az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/w1... ·...

32
Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor Eötvös Loránd Tudományegyetem Genetikai Tanszék Az öregedési folyamat szabályozása és mechanizmusa

Upload: others

Post on 19-Oct-2020

4 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Budapest, 2018.11.10

Vellai Tibor

Eötvös Loránd Tudományegyetem

Genetikai Tanszék

Az öregedési folyamat

szabályozása és

mechanizmusa

Page 2: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Öregedés: az egyed fitneszében és általános fiziológiájában

bekövetkező folyamatos hanyatlás az élettartam során,

amelyet molekuláris károsodások okoznak.

Page 3: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Abbott (Nature

428:116, 2004):

Across the developed

world, birth rates are

falling and people are

living longer. This

requires a new focus

on research to

promote healthy

ageing, rather than

simply treating the

diseases of old age.

A fejlett országokban a várható élettartam meghaladja a 80 évet

(Monaco: 95 év!).

Az öregedési folyamat társadalmi, gazdasági

jelentősége

Page 4: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Orvosbiológiai jelentőség: öregkori degeneratív

patológiák sikertelen kezelése

„aging is a collection of mostly independent degenerative processes

leading to disease and, ultimately, death.”

(Hekimi and Guarente, Science 299: 1351, 2003).

• rák

• neurodegeneratív betegségek

• cukorbetegség

• szöveti atrófia (pl. szarkopénia)

• fibrózis

• Immun-deficienciák

• ...

Molekuláris károsodás

Page 5: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Genetika: hosszú élettartamú mutáns törzsek

izolálása

Cynthia Kenyon

Az elmúlt 3 évtized: kb. 500 „aging” gén feltárása. Jelátviteli rendszerek,

szabályozó fehérjék, respiráció, transzláció, ...

Nature, 366:461-4, 1993.

Életkor (napok)

Élő

álla

tok

(%) vad típus

daf-2(-)

Page 6: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

„Some aspects of ageing remain particularly enigmatic.

One of these is the all-important question of what

actually causes ageing.”

Miért?

Az öregedési folyamat mechanizmusa feltáratlan

maradt

• ROS

• telomér rövidülés

• mutációk

• ...

Élő

álla

tok

(%)

Életkor (napok)

vad típusdaf-2(-); daf-2-RNSi, gonád(-)

6x

Page 7: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Eredmények

I.

Piwi fehérjék

Page 8: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Rákos sejtek CsalánozókCsíravonal

Piwi fehérjék (Piwi-piRNS útvonal)

Nem öregedő sejtek (replikatív immortalitás)

összehasonlító elemzése

zigóta

szomatikus sejtek

csíravonal sejtek

Sturm Á. és mtsi., CMLS, 2015Sturm Á. és mtsi., Aging Cell, 2017

Page 9: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

ugráló gén gén

enzim

inszerciós mutáns gén

(elrontott gén)

Piwi-piRNS útvonal: transzpozábilis elemek (TE)

blokkolása

Page 10: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Az eukarióta genomok jelentős részét TE-eredetű

szekvenciák alkotják

ENCODE (2012)

Page 11: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

„Miért?”

TE-k: nagy kópiaszám (több ezer/millió)

nem lehet genetikailag inaktiválni

TE-k:

• A kópiaszám exponenciális növekedése a szomatikus genomban

• DNS hibajavító rendszer nem ismeri fel

Page 12: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Caenorhabditis elegans genom: kevés TE (12%),

csak néhány család aktív

31/haploid genom

29/haploid genom

Egy új, hatékonyabb RNSi rendszer kifejlesztése.Sturm Á. és mtsi., Nucleic Acids Res 46:e105, 2018.

Page 13: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

TE családok csendesítése megnöveli az élettartamot

C. elegans-ban

Tc1Tc3Tc14...

Élő

álla

tok

(%)

Életkor (napok)

Kontroll RNSi

Tc1-RNSi

0

5

10

15

20

25

Mea

n li

fesp

an (

day

s)

control RNAi

Tc1(RNAi)

***Kontroll

Tc1-RNSi

Átl

ago

s é

lett

arta

m

Page 14: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Piwi/PRG-1 szomatikus (ektopikus) expressziója

jelentősen megnöveli az élettartamot

Élő

álla

tok

(%)

Életkor (napok)

Vektorhs::prg-1Vad típus

Page 15: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Az adenin metiláció szintje progresszíven nő TE

szekvenciák mentén

DNS

2 DAMT-1(C18A3.1)

NMAD-1(F09F7.7)

DNS

CH3

Cele141 napos felnőttek 11 napos felnőttek

PvuII M DpnI PvuII M DpnI

30 34 38 30 34 38 30 34 38 30 34 38

(kontroll) (6mA) (kontroll) (6mA)

0100200300400500600700

Day 1 Day 11R

elat

ive

6mA

leve

lsat

Cel

e14

stre

ches

Adult age

DpnI

1 nap 11 nap(életkor)

Re

latí

v 6

mA

szi

nt

a C

ele1

4TE

sz

ekv

enci

ák m

en

tén

Page 16: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

0

100

200300

400

500

600700

Day 1 Day 11

Rel

ativ

e6m

A le

vels

atTc

1 st

rech

es

Adult age

DpnI

***

0100200300400500600700

Day 1 Day 11

Rel

ativ

e6m

A le

vels

atTc

3 st

rech

es

Adult age

DpnI

***

Re

latí

v 6

mA

szi

nte

k a

Tc1

sze

kven

ciák

me

nté

n

Re

latí

v 6

mA

szi

nte

k a

Tc3

sze

kven

ciák

me

nté

n

1 nap 11 nap(életkor)

1 nap 11 nap(életkor)

Page 17: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Tc3

100 bpTc3

cdc-42

Tc1

Tc1

cdc-42

800 bp

Az adenin metiláció befolyásolja a TE transzkripciót

Page 18: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Az öregedés sztochasztikus/mutációs aspektusa

(mechanizmus)

Genom instabilitás

TE transzkriptum

kromoszóma

6mA

Fiatal felnőtt Idős felnőttkor

Genomi integritás

ÖregedőNem öregedő

TE TE

TE transzkriptum

kromoszóma

Nincs/minimális transzpozíció Transzpozíció

Page 19: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Eredmények

II.

MTMR14/EDTP fehérjék

Page 20: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Az öregedést sejtes károsodások felhalmozódása

okozza.

A sejtes károsodások eltávolításának legfontosabb

mechanizmusa: AUTOFÁGIA.

Atg génekben TE inszerciók egyedi sejtekben.

Page 21: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

AUTOFÁGIA

Sejt anyagainak megújítása

Page 22: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Atg8/LC3B-II

Atg12-Atg5-Atg16

SQSTM1/p62

fagofór autofagoszómalizoszóma

autolizoszóma

PI3K Savas hidrolázokMTMR14

MTMR14

PI3K

Page 23: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Az autofág kapacitás hanyatlása idegsejtekben a felnőtt élettartam során

1 nap 10 nap 30 nap 50 nap 70 nap

Atg5

Hoechst

FYVE-GFP

Hoechst

Ref(2)P/p62

Hoechst

50 µm

Page 24: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

0

2

4

6

8

10

1

cove

rag

eo

f A

tg5

par

ticl

es

1

10

30

50

70

Atg5

0

5

10

15

1

1

10

30

50

70

PI3K (FYVE)

cove

rag

eo

f

FY

VE

-GF

P p

arti

cles

napok

Atg

5 s

tru

ktú

rák

me

nn

yisé

ge

FYV

E st

rukt

úrá

km

en

nyi

sége

napok

0

4

8

12

Oregon

1

10

30

50

70

cove

rag

eo

f

Ref

(2)P

par

ticl

es

Ref(2)P/p62

napokRef

(2)P

/p6

2 s

tru

ktú

rák

me

nn

yisé

ge

Fluoreszcens mikroszkópia

Page 25: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

α-Tub84B

p62/Ref(2)P

Atg8a-I

Atg8a-II

100 kDa

49.9 kDa

15 kDa

12 kDa

nap 1 10 20 30 40 50 60

Ref(2)P/p62

0

2

4

6

1

1

10

20

30

40

60

50

Rel

ativ

eam

ou

nts

of

Ref

(2)P

Ref(2)P/p62

Ref

(2)P

/p6

2 s

zin

tek

Western blot

napok

Page 26: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

year 42

year 71

p62

DAPI

p62

DAPI

p62

0

10

20

30

40

1

abu

nd

ant

of

p62

p

osi

tive

stru

ctu

res

42

71

p6

2 s

zin

tek

Fluoreszcens mikroszkópia

Page 27: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

MTMR14/EDTP gátolja az autofágiát

MTMRs

PI3K/Vps34

PI

PI5P

PI3P

MTMRsPI3,5-P2

P1

23

4

5 6P

P

1

23

4

5 6

P

P1

23

4

5 6P

P1

23

4

5 6

P

5’ phosphatasesPIPK

AUTOFÁGIA

Page 28: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

MTMR14/EDTP folyamatosan akkumulálódik neuronokban a felnőtt élettartam során

EDTPHoecsht

0

25

50

75

100

1

10

20

30

40

60

50

ED

TP

exp

ress

zió

s

szin

tje

EDTP

napok

Fluoreszcens mikroszkópia

Page 29: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

0

3

6

1

1

10

20

30

40

60

50

ED

TP

szi

nte

k

EDTP

Western blot

napok

EDTP

αTub84B

Day: 1 10 20 30 40 50 60M

49.9 kDa

EDTP

α-Tub84b

83.1 kDa

control EDTPminos

Page 30: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

MTMR14 akkumulálódik neuronokban a felnőtt élettartam során

27 éves 73 éves

Page 31: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Az öregedés szabályozása – MTMR14/EDTP lipid

foszfatázok, mint endogén pro-aging faktorok

Életkor

Re

latí

v ak

tivi

tás

MTMR14/EDTP

Autofág kapacitás

Page 32: Az öregedési folyamat szabályozása ésmedinprot.chem.elte.hu/system/resources/W1... · Budapest, 2018.11.10 Vellai Tibor EötvösLorándTudományegyetem Genetikai Tanszék Az

Öregedési modellünk

Szabályozó faktorok

(pl. MTMR14)

Sztochasztikus faktorok

(random mutációk,

elsősorbanTE-k)

Fenntartó rendszerek

• Autofágia

• Ubikvitin-proteoszóma rendszer

• Chaperone-ok

• DNS hibajavító útvonalak

Sejtes károsodások

Öregedés

• Öregkori betegségek kezelése

• Egészséges élettartam növelése