testiranje hipotezeneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · primjer: usporedba proporcije one...

38
TESTIRANJE HIPOTEZE

Upload: others

Post on 23-Jan-2020

1 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

TESTIRANJE HIPOTEZE

Page 2: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s
Page 3: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

PRINCIPI TESTIRANJA HIPOTEZE

Svrha epidemioloških studija je istražiti postoji li POVEZANOST između varijable od interesa i pojedinog ishoda.

Kada dizajniramo kliničke pokuse želimo pokazati je li eksperimentalna terapija EFIKASNIJA OD STANDARDNE TERAPIJE ILI PLACEBA. (Eksperimentalna terapija mora biti efikasnija za neki MINIMALNI IZNOS,

ODREĐEN na temelju KLINIČKE PRAKSE.)

Page 4: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

PRINCIPI TESTIRANJA HIPOTEZE – Što testiramo?

Učinci ili razlike koje su nam interesantne Razlike u aritmetičkoj sredini ili proporcijama Omjer izgleda (OR) Relativni Rizik (RR) Korelacijski koeficijent – povezanost dvaju

varijabli

Medicina: uglavnom usporedba aritmetičkih sredina između 2 skupina

Page 5: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

PRINCIPI TESTIRANJA HIPOTEZE – Što testiramo?

KLINIČKI ZNAČAJNA RAZLIKA Najmanja razlika koja je biološki ili klinički

relevantna Npr razlika od 2 M glukoze ili 0.2 M glukoze?

Page 6: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Nulta hipoteza = ništična hipoteza

izjava o stvarnim populacijskim parametrima koji se istražuju;

µ1=µ2

Alternativna hipoteza-hipoteza različita od nulte

µ1≠µ2

Page 7: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Nulta hipoteza = ništična hipoteza

izjava o stvarnim populacijskim parametrima koji se istražuju;

µ1>=µ2

Alternativna hipoteza- hipoteza različita od nulte

µ1<µ2

Page 8: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

PRINCIPI TESTIRANJA HIPOTEZE

Rezultat testiranja hipoteze je broj koji nazivamo P vrijednost

P-vrijednost je VJEROJATNOST da ćemo dobiti toliko velike razlike ili još veće razlike između skupina SLUČAJNO

P=0.01=1%

P=0.78=78%

P=0.05=5%

Na temelju P-vrijednosti

možemo prihvatiti ili

odbaciti ništičnu

hipotezu

Page 9: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Testiranje hipoteze

P vrijednost

Manja od 0,05 (ili 0,01) P<0,05

P NS.

P=0,021

P<0,001

P=3,45*10-5

Page 10: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Odabir testa

Zavisne ili nezavisne skupine

Tipu varijable koju testiramo

Broju skupina koje testiramo

Page 11: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

TIP PODATKA

Kvalitativni

(kategorijski)

1 neovisna varijabla

2 ili više neovisnih varijabli

Kvantitativni

Povezanost

Razlika

2 skupine

Više skupina

Neparametrijske

Parametrijske

2 ili više ovisnih varijabli

Goodness of fit x 2

Hi kvadrat (x 2)

1 prediktor

Više prediktora

Kontinuirana

varijabla

Rangovi

Multipla regresija

Spearman r

Pearson r

Regresija

neovisne

ovisne

t test

Mann-Whitney

t test za povezane uzorke

Wilcoxon

neovisne

ovisne

One-way ANOVA

Kruskal-Wallis

ANOVA za ponavljane uzorke

Friedman

McNemar test

Testiranje

hipoteze

Page 12: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):

Mogućnosti

A. analiza varijance (ANOVA)

B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka

C. t-test za nepovezane uzorke

D. t-test za povezane uzorke

E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka

1. Djelovanje novoga lijeka za snižavanje krvnoga tlaka u ukriženom se pokusu uspoređuje s djelovanjem placeba

Page 13: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):

Mogućnosti

A. analiza varijance (ANOVA)

B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka

C. t-test za nepovezane uzorke

D. t-test za povezane uzorke

E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka

2. Postoji li veći rizik oboljenja od karcinoma dojke u žena koje rabe hormonsku kontracepciju u odnosu na one koje to ne čine?

Page 14: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

7. Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):

Mogućnosti A. analiza varijance (ANOVA) B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka C. t-test za nepovezane uzorke D. t-test za povezane uzorke E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka

3. Razlikuju li se proporcije pušača u Francuskoj,

Velikoj Britaniji i Njemačkoj?

Page 15: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

7. Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):

Mogućnosti

A. analiza varijance (ANOVA)

B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka

C. t-test za nepovezane uzorke

D. t-test za povezane uzorke

E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka

4. Je li prosječna vrijednost indeksa tjelesne mase (BMI) petnaestogodišnjaka u Škotskoj veća od istoga indeksa petnaestogodišnjaka u Engleskoj?

Page 16: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

7. Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):

Mogućnosti

A. analiza varijance (ANOVA)

B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka

C. t-test za nepovezane uzorke

D. t-test za povezane uzorke

E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka

Usporedba djelovanja triju različitih lijekova u bolesnika s hiperkolesterolemijom, pri čemu su skupine ispitanika razdijeljene u podskupine s prosječnom razinom kolesterola.

Page 17: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

Poredajte postupke testiranja hipoteze u pravilan redoslijed:

A. tumačenje P-vrijednosti

B. statistički izračun

C. postavljanje ništične i alternativne hipoteze

D. prikupljanje odgovarajućih podataka

E. očitavanje P-vrijednosti iz odgovarajuće krivulje raspodjele vjerojatnosti.

Page 18: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

Novi model liječenja karcinoma dojke pokazuje poboljšanje stope izlječenja. Proporcija žena koje prežive dvije godine nakon početka liječenja veća je uz primjenu novoga lijeka, u odnosu na lijek rabljen tijekom prethodnoga dvogodišnjega razdoblja: χ2 = 4,2, broj stupnjeva slobode (df) = 1, P < 0,05.

A. Vjerojatnost dobivanja takve razlike proporcija izlječenja

manja je od jednom u 20 slučajeva, uz uvjet da nema stvarne razlike u djelovanju lijekova.

B. Poboljšanje ishoda liječenja je statistički značajno. C. Bolji rezultat liječenja može biti posljedica utjecaja

zbunjujućeg čimbenika.

Page 19: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Povezanost varijabli

Kvantitativne – koeficijent korelacije

Kvalitativne - χ2 test, McNemar

- omjer izgleda, relativni rizik

Page 20: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

KVANTITATIVNE Točkasti graf – za usporedbu 2 varijable

Citat iz rada: Scatter plot, showing the strong association

between enzyme activity at pH 5.5 and the 5α-reductase 2-specific mRNA expression, as expressed on the basis of β-actin (n = 30; rs = 0.81; 95% confidence interval, 0.64–0.91; P < 0.0001).

Page 21: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Obrasci na točkastom grafikonu

Linearnost i Smjer su dva koncepta koja nas interesiraju

Pozitiva linearna ovisnost Negativna linarna ovisnoat

Slaba ili ne-linearna ovisnost Nema ovisnosti

Page 22: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

(n = 30; rs = 0.81; 95% confidence interval, 0.64–0.91; P < 0.0001)

Citat iz rada: Scatter plot, showing the strong association

between enzyme activity at pH 5.5 and the 5α-reductase 2-specific mRNA expression, as expressed on the basis of β-actin (n = 30; rs = 0.81; 95% confidence interval, 0.64–0.91; P < 0.0001).

Page 23: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Kvalitativne varijable – Tablice frekvencija

Za usporedbu 2 kategorijske varijable

Ako prva varijabla ima r kategorija, druga varijabla c kategorija, tada izrađujemo tablicu frekvencija r×c (cross table).

Page 24: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Povezanost kvalitativnih varijabli

Disease X

YES NO TOTAL

YP

EL5

G

en

oty

pe

AA 2 0 2

AB 1 3 4

BB 0 4 4

TOTAL 3 7 10 0

1

2

3

4

AA AB BB F

req

ue

ncy

Disease

Healthy

Page 25: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

χ2 = 4,2, broj stupnjeva slobode (df) = 1, P < 0,05.

Novi model liječenja karcinoma dojke pokazuje poboljšanje stope izlječenja. Proporcija žena koje prežive dvije godine nakon početka liječenja veća je uz primjenu novoga lijeka, u odnosu na lijek rabljen tijekom prethodnoga dvogodišnjega razdoblja: χ2 = 4,2, broj stupnjeva slobode (df) = 1, P < 0,05.

Page 26: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

Pokušajte odrediti ovisi li rezultat atletičara na 100 m o godini u kojoj je postigao rezultat?

Kako to objašnjavate?

Podatke možete naći na

http://www.mefst.hr/default.aspx?id=1772

Page 27: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Mjere povezanosti

ᵪ2 test odgovara na pitanje "Ima li povezanosti?"

Odgovor na pitanje “Koliko je jaka povezanost?” daju nam mjere za snagu povezanosti kao što je npr. razlika u proporcijama, omjer izgleda, relativni rizik

Page 28: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Primjer: Mišljenje o radu George W. Busha kao predsjednika (08/09 Gallupova anketa)

Mišljenje (n=1000) Stranka Odobrava Nedobrava

Demokrati 3% 97%

Republicanci 64% 36%

Rod Odobrava Nedobrava Žene 24% 76%

Muškarci 27% 73%

Razlika u proporcijama 0.64 – 0.03 = 0.61 ukazuje na puno jaču povezanost između političke stranke i mišljenja od povezanosti spola i mišljenja 0.27 – 0.24 = 0.03

Page 29: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Povezanost prihoda i sreće

Happiness Prihod Vrlo Uglavnom Ne baš Iznad 272 (44%) 294 (48%) 49 (8%) Prosjek 454 (32%) 835 (59%) 131 (9%) Ispod 185 (20%) 527 (57%) 208 (23%)

Page 30: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Usporedba s omjerima – Relativni rizik

Omjer proporcija također može biti koristan ("relativni rizik")

Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s vrlo sretnima čija su primanja ispod prosjeka, 0.44/0.20 = 2.2

Page 31: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Usporedba s omjerima – omjer izgleda

Alternativna mjera za usporedbu proporcija, koja se obično koristi u modelima logističke regresije za kategoričke varijable, je omjer izgleda.

Page 32: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Izgled

Za dva ishoda (“uspjeh”, “neuspjeh”) u skupini,

Izgled /ODDS = P(uspjeh)/P(neuspjeha) = P(uspjeh)/[1 - P(neuspjeh)]

npr., ako je P(uspjeh) = 0.80, P(neuspjeh) = 0.20,

Izgled = 0.80/0.20 = 4.0

ako P(uspjeh) = 0.20, P(neuspjeh) = 0.80,

Izgled = 0.20/0.80 = ¼ = 0.25

Vjerojatnost uspjeha na temelju OR

Vjerojatnost = Izgled/(Izgled + 1)

Npr. Izgled = 4.0 odgovara vjerojatnosti = 4/(4+1) = 4/5 = 0.80

Page 33: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Omjer izgleda omjer izgleda = (izgled u 1. redu)/(izgled u 2. redu) Example: Upitnik za srednjoškolce Alkohol Pušenje DA NE DA 1449 46 NE 500 281 2 = 451.4, df = 1 (P-value = 0.000001) Izgled za pijenje alkohola u skupini koja puši =1449/46 = 31.50

Izgled za pijenje alkohola u skupini ne puši 500/281 = 1.78 Omjer izgleda 31.5/1.78 = 17.7

Relativni rizik (1449/1495)/(500/781)=1.5

Page 34: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

Koje od navedenih vrijednosti su mjera jakosti povezanosti?

a. omjer izgleda

b. standardna devijacija

c. raspon pouzdanosti

d. koeficijent korelacije

e. P-vrijednost ᵪ2 testa

Page 35: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

U studiji parova ispitivana je povezanost između pojave zloćudne novotvorine mokraćnoga mjehura i pušenja:

• 145 ispitanika sa zloćudnom novotvorinom mokraćnoga mjehura: 87 pušača i 58 nepušača

• 178 ispitanika u kontrolnoj skupini (nemaju zloćudnu novotvorinu mokraćnog mjehura): 62 pušača i 116 nepušača

Izračunajte omjer izgleda za povezanost pušenja i pojave zloćudne novotvorine mokraćnoga mjehura.

Page 36: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Zadatak

Protumačite slijedeći graf

Page 37: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Citat iz rada: Squamous cell carcinoma tumor and perilesional display distinctly different scatter plots from normal tissue. Expresion levels for gene subset 1 in patient 1

KVANTITATIVNE Točkasti graf – za usporedbu 2 varijable – Primjer 2

Page 38: TESTIRANJE HIPOTEZEneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s

Confidence interval