<title>XML u znanstvenom izdavaštvu</title><subtitle>korištenje JATS standarda za oblikovanje znanstvenih

članaka u Hrčku</subtitle>

<contrib contrib-type="author">

<name>

<surname>Jertec</surname>

<given-names>Ljiljana</given-names>

</name>

<email>hrcak@srce.hr</email>

<role>Član Hrčak tima</role>

</contrib>

20.9.2017., PubMet2017, FER

• Časopisi: 448

• Radovi: više od 175.000

• OpenAIRE2020 FP7 post-grant Open Access Pilot projekt

• Mogućnost pohrane XML verzije rada

• Podrška za korištenje identifikatora autora ORCID

• Podrška za prikupljanje informacija o financijerima i projektima s kojima je rad povezan

• Podrška za dostavu informacija o radovima DOAJ-u

• Podrška za citiranje istraživačkih podataka u okviru metapodataka o radu korištenjem JATS formata

• Unaprjeđenje naprednog pretraživanja Hrčka i implementacija facetnog pretraživanja

<title>XML format</title>

• eXtensible Markup Language

• Jezik za označavanje, opisivanje i razmjenu podataka

• Čitljiv i ljudima i računalnim programima

• Proširiv, otvoren format

• Sastoji se od oznaka (tag) i sadržaja tih oznaka

• Oznaka se sastoji od elemenata i atributa:

• <element> počinje i završava istom oznakom </element>

• @atribut dodatno upotpunjava značenje elementa: <element type=”testni”>

• Prazan <element/> se može označiti kosom crtom

• Svaki otvoren element mora se zatvoriti!

<title>XML format</title><subtitle>primjer</subtitle>

• Imena oznaka nisu unaprijed definirana te mogu biti proizvoljna – osim ako ne postoji deklaracija na početku XML-a

Journal Article Tag Set

• Skup elemenata i atributa koji se koristi za opis znanstvene literature u XML formatu

• Stabilan format za pohranjivanje i dugotrajno arhiviranje digitalnih članaka

• Razvio se iz National Library of Medicine (NLM DTD) standarda za opis znanstvenih open access časopisa (PubMed Central)

• 3 vrste JATS-a:

• Journal Article Authoring (orange)

• Journal Publishing (blue)

• Journal Archiving and Interchange (green)

• Baze podataka (PubMed, ScieLo, MDPI, e-ScienceCentral)

Semantičko značenje

Hijerarhija dijelova članka

Struktura

članka

<XML/>

Članak = malena, tekstualna baza podataka

Izvor: http://www.iconarchive.com/

Content mining, kvalitetnije pretraživanje, lakše korištenje sadržaja, korištenje LaTeX-a za unos formula, korištenje podataka iz tablica, rudarenje referenci, multimedijski sadržaj u člancima, brži unos u Hrčak

Primjer časopisa: ZooKeys

Objava članaka u XML formatu na Hrčku

• Objava na Hrčku:1. Uredništvo priprema članke cijelog broja u XML formatu prema JATS standardu

2. Uredništvo objavi cijeli broj u XML-u na Hrčak

3. Na javnom sučelju Hrčka vidljiv je prikaz članka u HTML-u te omogućeno preuzimanje u XML i PDF formatu.

Upute:

• https://wiki.srce.hr

• https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/

Objava članaka u XML formatu u Hrčku –rezultati*

• 11 časopisa: • Acta stomatologica Croatica, Biochemia medica, Cardiologia Croatica, Croatian

journal of food science and technology, Croatian medical journal, Food Technology and Biotechnology, Geofizika, Medicus, Mljekarstvo, Šumarski list, Tusculum

• Ukupno brojeva: 41

• Ukupno XML-ova: 471

• Preuzimanje XML-a i prikaz referenci:

*Rezultati na dan 18.9.2017.

Izrada članaka u XML formatu - alati

Alat Vrsta alata Cijena

eXtyles Word add-in 10,000 $ per seat;2,000 $ per sear per year

Xeditor Online alat Up to 5 names users 3,000€;Up to 5 concurrent users 9,000€Annual update 20% of licence fee

Oxygen XML Editor + JATSKIT framework

Samostalan alat Licence: 99$ - 2064$

Article Authoring Add-in Word add-in besplatan

Stilo Migrate Cloud Konverzija u oblaku Pay-as-you-use (3$/str)

Najave…

Stilo AuthorBridge Online alat 100$ per annum (inc meintenance)

Texture Online alat besplatan

Izrada članaka u XML formatu

• Outsourcing• Rogor Editing, Zagreb. Kontakt: stjepan.marusic@gmail.com

• Allianze BPO International (http://www.allianzebpo.com/pubmed-conversion-services.php)

• Hi-Tech – Data Conversion Services (http://www.hitechbpo.com/data-conversion-services.php)

• Cenveo Publisher Services (http://www.cenveopublisherservices.com/conversion-services/)

• Eureka Science (http://eureka-science.com/xml.php)

• Ivona Žufić, ivonazufic@hotmail.com

Struktura članka u XML formatu prema JATS standardu

<article>

<front>

<journal-meta>

<article-meta>

<body>

<sec>, <label>, <p>, <graphic>…

<back>

<app-group> <ack>

<ref-list>

Srce politikom otvorenog pristupa široj javnosti

osigurava dostupnost i korištenje svih rezultata rada

Srca, a prvenstveno obrazovnih i stručnih informacija

i sadržaja nastalih djelovanjem i radom Srca.

Ovo djelo je dano na korištenje pod licencom

Creative Commons Imenovanje-Nekomercijalno

4.0 međunarodna.

www.srce.unizg.hr creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/deed.hr www.srce.unizg.hr/otvoreni-pristup

Pitanja?

hrcak@srce.hr

Izvor: https://blog.safe.com/2016/07/understanding-xml-humans-guide-machine-readable-data/