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UNIVERSIDADE DO ESTADO DE MATO GROSSOCAMPUS ALTA FLORESTA
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS
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UNIVERSIDADE DO ESTADO DE MATO GROSSOCAMPUS ALTA FLORESTA
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS
Mestranda Amanda Fernanda Nunes Ferreira
Mar!" #$%& ' A(ta F("resta
An)(*se da d*+ers*dade ,en t*.a deCapparis spinosa L/ 0"01(a!2es 1t*(*3and"
4ar.ad"res ISSR
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An)(*se da d*+ers*dade ,en t*.a de Capparis spinosa L/ 0"01(a!2es 1t*(*3and"4ar.ad"res ISSR
INTRODUÇÃO
A origem geográfica de C.spinosaé disputada, com os adeptos quereivindicam origens na China,Índia e da Ásia Central.
Ca00ar*s s0*n"sa L/Fa45(*a Ca00ar*da.eae
A 0(anta .res.e e4 re,*2es des rt*.asda C6*na7 *n.(1*nd" " G"8*/
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An)(*se da d*+ers*dade ,en t*.a de Capparis spinosa L/ 0"01(a!2es 1t*(*3and"4ar.ad"res ISSR
INTRODUÇÃO
9"t2es 1t*(*3ad" e4 0r)t*.as.1(*n)r*"s ."4" ."nd*4ent" na."3*n6a:Med*.*na( ."4" 14 d*1r t*."7ant*-6*0ertens*+"s7 .ata0(as4a/
Fr1t"s t;4 s*d" 1t*(*3ad"s 0aratratar a artr*te re14at
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O9=ETIVOS
Ana(*sar " n5+e( de d*+ers*dade ,en t*.a da 0"01(a!>" de C. spinosa1t*(*3and" 4ar.ad"res ISSR 0ara deter4*nar a d*?eren.*a!>" ,en t*.aentre 0"01(a!2es de d*?erentes re,*2es e4 @*n *an,/
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MATERIAL E METÓDOS
• De popula!"es de # locaisseparados geograficamenteno Norte, Central e $ul%in&iang'
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MATERIAL E METÓDOS
• (m cada local, foram coletadas amostras aleatoriamente )*+ indiv-duosseparados por uma dist.ncia de cerca de + m
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MATERIAL E METÓDOS
/ DNA genomico foi e0tra-do de folhas &ovens1 C2A31
Concentra!4o e a qualidade do DNA foi avaliada através de gel de agarose a +5 utili ando espectrofot6metro NanoDrop 1
E@TRAÇÃO DO DNA
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MATERIAL E METÓDOS
A amplifica!4o dos marcadores foram produ idos por 7C8 utili ando o DNA gen9mico e
iniciadores :$$81
;tili ou*se amostras1
E@TRAÇÃO DO DNA
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MATERIAL E METÓDOS
A 4*st1ra de #$ 4L ."nt*n6a
+ ng de DNA molde,
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MATERIAL E METÓDOS
/s produtos de 7C8 foram analisados por eletroforese em gel de agarose a +, 5 comtamp4o 23( ,B%1
2odos produtos foram analisados em +,B5 ?p v de geles de agarose corados com
tamp4o de carga1
;m DNA de + p escada foi usada como um marcador de tamanho1
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MATERIAL E METÓDOS
A porcentagem de locos polim6rficos ?7 1
/s nGmeros efetivos de alelos ?N( 1
Diversidade genética ?Hetero igosidade esperada, H( 1
Índice de diversidade de $hannon ?: 1Dist.ncias genéticas imparciais de acordo com Nei ?+=E) 1
Foram calculados usando 7opIene ?Jeh et al', +=== para am os os marcadores'
:$$8s s4o marcadores dominantes, com cada anda que representava o fen6tipo numGnico locus ialélico'
Apenas as andas que poderia ser inequivocamente marcados foram utili ados naanálise'
3andas :$$8 amplificados foram pontuadas para a 0resen!a da 8anda B% "1 a1s;n.*aB$ 7e uma matri de dados qualitativa inário foi formado'
ANALISE DEDADOS
D*st n.*a ,en t*.a 14a 4ed*da da d*?eren!ade 4ater*a( ,en t*." entre d*?erentes es0 .*es
"1 *nd*+5d1"s da 4es4a es0 .*e "1 n>"/ a
4ed*da da d*st n.*a ,en t*.a 0"de ser 1sada
."4" 14a ?erra4enta 0ara ."nstr1*r
.(ad",ra4as 4"strand" a )r+"re ,enea(
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MATERIAL E METÓDOS
A matri de dist.ncia genética o tida foi utili ada para reali ar a análise de cluster e
construir o método grupo par n4o ponderada com média aritmética ?;7I@A 1
A terceira a ordagem foi utili ada a estrutura do programa que identifica agrupamentos
de indiv-duos relacionados de gen6tipos multilocus1
/s indiv-duos foram atri u-do ?pro a ilisticamente a um con&unto ou, em con&unto, dois
ou mais con&untos, se os seus hapl6tipos indicado que eles s4o misturados1
Análise de agrupamentos ou Análisede KClusterK , tam ém denominadoclassifica!4o n4o supervisionada, é aclassifica!4o de o &etos emdiferentes grupos, cada um dos quaisdeve conter os o &etos semelhantessegundo alguma fun!4o de dist.nciaestat-stica.
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MATERIAL E METÓDOS
Cada con&unto é caracteri ado por um con&unto de frequLncias de alelos em cada locus
?7ritchard et ai', < 1
7ara escolher o melhor nGmero de clusters genéticos ?M , vários valores foram testado
?+*E utili ando um comprimento de per-odo de + ' passos e + repeti!"es1
/s resultados foram analisados através da ferramenta, (strutura Harvester ?(arl et al',
< +< , que implementa o método de (vanno et al', < B, para detectar o verdadeiro
nGmero de aglomerados numa amostra n4o*homogenea dos indiv-duos1
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RESULTADOS
A amplifica!4o dos fragmentos :$$8 nos => indiv-duos, analisados com de iniciadores,
produ iram #+# andas eletroforéticas inequ-vocas e reprodut-veis que variam de B a +B
andas para cada um dos iniciadores, com uma média de =,# andas por iniciador'
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RESULTADOS
As est*4at*+as da ,en t*.a d*+ers*dade na C. spinosa de4"nstrara4 14
n"t)+e( n5+e( de +ar*a!>" ,en t*.a entre as 0"01(a!2es
?77 O EP,+#5?H( O ,
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RESULTADOS As percentagens de locospolim6rficos para uma Gnicapopula!4o variou de < ,P>5 ?%J a>E,)E5 ?2 F com uma média de
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RESULTADOS
/ gene de diversidade Nei depopula!"es de C' spinosa emdiferentes regi"es tinha umadiversidade ?H e -ndice deinforma!4o de $hannon ?: gama,respectivamente, de ,+#+
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RESULTADOS
/ maior H( e o valor : foram para aspopula!"es 2 F1
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RESULTADOS
/s valores mais ai0os foram para apopula!4o Q @R' -ndices da médiade $hannon mostrou uma fortecorrela!4o ?r de 7earson O ,===com o gene diversidade1
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RESULTADOS/s valores de diversidade e gene de
-ndice de $hannon apresentou umatendLncia semelhante ao dopercentagens de locos polim6rficos'
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RESULTADOS
2rLs grupos de popula!"es de C' spinosa das montanhas de 2ianshan foramo tidos em trLs cladogramas com altos valores de ootstrap1
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RESULTADOS
/ primeiro grupo era compostopor B popula!"es de Q @, S,M @J e $HT, todos locali adosna parte norte da regi4o1
/ segundo grupo foi formado por AM$, M$ e H2, as trLspopula!"es locali adas na regi4osul1
/ terceiro grupo incluiu H@ e2 F, duas popula!"eslocali adas na por!4ooriental da regi4o amostrada1
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RESULTADOS
Como pode ser visto a partir da resultados de agrupamento, a distri ui!4ogeográfica das + popula!"es e o germoplasma, que tinha uma dist.ncia
geográfica mais curta, tende a estar na mesma categoria1
(m geral, a + C' spinosa popula!"es teve pequena dist.ncia genética e alta
similaridade genética'
A análise de gen6tipos multilocus individuais das => amostras usando a(strutura algoritmo mostrou a melhor solu!4o para o agrupamento M O #'
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RESULTADOS
A Figura # mostra que todos os indiv-duos de as popula!"es 2ianshan@ontanha C. Spinosa foram designados para os trLs grupos restantesU iindiv-duos de 2 F e H@ ?popula!"es orientais , ii indiv-duos de AM$, M$ e H2?sul popula!"es , e iii indiv-duos de %J, RS, M @J, $HT e Q @R ?popula!"esdo norte '
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RESULTADOS
/s indiv-duos que mostram pro a ilidades de atri ui!4o de mais do que umagrupamento foram o servadas em todos os 2ianshan @ontanhas popula!"es,
revelando que houve algum flu0o gLnico entre clusters'
As propor!"es de indiv-duos que tLm pelo menos uma pro a ilidade de B5 decess4o a outro cluster eram de
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RESULTADOS
C. spinosa é um ar usto perene com uma distri ui!4o desigual1
As popula!"es s4o frequentemente locali ado em serras distantes e s4o
isolados uns dos outros pelo Io i ou outros desertos1
Dentro este resistente, relatamos o primeiro estudo do polimorfismo genético
em popula!"es de C. spinosa usando :$$8 marcadores1
/s altos n-veis de varia!4o entre popula!"es de C. spinosa pode ser devido
principalmente ao gene1
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RESULTADOS
Flu0o t4o ai0as quanto ,E =# ?Nm O ?+ * I$2
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RESULTADOS
/ cluster de primeira, que contém popula!"es RS, M @J, $HT, e %J, tinhammaior similaridade genética e frutas de tamanho médio'
As popula!"es restantes, com e0cep!4o de M$ e H2, formado outro cluster eteve grande frutas' diferen!as genéticas podem ter sido refletido no fen6tipo
de frutos1
@ais pesquisas de C. spinosa varia!4o genética deve ser reali ado em
com ina!4o com análises morfol6gicas'
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An)(*se da d*+ers*dade ,en t*.a de Capparis spinosa L/ 0"01(a!2es 1t*(*3and" 4ar.ad"resISSR
RESULTADOS
C. spinosa na popula!4o 2 F é mais amplamente utili ada como um
medicamento'
A partir deste estudo, a análise genética pode ser utili ado para determinar
condi!"es de crescimento adequadas para plantio e fornecem a ase para a
prote!4o dos recursos de C. spinosa e plantas medicinais semelhantes'
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