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Applied Biosystems™ TaqMan™ Gene Expression Assays

インターネットオーダー方法

2010/06/14

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TaqMan Gene Expression Assays の概要

世界最大規模のリアルタイムPCRアッセイ用デザイン済みプライマー＆TaqManプローブセット

TaqMan Gene Expression Assaysのプライマー&プローブセットは、数多くのアッセイ構築で培われたノウハウと経験に基づいた弊社独自のアルゴリズムを採用しています。

ヒト、マウス、ラットのアッセイの、デザインの元となる遺伝子配列情報は公共のデータベースとセレラのゲノムデータベースを使用しており、リピートや偽遺伝子、SNPなどのリアルタイムPCR定量に影響をあたえる可能性のある要因を排除しています。

またプライマー＆プローブは、Exon-Exonバウンダリーを中心に設計されているのでゲノムDNAの影響を受けにくく、RNAiの確認、マイクロアレイデータの確認、スプライスバリアントの解析等に最適です。

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多くの遺伝子に対して、複数のTaqMan Gene Expression Assaysがデザインされています。

Exon Boundary特異的な定量が必要ない場合は、納期が早く、価格も割安なTaqMan Gene Expression Assays,

Inventoried がご利用できます｡

スプライスバリアントに注目する定量実験を行う場合は、後述のMapViewでExon Boundaryを確認し、対応するア

ッセイを選択してください｡

注）Inventoried 製品とMade-to-Order製品には、商品番号、価格、反応数および納期に違いがあるので注文の

際にはご注意下さい。

TaqMan Gene Expression Assays 製品情報

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蛍光色素VIC ラベルが追加されました。

DuplexでリアルタイムPCRを行う際は、発現レベルが低い遺伝子は従来のFAMラベルを選択し、内在性コントロ

ール等の発現レベルが高い遺伝子についてTaqMan Gene Expression Assays, VIC PL（Primer-Limited）シリー

ズを選択することをお勧めします。Primerの濃度を抑えることで発現量が高い遺伝子増幅が目的遺伝子の増幅

を阻害する事を避けることができます。


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TaqMan Gene Expression Assaysは、2ステップでのリアルタイム定量PCRによる実験手法にてご使用ください。

また、cDNA調整時の逆転写反応に用いるプライマーは､オリゴdTプライマーだけではなく、ランダムプライマーも

ご利用ください。


逆転写反応推奨試薬

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TaqMan Gene Expression Assays 検索方法

TaqMan Gene Expression Assaysを検索するには？− 以下のサイトへアクセスします。

− アプライドバイオシステムズジャパンウェッブサイトからのリンクもございます。

https://products.appliedbiosystems.com/ab/en/US/adirect/ab?cmd=catNavigate2&catID=60

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検索機能をご利用いただくには、特別な登録は必要ございませんが、製品をご注文いただく場合には、アプライドバイオシステムズのユーザーID事前登録が必要になります。

ユーザーIDをお持ちでない方は、以下の『インターネットオーダーシステムご利用案内』よりユーザーIDの登録をお願いします。

http://www.appliedbiosystems.co.jp/website/jp/store/pages.jsp?PGCD=15

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トップページ（ http://www.appliedbiosystems.jp/website/jp/home/index.jsp）でサポート → アッセイ検索を選択します。

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内在性コントロールについての情報も参照ください。

Search をクリック

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Assay Searchをクリック

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Gene Expression Assaysもしくは、Non-coding Assaysを選択

遺伝子名、GeneBank ID等のキーワードを入力

必要に応じてサーチフィールドを選択 All Text も可

生物種を選択設定後、Searchをクリック

他の検索オプションを設定後条件を絞り込んだ検索も可能

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キーワードの一部しか分からない場合は、入力したキーワードの後に * を入力することで曖昧検索ができます。例）インターロイキンすべての検索：IL*

キーワード検索は、遺伝子名だけでなく、RefSeqやGenBank、Locus Link等の公共データベースIDや遺伝子シンボルでも検索可能です。

アッセイが見つからない場合は、RefSeq IDでの検索が有効です。RefSeq の見つけ方は、こちらを参照ください。

キーワード検索のヒント

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Availabilityで、Inventoried、Made to Order Assays情報の確認ができます。

Assay ID をクリックすると、各アッセイの詳細情報が確認できます。

Inventoried AssaysはInventoriedと表記され、non-Inventoried AssaysはMade to Orderと表記されます｡

Ambion SiRNA製品へのリンク

Aligment Mapボタンをクリックすると、ゲノム地図上でのアッセイマップ情報が確認できます。

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Inventoried Assaysのみ

Inventoried Assays + Made to orderAssaysを含む全製品

Made to order Assaysのみ

検索結果の絞込みを行う場合

チェックボックス選択後、Filter Resultsをクリック

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アッセイの詳細情報画面

Aligment Mapボタンをクリックすると、ゲ

ノム地図上でアッセイのマップ情報が確認できます。

アッセイID

アッセイIDに対応する各種情報の表示。• NCBI Entrez Geneに登録されている遺伝子情報（遺伝子名、遺伝子シンボル

NCBIゲノム上のマップ情報など）• NCBI RefSeqに登録されているmRNA（NM_xxxxxx）、タンパク質（NP_xxxxxx

）及びGenoBankに登録されているmRNA情報• Exon Boundary,Assay Location各転写産物上でのTaqManアッセイの位置情報

（Probeが設計されているエクソンジャンクションの位置とそのおよその塩基番号）

• IMAGEクローンのID情報• Amplicon Size PCR産物のサイズ

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Alignment Map

• Alignment Mapの表示

• 選択したアッセイに対応する遺伝子Mapが表示されます。

• Show GenBank mRNAsをチェックすると、RefSeq以外のGeneBank mRNAも表示します。


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• でZoom in/Zoom outします。

• TaqMan Assayの上にマウスを置くと、

検出可能なトランスクリプトがハイライトされます。

• トランスクリプトの上にマウスを置くと、対応するTaqMan Assayがハイライトされます。

• TaqMan Assayをクリックすると、アッセイ詳細情報ページへリンクします。


Alignment Map

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検索リストからのアッセイ選択のフロー

エキソンの指定がある

全てのアッセイから指定のエキソンを含む

アッセイを選択

Inventoriedアッセイがある

全てのアッセイから任意のアッセイを

選択

Inventoriedアッセイが複数ある

目的に適したInventoriedアッセイを

確認・選択

Inventoriedアッセイを選択

YES

YES YES

NO

NO NO

→特に設計位置の指定がないときにはInventoriedアッセイをご利用ください。

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Assay IDに含まれる情報

生物種学名の頭文字の組み合わせです

Hs: H. SapienceMm: M. musculus Rn: R. norvegicusAt: A. thaliana Dm: D. melanogasterCe: C. elegansRh:M. mulattaCf:C. familiaris

プライマー・プローブセット固有の番号設計した順番に割り当てられているので、数が大きいほど新規に設計されたセットであることを示します

Genomic DNA由来の増幅m: genomic DNAが混入していても増幅しませんs: 同一のエキソン上にプライマー・プローブが設計されているので、genomic DNAが混入していたら増幅しますg: 染色体上に相同性の高い配列が存在するため、genomic DNAから増幅する恐れがありますu:プライマーは異なるエキソン上に設計してあ

りますが、プローブはエキソンジャンクションではなく、どちらかのエキソン上に設計されています。genomic DNAから増幅する恐れがあります

配列の特異性1: ターゲット遺伝子特異的に検出することができますH: 相同性が高いmRNAからも若干(10-15cycleのずれで）増幅する可能性があります

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複数のアッセイから選択するときのポイント

～Assay IDからの判断～

•右から２番目のアルファベットが“m”のものを選択

•genomic DNAからの増幅を考慮する必要がありません

•一番右が“1”のものを選択

•特異性の高いセットを選択

•番号が大きいものを選択

•最新のデータベース上の転写産物配列情報を元に設計

注記：上記は目安です

ターゲットとなる配列情報も併せてご判断いただくことをお勧めします

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Inventoried アッセイが沢山ある時の例①

Assay IDの数字が一番大きい→最新のアッセイ

対象となる配列数が最も多い→網羅的に検出することが可能

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Inventoried アッセイが沢山ある時の例②-a

Assay IDの数字が一番大きい→最新のアッセイ

対象となる配列数が最も多い→網羅的に検出することが可能

このように最新のアッセイの対象とする配列数が多くない場合→全てのバリアントを検出することができない可能性が高い→Mapにて対象となるExon位置の確認

Alignment Mapスプライシングバリアントなどを表示

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Inventoriedアッセイが沢山ある時の例②-b

Hs01124177_m1 :多くのSplicing Variantの検出

Hs00357143_g1 :多くのSplicing Variantの検出しかし“g”なのでgenomic DNA由来の増幅の可能性あり

Hs00360501_m1 :3つのValiantだけを検出

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TaqMan Gene Expression Assays オーダー方法

Log Inが必要です

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Username/Passwordは、

インターネットオーダー用のユーザーIDを使用（6ページ参照）

Username・Passwordを入力後、Loginをクリック


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①必要なアッセイをチェック

②Add to Basketをクリック


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Shopping Basketをクリック


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蛍光ラベル・スケールの変更

数量の更新 – ショッピン

グバスケット内の製品の数量を変更した場合、このボタンを押して下さい。

削除－注文した製品1つ

、もしくは複数を削除することができます。

ご注文を先に進める場合、『次へ』ボタンを押します。

数量を変更することができます。


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お支払方法について：

お支払方法のPurchase Orderの表示、Blanket Orderの空欄はそのままで変更しないでください。

お名前には、登録ユーザーのお名前を半角のアルファベットでご入力ください。

｢出荷情報｣ページが表示されます。

お支払方法を確認後、次へをクリックして、ご注文を続けます。


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ご注文の確認を行います。

ご注文を完了するには、『ご注文』ボタンをクリックします。

内容を修正したい場合は、『戻る』ボタンをクリックします。


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• ご注文が完了し、受注伝票番号を発行します。

• 受注伝票番号が表示されます。番号をお控え下さい。

• ‘印刷用ページ’ボタンを押すと印刷に適したページが表示されます。

• ご登録いただいたお客様のe-mailアドレスに確認メールが送信されます。

• 『お買い物を続ける』ボタンを押すと、引き続き“Products＆Services”ページに戻ります。

『ご注文』ボタンを押すと、｢ご注文の確認｣ページが表示されます。

yamada

JPOrderAdminCS


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TaqMan Gene Expression Assays 検索方法：補足

– Advanced Keyword Search

“Advanced Keyword Searchをク

リックすると、下記のようなオプションキーワード入力画面が出ます。

必要に応じてキーワードを追加入力します。

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– Batch IDサーチ 1

1. “Batch ID Search”をクリックします。

Batch IDサーチの機能を利用すれば、複数のアッセイを同時に検索することが出来ます｡

Batch IDサーチには、複数のIDを直接入力する検索方法(オプション1)と、保存されたファイルを読み込みませて検索する方法(オプション2)があります｡

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– Batch IDサーチ 2

2. オプション1：複数のIDを入力（コンマ、スペース、リターンで区切る）します。

3. オプション2：“Browse”ボタンをクリックして、お客様のローカルPCに保存され

ているIDリスト、もしくは以前にサーチして得られたアッセイリストのExportファ

イルを読み込みます。

4. 種の選択をします。

5. “Search”ボタンをクリックします。

6. アッセイの確認方法は、キーワードサーチの場合と同じです｡

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研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続き上での使用は出来ません。

The trademarks mentioned herein are the property of Life Technologies Corporation or their respective owners.TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc

本誌に記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。

記述内容は改良のため予告なく変更される場合がありますので、ご了承下さい。

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