Sistem reproduksi kuda jantan terdiri dari 2 testis, 3 kelenjar seks tambahan, dan serangkaian tubulus dimana spermatozoa diangkut ke reproduksi kuda betina.

Spermatozoa diproduksi di tubulus seminiferus yang melingkar didalam testis yang panjangnya 400 sampai 500 meter. Karena sel-sel ini tak dapat berkembang disuhu tubuh maka pengaturan suhu sangatlah penting. Otot skrotum mengembang dan mengerut saat terjadi perubahan suhu sebagai proses penormalan suhu. Kriptorkismus ( cryptorchid) berfungsi sebagai pensterilan testis dalam tubuh untuk menjaga kesuburan testis.

Kelenjar seks tambahan yaitu vesikula seminalis, prostat, dan kelenjar bulbourethral. Kelenjar ini Berfungsi untuk mensekresi cairan alkali sebagai bentuk penteralan uretra dimana spermatozoa yang diangkut dari epididimis ke ujung kelenjar penis kuda jantan.

Kehidupan sperma dalam saluran kuda dalah 24 sampai 48 jam. Sperma berada di tabung fallopi sekitar 15 sampai 18 menit setelah coitus (bersenggama). Tetapi waktu normal perjalanan sperma dari tempat penampungan ke tabung fallopi sekitar 5 sampai 8 jam.

Karena siklus estrus panjang dan umur yang pendek dari sperma dan telur, tidak jarang pembuahan terjadi tidak kurang dari 50 % dari penyatuan telur dan sperma.