelaskan dan menggambarkan struktur tersier6. Menjelaskan struktur kwaterner
B. Pokok BahasanProtein (lanjutan)
B. Sub Pokok Bahasan1. Klasifikasi protein2. Organisasi struktur protein3. Struktur primer4. Struktur sekunder5. Struktur tersier6. Struktur kwaterner
C. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
8
Kuliah Minggu ke 6
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan sifat larutan protein2. Menjelaskan sifat asam dan basa larutan protein3. Menjelaskan pemisahan protein4. Menjelaskan penentuan berat molekul protein5. Menjelaskan isolasi dan pemurnian protein
B. Pokok BahasanProtein (lanjutan)
C. Sub Pokok Bahasan1. Sifat larutan protein2. Sifat asam dan basa larutan protein3. Pemisahan protein4. Penentuan berat molekul protein5. Isolasi dan pemurnian protein
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
9
Kuliah Minggu ke 7
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan penamaan dan klasifikasi enzim2. Menjelaskan kinetika reaksi kimia3. Menjelaskan tingkat reaksi4. Menjelaskan katalisa5. Menjelaskan kinetika reaksi enzim
B. Pokok BahasanEnzim
C. Sub Pokok Bahasan1. Penamaan dan klasifikasi enzim2. Kinetika reaksi kimia3. Tingkat reaksi4. Katalisa5. Kinetika reaksi enzim
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
10
Kuliah Minggu ke 8
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan azas keseimbangan menurut Michaelis-Menten2. Menjelaskan transformasi persamaan Michaelis-Menten3. Menjelaskan analisis kuantitatif aktivitas enzim4. Menjelaskan mekanisme reaksi enzim5. Menjelaskan kekhususan substrat
B. Pokok Bahasan Enzim (lanjutan)
C. Sub Pokok Bahasan1. Azas keseimbangan menurut Michaelis-Menten2. Transformasi persamaan Michaelis-Menten3. Analisis kuantitatif aktivitas enzim4. Mekanisme reaksi enzim5. Kekhususan substrat
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
Pertemuan ke 9
Ujian mid semester
11
Kuliah Minggu ke 10
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan basa pirimidin dan purin2. Menjelaskan dan menggambarkan nukleosida dan nukleotida3. Menjelaskan dan menggambarkan nukleotida monofosfat4. Menjelaskan dan menggambarkan nukleotida difosfat5. Menjelaskan dan menggambarkan nukleotida trifosfat6. Menjelaskan polinukleotida
B. Pokok Bahasan Asam Nukleat
C. Sub Pokok Bahasan
1. Basa pirimidin dan purin2. Nukleosida dan nukleotida3. Nukleotida monofosfat4. Nukleotida difosfat5. Nukleotida trifosfat6. Polinukleotida
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
12
Kuliah Minggu ke 11
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan DNA2. Menjelaskan RNA3. Menjelaskan struktur tulang punggung asam nukleat4. Menjelaskan mekanisme replikasi DNA5 Menjelaskan transkripsi
B. Pokok Bahasan Asam Nukleat (lanjutan)
C. Sub Pokok Bahasan1. DNA2. RNA3. Struktur tulang punggung asam nukleat4. Mekanisme replikasi DNA5 Transkripsi
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
Pertemuan ke 12
Quiz kedua
13
Kuliah Minggu ke 13
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan gambaran umum metabolisme karbohidrat2. Menjelaskan dan menggambarkan biosintesis dan perombakan glikogen 3. Menjelaskan dan menggambarakan proses glikogenesis4. Menjelaskan dan menggambarkan proses glikogenolisis5. Menjelaskan dan menggambarakan pembentukan dan penguraian glikogen
B. Pokok BahasanMetabolisme karbohidrat
C. Sub Pokok Bahasan6. Gambaran umum metabolisme karbohidrat 7. Biosintesis dan perombakan glikogen 3. Proses glikogenesis 4. Proses glikogenolisis
5. Pembentukan dan penguraian glikogen
D.Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
14
Kuliah Minggu ke 14
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan glikolisis2. Menjelaskan glukoneogenesis3. Menjelaskan glikolisis anaerob4. Menjelaskan fermentasi alkohol5. Menjelaskan jalur metabolisme simpang fosfoglukonat
B. Pokok BahasanMetabolisme karbohidrat (lanjutan)
C. Sub Pokok Bahasan1. Glikolisis2. Glukoneogenesis3. Glikolisis anaerob4. Fermentasi alkohol5. Jalur metabolisme simpang fosfoglukonat
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
15
Kuliah Minggu ke 15
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan jalur metabolisme Entner-Doudorof2. Menjelaskan perubahan piruvat menjadi asetil-CoA3. Menjelaskan dan menggambarkan siklus Krebs4. Menjelaskan daur glioksilat5. Menjelaskan kelainan metabolisme karbohidrat bersifat turunan
B. Pokok BahasanMetabolisme karbohidrat (lanjutan)
C. Sub Pokok Bahasan1. Jalur metabolisme Entner-Doudorof2. Perubahan piruvat menjadi asetil-CoA3. Siklus Krebs4. Daur glioksilat5. Kelainan metabolisme karbohidrat bersifat turunan
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
16
Kuliah Minggu ke 16
A. Tujuan Instruksional KhususSetelah mengikuti perkuliahan ini mahasiswa dapat:
1. Menjelaskan gliserida2. Menjelaskan katabolisme asam lemak3. Menjelaskan biosintesis asam lemak
B. Pokok Bahasan Metabolisme lipid
C. Sub Pokok Bahasan1. Gliserida2. Katabolisme asam lemak3. Biosintesis asam lemak
D. Proses Pembelajaran
No. Proses Pembelajaran Alokasi Waktu Referensi1.
2.
Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.
Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan.
Kuliah2 x 50 menit
1,2,3,4,5
Pertemuan ke 17
Ujian Akhir semester
17
KONTRAK PERKULIAHAN
a. Nama Mata Kuliah : Biokimia b. Kode Mata Kuliah/sks : KKM 314 3 sks (2-1)c. Semester : Duad. Hari Pertemuan/Jam : Senin/13.00-14.40 dan Rabu/8.00-8.50e. Tempat Pertemuan : G 8f. Status Mata Kuliah : Wajibg. Mata Kuliah Prasyarat : Kimia Dasar
1. Manfaat kuliah bagi Mahasiswa : Biokimia, merupakan mata kuliah yang membahas tentang ilmu biokimia dan zat hidup yang banyak terlibat dalam reaksi-reaksi biokimia. Dalam biokimia ini juga dibahas zat-zat yang berperan dalam metabolisme yang terjadi dalam tubuh serta fungsi dari masing-masing senyawa tersebut. Dengan mempelajari mata kuliah ini kita dapat mengetahui pentingnya mempelajari reaksi-reaksi kimia yang terjadi dalam makhluk hidup.
.2. Deskripsi Perkuliahan : Pendahuluan dan filsafat ilmu biokimia,
asam amino, protein, asam deoksiribonukleat (DNA), asam ribonukleat (RNA), metabolism karbohidrat, metabolism lemak.
3. Tujuan Instruksional Umum : Setelah mengikuti mata kuliah ini, mahasiswa akan dapat menerapkan pengetahuannya menyangkut proses-proses atau reaksi-reaksi kimia yang terjadi dalam zat hidup dan fungsi dari senyawa-senyawa yang terlibat dalam reaksi-reaksi tersebut.
4. Strategi Perkuliahan : Dosen memberikan kuliah mimbar dengan menggunakan OHP dan transparasi disertai dengan contoh-contoh soal.Mahasiswa memperhatikan, mencatat, mengerjakan soal-soal latihan
5. Materi/Bacaan Perkuliahan :
1. Lehninger, A.L., Biochemistry, Worth Pub. Inc., New York, 1987.2. Devlin, T.M., Textbook of biochemistry with clinical correlation, John Wiley & Sons. 1998.3. Murray, R.K., D.K., Granner, A Lange medical book Harper’s biochemistry, 20004.Wirahadikusumah, M.,. 1985. Biokimia, Metabolisme Energi, Karbohidrat, dan Lipid, ITB Bandung.5.Lehninger, A.L.,., 1982. Principle of biochemistry, Worth Publisher Inc.
18
6. Tugas untuk Mahasiswa : Bacaan perkuliahan dibaca sebelum dan sesudah kuliah. Tugas diserahkan satu minggu setelah diumumkan.
7. Kriteria Penilaian Hasil Belajar MahasiswaPembobotan nilai mata kuliah 3 sks (2-1)
Hal yang dinilai Bobot (%)TugasQuizUjian Tengah SemesterUjian Akhir SemesterPraktikum
1015202530
Nilai Total 100
8. Penilaian dengan PAP:Nilai total Huruf mutu>7.5 A7,1 -7,5 B+
6,6-7,0 B6,2-6,5 C+
5,5-6,1 C5,0-5,4 D<5,0 E
Apabila nilai rata-rata < 5,0 maka digunakan Penilaian Acuan Normal (PAN) atau metode ranting-daun.
9. Jadwal PerkuliahanTanggal Topik bahasan Bacaan/Bab
Pengantar dan filsafat biokimia 1,2,3,4,5Protein 1,2,3,4,5Quiz pertama 1,2,3,4,5Protein (lanjutan) 1,2,3,4,5Protein (lanjutan) 1,2,3,4,5Protein (lanjutan) 1,2,3,4,5UTS 1,2,3,4,5Enzim 1,2,3,4,5Enzim (lanjutan) 1,2,3,4,5Asam Nukleat 1,2,3,4,5Asam Nukleat (lanjutan) 1,2,3,4,5Quiz kedua 1,2,3,4,5Metabolisme Karbohidrat 1,2,3,4,5Metabolisme Karbohidrat (lanjutan) 1,2,3,4,5Metabolisme Karbohidrat (lanjutan) 1,2,3,4,5Metabolisme Lemak 1,2,3,4,5UAS
19
10. Penilaian Hasil Mengajar Dosen
11. Dosen Pengajar : Penanggung jawab: : Dr. Ir. Yandri A.S. M.S
Bandar Lampung, Februari 2013
Dosen Penanggung Jawab MK,Menyetujui,Ketua PS Biologi
Pramudiyanti S.Si, M.Si. Dr. Ir. Yandri A.S., M.S.NIP 19730310 199802 2001 NIP 19560905 199203 1001
Mengetahui,Ketua Jurusan PMIPA
Dr. Caswita, M.Si. NIP 196710041993031004
20
PERANGKAT PEMBELAJARAN
BIOKIMIA
Oleh:
Dr. Ir. Yandri A.S., M.S.
PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGIFAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
UNIVERSITAS LAMPUNGBANDAR LAMPUNG
2013
21