scifinder web使用介绍 - shu.edu.cn · 美国化学文摘社 ... 默认开始检索文献...

1

SciFinder Web使用介绍李凤梅

2011.12.05

2

提纲

• 介绍– SciFinder 中的内容– SciFinder 的注册和登陆

• SciFinder 中的检索和后处理– SciFinder 中的文献检索– SciFinder 中的物质检索– SciFinder 中的Markush检索– SciFinder 中的反应检索

• SciFinder网络资源平台

美国化学文摘社—Chemical Abstracts Service

•创建于1907年

•ACS的分支机构

•密切关注，索引和提炼着全球化学相关的文献和专利

•最早创立了《化学文摘》

•总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市

3

SciFinder中的内容

4

期刊专利论文会议报告

溶剂，催化剂，产率，反应过程等

物质基因合成信息

CAPlus Medline

Registry CASReact

Chemcats

Chemlist

SciFinder中的内容—文献数据库CAPlus（Pre 1907－）

覆盖化学相关众多学科领域的参考文献。3400万条文献信息。上万种期刊和62个专利发行机构的专利（含专利族）。会议录、技术报告、图书、学位论文、评论、会议摘要日更新4500条以上的记录

Medline

美国国立医学图书馆出品生命科学医学相关毒理，病理学报告期刊、临床报告每周更新五次

SciFinder中的内容—反应数据库

66

CAS React（1840－）源自期刊，专利中有机、有机金属、无机、生化反应。3650万单步，多步反应。1400万制备信息周更新。每周增加 3 - 5 万种单步和多步化学反应。

SciFinder中的内容—物质数据库Registry （Pre 1957－）

世界上最大的物质数据库6300万个物质；6300万个序列无机物、有机物、聚合物、混合物、合金、核酸蛋白质序列等所有具有CAS No 物质日更新12000多个物质

ChemList

查询备案/管控化学信息的工具。

Chemcats

5300万化学物质提供商的联系信息包含价格情况、运送方式、质量等级等信息。

8

提纲

• 介绍– SciFinder中的内容– SciFinder的注册和登陆

• SciFinder中的检索和后处理– SciFinder中的文献检索– SciFinder中的物质检索– SciFinder中的Markush检索– SciFinder中的反应检索


SciFinder的注册和登陆

9

SciFinder Web的系统要求

Windows用户支持IE 7.x或者FireFox 3.x

Mac 用户支持 Firefox 和 Safari

Java 安装（初次使用结构时自动安装）

在图书馆相关页面上找到SciFinder Web注册用的网址

SciFinder的注册和登陆

10

上海大学图书馆—数据库资源---选择SciFinder

http://www.lib.shu.edu.cn/shulib/node/482

点击URL创建SciFinder账号

11

开始创建SciFinder帐号

每个用户必须输入各自信息

12

用学校邮箱注册SciFinder Web

密码设置技巧：

1：不要和账号中有重复的字符

2：密码格式最好是abc@123

对新ID的Email确认

13

需要点击邮件中的确认链接

使用这个链接登陆SciFinder

14

Http://scifinder.cas.org

SciFinder登陆界面

15

输入SciFinder帐号和密码

SciFinder登陆后主界面

16

文献，物质，反应检索入口，默认开始检索文献

可用的检索方法保存过的结果集

邮件提醒结果集

检索完，请点击退出

17

提纲




SciFinder中的文献检索

18

主题检索举例：quasicrystal in material（用于材料中的准晶体）

使用介词来连接关键词，点击Search

主题检索候选项

19

“Concept”表示做了同意词的扩展

“Closely associated with one another”

表示同时出现在一个句子中

“were present anywhere in the reference”

表示同时出现在一段话中

SciFinder中的结果

20

文献分析工具

SciFinder中的Analysis

21

Author Name分析，

了解本领域、本课题的主要研究人员

Company Organization

分析，了解本领域的核心研究机构，寻找国际合作伙伴。

Journal Name分

析，帮助选择投稿期刊


22

索引词（Index Term）：可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解

选择感兴趣的内容点击Apply


23

点击keep

Analysis，

将预览结果保存成分析后的结果集

24

选择Citing References方式排序，快速找到重要文献。

点击此处可获得引用了此文献的文献

SciFinder中的结果排序方式

SciFinder中的Refine

25

Refine by Document Type：可以帮助我们迅速获得特定文献类型的文献

历史导航条，迅速返回曾经检索过的界面

SciFinder中的Categorize

26

Categorize系统分类工具帮助我们根据学科目录迅速找到感兴趣的内容

SciFinder中的Categorize

27

Categorize直接获得与特定技术相关的文献

一级目录二级目录和二级目录相关的Index Term

获得特定技术相关的文献

28

如何进行文献的精读、泛读？

29

查看文献详情

文献详细著录信息

摘要信息

专利信息

30

查看文献详情

物质信息

重要概念索引

添加标签和评论

文献的保存

31

使用Export

将结果输出

Citation manager: 保存成RIS

格式，用于导入EndNote等文献管理工具Offline Review:保存成PDF，RTF格式，用于脱机浏览

SciFinder中的KMP定题查询

3232

设定Email提醒，一旦有新的记录，会发邮件通知

设置提醒文件名和提醒周期

KMP：Keep Me Posted

文献检索小结

主题检索时，使用介词作为连接

尽量选择包含Concept和Closed Associated with的候选项

通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围

尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益

使用Categorize可以让系统来实现自动分类

• 更多细节化内容，请参考

• www.igroup.com.cn/cas

33

34

提纲




通过物质标示符检索物质

35

案例：在SciFinder中查询Brufen（布洛芬, CAS号:15687-27-1 ）

这里可以通过输入物质的名称，CA号，俗名，商品名，来进行检索

SciFinder中的物质记录

36

在SciFinder中，

鼠标滑过物质，可以打开物质的标准菜单，通过标准菜单，可以获得和物质有关的所有内容

Substance Detail获得和物质有关的所有信息

37

物质的详细信息

物质的结构、CAS登记号、分子式、俗名、别名

按照CAS Role分类的专利、

非专利文献列表。对某类文献感兴趣，仅需点击交叉处的即可方便快捷地获取。

预测数据和实验数据

38

实验数据

39

可以看到原始文献对应的链接和谱图

获得布洛芬特定研究相关的文献

40

获得布洛芬分析研究相关的文献

41

获得布洛芬相关的反应

42

获得布洛芬相关的反应

43

SciFinder中的结构检索

44

点击画图版来进行结构输入，初次使用时需要安装Java插件

SciFinder结构绘制工具

重复基团工具

铅笔

元素周期表

可变基团

碳链工具

选择工具

旋转工具

环锁定工具

正电子

橡皮

常用基团

R基团定义工具

可变位置连接工具

模版工具

原子锁定工具

镜面旋转工具

负电子

索套选择工具

常见环，多元环工具

C原子和单键恢复工具

结构检索选择

单双键，RS构型，不确定键定义工具

结构和反应切换功能

46

精确结构检索

使用精确结构检索结构

精确结构检索，帮助获得盐，聚合物，配合物，本身

47

发现检索到了很多包含同位素的物质。

SciFinder中的结构限定

48

使用限定工具将包含同位素的物质去除。

结构检索—Substructure search

49

Substructure search会检索到内含所输入结构的所有结构

亚结构检索结果

50

检索界面可以看到对应的结构和检索方式

SciFinder中的物质分析

51

Substance Role分析，帮助获得具有特定研究报道的物质点击Keep Analysis来获取当前的结果集。

物质结果集的排序及历史导航条

52

SciFinder Web中的历史导航

条，方便快速返回曾经检索过的界面。

Refine-Atom Attachment获得结构中特定修饰情况

53

Refine下的Atom Attachment工具，帮助科研工作者了解结构中各个位点的可修饰性

Refine-Atom Attachment获得结构中特定修饰情况

54

获得特定位点只与杂环相连的物质

结构检索—相似结构检索

55

SciFinder中的相似结构检索，帮助获得在结构上存在相似的物质。

相似结构检索

56

分值越高，结构越相近

获得相似度75分以上的物质

相似结构检索

57

与原结构存在以下的区别：

取代基位置变化

取代基变化

母体结构变化

原结构

结构检索小结

58

精确结构检索：

获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等，母体结构不能修改，不能修饰

亚结构检索：

所画的结构必须存在，母体结构不能修改，但可以被修饰

相似结构检索：

相似度越高结构越相近，母体结构可以修改，也可以被修饰，用相似度来控制获得的结果

59

提纲




Markush检索——初步的专利评估

60

Markush检索直接返回保护了该结构的专利

61

获得专利原文

查看专利权利要求说明书

62

63

X1，X2，X3为C、N原子，至少有两个是N原子R1包括COOH基团，R6包括SH基团保护了我们设计的目标化合物

设计的目标化合物专利原文中保护的结构

64

提纲




SciFinder中的反应定义工具

65

反应位置标记工具

反应箭头

反应官能团列表

反应原子标记工具

反应角色工具

反应检索—基础检索

• 检索苯甲醛氧化成苯甲酸的反应

• 反应结构中的所有的伯醇不能参与反应

66

CHO COOH

SciFinder中的反应定义

67

反应原子标记工具，保证反应前后原子匹配

官能团选择工具，可以用官能团来定义反应，或者保护某特定官能团。

亚结构反应检索，帮助找到所有相关的反应

SciFinder中的反应结果

68

让一篇文献出现一条反应

SciFinder中的反应后处理

69

SciFinder中可以使用Analysis/Refine工具对反应进

行处理，这些工具的使用能让我们更好的了解反应的信息。

获得有实验过程的反应

70

分析后的结果是一个预览结果，需要点击Keep

Analysis来获得最后的结果。

反应信息和反应过程

71

反应的整体概述，每一步的溶剂，温度，反应条件

反应信息和反应过程

72

反应实验历程的获取

SciPlanner—更加直接的方法组织，管理结果

73

•勾选感兴趣的反应•点击Send to SciPlanner

•可以看到有1条反应推送到SciPlanner

SciPlanner—主面板

74

•点击屏幕右上方的SciPlanner，可以看到SciPlanner的

面板，刚才推送的反应，就在这里

•创建一个新的SciPlanner文件

SciPlanner—拖入反应，并尝试中间体的合成检索

75

•将右侧的反应，拖入SciPlanner中

•如对其中一个物质的合成很感兴趣，可以直接点击，使用物质标准菜单，获得它的合成方法

SciPlanner—将中间体的合成路线添加至SciPlanner

76

•类似上述的步骤，将中间体的反应拖至SciPlanner中•可以看到这两条反应的产物和反应物是同样的•用鼠标将这两个结构拖至重贴状态

SciPlanner—可以不断的重复上述的步骤

77

两条反应的结果

三条反应的结果,

反应都是从简单的原料开始的。

SciPlanner—获得反应对应的文献

78

•框选所有的反应，所有的结构都显示为红色•点击上面的Goto，选择Selected References

SciPlanner—反应对应的文献

79

•勾选文献•Send to SciPlanner

•3篇文献推送到SciPlanner中

SciPlanner—自由组合文献和反应的排列

80

获得结果后，点击WorkPlace下的Export，将结果输出成PDF格式

SciPlanner小结

• 针对要研究的物质，快速查找合成路线并找到支持的文献信息

• 简洁方便的工作平台，帮助对合成路线进行整理

• 所有文献、物质、反应信息都可以导出至一张工作表中

• 节省大量的文献整理时间，提高工作效率

• 方便科研人员之间的信息分享

81

82

提纲




网络在线资源平台

www.igroup.com.cn/cas

83

资源下载：PDF文件

在线演示：Flash演示

网络培训：不定期的网络专题培训

Flash演示

84

在线演示，录制了不同检索类型下的检索步骤，帮助了解更加细节的内容.

SciFinder Web 常见问题

并发用户数已满，请稍后再试

85


账号或密码错误，请在username处填写，截图，并与图书馆联系

86


请点击测试IP地址的链接

http://www.cas.org/cgi-bin/casip

87

将页面截图下来和user name一并发给图书馆

88

谢谢

scifinder web使用介绍 - shu.edu.cn · 美国化学文摘 社 ... 默认开始检索文献...

Documents

scifinder web使用介绍 - shu.edu.cn · 美国化学文摘社 ... 默认开始检索文献...