TRADUCCIÓN

- ARN de transferencia

- Aminoacil tRNA sintetasa

- Ribosomas

-El proceso de traducción

elementos necesarios

en eucariotas

en procariotas

tRNA

aa tRNAsintetasatRNA

cargado ribosomamRNA

tRNAsAdaptan física e informacionalmenteal mRNA con la proteína codificada

Prokaryotic tRNA genes

Eukaryotic tRNA genes

7 pb

5 pb

5 pb

3-4 pb

Elementos de identidad en los tRNAs

Estructura terciaria de un tRNA

AA+ATP+AARS AARSAA-AMP+PPi

AARSAA-AMP+tRNA AARS+AA-tRNA

+AMP

enlace covalente del aminoácido al extremo 3´CCA del tRNA

Activación y anclaje covalente del aminoácido al tRNA

Yeast AspRS·tRNAasp·ATP Complejo del tipo II

E. coli GlnRS·tRNAgln · ATP Complejo del tipo I

Eucariótico Procariótico Valor S 40S 30S Masa molecular 1,400 kDa 900 kDa rRNAs 18S, 1900 nts 16S, 1540 nts Proteínas > 33 21 Valor S 60S 50S Masa molecular 2,800 kDa 1,600 kDa rRNAs 28S, 4700 nts

5.8S, 160 nts 5S, 120 nts

23S, 2900 nts 5S, 120 nts

Proteínas > 49 34

Estructura y función del ribosoma

sitios funcionales en el ribosoma

5’

3’

Estructura de la subunidad grande

1. rRNA 16S

2. rRNA 5S

3. proteínas (LSU)

4. centro peptidil-transferasa y mecanismo catalítico

rRNAs 23S y 5S en la estructura terciaria del ribosoma

estructura terciaria del rRNA 5s

Bases conservadas en la estructura terciaria de la subunidad grande

bases muy conservadas (rojo)-ligado de substrato y factores-actvidad catalítica-estabilización de estructura tridimensional (gran número de adeninas)

extensiones variables(verde)

Estructura de proteínas ribosomales

13/30 proteínas presentan extensiones largas:-estabilizan el plegamiento terciario- rellenan los huecos- funcionan como un pegamento molecular-23/29 interaccionan con más de un dominio

rRNA 23s- 1157/2923 nucleótidos hacen contactos de van der Waals con proteínas

Localización de proteínas en la subunidad grande del ribosoma

Estructura cristalográfica del ribosoma de Haloarcula marismortui a 2.4Å

Túnel de salida de la proteína y extensiones cercanas de proteínas ribosomales

Túnel de salida de la proteína en la subunidad grande del ribosoma

Comparación de las estructuras secundarias predichas para los rRNAs 16S de (a) Halobacterium volcanii, (b) levadura y (c) mitocondria bovina

Traducción

Fibroína 0.1 m

Resumen del tema de la traducción

Bioquímica de la traducción

Procariotes: 20aa/s = 20s por 400 AA/proteína

Eucariotes: 2 aa/s

1. Activación del aminoácido (ATP, aminoacil-tRNA sintetasa)

2. Pegado covalente del AA al 3´OH del CCA terminal del tRNA

3. Unión del tRNA al mRNA por apareaminento codón-anticodón

4. Formación del enlace peptídico en el ribosoma

5. Terminación del polipéptido

INICIO DE LA TRADUCCIÓN

INICIO DE LA TRADUCCIÓN

C A P DEPENDIENTE

ELONGACIÓN DE LA TRADUCCIÓN

Mecanismo de formación del enlace peptídico

Formación del enlace peptídico

TERMINACIÓN DE LA TRADUCCIÓN

Mecanismo de terminación del polipéptido

Mecanismo de inicio de la traducción en E. coli

Estructura del factor de iniciación de la traducción EF-Tu unido a GDP y a GDPNP

Orientación de las moléculas de tRNA unidas a los sitios E-, A- y P-

anticodones

Algunos antibióticosque funcionan comoinhibidores de latraducción en bacterias

Rescate de ribosomas bacterianos por Rescate de ribosomas bacterianos por tmRNAstmRNAs

Modificación de los rRNA y funcionalidad del ribosoma