1. molekularna osnova procesa apoptoze...1 1. molekularna osnova procesa apoptoze 1.1. apoptoza...

19
1 1. Molekularna osnova procesa apoptoze 1.1. Apoptoza Ćelijska smrt, zajedno sa rastom i diferencijacijom, predstavlja suštinski deo životnog ciklusa ćelije. Dnevno u organizmu čoveka umire do 5% od ukupnog broja ćelija. Svaka osoba, u toku jedne godine, produkuje i razgradi ćelijsku masu koja je jednaka težini tela. Homeostatska kontrola broja ćelija ostvaruje se putem dinamičke ravnoteže između dva suprotna procesa - ćelijske deobe i ćelijske smrti (slika 1). B R O J Ć E L I J A Slika 1. Homeostatska kontrola broja ćelija. Tkivna homeostaza je posledica ravnoteže između proliferacije čelija i regulisanog ćelijskog umiranja po tipu apoptoze. Ulogu ćelijske smrti u razvoju organizma prvi put su opisali pedesetih godina prošlog veka Glucksmann i Saunders. Prvi dokaz za postojanje dva morfološki različita tipa ćelijske smrti dao je australijski patolog Džon F. R. Ker (r.1934) 1965. godine ( slika 2). Ker i saradnici su histohemijskim metodama ispitivali promene na lizozomima hepatocita pacova u uslovima ishemije. Tokom tih ispitivanja uočili su postojanje ćelija koje verovatno umiru, ali se po morfološkim odlikama razlikuju od ćelija koje se nalaze u procesu nekroze. Slika 2. Džon F. R. Ker. Australijski patolog koji je sredinom šezdesetih godina prošlog veka prvi opisao ćelije koje umiru procesom apoptoze.

Upload: others

Post on 02-Feb-2021

3 views

Category:

Documents


1 download

TRANSCRIPT

  • 1

    1. Molekularna osnova procesa apoptoze

    1.1. Apoptoza

    Ćelijska smrt, zajedno sa rastom i diferencijacijom, predstavlja suštinski deo

    životnog ciklusa ćelije. Dnevno u organizmu čoveka umire do 5% od ukupnog broja

    ćelija. Svaka osoba, u toku jedne godine, produkuje i razgradi ćelijsku masu koja je

    jednaka težini tela. Homeostatska kontrola broja ćelija ostvaruje se putem dinamičke

    ravnoteže između dva suprotna procesa - ćelijske deobe i ćelijske smrti (slika 1).

    B R O J Ć E L I J A

    Slika 1. Homeostatska kontrola broja ćelija. Tkivna homeostaza je posledica ravnoteže između proliferacije čelija i regulisanog ćelijskog umiranja po tipu apoptoze.

    Ulogu ćelijske smrti u razvoju organizma prvi put su opisali pedesetih godina

    prošlog veka Glucksmann i Saunders. Prvi dokaz za postojanje dva morfološki različita

    tipa ćelijske smrti dao je australijski patolog Džon F. R. Ker (r.1934) 1965. godine (slika

    2). Ker i saradnici su histohemijskim metodama ispitivali promene na lizozomima

    hepatocita pacova u uslovima ishemije. Tokom tih ispitivanja uočili su postojanje ćelija

    koje verovatno umiru, ali se po morfološkim odlikama razlikuju od ćelija koje se nalaze u

    procesu nekroze.

    Slika 2. Džon F. R. Ker. Australijski patolog koji je sredinom šezdesetih godina prošlog veka prvi opisao ćelije koje umiru procesom apoptoze.

  • 2

    Ker je novootkrivenu formu ćelijske smrti nazvao apoptoza. Reč apoptoza potiče

    iz grčkog jezika (apo + pto) i znači opadanje (lišća sa drveta). Ovim nazivom Ker je želeo

    da naglasi da se radi o fiziološkom, odnosno „prirodnom“ načinu umiranja ćelija.

    Danas se ćelijska smrt deli na akcedentalnu i regulisanu ćelijsku smrt.

    Akcedentalna ćelijska smrt je posledica dejstva ekstremnih fizičkih (visoka

    temperatura, pritisak, ...), hemijskih (jaki deterdženti, velike promene pH) i mehaničkih

    stimulusa. U tim okolnostima ćelija umire bez “uključenja” specifične molekularne

    mašinerije. Regulisana ćelijska smrt je vrsta ćelijskog odgovora na prisustvo

    odgovarajućih signala koji dovode do aktiviranja specifičnih molekularnih mašinerija.

    Programirana ćelijska smrt je vrsta regulisane ćelijske smrti.

    Prema morfološkim karakteristikama razlikuju se tri tipa ćelijske smrti. Ćelijska smrt

    tipa I – apoptoza (ćelijsko samoubistvo), ćelijska smrt tipa II – autofagija i ćelijska smrt

    tipa III – nekroza (ćelijsko ubistvo).

    Apoptoza je aktivan proces genski regulisanog ćelijskog samouništenja i u

    većini slučajeva služi homeostatskoj funkciji. To je jedan od najizučavanijih bioloških

    fenomena ćelija eukariota. Poslednjih deset godina preko 10.000 naučnih radova

    godišnje za temu istraživanja ima proces apoptoze.

    Programirana ćelijska smrt po tipu apoptoze opisana je u normalnim fiziološkim

    uslovima (tokom procesa embriogeneze, diferencijacije i u procesima razvoja i regulacije

    imunskog sistema), kao i u nizu patoloških stanja organizma.

    Biološka uloga apoptoze u normalnim fiziološkim uslovima organizma ogleda se u:

    1. programiranom smanjenju broja ćelija tokom embriogeneze i metamorfoze - kod

    čoveka najpoznatiji primer ćelijskog umiranja po tipu apoptoze je onaj tokom

    embrionalnog formiranja prstiju ruku;

    2. eliminaciji suvišnih ćelija u održavanju konstantnog broja ćelija - održavanje tkivne

    homeostaze;

    3. hormon zavisnoj redukciji broja ćelija kod adulta - ćelije endometrijuma tokom

    menstrualnog ciklusa;

    4. deleciji ćelija u ćelijskim populacijama koje karakteriše visok nivo proliferacije -

    epitelne ćelije intestinalnih kripti gastrointestinalnog trakta;

    5. u imunskom odgovoru tokom regulisane eliminacije specifičnih ćelijskih populacija,

    kao i samih autoreaktivnih ćelija imunskog sistema;

    6. uklanjanju transformisanih ili na drugi način oštećenih ćelija.

    Rezultati eksperimentalnih istraživanja brojnih laboratorija pokazuju da postoji

    čitav niz faktora koji mogu stimulatorno ili inhibitorno uticati na proces apoptoze.

    Jonizujuće zračenje, virusna infekcija, toplotni stres i bilo koja druga promena spoljne

    sredine koju ćelija prepoznaje kao stres jesu znak da ćelija aktivira program svog

  • 3

    suicida. Svi prirodni i veštački agensi koji dovode do oštećenja DNK mogu se, takođe,

    smatrati induktorima procesa apoptoze (slobodni radikali, npr.). Naravno, postoji i veliki

    broj fizioloških aktivatora procesa apoptoze, kao što su faktori rasta, neurotransmiteri,

    hormoni, itd. Limfociti T koji su CD8+ imaju sposobnost indukcije procesa apoptoze

    drugih ćelija.

    Postoji čitav niz bolesti čoveka tokom kojih dolazi do inhibicije procesa apoptoze.

    To su, pre svega, maligne bolesti. Inhibicija procesa apoptoze karakteriše i brojna auto-

    imunska oboljenja. Istovremeno postoje mnoge bolesti kod kojih dolazi do stimulacije

    procesa apoptoze. U prvom redu to su neurološka oboljenja, kao što su Parkinsonova

    bolest, Alchajmerova bolest i ALS (amilotrofična lateralna skleroza). Progresivno

    umiranje CD4+ limfocita T procesom apoptoze karakteristika je infekcije izazvane

    virusom humane imunodeficijencije (HIV).

    Na osnovu ovih saznanja, apoptoza je kao genski regulisan proces postala tema

    brojnih molekularno-bioloških studija koje za cilj imaju istraživanja patofizioloških

    mehanizama nastanka i lečenja bolesti čoveka.

    1.1.2. Morfološke karakteristike procesa apoptoze

    Apoptoza je asinhrona pojava koja zahvata pojedinačne ćelije tkiva. To je veoma brz

    proces koji ćeliju iz jedne ćelijske populacije može „ukloniti“ za manje od 4 sata. U toku

    procesa apoptoze dolazi do karakterističnih morfoloških promena koje se ispoljavaju bez

    obzira na vrstu tkiva ili okolnosti pod kojim je izazvana. Upravo je ovaj ustaljeni obrazac

    morfoloških promena bio presudan za pretpostavku da su u osnovi procesa apoptoze

    pre aktivni nego pasivni ćelijski procesi.

    Morfološke promene u toku ovog procesa mogu se podeliti na promene rane i

    kasne faze procesa apoptoze. Prvi morfološki znak apoptoze predstavlja kondenzacija

    hromatina, najčešće u marginalnim oblastima nukleusa. Uporedo sa izmenama

    hromatina, u ovoj ranoj „kondenzacijskoj” fazi apoptoze, dolazi i do kondenzacije

    citoplazme (slika 3). Kondenzacija nukleusa i citoplazme dovodi do smanjenja

    zapremine ćelije, uz povećanje gustine citoplazme, sabijanja intaktnih organela i

    razgradnje citoskeleta.

    Kasnu fazu apoptoze obeležava segmentacija nukleusa i fragmentacija

    citoplazme. Na ćelijskog membrani dolazi do pojave većeg broja citoplazmatskih izvrata.

    Ovaj proces Ker je nazvao „pupljenje“ ćelijske membrane (slika 4).

  • 4

    Slika 3. Elektronsko-mikroskopski snimak limfocita B periferne krvi čoveka. Strelicom obeležena ćelija smanjene zapremine i kondezovanog hromatina koja se nalazi u procesu apoptoze (TEM, 20.000x).

    Slika 4. Shematski prikaz morfoloških promena tokom procesa apoptoze. Objašnjenje dato u tekstu.

    Završnu fazu procesa apoptoze karakteriše pojava fragmenata apoptotske ćelije

    koji su okruženi ćelijskom membranom i nazivaju se apoptotska tela. Apoptotska tela

    podležu procesu fagocitoze u kom učestvuju makrofagi, dendritske i druge ćelije

    parenhima ili okolne ćelije. To je krajnja faza apoptoze - faza fagocitoze i unutarćelijske

    razgradnje (slika 4). Proces fagocitoze apoptotskih tela karakteriše i odsustvo

  • 5

    zapaljenske reakcije. Apoptotska tela, koja se formiraju u eksperimentalnim uslovima in

    vitro, ne bivaju fagocitovana. Ona spontano propadaju, u toku nekoliko sati, procesom

    koji se naziva sekundarna nekroza.

    Određene morfološke karakteristike procesa nekroze (značajna razgradnja

    citoskeleta i „pupljenje“ ćelijske membrane) veoma su slične karakteristikama kasne faze

    procesa apoptoze. Identifikacija biohemijskih mehanizama koji prate morfološke

    promene apoptoze, pomaže u boljem razlikovanju ove dve vrste ćelijske smrti.

    1.1.3. Biohemijske karakteristike procesa apoptoze

    Najizučavaniji biohemijski aspekt procesa apoptoze predstavljaju promene na

    molekulu DNK. Tokom rane faze procesa apoptoze dolazi do inicijalne fragmentacije

    molekula DNK u okviru hromatinskih petlji na fragmente veličine od 50 – 300 kb.

    Morfološki uočljivu kondenzaciju hromatina prati fragmentacija molekula DNK na

    fragmente od približno 180 bp. Endonukleaza koja je odgovorna za internukleozomalnu

    fragmentaciju molekula DNK nije još prečišćena i potpuno opisana. Na agaroznom gelu,

    genomska DNK izolovana iz apoptoske ćelije daje karakteristična izgled nalik

    merdivinama.

    Tokom procesa apoptoze uočena je pojava promene orijentacije molekula

    fosfatidilserina (PS) sa unutrašnje na spoljašnju stranu ćelijske membrane. Ova

    promena lokacije PS definiše se kao signal „pojedi me“ („eat me“) preko kojeg fagociti i

    druge ćelije prepoznaju apoptotsku ćeliju. Detekcija PS na spoljašnjoj strani ćelijske

    membrane predstavlja i jednu od metoda detekcije apoptotskih ćelija.

    Rezultati eksperimentalnih studija rađenih na nematodi C. elegans dali su dokaze o

    ulozi enzima proteaza u procesu apoptoze. Ovo je podstaklo brojne naučnike da svoja

    istraživanja usmere u pravcu uloge enzima proteaza i u procesu programirane ćelijske

    smrti složenijih organizama, uključujući i čoveka. U skorije vreme učinjen je veliki

    napredak u razumevanju molekularnih mehanizama izvršne faze apoptoze u kojoj je

    dokazano učešće enzima proteaza, naročito zasebne familije cistein proteaza, kaspaza.

    1.1.4. Apoptoza versus Nekroza

    Postoje mišljenja da su apoptoza i nekroza „dva lica“ iste vrste ćelijske smrti.

    Međutim, i ako obe vrste ćelijske smrti mogu indukovati isti stimulusi, rezultati brojnih

    eksperimentalnih istraživanja idu u prilog činjenici da su apoptoza i nekroza dva različita

    fenomena. Različiti odgovor ćelija na dejstvo istog stimulusa objašnjava se dužinom i

    jačinom stimulusa.

    Za razliku od apoptoze, nekroza se definiše kao pasivan proces koji nastaje pod

    dejstvom nefizioloških uslova spoljašnje sredine. Ovaj proces je energetski nezavisan,

  • 6

    dok odvijanje apoptoze zahteva energiju (ATP). Glavna morfološka razlika ova dva

    procesa je u tome što kod nekroze dolazi do bubrenja ćelijske membrane i lize ćelije uz

    oslobađanje lizozomskih enzima koji indukuju zapaljensku reakciju. Za razliku od

    apoptoze, fragmentacija DNK kod nekroze je „nasumična”, pa se na agaroznom gelu

    uočavaju fragmenti različite veličine u vidu razmaza. Zbir osnovnih razlika između

    apoptoze i nekroze dat je u tabeli 1.

    Tabela 1. Apoptoza versus Nekroza

    1.2. Molekularna osnova procesa apoptoze

    1.2.1. Induktori procesa apoptoze

    „Odluka“ ćelije da uđe u proces apoptoze može biti posledica vanćelijskih signala

    smrti. To su najčešće specifični ligandi za tzv. receptore smrti (eng. death receptors,

    DRs). Receptori smrti pripadaju familiji TNFRs (eng. tumour necrosis factor receptors,

    TNFRs).

    Vezivanjem odgovarajućih vanćelijskih molekula za receptore smrti, procesom

    prenosa signala, moguće je aktiviranje procesa apoptoze. Najpoznatije ligande, koji

    vezivanjem za svoje receptore indukuju proces apoptoze, predstavljaju TNF- (ligand za

    TNFR 1 receptor) i Fas ligand (za receptor Fas poznat i pod nazivima CD95 i APO-1).

    Fas ligand (FasL) je trimer, protein težak 40kDa, koji vezivanjem za receptor Fas

    indukuje proces apoptoze. Receptor Fas je transmembranski receptor tipa I težak

    45kDa. Prisutan je na ćelijskim membranama različitih tipova ćelija, uključujući i limfocite

    T i NK ćelije čoveka. Receptori smrti, kao što je receptor Fas, poseduju citoplazmatske

    domene veličine od približno 80 aminokiselinskih ostataka koji se zbog svog značaja u

    prenosu signala nazivaju domeni smrti (eng. death domains, DDs) (slika 5).

    Vrsta ćelijske smrti Apoptoza Nekroza

    Pojava Asinhrona Masivna

    Energetski zavisan proces Da Ne

    Fragmentacija molekula DNK Uniformna Nasumična

    Oštećenja na organelama Ne / Da Da

    Apoptotska tela Da Ne

    Liza ćelije Ne Da

    Zapaljenska reakcija Ne Da

    Ožiljak u tkivu Ne Da

  • 7

    Slika 5. Uloga kompleksa DISC u indukciji procesa apoptoze. Vezivanjem liganda (vanćelijskog signala smrti) za receptor Fas dolazi do konformacione promene koja omogućava interakciju domena smrti receptora sa domenima smrti proteina FADD. Protein FADD interaguje sa kaspazom 8 putem domena DED i na taj način formira se kompleks DISC.

    Aktivacija receptora indukuje interakciju receptornih domena smrti sa homolognim

    domenima smrti unutarćelijskih proteina koji se nazivaju proteinski adapteri. Tako,

    domeni smrti receptora Fas interaguju sa homolognim domenima proteinskog adaptera

    koji se naziva protein FADD (eng. Fas-associated death domain, FADD). Proteini

    adapteri sadrže i efektorne domene smrti (eng. death effector domains, DEDs).

    Domeni DED interaguju sa sebi homolognim efektornim domenima smrti enzima

    kaspaze 8.

    Kaspaza 8 je prvi enzim koji se tokom prenosa vanćelijskog signala smrti aktivira u

    ćeliji i indukuje kaskadnu reakciju aktivacije drugih apoptotskih enzima, kaspaza. Zbog

    svoje biološke uloge kaspaza 8 dobila je naziv inicijator kaspaza. Kompleks proteina –

    receptor Fas, protein FADD i prokaspaza 8, koji indukuje proces apoptoze, naziva se

    kompleks DISC (eng. Death Inducing Signaling Complex, DISC) (slika 5).

  • 8

    Osim vanćelijskim, proces apoptoze može biti indukovan i unutarćelijskim

    signalima smrti. Unutarćelijski signali smrti najčešće se aktiviraju kao odgovor ćelije

    na različite oblike stresa. Lekovi i druga toksična jedinjenja, toplotni stres, zračenje,

    hipoksija i virusna infekcija najčešći su uzročnici aktivacije unutarćelijskih signala smrti.

    Mehanizmi kojima različite vrste stresova aktiviraju biohemijsku mašineriju apoptoze

    nisu potpuno poznati. Smatra se da intenzitet i dužina trajanja stresa predstavljaju

    ključne faktore u „odluci“ ćelije da aktivira program svog samouništenja.

    1.2.1. Efektori procesa apoptoze

    Bez obzira na vrstu stimulusa (vanćelijski ili unutarćelijski) koji ga indukuje,

    ključni događaj tokom procesa apoptoze predstavlja kaskadna reakcija proteolitičke

    aktivacije članova familije enzima cistein proteaza – kaspaza. Kaskadna reakcija

    aktivacije kaspaza glavna je karakteristika tzv. egzekutorne ili izvršne faze procesa

    apoptoze. Kaspaze su aspartat-specifične cistein proteaze. U ćelijama čoveka otkrivena

    je familija enzima kaspaza od 14 članova. Prema svojoj biološkoj ulozi u ćeliji one se deli

    u dve potfamilije: potfamilija inflamatornih kaspaza (kaspaze 13, 5, 4, 1) i potfamilija

    apoptotskih kaspaza (kaspaze 7, 3, 6, 8, 10, 2, 9).

    Sve kaspaze sintetišu se u formi proenzima (zimogena) koji se sastoji od tri

    domena: a) prodomena različite dužine na N-kraju proteina; b) velike subjedinice od 20

    kDa (p20); i c) male subjedinice od 10 kDa (p10) na C–kraju proteina.

    Aktiviraju se proteolitičkim mehanizmom koji razdvaja (na mestu aspartata)

    najpre veću (p20) od manje (p10) subjedinice, a potom u formiranom dimeru p20/p10

    dolazi do razdvajanja velike subjedinice (p20) od prodomena. Poslednja faza aktivacije

    kaspaza predstavlja povezivanje dva heterodimera u aktivni tetramer, koji sa dva aktivna

    mesta svoju proteolitičku aktivnost ispoljava na većem broju proteina (slika 6).

    Slika 6. Shematski prikaz aktivacije kaspaza. Kaspaze se aktiviraju proteolitičkim raskidanjem velike (p20) od male subjedinice (p10). U formiranom dimeru p20/p10 dolazi do razdvajanja prodomena od velike subjedinice.

    Kaspaze svojom enzimskom aktivnošću vrše inaktivaciju inhibitora apoptoze i

    razgradnju struktura nukleusnog matriksa, nukleusne lamine i citoskeleta. Istovremeno,

  • 9

    proteoliza predstavlja jedan od mogućih mehanizama aktivacije endonukleaza tokom

    procesa apoptoze. Dezintegracija hromatina, promene na citoskletu i „pupljenje” ćelijske

    membrane su morfološki uočljive manifestacije biohemijskih dešavanja nastalih

    dejstvom aktiviranih kaspaza.

    Aktivacija kaspaza predstavlja sigurni znak da je ćelija krenula putem suicida, i

    taj se suicid, odnosno njegova izvršna faza, nikakvim mehanizmima ne može sprečiti.

    U ćelijama sisara dokazano je i prisustvo prirodnih inhibitora kaspaza koji se

    nazivaju proteini inhibitori apoptoze (eng. inhibitors of apoptosis proteins, IAPs). Do

    sada, otkriveno je sedam članova ove familije proteina. U okolnostima kada ne postoji

    apoptotski stimulus, inhibitori kaspaza uspešno onemogućavaju njihovu proteolitičku

    aktivaciju i konverziju iz forme proenzima u enzim.

    Poslednjih godina pokazano je da unutarćelijski signali mogu indukovati proces

    apoptoze koji je nezavisan od aktiviranja enzima kaspaza. U nekim ćelijama, proces

    apoptoze indukuje se aktivacijom endonukleaze G i faktora AIF (eng. apoptosis-inducing

    factor, AIF). Ova dva proteina primarno su lokalizovana u mitohondrijama. Nakon

    dejstva unutarćelijskog signala, oni se iz mitohondrija transportuju u nukleus.

    Endonukleaza G vrši fragmentaciju molekula DNK.

    1.3. Regulacija procesa apoptoze

    Brojni vanćelijski i unutarćelijski signali (induktori apoptoze) mogu indukovati

    proces apoptoze, u čijoj izvršnoj fazi dolazi do aktivacije kaspaza (efektori apoptoze).

    Rezultati eksperimentalnih istraživanja na raznim model sistemima su pokazali da je

    proces apoptoze regulisan značajnim brojem unutarćelijskih regulatora (modulatori

    apoptoze).

    Proteini familije Bcl 2, protein p53, proteinski produkti određenih onkogena i gena

    regulatora ćelijskog ciklusa, zatim citohrom C, razni transkripcioni regulatori, određene

    klase fosfataza i kinaza predstavljaju samo neke od poznatih modulatora ovog procesa.

    1.3.1. Uloga proteina familije Bcl 2 u regulaciji procesa apoptoze

    Proteini familije Bcl 2 ključni su unutarćelijski modulatori (regulatori) procesa

    apoptoze. Prvootkriveni član familije Bcl 2 bio je protein Bcl 2 (eng. B-cell

    leukemia/lymphoma 2, Bcl 2). Gen je lokalizovan na dugom kraku hromozoma 18

    (q21.3). Otkriven je 1984. godine tokom ispitivanja akutne B leukemijske ćelijske linije sa

    detektovanom hromozomskom translokacijom t(14;18). Istraživanja na uzorcima

    periferne krvi bolesnika sa kliničkom dijagnozom folikularnog limfoma pokazala su da se

    t(14;18) aktivira proto-onkogen Bcl 2. Ovom translokacijom, gen BCL 2 „prebacuje” se u

  • 10

    blizinu lokusa teškog lanca imunoglobulina, što dovodi do visokog nivoa njegove

    ekspresije.

    Bcl 2 je unutarćelijski protein težine 26 kDa, lokalizovan u membranama

    mitohondrija, endoplazmatičnog retikuluma i u spoljašnjoj membrani nukleusnog ovoja.

    Nakon proteina Bcl 2, otkrivena je čitava familija homolognih proteina od kojih neki imaju

    stimulatorni, a drugi inhibitorni efekat na proces apoptoze. Kao ko-imunoprecipitat

    proteina Bcl 2, prvo otkriveni pro-apoptotski homolog bio je protein Bax (eng. Bcl 2 -

    associated X, Bax). To je unutarćelijski protein težine 21 kDa pretežno lociran u

    citoplazmi. U ćelijama čoveka otkriveno je preko 20 članova familije proteina Bcl 2.

    Svi članovi familije proteina Bcl 2 sadrže najmanje jedan od četiri visoko

    konzervirana Bcl 2 homologa domena (domeni BH). Šest anti-apoptotskih članova

    familije Bcl 2 (Bcl 2, Bcl–Xl, Bcl-W, MCL1, A1 i Bcl-B) sadrže sva četiri homologna

    domena (BH1-BH4). Na osnovu broja homolognih domena koje sadrže, pro-apoptotski

    proteini su podeljeni u dve potfamilije (slika 7).

    Slika 7. Proteini familije Bcl 2. Anti-apoptotski članovi familije Bcl 2 imaju sva četiri domena BH. Po broju domena BH, pro-apoptotski članovi ove familije dele se u dve potfamilije. Potfamilju protein Bid čine proteini koji sadrže samo domen BH3.

    Proteini potfamilije od tri člana (Bax, Bak i Box) sadrže tri homologna domena i

    nazivaju se potfamilija proteina Bax. Ostali pro-apoptotski proteini (potfamilija

    proteina Bid) sadrže samo jedan domen BH. To je domen BH3 po kome su i dobili

    naziv “BH3 – only proteins”. Većina članova familije proteina Bcl 2 sadrži i domene koji

    omogućavaju njihovo vezivanje za različite membrane ćelija (domeni TM). Bcl 2

    homologni domeni odgovorni su za procese homodimerizacije i heterodimerizacije

    proteina članova familije Bcl 2. Zahvaljujući ovim domenima BH, heterodimere formiraju i

    proteini sa suprotnim dejstvom na proces apoptoze.

  • 11

    Tokom indukcije procesa apoptoze, pod dejstvom apoptotskog stimulusa

    aktivirani proteini Bax formiraju dimere. Homodimeri proteina Bax formiraju kanale na

    spoljašnjoj membrani mitohondrija. Istu sposobnost ima i još jedan pro-apoptotski

    protein familije Bcl 2. To je protein Bak (eng. BCL‑2 antagonist/killer, Bak)(slika 8).

    Slika 8. Uloga mitohondrija u procesu apoptoze. Pro-apoptotski članovi familije Bcl 2 (protein Bax i Bak) formiraju kanale na spoljašnjim membranama kroz koje citohrom C napušta mitohondrije. Protein Bcl 2 može formirati heterodimere sa proteinima Bax ili Bak i na taj način blokira formiranje njihovih homodimera, odnosno kanala, na spoljašnjim membranama mitohondrija.

    Putem ovih kanala molekuli citohroma C, koji je jedan od ključnih aktivatora

    izvršne faze procesa apoptoze, napuštaju mitohondrije. U slučajevima kada je

    predominantno prisustvo proteina Bcl 2 u ćeliji, vezivanjem za protein Bax, ovi molekuli

    inhibiraju formiranje mitohondrijalnih membranskih kanala i oslobađanje citohroma C. Na

    osnovu ovih saznanja većina autora kao glavnu biološku ulogu proteina Bcl 2 u inhibiciji

    procesa apoptoze smatra njegovu sposobnost vezivanja za protein Bax i

    heterodimerizacionu neutralizaciju njegovog pro-apoptotskog dejstva.

    Zbog izuzetnog značaja, odnos pro-apoptotskih i anti-apoptotskih homodimera i

    heterodimera smatra se vrstom autonomnog „ćelijskog reostata“ koji opredeljuje vrstu

  • 12

    ćelijskog odgovora na dejstvo apoptotskog stimulusa. Međutim, postoje i suprotna

    mišljenja. Na osnovu rezultata eksperimentalnog rada na transgenim miševima,

    Knudson i Korsmeyer zaključuju da proteini Bcl 2 i Bax mogu i na funkcionalno

    nezavisan način da regulišu proces apoptoze.

    Pojedini autori smatraju da ključnu ulogu u regulaciji procesa apoptoze ćelija

    sisara ima protein Bcl-X. Alternativnom obradom primarnog transkripta gena BCL-X

    moguće je dobiti 2 različita molekula iRNK, odnosno dva proteina Bcl-X: duži (Bcl-Xl) i

    kraći (Bcl-Xs). Protein Bcl-Xl je strukturno i funkcionalno sličan proteinu Bcl 2. Drugi

    protein Bcl-Xs u heterodimernoj kombinaciji sa proteinom Bcl 2 funkcioniše kao njegov

    dominantni inhibitor.

    Oslobađanje citohroma C je posledica aktivacije modulatora apoptoze dejstvom

    unutarćelijskih signala smrti. Citohrom C je zbog svog pozitivnog dejstva na aktivaciju

    kaspaze 3 dobio naziv Apaf 2 (eng. apoptotic protease activating factor 2, Apaf 2). U

    prisustvu adapterskog molekula - proteina Apaf 1, citohroma C i adenozin-trifosfata

    (ATP) dolazi do proteolitičke aktivacije prokaspaze 9 (Apaf 3). Protein-protein

    interakciju Apaf 1 i Apaf 3 omogućuju njihove homologne sekvence nazvane CARD

    (eng. caspase recruitment domains, CARDs) (slika 9). U odsustvu citohroma C ova

    interakcija je blokirana zahvaljujući strukturnoj konformaciji molekula Apaf 1.

    Slika 9. Apoptozom. Citohorom C vezivanjem za protein Apaf 1 vrši njegovu konformacionu protenu. Ova promena omogućava protein-protein interakciju ovog adapterskog molekula sa enzimom prokaspazom 9. Na ovaj način formira se apoptozom u kome dolazi do proteolitičke aktivacije enzima kaspaze 9.

  • 13

    Vezivanjem citohroma C za molekul Apaf 1 dolazi do njegove konformacione

    promene koja domene CARD čini dostupne za interakciju sa homolognim domenima

    prokaspaze 9. Proteinski kompleks koga čine proteini Apaf 1, Apaf 2 i citohrom C naziva

    se apoptozom. Rezultat ove interakcije je proteolitička aktivacija prokaspaze 9.

    Aktivirana kaspaza 9 u kaskadi apoptotskih događaja aktivira kaspazu 3, što predstavlja

    početak ireverzibilne, izvršne faze procesa apoptoze. Kontrolisano oslobađanje

    citohroma C iz mitohondrija u citosol je neophodan uslov za otpočinjanje izvršne faze

    procesa apoptoze. Upravo zbog toga mitohondrije se nazivaju ćelijskim regulatorom

    života i smrti.

    Proteini potfamilije proteina Bid koji sadrže samo domen BH3 na dva načina

    ostvaruju svoj pro-apoptotski efekat. Proteini Bad (eng. BCL‑2 antagonist of cell death,

    Bad) i NOXA inaktiviraju anti-apoptotske članove svoje familije procesom

    heterodimerizacije. Drugi članovi ove potfamilije (Bid, Bim i PUMA) direktno aktiviraju

    pro-apoptotske proteine Bax i Bak koji imaju sposobnost formiranja kanala na

    spoljašnjim membranama mitohondrija (slika 10).

    Slika 10. Uloga pro-apoptotskih članova familije proteina Bcl 2 u procesu apoptoze. Proteini Bax i Bak formiraju kanale na membranama mitohondrija. Proteini Bid, Bim i PUMA direktno aktiviraju proteine Bax i Bak dok proteini Bad, Bcl-Xs i NOXA inaktiviraju anti-apoptoske članove familije (Bcl 2, Bcl-Xl i MCL-1).

  • 14

    1.3.2. Uloga proteina p53 u regulaciji procesa apoptoze

    Protein p53 otkriven je 1979. godine. Inicijalno je okarakterisan kao ko-

    imunoprecipitat velikog T antigena u SV 40-transformisanim ćelijama. Čitavih deset

    godina verovalo se da je gen TP53 onkogen. Godine 1989. Bert Vogelstein i saradnici,

    na osnovu istraživanja mutacija gena TP53, zaključuju da je protein p53 tumor-

    supresorni protein. Od tada započinju intenzivna izučavanja ovog gena i njegovog

    proteinskog produkta. Na osnovu broja naučnih studija, časopis Science 1993. godine

    protein p53 proglašava za „Molekul godine” („Molecule of the Year“). Gen TP53

    lokalizovan je na 20 kb dugoj sekvenci čovečijeg hromozoma 17 (17p13.1) kod čoveka.

    Gen TP53 sastoji se od 11 egzona koji se prepisuju u iRNK dugu 1,8 kb. Prepisuje

    se sa tri promotora. Pored uzvodnog promotora, poseduje promotore i u intronu 1 i

    intronu 4. Proteinski produkt ovog gena od 375 aminokiselina ima molekulsku masu od

    oko 53 kDa. U okviru proteinske sekvence razlikuje se nekoliko bitnih domena (slika

    11):

    na amino kraju (1-44 ak) nalazi se transaktivacioni domen odgovoran za

    aktivaciju transkripcije ciljnih gena;

    prolin-bogat domen (58-101ak) sa funkcijom u odgovoru proteina p53 na

    oštećenja DNK procesom apoptoze;

    DNK-vezujući domen (102-292ak) odgovoran za interakciju ovog proteina sa

    molekulom DNK (ovaj domen najčešće je pogođen mutacijama); i

    oligodimerizacioni domen (325-356 ak) odgovoran za vezivanje sa drugim

    molekulima p53.

    Slika 11. Shematski prikaz peptidnog lanca p53. Objašnjenje dato u tekstu.

    Poluživot ovog proteina je kratak i iznosi od 5 do 20 minuta, a svoju biološku

    ulogu ispoljava kao regulatorni protein transkripcije (slika 12). Metodom hromatin

    imunoprecipitacije do sada je identifikovano preko 540 sekvenci u genomu čoveka koje

    sadrže potencijalna vezujuća mesta za protein p53.

  • 15

    Slika 12. Protein p53 je regulatorni protein transkripcije. Protein p53 je transkripcioni represor gena čiji su proteinski produkti odgovorni za normalnu propagaciju ćelije kroz faze ćelijskog ciklusa. Istovremeno, on je i transkripcioni aktivator gena čiji su proteinski produkti uključeni kako u procese zaustavljanja ćelijskog ciklusa u fazi G1, tako i u indukciju procesa apoptoze.

    U ćelijama se razgradnja proteina p53 ostvaruje posredstvom ubikvitin ligaze E3

    koja je nazvana protein Mdm2 (eng. murine double minute 2, Mdm2). U uslovima

    dejstva stresa na ćeliju dolazi do raskidanja heterodimera proteina p53 i Mdm2 i

    blokiranja procesa razgradnje. Posttranslaciona modifikacija proteina p53 fosforilacijom

    je odgovorna za stabilizaciju molekula i produžetak njegovog poluživota na nekoliko sati.

    Kao posledica nagomilavanja proteina p53, u zavisnosti od jačine stresa, dolazi do

    zaustavljanja ćelijskog ciklusa ili indukcije procesa apoptoze.

    Zaustavljanje ćelijskog ciklusa u fazi G1 (tzv. „G1 zastoj”) za ćeliju predstavlja

    „time out“ koji koriste reper mehanizmi da isprave oštećenja u molekulu DNK. U

    neizmenjenim ćelijama tkiva, ovo vreme je dovoljno za ispravljanje većeg dela

    oštećenja, i posle G1 zastoja ćelija nastavlja svoj ćelijski ciklus. Ukoliko je broj oštećenja

    na molekulu DNK veliki, protein p53 indukuje proces apoptoze. Kada je protein p53 na

    bilo koji način inaktiviran (najčešće mutacijama), ne dolazi do indukcije procesa

    apoptoze zavisnog od proteina p53. To je čest slučaj u neoplastično transformisanim

    ćelijama, što za rezultat ima agresivniji tumorski rast.

    Uloga proteina p53 u indukciji procesa apoptoze je dvojaka. Kao aktivator

    transkripcije učestvuje u regulaciji ekspresije pro-apototskih gena (PUMA, NOXA, BAX,

    APAF 1). Pored toga, direktnom interakcijom sa proteinom Bcl-Xl favorizuje formiranje

    dimera proteina Bax (slika 13).

  • 16

    Slika 13. Uloga proteina p53 u indukciji procesa apoptoze. Kao transkripcioni aktivator indukuje ekspresiju pro-apoptotskih gena, a direktnom interakcijom sa proteinom Bcl-Xl favorizuje formiranje homodimera proteina Bax.

  • 17

    Ključni koncepti

    Danas se ćelijska smrt deli na akcedentalnu i regulisanu ćelijsku smrt.

    Programirana ćelijska smrt je vrsta regulisane ćelijske smrti. Prema morfološkim

    karakteristikama razlikuju se tri tipa ćelijske smrti. Ćelijska smrt tipa I – apoptoza

    (ćelijsko samoubistvo), ćelijska smrt tipa II – autofagija i ćelijska smrt tipa III –

    nekroza (ćelijsko ubistvo).

    Apoptoza je aktivan proces genski regulisanog ćelijskog samouništenja i u većini

    slučajeva služi homeostatskoj funkciji. Programirana ćelijska smrt po tipu

    apoptoze opisana je u normalnim fiziološkim uslovima (tokom procesa

    embriogeneze, diferencijacije i u procesima razvoja i regulacije imunskog

    sistema), kao i u nizu patoloških stanja organizma.

    Morfološke promene u toku ovog procesa mogu se podeliti na promene rane i

    kasne faze procesa apoptoze. Kondenzacija nukleusa i citoplazme dovodi do

    smanjenja zapremine ćelije, uz povećanje gustine citoplazme, sabijanja intaktnih

    organela i razgradnje citoskeleta. Kasnu fazu apoptoze obeležava segmentacija

    nukleusa i fragmentacija citoplazme. Završnu fazu procesa apoptoze karakteriše

    pojava fragmenata apoptotske ćelije koji su okruženi ćelijskom membranom i

    nazivaju se apoptotska tela. Apoptotska tela podležu procesu fagocitoze.

    Najizučavaniji biohemijski aspekt procesa apoptoze predstavljaju promene na

    molekulu DNK. Tokom rane faze procesa apoptoze dolazi do inicijalne

    fragmentacije molekula DNK u okviru hromatinskih petlji na fragmente veličine od

    50 – 300 kb. Morfološki uočljivu kondenzaciju hromatina prati fragmentacija

    molekula DNK na fragmente od približno 180 bp.

    „Odluka“ ćelije da uđe u proces apoptoze može biti posledica vanćelijskih signala

    smrti. To su najčešće specifični ligandi za tzv. receptore smrti. Kaspaza 8 je prvi

    enzim koji se tokom prenosa vanćelijskog signala smrti aktivira u ćeliji i indukuje

    kaskadnu reakciju aktivacije drugih apoptotskih enzima, kaspaza. Zbog svoje

    biološke uloge kaspaza 8 dobila je naziv inicijator kaspaza. Kompleks proteina –

    receptora, protein adaptera i prokaspaza 8, koji indukuje proces apoptoze,

    naziva se kompleks DISC.

    Osim vanćelijskim, proces apoptoze može biti indukovan i unutarćelijskim

    signalima smrti. Unutarćelijski signali smrti najčešće se aktiviraju kao odgovor

    ćelije na različite oblike stresa.

  • 18

    Bez obzira na vrstu stimulusa (vanćelijski ili unutarćelijski) koji ga indukuje,

    ključni događaj tokom procesa apoptoze predstavlja kaskadna reakcija

    proteolitičke aktivacije članova familije enzima cistein proteaza – kaspaza.

    Kaspaze svojom enzimskom aktivnošću vrše inaktivaciju inhibitora apoptoze i

    razgradnju struktura nukleusnog matriksa, nukleusne lamine i citoskeleta.

    Brojni vanćelijski i unutarćelijski signali (induktori apoptoze) mogu indukovati

    proces apoptoze, u čijoj izvršnoj fazi dolazi do aktivacije kaspaza (efektori

    apoptoze). Rezultati eksperimentalnih istraživanja na raznim model sistemima su

    pokazali da je proces apoptoze regulisan značajnim brojem unutarćelijskih

    regulatora (modulatori apoptoze).

    Proteini familije Bcl 2 ključni su unutarćelijski modulatori (regulatori) procesa

    apoptoze. Svi članovi familije proteina Bcl 2 sadrže najmanje jedan od četiri

    visoko konzervirana Bcl 2 homologa domena (domeni BH). Bcl 2 homologni

    domeni odgovorni su za procese homodimerizacije i heterodimerizacije proteina

    članova familije Bcl 2. Zahvaljujući ovim domenima BH, heterodimere formiraju i

    proteini sa suprotnim dejstvom na proces apoptoze. Pro-apoptotski članovi

    familije Bcl 2 (protein Bax i Bak) formiraju kanale na spoljašnjim membranama

    kroz koje citohrom C napušta mitohondrije. Protein Bcl 2 može formirati

    heterodimere sa proteinima Bax ili Bak i na taj način blokira formiranje njihovih

    homodimera, odnosno kanala, na spoljašnjim membranama mitohondrija. Zbog

    izuzetnog značaja, odnos pro-apoptotskih i anti-apoptotskih homodimera i

    heterodimera smatra se vrstom autonomnog „ćelijskog reostata“ koji opredeljuje

    vrstu ćelijskog odgovora na dejstvo apoptotskog stimulusa.

    Citohorom C vezivanjem za protein Apaf 1 vrši njegovu konformacionu protenu.

    Ova promena omogućava protein-protein interakciju ovog adapterskog molekula

    sa enzimom prokaspazom 9. Na ovaj način formira se apoptozom u kome dolazi

    do proteolitičke aktivacije enzima kaspaze 9.

    Protein p53 je transkripcioni represor gena čiji su proteinski produkti odgovorni

    za normalnu propagaciju ćelije kroz faze ćelijskog ciklusa. Istovremeno, on je i

    transkripcioni aktivator gena čiji su proteinski produkti uključeni kako u procese

    zaustavljanja ćelijskog ciklusa u fazi G1, tako i u indukciju procesa apoptoze.

    Kao transkripcioni aktivator indukuje ekspresiju pro-apoptotskih gena, a

    direktnom interakcijom sa proteinom Bcl-Xl favorizuje formiranje homodimera

    proteina Bax.

  • 19

    Pitanja

    1. Šta je apoptoza i navedi njenu ulogu u normalnim fiziološkim stanjima organizma?

    2. Navedi najznačajnije morfološke karakteristike procesa apoptoze.

    3. Navedi najznačajnije biohemijske karakteristike procesa apoptoze.

    4. Koje su osnovne razlike između procesa apoptoze i nekroze ?

    5. Objasni dešavanja u ćeliji u kojoj je proces apoptoze indukovan vanćelijskim signalima.

    6. Objasni dešavanja u ćeliji u kojoj je proces apoptoze indukovan unutarćelijskim

    signalima.

    7. Koja je uloga Bcl 2 familije proteina u procesu apoptoze ?

    8. Koja je uloga proteina p53 u procesu apoptoze ?

    9. Šta su kasapaze i koja je njihova uloga u ćeliji ?

    10. Objasni ulogu mitohondrija u procesu apoptoze.