seminar biometrie 04.07.2002

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1 Seminar Biometrie 04.07.2002 Lars Burmeister Permutative Tests Jonckheere – Terpstra Trendtest für doppelt geordnete, kategoriale Daten

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Seminar Biometrie 04.07.2002. 1. Permutative Tests Jonckheere – Terpstra Trendtest für doppelt geordnete, kategoriale Daten. Lars Burmeister. Trichoderma harzianum. 2. Organismus bodenbürtiger Pilz Mykoparasit. - PowerPoint PPT Presentation

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1Seminar Biometrie 04.07.2002

Lars Burmeister

Permutative Tests

Jonckheere – Terpstra

Trendtest

für doppelt geordnete,

kategoriale Daten

Page 2: Seminar                                Biometrie                           04.07.2002

2Trichoderma harzianum

Wirkung (nach Bodenimpfung)

Auflauf von Keimlingen beschleunigt

Antagonist zu bodenbürtigen Schaderregern

verringerter Befall durch Wurzel- und Blattpathogene

Organismus

bodenbürtiger Pilz

Mykoparasit

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3Experiment

Faktor

Konzentration von Trichoderma harzianum im Substrat

- t0 – Kontrolle

- T1 – 0,5 % (= 2 g / Topf)

- T2 – 1 % (= 4 g / Topf)

Zielvariable

Auflauf der gesäten Bohnen nach x Tagen

Versuchsfrage

Beschleunigt Trichoderma harzianum den Auflauf von Bohnen (Phaseolus vulgaris ´Duffrix´)?

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4Datensituation

# Bohnen / Topf Konz. 0 1 2 3 4 Summe

t0 0 11 16 16 5 48 T1 2 8 16 15 7 48 T2 2 0 13 18 15 48

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5Datensituation

# Bohnen / Topf Konz. 0 1 2 3 4 Summe

t0 48 T1 48 T2 48

Daten sind doppelt geordnet!

r x c – Tafel i Konzentrationsstufen (i = 1,...,r) j Ergebnis-Kategorien (j = 1,...,c)

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6Auswertung permutativ?

Auswertung parametrisch?

Verteilungsannahme? // 5 Klassen??

NEIN, weil Daten NICHT stetig, sondern kategorial (0,1,...,4)

NEIN, weil sehr viele Bindungen vorliegen

Auswertung permutativ!

optimal für Zähl-Daten; kleine Fallzahl; Bindungs-„stabil“

Auswertung nicht-parametrisch?

hohe Fallzahl (n = 48) spricht für Asymptotik

ABER: extrem viele Bindungen (und kategoriale Daten)

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7Versuchsfrage

Kommt es – in Abhängkeit von der Konzentration an Trichoderma im Substrat – zu einer Erhöhung der Auflaufrate (zum Zeitpunkt x)?

rjjjH ...: 210

Hypothesen:

rjjjAH ...: 21

Ereignis Stufe 1 ... ... ... c Summe

1 - ... - r -

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8Auswertung

Jonckheere-Terpstra Test

3 x 5 - Tafel

StatXact

Statistics

Doubly Ordered R x C Table

Jonckheere-Terpstra Test

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9p-Werte

pasy pex pmid t0-T2 0,0011 0,0010 0,0010

t0-T1 0,3814 0,3819 0,3811

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10Ergebnis

Je höher die Konzentration an Trichoderma im Substrat, um so höher ist die Auflaufrate zum optimalen Boniturzeitpunkt x.

signifikanter Trend zwischen Konzentrationsstufen 0 – 2

kein signifikanter Unterschied zwischen Stufen 0 und 1

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11Analyse

pmid < pasy

aber: Unterschied nur geringfügig

asymptotische Lösung entspricht der exakten wegen hoher Fallzahl

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12elegantere Problemlösung

Anzahl Bohnen je Gefäß erhöhen

deutlicherer Effekt

Time-to-event – Analyse

Auflaufzeit bis zu Ergebnis x bonitieren

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13Quelle

Lars Burmeister.

SS 2002.

Diplom-Versuch Phytomedizin.

8. Semester.

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14Quelle

Lars Burmeister.

SS 2002.

Diplom-Versuch Phytomedizin.

8. Semester.