tibbİ bİyolojİ 4. hafta...3 c’lugliserol molekülüde öncepgal, daha sonra pga ve nihayet 3...

25
TIBBİ BİYOLOJİ YAĞLARIN VE PROTEİNLERİN OKSİDASYONU

Upload: others

Post on 17-Sep-2020

3 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

TIBBİ BİYOLOJİ

YAĞLARIN VE PROTEİNLERİN OKSİDASYONU

Page 2: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Yağların OksidasyonuBesinlerle alınan yağlar ince bağırsakta safra

asidi tuzları ile önce emülsiyonlaşarak küçükdamlacıklar haline getirilir. Sonra pankreastangelen lipaz enzimi ile sindirime uğrayarakhidroliz olur, gliserol ve yağ asitlerineparçalanırlar. Daha sonra bağırsaktan emilerekbir kısmı lenf sistemine ulaşır ve bu sistemaracılığı ile kana karışırlar. 12 karbondan küçükzincirli yağ asitleri ve bunların trigliseritleri isevena porta yolu ile karaciğere, oradan da büyükdolaşıma taşınırlar.

Page 3: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Emilen yağlar kana ulaşınca plazmada beyaz bir bulanıklıkgörülür. Böylece her iki yolla kana geçen yağların birkısmı karaciğere, bir kısmı ise diğer dokulara geçer, birkısmı da yağ hücrelerine geçerek orada depo edilir.Gereğinde depo edilenler de enerji elde etmede kullanılır.

Yağ asitleri ve gliserol’e parçalanan yağlar, enerjielde etmede kullanılacaksa Krebs siklusundan geçmelerigerekir. Bunun için yağ asitleri önce CoA ile birleşerekaktifleşirler ve Asetil-CoA’yı oluştururlar. Daha sonraAsetil-CoA, CoA’nın ayrılmasıyla 2 C’lu asetik asit halinegeçer ve Krebs siklusuna girerek okside olur veorganizmaya enerji sağlar.

Page 4: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

3 C’lu gliserol molekülü de önce PGAL,daha sonra PGA ve nihayet 3 C’lu Pirüvikasite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO2

kaybeder, geriye kalan 2 C’lu madde CoAile birleşerek 2 C’lu Asetil-CoA’yıoluşturur. CoA’dan ayrılan madde 2 C’luasetik asit halinde Krebs siklusuna girerve okside olarak enerji meydana getirir.

Page 5: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Yağların oksidasyonunda bir molekülPalmitik asit’in parçalanmasından 131 ATPelde edilir.

Yağ asitleri ve aminoasitler farklı sayıdaC atomu taşıdıkları için farklı sayıda ATP,H2O ve CO2 meydana getirirler. Örneğin: Yağasitleri az oksijen (O2), çok hidrojen (H)atomu taşır. Bunun için solunum sonucunda azCO2, çok H2O oluştururlar. Bu nedenle yağlarkurak ortamda yaşayan hayvanlarda iyi bir sudeposu kaynağıdır

Page 6: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Proteinlerin oksidasyonuProteinler yapılarında C, H, O, N, S ve P bulunan

maddeler olup, en küçük molekülleri aminoasitlerdir.Amino asitlerin yapısında bir amino (NH2) ve bir karboksil(COOH) grubu vardır. Karboksil grubunun birleşmedeğeri asidik ve amino grubunun birleşme değeri baziktir.En basit protein molekülü iki amino asitten birinin aminogrubunun diğerinin karboksil grubuyla birleşmesi vebunun sonucunda su çıkmasıyla oluşur. Bu sırada oluşanbağa peptid bağı denir.

Page 7: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Amino asitlerin farklılığı esas yapılar olankarboksil ve amino gruplarına ek gruplardanmeydana gelmektedir. Bu yan gruplar alifatik,alifatik alkol, kükürt, imino asit, amid, bazikasidik ve aromatik yapıdadır. Molekülağırlıkları 5000 ile birkaç milyona arasındadeğişir.

Amino asitleri bu şekilde gruplandırırsak:

Page 8: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

• Alifatik amino asitler: Gly, Ala, Val, Leu,İleu

• Hidroksilli amino asitler: Ser, Thr• Asidik amino asitler: Asp, Glu• Amidler: Asn, Gln• Bazik amino asitler: His, Lys, Arg• Kükürt amino asitler: Cys, CysSH, Met• Aromatik amino asitler: Phe, Try, Trp• İmino asitler: Pro

(Gly: Glisin, Ala: Alanin, Val: Valin, Leu: Lösin, İleu: İzolösin,Ser: Serin, Thr: Treonin, Asp: Aspartik asit; Glu: Glutamikasit, Asn: Asparagin; Gln: Glutamin; His: Histidin, Lys, Lizin;Arg: Arginin, Cys: Sistein, Met: Metionin, Phe: Fenil alanin,Try: Tirozin, Trp: Triptofan, Pro: Prolin)

Page 9: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Canlılık özelliklerinin sürmesi için kesinliklegerekli olan bileşiklerdir. Protein sentezigenlerin kontrolü altında olduğundan hercanlının proteinleri değişiktir. Proteinlersindirim olayı sonunda kana geçmeden öncehidrolize olarak kendilerini oluşturan aminoaside dönerler. Proteinlerin büyük kısmınınbiyolojik aktivitelerini belli pH ve sıcaklıkaralığında koruyabilmesine rağmen, proteineriyikleri 60-80ºC’a ısıtılırsa proteinler çöker.Buna denatürasyon denir ve proteinin biyolojikaktivitesi tamamen bozulur. Denatürasyon bazıhallerde geri dönebilir ve protein aktivitesinitekrar kazanabilir. Buna ise renatürasyon denir

Page 10: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Proteinlerin biyolojik fonksiyonları:

• Hücre zarı ve endomembranlarda yapı maddesiolarak önemlidirler.

• Kaslarda ve konektif dokularda yapısal görevivardır.

• O2’in hemoglobinle, elektronların sitokromlararacılığıyla taşınmasında ve hücre membranlarındabazı maddelerin taşınmasında rol alırlar.

Page 11: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

• Serum albumininin etkili olduğu elektrolitdengesini düzenlerler.

• Anabolik ve katabolik reaksiyonların enzim vehormonlar tarafından katalizlenmesinde işgörürler.

• Plazma hücreleri tarafından oluşturulanimmunglobulinler (antikor) antijenlere karşıorganizmayı koruma grevi sağlar.

• Nükleoproteinler aracılığıyla oluşturulan canlınınbüyümesi ve üremesi, aynı zamanda kalıtsalözelliklerin nesilden nesile aktarılması göreviniüstlenirler.

• Organizmanın kas kontraksiyonu (kasılması), yanihareket yeteneğini sağlama görevini yaparlar.

Page 12: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

1 molekül protein okside edilince elde edilenenerji karbonhidratlarınkinden fazla, yağlarınoksidasyonundan ise azdır. Çünkü bir gram yağdan 9.1,proteinden 4.8, karbonhidrattan 3.8 kilokalori/g enerjielde edilir.

Hücrede en son proteinler yakıt maddesi olarakkullanılır. Çünkü proteinler hücrede yapı maddesi veenzim olarak görev alırlar. Proteinler okside olmadanönce proteinaz enzimi ile aminoasitlere parçalanırlar.Daha sonra aminaz enziminin etkisi ile amin grupları (-NH2) çıkarılır ve meydana gelen madde sitrik asitsiklusuna girer.

Page 13: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Asetil CoA’nın rolü:

Asetil CoA, çeşitli temel maddelerin oksidasyonundaönemli bir ara maddedir. Karbonhidrat, yağ ve bazıproteinler sitrik asit siklusuna girmeden önce CoA ilebirleşip Asetil-CoA’yı oluşturur (C2-CoA), sonra sitrikasit siklusuna girerler.

Page 14: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

2. Anaerobik Solunum (Oksijensiz Solunum) (Fermantatif Solunum)

Besin maddelerinin oksijen kullanmadanyapılan oksidasyonuna Anaerobik (oksijensiz)solunum veya fermentatif solunum adı verilir.Anaerobik solunum oksijensiz ortamdacereyan ettiğinden oksijen son elektron alıcısıolarak iş görmez. Burada elektron taşıyıcısistemin reaksiyonları, ara alıcıların tümüindirgenmiş duruma düşünce ve mümkün olanelektronların hepsi alındığı zaman sona erer.

Page 15: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Fermentasyon daha ziyade ilkelorganizmalarda; maya mantarları(Oksijensiz solunumu benimsemiş olanmaya hücrelerinde piruvat etil alkoledönüşür (Alkol fermentasyonu)) vebakterilerde görülür (Gelişmişhayvanlarda iskelet kas hücrelerindeveya laktik asit bakterilerinde oksijensizkoşullarda pirüvik asit laktik asidedönüşür (Laktat fermentasyonu)).

Page 16: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Bunun sonunda elde edilen enerji çok az olupancak 2 ATP’dir. İlkel atmosferde serbest oksijenolmadığından o zamanki organizmalar dafermentatif solunum yapmışlar ve basityapılarından dolayı solunum sonucu elde edilen2ATP’lik enerji yaşamlarını sürdürmeye yetmiştir.

Page 17: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Anaerobik (oksijensiz) solunum ve aerobik(oksijenli) solunumu karşılaştıracak olursak;bunların glikoliz evresi yani Pirüvik aside kadar olanevresi her ikisinde de aynen cereyan eder ve sonuçolarak Aerobik (oksijenli) solunumda net 36-38ATP; Anaerobik (oksijensiz) solunumda ise net 2ATP elde edilir.

Page 18: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Görüldüğü gibi eğer ortamda oksijenbulunmazsa son hidrojen alıcısı oksijen olmayıpbaşka bir maddedir. Bu nedenlefermantasyonda son ürün:

- hayvan hücresinde 3 C’lu laktik asit (C3H6O3),

- bitki hücresinde ise fermantasyon tipine görealkol ve sirke asididir.

Bu tip solunumda Pirüvik asit ile son ürünarasında ATP meydana gelmemektedir. 2ATP’lik enerji yukarıda da belirtildiği gibiGlikoliz evresinde meydana gelir.

Page 19: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Mayalanma anlamına da gelen fermentasyonsanayide ve günlük yaşantımızda oldukça önemlidir.Mayalanma sayesinde alkol, sirke, turşu, yoğurt,peynir, kefir, kımız gibi çeşitli sanayi ve besinürünleri oluşturulur. Alkol mayalanmasında mayamantarlarının enzimleri önemli bir rol oynar.

Page 20: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Bitki ve hayvan hücrelerindeki fermentasyon çeşitleri:

1) Laktik asit fermantasyonu:

Hayvansal hücrelerde oluşur. Dokularda, özellikle de kasdokusunda yeterli oksijen bulunmazsa NADH+H+ pirüvik aside2H vererek laktik asit oluşur. Bu madde kaslarda birikirse kasyorgunluğu görülür. Burada reaksiyon sonucu çıkan enerjisadece 18 kaloridir. Eğer daha sonra doku yeterince O2sağlarsa laktik asit aldığı H’leri vererek tekrar pirüvik asidedöner ve pirüvik asit de sitrik asit siklusuna girer, CO2 +H2O’ya kadar parçalanır.

Page 21: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

2) Alkol fermentasyonu

Pirüvik asitte Co-karboksilaz enzimiyle CO2 koparılarakasetaldehit meydana gelir. Asetaldehit böylece NADH +H+ ‘den 4H alarak redüklenir ve alkol oluşur. Bu sırada 2NAD+ serbest kalır. Alkol ve CO2 maya hücresifermentasyonunun son ürünleridir. Elde edilen enerji 56kilokalori/mol kadardır.

Page 22: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

3) Sirke asidi (asetik asit) fermentasyonu

Pirüvik asitten Co-karboksilaz enzimi ile CO2 ayrılırve asetaldehit oluşur, bu da su bağlayarak asetaldehithidrat meydana getirir. Asetaldehit hidrat ensonunda dehidrogenaz enzimi ile okside olup 2Hkaybederek 2C’lu asetik asit oluşur.

Page 23: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Oksijenli ve oksijensiz solunumun ortak özellikleri

• ATP kullanılır.

• Organik moleküllerin kimyasal bağlarındakienerji ATP molekülüne aktarılır.

• CO2 oluşur (Laktik asit fermentasyonu hariç)

Page 24: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Oksijenli ve oksijensiz solunumun farklarıOksijenli Solunum Oksijensiz Solunum

O2 kullanılır. O2 kullanılmaz.

Glikoz inorganik maddelere kadar

parçalanır

Glikoz organik maddelere kadar parçalanır

36-38 ATP elde edilir. Net 2 ATP elde edilir.

Sitoplazmada başlar ve mitokondride devam eder.

Sitoplazmada gerçekleşir.

Page 25: TIbbİ Bİyolojİ 4. Hafta...3 C’lugliserol molekülüde öncePGAL, daha sonra PGA ve nihayet 3 C’luPirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit 1 CO 2 kaybeder, geriye kalan 2 C’lumadde

Solunum ile Fotosentezin Karşılaştırılması

SOLUNUM FOTOSENTEZ

Kullanılan madde

Glikoz, yağ, protein, O2 CO2, H2O

Son ürün CO2, H2O, Enerji Glikoz, H2O, O2

Kimyasal değişim

Organik moleküllerin parçalanması

Organik moleküllerin yapımı

Ne zaman oluşur

Aralıksız Gün ışığı devamınca

Nerede olur Tüm canlı hücrelerde Klorofil taşıyan hücrelerde

Genel formülü C6H12O6 + 6O2 →

6CO2 + 6H2O + 38 ATP

(Enzim aracılığıyla)

6CO2 +12H2O →C6H12O6 +6H2O + 6O2

(Güneş enerjisi – klorofil aracılığıyla)