skrining mikroba potensial
DESCRIPTION
pptTRANSCRIPT
![Page 1: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/1.jpg)
Dr. Ni’matuzahrohDepartemen Biologi
Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Airlangga
2010
![Page 2: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/2.jpg)
QUIZ
Apa kepentingan mempelajari mikroba bagi perkembangan studi Anda ?
Mikroba apakah yang ingin Anda eksplorasi ? Bagaimanakah cara Anda mendapatkannya? Apa sajakah yang harus Anda fahami dalam
upaya eksplorasi mikroba potensial ? Uji apa sajakah yang Anda butuhkan untuk
meyakinkan bahwa isolat mikroba Anda tersebut potensial ?
![Page 3: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/3.jpg)
PENDAHULUAN Mikroba berperan penting dalam proses
biodegradasi berbagai jenis limbah di lingkungan Jenis-jenis limbah di lingkungan dapat dibagi
berdasarkan berbagai kategori antara lain : Bentuk : padat, cair, lumpur, gas Jenis komposisi senyawa : organik dan anorganik Sumber : pemukiman, pertanian, industri,
pertambangan Penggunaan mikroba untuk berbagai kepentingan
misalnya : upaya bioremediasi limbah membutuhkan upaya eksplorasi mikroba yang berpotensi mendegradasi senyawa penyusun limbah
![Page 4: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/4.jpg)
Hal-hal yang harus diperhatikan dalam eksplorasi mikroba potensial Pemahaman tentang karakteristik morfologis dan
fisiologis mikroba diperlukan dalam isolasi mikroba. Faktor-faktor yang memengaruhi pertumbuhan
mikroba juga mutlak diteliti agar didapatkan hasil pertumbuhan yang optimum.
Kesabaran, ketelitian, dan kemampuan dalam mengenal karakteristik koloni mikroba yang tumbuh saat skrining awal sangat membantu untuk mengurangi jumlah uji lanjut yang sering digunakan untuk mengukur aktivitas dari masing-masing isolat tunggal yang didapatkan.
Metode penyimpanan stok isolat mikroba juga harus menjadi perhatian penting untuk tetap mempertahankan atau menghambat penurunan kemampuan degradasinya.
![Page 5: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/5.jpg)
Keanekaragaman jenis mikroba pengurai limbah pencemar Jenis-jenis mikroba yang telah diketahui mempunyai
peranan besar dalam proses bioremediasi lingkungan dari pencemaran utamanya dari golongan bakteri, khamir dan kapang.
Tingkat keanekaragaman jenis mikroba yang mampu mendegradasi limbah pencemar adalah sangat tinggi, dan bervariasi dari suatu tempat ke tempat yang lain bergantung pada jenis, karakteristik, dan kelimpahan kandungan substrat bahan pencemar.
Perbedaan kemampuan degradasi pada masing-masing jenis mikroba bergantung pada variasi jenis mikroba dan enzim yang dimilikinya. Contoh berbagai jenis mikroba dan substrat yang dapat didegradasi disajikan pada Tabel 1.
![Page 6: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/6.jpg)
Pencemaran limbah di lingkungan
Bioremediasi
Biodegradasi
Mikroorganisme
Faktor lingkungan yang menjamin Survival mikroba dan interaksinya
Jenis substrat
![Page 7: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/7.jpg)
Bioremediasi mempunyai dua tujuan yaitu
menstimulasi pertumbuhan mikroba baik yang indigenus yaitu mikroba asli maupun non indigenus non indigenus atau mikroba yang sengaja dimasukkan dari luar ke daerah yang terkontaminasi, dan
menciptakan kondisi lingkungan yang sesuai untuk meningkatkan intensitas kontak langsung antara mikroba dengan senyawa kontaminan di lingkungan baik yang terlarut maupun yang terikat oleh partikel untuk mengalami biotransformasi, biodegradasi, bahkan sampai biomineralisasi.
![Page 8: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/8.jpg)
Pencemaran minyak di tanah
![Page 9: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/9.jpg)
Limbah pencemar di lingkungan
![Page 10: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/10.jpg)
Sumber pencemar di air
![Page 11: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/11.jpg)
Sumber Polutan Petroleum
A tanker accident with oil flowing into the water
Oil set on fire after a ship has broken
![Page 12: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/12.jpg)
![Page 13: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/13.jpg)
![Page 14: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/14.jpg)
CONTOH Berdasarkan kandungan bahan organik yang
ada dalam limbah cair rumah tangga, maka proses transformasi dari bahan organik yang akan terjadi adalah proses penguraian antara lain meliputi hidrolisis :
Terjadinya proses transformasi dalam air limbah tersebut adalah akibat terjadinya reaksi enzimatis yang diproduksi oleh mikroba pengurai secara hidrolisis
Reaksi enzim secara umum dinyatakan dalam enzim + substrat kompleks enzim-substrat produk
+ enzim
![Page 15: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/15.jpg)
CONTOH BAKTERI POTENSIAL Bakteri pengurai proteolitik
Staphylococcus aureus, Pseudomonas spp., Proteus spp., Bacillus subtilis, bacillus cereus, Clostridium botulinum, Clostridium nigricans
Bakteri pengurai karbohidrat Bacillus subtilis, B. polymixa, B. macerans, B.
licheniformis, B. diastaticus Bakteri pengurai detergen
Pseudomonas facilis, Escherichia sp. , Kurthis zopfii
Bakteri pengurai minyak/lemak Pseudomonas spp., Alcaligenes, Micrococcus,
Flavobacterium, Acinetobacter, Alcaligenes, Streptococcus, Achromobacter, Serratia, Bacillus, Staphylococcus, Clostridium
![Page 16: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/16.jpg)
SKEMA IDENTIFIKASI BAKTERI
Isolasi (kultur stok)
Enrichment
Identifikasi
Pre-enrichment
Sampel
Karakteristik mikroskopik
Karakteristik Pertumbuhan m.o
Karakteristik koloni
Karakteristik fisiologi
![Page 17: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/17.jpg)
CONTOH Metode skrining bakteri pengurai amilum,
protein, lemak(minyak), dan detergen Sampel (air /tanah) ditumbuhkan pada media
selektif cair yang berisi mineral dan substrat (amilum, susu skim, minyak, olive dan detergent)
Setelah beberapa hari inkubasi (4 hari) kultur ditumbuhkan kembali pada media padat selektif
Bakteri yang tumbuh merupakan bakteri potensial hasil skrining
Isolat bakteri dimurnikan sampai didapatkan isolat tunggal
Bakteri disimpan untuk uji lanjut dalam tabung reaksi di tabung reaksi
![Page 18: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/18.jpg)
KOMPOSISI MEDIA UNTUK UJI BAKTERI PROTEOLITIK< AMILOLITIK, LIPOLITIK DAN PENGURAI DETERGEN
(Bushnell-Haas Mineral Medium + substrat selektif)
No. Senyawa Jumlah 1. MgSO4. 7H2O 0,2 g2. CaCl2 0,02 g3. KH2PO4 1 g4. K2HPO4 1 g5. NH4NO3 1 g6. FeCl3 (60%) 2 tetes7. Aquadest steril 1000 ml8. pH 7 – 7,29 Substrat :
- amilum 1 %- susu skim 2 %- minyak 2 % (v/v)-detergent 1oo ppm-CMC (selulosa) 2 %
![Page 19: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/19.jpg)
Pertumbuhan pada media selektif
setelah pengenceran
Hasil uji potensi bakteri pengurai
protein (Bakteri proteolitik)
Kultur bakteri pada media selektif
(amilum, susu skim, minyak olive, dan
detergen)
![Page 20: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/20.jpg)
Pengukuran indeks hidrolisis
Aktivitas amilolitik
Aktivitas proteolitik dan lipolitik
![Page 21: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/21.jpg)
PENGHITUNGAN
Indeks hidrolisis =Diameter zona bening – diameter
koloni ------------------------------------------------------
Diameter koloni
Indeks pengurai detergen Selisih kadar akhir detergen dan kadar
awal fermentasi
![Page 22: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/22.jpg)
Hasil uji hidrolisis bakteri
![Page 23: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/23.jpg)
Skrining kemampuan mikroba dalam mendegradasi komponen hidrokarbon minyak
Minyak mentah (crude oil)
Solar
(Penelitian Strategis Nasional Ni’matuzahroh et al, 2009)
![Page 24: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/24.jpg)
Kultur bakteri hidrokarbonoklastik
![Page 25: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/25.jpg)
Kultur mikroba hidrokarbonoklastik
Penelitian : Eksplorasi bakteri pengurai minyak dari Kali Donan Cilacap dan Tanjung Perak Surabaya
(Ni’matuzahroh et al., 2003-2005)
![Page 26: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/26.jpg)
Skrining mikroba pada substrat
Penelitian Disertasi Ni’matuzahroh 1998
![Page 27: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/27.jpg)
Mekanisme asimilasi hidrokarbonoleh bakteri Pseudomonas sp. (Ni’matuzahroh et al, 2002)
![Page 28: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/28.jpg)
Eksplorasi mikroba pengurai hidrokarbon
Kapang BakteriKhamir
Penelitian : Eksplorasi bakteri pengurai minyak dari Kali Donan Cilacap dan Tanjung Perak Surabaya (Ni’matuzahroh et al., 2003-2005)
![Page 29: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/29.jpg)
3. Inoculation Method Streaking
Streaking phase
S. aureus
E. coliRhodotorula
![Page 30: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/30.jpg)
Keanekaragaman mikroba pengurai limbah
![Page 31: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/31.jpg)
Penelitian Riset Unggulan Terpadu ,
RISTEK “Bakteri potensial
penghasil biosurfaktan”
Ni’matuzahroh et al,
2003-2005
![Page 32: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/32.jpg)
Mikroba (bakteri dan yeast) hasil isolasi
Beberapa koleksi mikroba potensial pendegradasi minyak hasil eksplorasi dari
Sumur minyak Wonocolo – Bojonegoro(Ni’matuzahroh et al, 2009)
Bakteri Yeast
![Page 33: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/33.jpg)
![Page 34: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/34.jpg)
Bioreaktor mini untuk uji bioremediasi limbah organik
![Page 35: Skrining Mikroba Potensial](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022061602/5695d0a51a28ab9b02934ab7/html5/thumbnails/35.jpg)
TERIMA KASIH ATAS PERHATIANNYA
Wassalamu’alaikum Wr.Wb.