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遺伝子共発現データベースCOXPRESdb トーゴーの日シンポジウム202014
Licensed under a Creative Commons 表示4.0国際ライセンス©2020大林武(東北大学大学院情報科学研究科)
http://coxpresdb.jp
公共の遺伝子発現量データ
大林武(東北大学大学院情報科学研究科)
Gene
Gene共発現データ
Gene
Gene
種内統合した共発現データ
ヒトの場合
128455GeneChips
22897runs
発現プロファイルが似ている遺伝子関係を提示するデータベース
遺伝子A
遺伝子B
様々なサンプル
遺伝子C
遺伝子D
Gene
Gene
様々なサンプル
遺伝子共発現データベースCOXPRESdb トーゴーの日シンポジウム202014
Licensed under a Creative Commons 表示4.0国際ライセンス©2020大林武(東北大学大学院情報科学研究科)
共発現ネットワークの描画ガイド遺伝子と共発現する遺伝子のリスト
パラログの片方しか 共発現していない例
オーソログがない
注目している共発現データ プラットフォーム比較 種間比較
PPIも表示
太さは共発現強度