ad en in a

Upload: dwi-putri-c

Post on 14-Jul-2015

30 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Adenina Adenina adalah salah satu dari dua basa N purina yang digunakan dalam membentuknukleotida dari asam nukleat DNA dan RNA. Pada DNA, adenina (A) berikatan dengan timina(T) melalui dua ikatan hidrogen untuk membantu menstabilkan struktur asam nukleat. PadaRNA berberkas ganda (dsRNA), adenin berikatan dengan urasil (U). Bersama dengan gula ribosa adenin membentuk nukleosida yang disebut adenosina, sementara bersama dengan deoksiribosa adenin membentuk deoksiadenosina. Adenosina dapat berikatan dengan gugus fosfat anorganik (PO43-). Jika mengikat satu gugus fosfat dinamakan adenosina monofosfat (AMP), dua gugus fosfat dinamakan adenosina difosfat(ADP), dan tiga gugus fosfat dinamakan adenosina trifosfat (ATP). ATP merupakan salah satu senyawa penting dalam metabolisme semua organisme hidup sebagai pembawa energi kimia untuk berbagai reaksi biokimiawi. Pada teknik PCR, deoksiadenosina trifosfat (dATP) merupakan satu dari empat nukleotida bebas yang perlu disediakan sebelum proses dimulai

Adenin Nama kimia 9H-purin-6-amina Nama 6-aminopurin alternatif Rumus kimia C5H5N5 Massa 135.13 g/mol molekul Titik lebur 360 - 365 C Nomor CAS 73-24-5 NC1=NC=NC2=C1N= SMILES CN2

Nukleobasa, nukleosida, dan nukleotida Nukleobasa Nukleosida/ (NB+pento sa) Purina (Adenina, Guanina, Analog purina) Pirimidina (Urasil, Timina, Sitosina, Analog pirimidina) RibonukleosidaAdenosina Guanosina Uridina Sitidina Deoksiribonukl Deoksiadenosina Deoksiguanosina Timidina Deoksiuridina Deoksisitidina eosida Ribonukleotidamonofosfat (AMP, GMP, UMP, CMP) difosfat (ADP, GDP, UDP, CDP) trifosfat (ATP, GTP, UTP, CTP) Nukleotida/ (NS+fosfat)

Deoksiribonukl monofosfat (dAMP, dGMP, dUMP, TMP, dCMP) difosfat (dADP, dGDP, TDP, dCDP) trifosfat (dATP, dG eotida SiklikcAMP, cGMP, c-di-GMP, cADPR

Guanina

Guanina merupakan satu dari dua basa N purina yang menyusun DNA dan RNA. Dalam DNA Nama kimia pilin ganda, guanina berikatan dengan sitosina melalui tiga ikatan hidrogen. Guanina Nama lain membentuk nukleosida bersama dengan gula ribosa yang dinamakan guanosina. Rumus Bentukdeoksiguanosina yang berikatan dengan tiga gugus fosfat anorganik (dGTP) kimia merupakan salah satu bahan baku dalam teknik PCR. Massa Secara kimiawi, guanina dapat berada pada dua bentuk tautomer yang molekul dinamakantautomerisme keto-enol. Titik lebur Nomor CAS Nama guanina diambil dari guano karena pertama kali diisolasi dari guano (pupuk kotoran burung). SMILES

Guanina 2-amino-1H-purin-6(9H)on 2-amino-6-okso-purina C5H5N5O 151.13 g/mol 360 C 73-40-5 NC(NC1=O)=NC2=C1N= CN2

Sitosina Sitosina

Nama IUPAC 4-amino-1H-pyrimidina-2-on Identifikasi Nomor CAS SMILES [71-30-7] C1=C(NC(=O)N=C1)N Sifat Rumus molekul Massa molar Titik lebur C4H5N3O 111,300 g/mol 320 - 325 C (dekomposisi)

Kecuali dinyatakan sebaliknya, data di atas berlaku pada temperatur dan tekanan standar (25C, 100 kPa) Sangkalan dan referensi Sitosina merupakan satu dari dua basa N pirimidina yang dimiliki DNA dan RNA. Nukleosidaribosanya dinamakan sitidina dan nukleosida deoksiribosanya dinamakan deoksisitidina. Sitosina berikatan dengan guanina pada DNA pilin ganda melalui tiga ikatan hidrogen. Sitidina dapat membentuk nukleotida bila mengikat satu, dua, atau tiga gugus fosfat anorganik (PO43-) membentuk CMP, CDP, dan CTP (masing-masing dinamakan sitidina mono-, di-, atau trifosfat). CTP dapat menjadi kofaktor dalam reaksi enzimatik biokimiawi dan mentransfer satu gugus fosfat bagi ADP untuk membentuk ATP. Deoksisitidina trifosfat (dCTP) diperlukan dalamPCR sebagai bahan baku sintesis DNA.

Pada keadaan tertentu, sitosina dapat mengalami deaminasi menjadi urasil. Mutasi ini biasanya dapat dikenali oleh enzim-enzim yang terlibat dalam reparasi DNA. Sebagaimana pada urasil,metilasi juga dapat terjadi pada sitosin dengan bantuan enzim DNA-metiltransferase.

Timina Timina tidak sama dengan tiamina, suatu jenis vitamin B. Timina atau 5-metilurasil merupakan salah satu dari dua basa N pirimidina yang menyusun DNA. RNA tidak memiliki timina dan, dengan sedikit perkecualian, urasilmenggantikan posisinya. Pada DNA berpilin ganda, timina akan berikatan denganadenina melalui dua ikatan hidrogen untuk membentuk struktur yang stabil. Timina bersama dengan gula deoksiribosa membentuk nukleosida yang disebutdeoksitimidina atau timidina. Timidina dapat membentuk nukleotida apabila mengalamifosforilasi menjadi dTMP, dTDP, atau dTTP (deoksitimidina mono-, di-, atau trifosfat). dTTP diperlukan dalam PCR sebagai salah satu bahan baku nukleotida.

Nama kimia Nama lain Rumus kimia Massa molekul Titik lebur Nomor CAS SMILES

Timina 5-metilpirimidina2,4(1H,3H)-dion 5-metilurasil C5H6N2O2 126.11 g/mol 316 - 317 C 65-71-4 CC1=CNC(NC1=O)=O