testiranje hipotezeneuron.mefst.hr/docs/katedre/znanstvena... · primjer: usporedba proporcije one...
TRANSCRIPT
TESTIRANJE HIPOTEZE
PRINCIPI TESTIRANJA HIPOTEZE
Svrha epidemioloških studija je istražiti postoji li POVEZANOST između varijable od interesa i pojedinog ishoda.
Kada dizajniramo kliničke pokuse želimo pokazati je li eksperimentalna terapija EFIKASNIJA OD STANDARDNE TERAPIJE ILI PLACEBA. (Eksperimentalna terapija mora biti efikasnija za neki MINIMALNI IZNOS,
ODREĐEN na temelju KLINIČKE PRAKSE.)
PRINCIPI TESTIRANJA HIPOTEZE – Što testiramo?
Učinci ili razlike koje su nam interesantne Razlike u aritmetičkoj sredini ili proporcijama Omjer izgleda (OR) Relativni Rizik (RR) Korelacijski koeficijent – povezanost dvaju
varijabli
Medicina: uglavnom usporedba aritmetičkih sredina između 2 skupina
PRINCIPI TESTIRANJA HIPOTEZE – Što testiramo?
KLINIČKI ZNAČAJNA RAZLIKA Najmanja razlika koja je biološki ili klinički
relevantna Npr razlika od 2 M glukoze ili 0.2 M glukoze?
Nulta hipoteza = ništična hipoteza
izjava o stvarnim populacijskim parametrima koji se istražuju;
µ1=µ2
Alternativna hipoteza-hipoteza različita od nulte
µ1≠µ2
Nulta hipoteza = ništična hipoteza
izjava o stvarnim populacijskim parametrima koji se istražuju;
µ1>=µ2
Alternativna hipoteza- hipoteza različita od nulte
µ1<µ2
PRINCIPI TESTIRANJA HIPOTEZE
Rezultat testiranja hipoteze je broj koji nazivamo P vrijednost
P-vrijednost je VJEROJATNOST da ćemo dobiti toliko velike razlike ili još veće razlike između skupina SLUČAJNO
P=0.01=1%
P=0.78=78%
P=0.05=5%
Na temelju P-vrijednosti
možemo prihvatiti ili
odbaciti ništičnu
hipotezu
Testiranje hipoteze
P vrijednost
Manja od 0,05 (ili 0,01) P<0,05
P NS.
P=0,021
P<0,001
P=3,45*10-5
Odabir testa
Zavisne ili nezavisne skupine
Tipu varijable koju testiramo
Broju skupina koje testiramo
TIP PODATKA
Kvalitativni
(kategorijski)
1 neovisna varijabla
2 ili više neovisnih varijabli
Kvantitativni
Povezanost
Razlika
2 skupine
Više skupina
Neparametrijske
Parametrijske
2 ili više ovisnih varijabli
Goodness of fit x 2
Hi kvadrat (x 2)
1 prediktor
Više prediktora
Kontinuirana
varijabla
Rangovi
Multipla regresija
Spearman r
Pearson r
Regresija
neovisne
ovisne
t test
Mann-Whitney
t test za povezane uzorke
Wilcoxon
neovisne
ovisne
One-way ANOVA
Kruskal-Wallis
ANOVA za ponavljane uzorke
Friedman
McNemar test
Testiranje
hipoteze
Zadatak
Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):
Mogućnosti
A. analiza varijance (ANOVA)
B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka
C. t-test za nepovezane uzorke
D. t-test za povezane uzorke
E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka
1. Djelovanje novoga lijeka za snižavanje krvnoga tlaka u ukriženom se pokusu uspoređuje s djelovanjem placeba
Zadatak
Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):
Mogućnosti
A. analiza varijance (ANOVA)
B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka
C. t-test za nepovezane uzorke
D. t-test za povezane uzorke
E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka
2. Postoji li veći rizik oboljenja od karcinoma dojke u žena koje rabe hormonsku kontracepciju u odnosu na one koje to ne čine?
Zadatak
7. Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):
Mogućnosti A. analiza varijance (ANOVA) B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka C. t-test za nepovezane uzorke D. t-test za povezane uzorke E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka
3. Razlikuju li se proporcije pušača u Francuskoj,
Velikoj Britaniji i Njemačkoj?
Zadatak
7. Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):
Mogućnosti
A. analiza varijance (ANOVA)
B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka
C. t-test za nepovezane uzorke
D. t-test za povezane uzorke
E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka
4. Je li prosječna vrijednost indeksa tjelesne mase (BMI) petnaestogodišnjaka u Škotskoj veća od istoga indeksa petnaestogodišnjaka u Engleskoj?
Zadatak
7. Opisima istraživanja (1-5) pridružite odgovarajući statistički test (A-E):
Mogućnosti
A. analiza varijance (ANOVA)
B. χ2-test za 3×2 tablicu podataka
C. t-test za nepovezane uzorke
D. t-test za povezane uzorke
E. χ2-test za 2×2 tablicu podataka
Usporedba djelovanja triju različitih lijekova u bolesnika s hiperkolesterolemijom, pri čemu su skupine ispitanika razdijeljene u podskupine s prosječnom razinom kolesterola.
Zadatak
Poredajte postupke testiranja hipoteze u pravilan redoslijed:
A. tumačenje P-vrijednosti
B. statistički izračun
C. postavljanje ništične i alternativne hipoteze
D. prikupljanje odgovarajućih podataka
E. očitavanje P-vrijednosti iz odgovarajuće krivulje raspodjele vjerojatnosti.
Zadatak
Novi model liječenja karcinoma dojke pokazuje poboljšanje stope izlječenja. Proporcija žena koje prežive dvije godine nakon početka liječenja veća je uz primjenu novoga lijeka, u odnosu na lijek rabljen tijekom prethodnoga dvogodišnjega razdoblja: χ2 = 4,2, broj stupnjeva slobode (df) = 1, P < 0,05.
A. Vjerojatnost dobivanja takve razlike proporcija izlječenja
manja je od jednom u 20 slučajeva, uz uvjet da nema stvarne razlike u djelovanju lijekova.
B. Poboljšanje ishoda liječenja je statistički značajno. C. Bolji rezultat liječenja može biti posljedica utjecaja
zbunjujućeg čimbenika.
Povezanost varijabli
Kvantitativne – koeficijent korelacije
Kvalitativne - χ2 test, McNemar
- omjer izgleda, relativni rizik
KVANTITATIVNE Točkasti graf – za usporedbu 2 varijable
Citat iz rada: Scatter plot, showing the strong association
between enzyme activity at pH 5.5 and the 5α-reductase 2-specific mRNA expression, as expressed on the basis of β-actin (n = 30; rs = 0.81; 95% confidence interval, 0.64–0.91; P < 0.0001).
Obrasci na točkastom grafikonu
Linearnost i Smjer su dva koncepta koja nas interesiraju
Pozitiva linearna ovisnost Negativna linarna ovisnoat
Slaba ili ne-linearna ovisnost Nema ovisnosti
(n = 30; rs = 0.81; 95% confidence interval, 0.64–0.91; P < 0.0001)
Citat iz rada: Scatter plot, showing the strong association
between enzyme activity at pH 5.5 and the 5α-reductase 2-specific mRNA expression, as expressed on the basis of β-actin (n = 30; rs = 0.81; 95% confidence interval, 0.64–0.91; P < 0.0001).
Kvalitativne varijable – Tablice frekvencija
Za usporedbu 2 kategorijske varijable
Ako prva varijabla ima r kategorija, druga varijabla c kategorija, tada izrađujemo tablicu frekvencija r×c (cross table).
Povezanost kvalitativnih varijabli
Disease X
YES NO TOTAL
YP
EL5
G
en
oty
pe
AA 2 0 2
AB 1 3 4
BB 0 4 4
TOTAL 3 7 10 0
1
2
3
4
AA AB BB F
req
ue
ncy
Disease
Healthy
χ2 = 4,2, broj stupnjeva slobode (df) = 1, P < 0,05.
Novi model liječenja karcinoma dojke pokazuje poboljšanje stope izlječenja. Proporcija žena koje prežive dvije godine nakon početka liječenja veća je uz primjenu novoga lijeka, u odnosu na lijek rabljen tijekom prethodnoga dvogodišnjega razdoblja: χ2 = 4,2, broj stupnjeva slobode (df) = 1, P < 0,05.
Zadatak
Pokušajte odrediti ovisi li rezultat atletičara na 100 m o godini u kojoj je postigao rezultat?
Kako to objašnjavate?
Podatke možete naći na
http://www.mefst.hr/default.aspx?id=1772
Mjere povezanosti
ᵪ2 test odgovara na pitanje "Ima li povezanosti?"
Odgovor na pitanje “Koliko je jaka povezanost?” daju nam mjere za snagu povezanosti kao što je npr. razlika u proporcijama, omjer izgleda, relativni rizik
Primjer: Mišljenje o radu George W. Busha kao predsjednika (08/09 Gallupova anketa)
Mišljenje (n=1000) Stranka Odobrava Nedobrava
Demokrati 3% 97%
Republicanci 64% 36%
Rod Odobrava Nedobrava Žene 24% 76%
Muškarci 27% 73%
Razlika u proporcijama 0.64 – 0.03 = 0.61 ukazuje na puno jaču povezanost između političke stranke i mišljenja od povezanosti spola i mišljenja 0.27 – 0.24 = 0.03
Povezanost prihoda i sreće
Happiness Prihod Vrlo Uglavnom Ne baš Iznad 272 (44%) 294 (48%) 49 (8%) Prosjek 454 (32%) 835 (59%) 131 (9%) Ispod 185 (20%) 527 (57%) 208 (23%)
Usporedba s omjerima – Relativni rizik
Omjer proporcija također može biti koristan ("relativni rizik")
Primjer: Usporedba proporcije one koji se izjašnjavaju kao vrlo sretni i s primanjima iznad prosječnog dohotka s vrlo sretnima čija su primanja ispod prosjeka, 0.44/0.20 = 2.2
Usporedba s omjerima – omjer izgleda
Alternativna mjera za usporedbu proporcija, koja se obično koristi u modelima logističke regresije za kategoričke varijable, je omjer izgleda.
Izgled
Za dva ishoda (“uspjeh”, “neuspjeh”) u skupini,
Izgled /ODDS = P(uspjeh)/P(neuspjeha) = P(uspjeh)/[1 - P(neuspjeh)]
npr., ako je P(uspjeh) = 0.80, P(neuspjeh) = 0.20,
Izgled = 0.80/0.20 = 4.0
ako P(uspjeh) = 0.20, P(neuspjeh) = 0.80,
Izgled = 0.20/0.80 = ¼ = 0.25
Vjerojatnost uspjeha na temelju OR
Vjerojatnost = Izgled/(Izgled + 1)
Npr. Izgled = 4.0 odgovara vjerojatnosti = 4/(4+1) = 4/5 = 0.80
Omjer izgleda omjer izgleda = (izgled u 1. redu)/(izgled u 2. redu) Example: Upitnik za srednjoškolce Alkohol Pušenje DA NE DA 1449 46 NE 500 281 2 = 451.4, df = 1 (P-value = 0.000001) Izgled za pijenje alkohola u skupini koja puši =1449/46 = 31.50
Izgled za pijenje alkohola u skupini ne puši 500/281 = 1.78 Omjer izgleda 31.5/1.78 = 17.7
Relativni rizik (1449/1495)/(500/781)=1.5
Zadatak
Koje od navedenih vrijednosti su mjera jakosti povezanosti?
a. omjer izgleda
b. standardna devijacija
c. raspon pouzdanosti
d. koeficijent korelacije
e. P-vrijednost ᵪ2 testa
Zadatak
U studiji parova ispitivana je povezanost između pojave zloćudne novotvorine mokraćnoga mjehura i pušenja:
• 145 ispitanika sa zloćudnom novotvorinom mokraćnoga mjehura: 87 pušača i 58 nepušača
• 178 ispitanika u kontrolnoj skupini (nemaju zloćudnu novotvorinu mokraćnog mjehura): 62 pušača i 116 nepušača
Izračunajte omjer izgleda za povezanost pušenja i pojave zloćudne novotvorine mokraćnoga mjehura.
Zadatak
Protumačite slijedeći graf
Citat iz rada: Squamous cell carcinoma tumor and perilesional display distinctly different scatter plots from normal tissue. Expresion levels for gene subset 1 in patient 1
KVANTITATIVNE Točkasti graf – za usporedbu 2 varijable – Primjer 2
Confidence interval