td 5 : les aminoacides bts dietetique 1 td de biochimie
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TD 5 : LES AMINOACIDES
BTS DIETETIQUE 1 TD DE BIOCHIMIE
Exercice 1 : Vrai ou faux3. Spectre d’absorbance des acides aminés
aromatiques
Exercice 1 : Vrai ou faux4. Etats de la glycine
pH
CH NH3+
HOOC
H
CH NH3+
OOC
H
- CH NH2OOC
H
-
pHi
Forme cationique
A+
Zwitterion
A
Forme anionique
A–
H3O+H2O
H3O+H2O
H3O+H2O
H3O+H2O
pH
CH NH3+
HOOC
H
CH NH3+
OOC
H
- CH NH2OOC
H
-
pHi
ZwitterionForme cationique Forme anionique
A+ A A–
A+ A A–
% forme
0
50
100
H3O+H2O
H3O+H2O
H3O+H2O
H3O+H2O
[A+] = [A] [A] = [A–]
pHpHi
% formepH = pKa1 pH = pKa2
pKa = pH de demi-ionisation des fonctions ionisables
A+ A A–
[A+] = [A] [A] = [A–]
0
50
100
21 pKa pKa 21 pHi
• Si pH = pKa1 [COOH] = [COOH]
• Si pH = pKa2 [NH2] = [NH3+]
Tampon pH = 6
Exercice 4 : Electrophorèse
AnodeCathode
G+
– +
PapierZone de dépôt
DÉ
PO
T
Exercice 6 : Analyse peptide
DE
NA
TU
RA
TIO
N
Oxy
datio
n S–
S
HYDROLYSE
TOTALE
Protéine
Acidesaminés
Ct
Nt
DéterminationNt et Ct
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Méthode de Sanger (au FDNB)
H2N COOH
HN COOHDNP
FDNB
HNDNP
HClLIBERATION DE TOUS LES AA
SEUL AA Nt EST MARQUE
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Méthode d’Edman
H2N COOH
PTCPITC
PITC
PITC
PITC
PITC
PITC
PITC
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Méthode d’Edman
H2N COOH
PITC
PITC
PITC
PITC
PITC
PITC
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Méthode d’Edman
H2N COOHH2N
PITC
PITC
PITC
PITC
PITC
PITC
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Méthode d’Edman
H2N COOHH2N
PITC
PITC
PITC
PITC
PITC
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Méthode d’Edman
H2N COOHH2N
PITC
PITC
PITC
PITC
PITC
H2N
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Méthode d’Edman
H2N COOHH2N
PITC
PITCPITC
PITC
H2N
H2N
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Méthode d’Edman
H2N COOHH2N
PITC
PITCPITC
PITC
H2N
DE
TE
CT
EU
R
MÉTHODE RÉCURRENTE
PERMET LE SÉQUENÇAGE
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Aminopeptidase
H2N COOH
AM
INO
PE
PT
IDA
SE
DE
TE
CT
EU
R
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Aminopeptidase
H2N COOH
AM
INO
PE
PT
IDA
SE
DE
TE
CT
EU
R
H2N
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Aminopeptidase
H2N COOH
AM
INO
PE
PT
IDA
SE
DE
TE
CT
EU
R
H2N H2N
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de N-terminal
Aminopeptidase
H2N COOH
AM
INO
PE
PT
IDA
SE
DE
TE
CT
EU
R
H2N H2N H2N
METHODE RECURENTE
LENTE AVEC CERTAINS AA
Exercice 6 : Séquence Mise en évidence de C-terminal
Carboxypeptidase
Dégradation de la protéine par le Ct
Exercice 6 : Analyse peptide
DE
NA
TU
RA
TIO
N
Oxy
datio
n S–
S
TRYPSINE
CHIMOTRYPSINE
Arg ou Lys
Phe, Tyr, Trp
SEQUENCAGE
SEQUENCAGE
HYDROLYSE
TOTALE
Protéine
Acidesaminés
Ct
Nt
DéterminationNt et Ct