taxonomia bacteriana 2010
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La diversidad del mundo microbiano
La diversidad del mundo microbiano
TaxonomíTaxonomía a
MicrobianMicrobianaa
TaxonomíTaxonomía a
MicrobianMicrobianaa
• Gran diversidad de organismos existentes
• Agruparlos y organizarlos en una estructura jerárquica sin superposiciones
• TAXONOMÍA Ciencia artificial influenciada por los
avances en las técnicas utilizadas para su estudio
Taxonomia Taxonomia
• La taxonomía –Del Griego
• taxis → estructuración u orden;
• nomos→ ley
• nemein→ distribuir o gobernar
–Se define como la ciencia de la clasificación biológica
TaxonomiaTaxonomia
• Clasificación– Estructuración de los organismos en grupos o
taxones en función de semejanzas mutuas o del parentesco evolutivo
• Nomenclatura– Se ocupa de la asignación de nombres a grupos
taxonómicos de conformidad con normas publicadas
• Identificación– Constituye el lado práctico de la taxonomía, el
proceso de determinar que un aislamiento en particular pertenece a un taxón reconocido
IMPORTANCIA DE LA TAXONOMIAIMPORTANCIA DE LA TAXONOMIA
• Organizar cantidades ingentes de conocimientos sobre los organismos– Sistema gigante de archivo o catálogo de
biblioteca
• Permite hacer predicciones y formular hipótesis para nuevas investigaciones – Sobre la base de los conocimientos
existentes acerca de organismos similares
• Ubica a los microorganismos en grupos útiles y significativos con nombres precisos – Permiten a los microbiólogos trabajar con
ellos y comunicarse de forma eficiente
• Es esencial para la identificación exacta de los microorganismos
Vocabulario suficiente, ortografía correcta y buena gramática
• Surgimiento de la vida Procariota• Carl Woese → Secuencias de rRNA• Hipótesis endosimbiótica
Evolución y diversidad microbianas
Evolución y diversidad microbianas
• Dominio Eucaria– Lípidos de membrana → acil diésteres de glicerol
y rRNA eucariótico.
• Dominio Bacteria (Eubacteria) – Lípidos de membrana → diacil diésteres de
glicerol y rRNA eubacteriano
• Dominio Archaea – Lípidos de membrana → isoprenoides del tipo
diéter de diglicerol o tetraéter de diglicerol y rRNA arqueobacteriano.
Rangos taxonómicos Rangos taxonómicos
Concepto de ESPECIEConcepto de ESPECIE
• Especie bacteriana – Colección de cepas que
comparten numerosas propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de cepas
• Cepa– Población de organismos que
desciende de un único organismo o de un aislamiento en cultivo puro
• Las cepas dentro de una especie pueden diferenciarse ligeramente unas de otra:– Biovariedades
• Variantes de cepas bacterianas caracterizadas por diferencias bioquímicas y fisiológicas.
– Morfovariedades• Se diferencian desde el punto de vista
morfológico.
– Serovariedades• Presentan propiedades antigénicas
diferenciadoras.
• Cepa tipo– Suele tratarse de una de las primeras
cepas estudiadas y a menudo está más caracterizada que otras cepas; sin embargo, no tiene por qué ser el miembro más representativo de la especie.
– La cepa tipo correspondiente a la especie se denomina especie tipo, y constituye el tipo nomenclatural o el titular del nombre de la especie.
– CEPAS ATCC
• Género– Grupo bien definido de una o
más especies que está claramente separado de otros géneros.
– En la práctica existe un grado considerable de subjetividad al asignar las especies a los géneros, y los taxonomistas pueden no coincidir en la composición de los mismos.
NOMENCLATURANOMENCLATURA• Sistema binomial de Linneo. • Nombre latinizado y en letra cursiva, consta de dos
partes. – 1ra. Parte → Primera letra en mayúscula, es el nombre
genérico
• Ej. →→Escherichia– 2da. Parte → en minúscula, epíteto de especie (nombre
específico) • Ej. →→ coli
Escherichia coliEscherichia coli – El epíteto de especie es estable. – Género Streptococcus → Enterococcus y Lactococcus
• Streptococcus faecalis → Enterococcus faecalis.
• A menudo se acorta el nombre abreviando el nombre genérico con una letra mayúscula: E. coli.
Sistemas de clasificación Sistemas de clasificación • Clasificación fenética
– Agruparse en función de similitudes globales: morfológicos, bioquímicos y fisiológicos
• Taxonomía numérica– Agrupamiento mediante métodos numéricos
de unidades taxonómicas en taxones, sobre la base de sus estados caracterológicos
• Clasificación filogenética– Agruparse en función de probables
relaciones evolutivas– Filogenia
• Del Griego phylon, tribu o raza; y génesis, generación u origen
Un carácter se define habitualmente como un atributo acerca del cual es posible realizar una única afirmación
Dendrograma Coeficientes de asociación
Principales características aplicadas en taxonomía
Principales características aplicadas en taxonomía
• Características clásicas– Morfológicas, fisiológicas, bioquímicas, ecológicas y
genéticas.
• Características moleculares– Comparación de proteínas
• Secuencia de aminoácidos• Movilidad electroforética
– Composición de ácidos nucleicos • Determinación de la composición de bases del DNA:
Contenido G + C– HPLC (high-performance liquid chromatography)– Temperatura de fusión y espectrofotometría
• Hibridación de ácidos nucleicos• Secuenciación de ácidos nucleicos
Características morfológicas
Características fisiológicas
Bergey's Manual of Systematic
Bacteriology Bergey's Manual of Systematic
Bacteriology • Manual Bergey
– Bergey' s Manual of Systematic Bacteriology – Bergey' s Manual of Determinative Bacteriology
• La primera edición del Manual Bergey– La primera edición del Bergey's Manual of Systematic
Bacteriology es principalmente fenotípico, y divide las bacterias en grupos en función de características de fácil determinación, como son la forma, la tinción de Gram, las relaciones con el oxígeno y la motilidad
• La segunda edición del Manual Bergey– La segunda edición, desarrollada en 5 volúmenes y 30
secciones, se organiza desde el punto de vista filogenético y distribuye los procariotas en 2 dominiós
IDENTIFICACIONIDENTIFICACION
1.- Selección de la muestra2.- Toma de la muestra3.- Examen directo de la muestra:
– Macroscópico y microscópico
4.- Cultivo bacteriológico primario
5.- Cultivo bacteriológico secundario
6.- Identificación Bacteriana
Esquema de Aislamiento e Identificación para M.O. Presentes en abscesosEsquema de Aislamiento e Identificación para M.O. Presentes en abscesos
1.- Recolección de la muestraMuestra de:______________________Técnica de recolección:_____________Fecha:__________________________Datos Clínicos____________________Transporte al laboratorio:____________
2.- Examen macroscopico y microscopico de la muestra
Características Macroscopicas:______________________________________
Coloración de GramCaracterísticas microscopicas
Gram + Gram -Morfología: __________Agrupación:__________
Morfología: __________Agrupación:__________
Caract. colonias:____________________Hemolisis:___________________Pigmentos:__________________Otros_______________________
Crecimiento:_________________Caract. colonias:______________Utilización de manitol __________Pigmentos:__________________Otros_______________________
Crecimiento:_________________Caract. colonias:______________Utilización de lactosa:__________Pigmentos:__________________Otros_______________________
4.- Obtención de cultivos puros
A partir de:______________
Gram -
Coloración de Gram
Gram +
Agar inclinado BHI o nutritivo
3.- Aislamiento Primario
Agar Sangre Bovina
Agar Manitol Sal
Agar MacConkey
37ºC
24-48 h
37ºC
24-48 h
37ºC
24-48 h
FilamentososFusobacterium necrophorum
BacilosPseudomona aeruginosaPasteurella multocidaActinobacillus lignieresii
Cocos
BacilosCorynebacterium sppActinomyces pyogenesRhodococcus equi
Cocoscatalasa
(-) Streptococcus
(+) Staphylococcus Micrococcus OF-glucosa
(O+ , F-) Micrococcus(O+ , F+) Staphylococcus
Selección de la muestra• Material representativo• Forma aséptica• Volumen representativo• Previa a tratamiento• Identificación correcta• Tiempo de colección
adecuada
Toma de la muestra• Hisopos (no algodón – si dracon o poliester)• Agujas estériles: Punción aspiración Culturette• BD Anaerobic Specimen Collect• Directamente (Mango de Kolle)• Medio de transporte y Preservación de la
muestra– M.O patógeno Laboratorio = M.O vivo– Evitar cambio de pH y carencia de nutrientes– Medios más usados: Amies, Stuart, Cary y Blair
» No aportan nutrientes» Tamponados: pH neutro» Bajo potencial de oxido-reduccióN
Examen directo de la muestra • Macroscópico
»Heces (moco, sangre, etc.)»Esputo (color, consistencia, olor,
etc.)• Microscópico
»Examen al fresco»Tinción de Gram
Cultivo bacteriológico primario• Siembra de
Microorganismos»Aislamiento bacteriano»Estudiar Crecimiento y
metabolismo»Conservar cepas o cultivos
puros• La siembra depende de la
técnica y el medio de cultivo
Cultivo bacteriológico primario• Consecuencias de un retraso en la
siembra»Perdida de las bacterias delicadas
o anaerobias»Cambio del número total de M.O =
invalida»Aumento en el número de
contaminantes• Técnicas de siembra
»En medio sólido: Placa y agar inclinado
»En medio líquido»En medio semisólido
Cultivo bacteriológico secundarioAislamiento bacteriano cultivos
puros o axénicos identificación bacteriana diagnóstico enfermedades infecciosas tratamiento adecuado
Cultivo puro, mixto y contaminado