rangkuman paper datmin

VERA RUSMALAWATI

135150201111194

DATA MINING / INFORMATIKA – C

Judul : Application of Data Mining In Bioinformatics

Kategori : Data Mining, Bioinformatics, Protein Sequence Analysis, Bioinformatics tools

Tujuan :

- Menjelaskan konsep dasar dari Bioinformatika dan data mining

- Menjelaskan penerapan data mining dalam Bioinformatika, serta penjelasan tentang

tantangan tantangan dan peluang pengembangan penggunaan data moning dalam

Bioinformatika

Data :

Bioinformatika memiliki set data biologi yang sangat besar, yang semuanya ditafsirkan

menggunakan teknologi informasi dan ilmu komputer. Contoh dari jenis analisis set data

biologi tersebut meliputi prediksi struktur protein, klasifikasi gen, klasifikasi kanker

berdasarkan data microarray, pengelompokan data ekspresi gen, pemodelan statistik

interaksi protein-protein, dll.

Hasil :

Aplikasi data mining untuk bioinformatika termasuk adalah finding gen, deteksi fungsi

domain protein, diagnosis penyakit, optimasi pengobatan penyakit. Contohnya adalah

teknologi microarray digunakan untuk memprediksi hasil pasien. Atas dasar genotype pasien

dalam data microarray, waktu kelangsungan dan resiko metastasis tumor atau kambuhnya

penyakit dapat diperkirakan.

Pendekatan data mining tampaknya ideal dan cocok untuk bioinformatika, karena

bioinformatika kaya data tetapi tidak memiliki teori yang komprehensif tentang organisasi

hidup di tingkat molekuler. Namun data mining dalam bioinformatika terhambat oleh

banyaknya aspek dari database biologi, termasuk ukuran, jumlah data, keragaman dan

kurangnya ontology standar untuk membantu penentuan query. Serta kualitas dan asal data

yang heterogen. Masalah yang lain adalah adanya berbagai macam tingkat domain dari

pengguna data sehingga menjadi sulit untuk penentuan mekanisme akses database yang tepat

untuk semua. Selain itu integrtas dari database biologis juga menjadi kendala, karena

perkembangannya yang sangat cepat, penting untuk memeriksa apakah penelitian biologi

tersebut penting. Sehingga sangat penting untuk menentukan bagian yang penting untuk

dilakukan penelitian dan mengembangkan metode data mining untuk analisis yang efektif

dan terukur.