contoh nested design

CONTOH NESTED DESIGN

Dalam penelitian u/ pendugaan nilai h2

suatu sifat ternak

Bila penelitian di laboratorium, dengan keterbatasan waktu biasa dilakukan

pada hewan percobaan (burung puyuh)

Untuk penelitian di lapang, dapat menggunakan data sekunder (selama

ada rekording yg jelas, misalnya pada

ternak sapi perah, kambing, domba)

Teladan:

Mengestimasi nilai h2 BB2Mgg

puyuh

Puyuh (Coturnix coturnix japonica): siklus hidup relatif pendek, pertum-

buhan & perkembangan cepat, peng-

eraman telur 16-17 hr, bobot tetas

7g/ekor, DK 42 hr, prod telur 250 bt/th

Reproduksi (1J : 2B) = fertilitas 80% & daya tetas 85%

Lama simpan telur 3-8 hr (Ok)

40J & 80B (dr peternakan berbeda)

Setiap B dlm sangkar baterai, 1J me-ngawini 2B (bergilir 2 hr 1x)

Tiap puyuh & telur diidentifikasi

Koleksi telur/simpan 5 hr ditetaskan (periode penetasan)

Metode pendugaan: Paternal half-sib correlation

dlm model

Three-way nested unequal sub-class

numbers

Model statistika:

Yhijk

= + Hh + S

hi + D

hij + E

hijk ,

Yhijk = Nilai pengamatan anak ke-k, dr induk ke-j

yg dikawin pejantan ke-i dlm periode penetas-

an ke-h

= Nilai tengan umum

Hh = Pengaruh periode penetasan ke-h

Shi = Pengaruh pejantan ke-i dlm periode penetasan

ke-h

Dhij = Pengaruh induk ke-j yg dikawin pejantan ke-i

dlm periode penetasan ke-h

Ehijk = Pengaruh lingkungan yg tdk terkontrol (genetik individu)

Periode Penetasan

Pe-J Induk 1 2 ......... 6

nhij dan Yhij. ________________________________

Jml dr setiap induk

n1ij Y1ij. n2ij Y2ij. ........ n6ij Y6ij.

______________________________________________________________

I 1 1 20,45 - - 2 35,55

2 1 18,50 1 27,35 3 79,20

II 3 - - 1 29,90 - -

4 2 51,80 2 41,55 - -

. .

. .

XL 79 - - 2 50,35 1 29,70

80 1 26,30 2 41,50 2 46,45

Jml dr setiap pe-J

n1i. Y1i.. n2i. Y2i.. ....... n6i. Y6i.. I 2 38,95 1 27,35 5 114,75

II 2 51,80 3 71,45 - -

.

XL 1 26,30 4 91,85 3 76,15

Periode Penetasan

Pe-J Induk 1 2 ......... 6

nhij dan Yhij. ________________________________

Jml dr setiap induk

n1ij Y1ij. n2ij Y2ij. ........ n6ij Y6ij.

______________________________________________________________

Jml dr setiap periode penetasan

n1.. Y1... N2.. Y2... ....... N6.. Y6... 139 3144,70 149 3489,95 159 3692,70

Jumlah total

n... Y....

785 17388,05

_______________________________________________________________

Perhitungan:

FK = Y....2/n = 17388,052/785 = 385151,9526

JK-induk belum terkoreksi (D):

D = Yhij.2/nhij = 20,45

2/1 + 18,502/1 + ... + 46,452/2 = 395059,9943

h i j

JK-peJ belum terkoreksi (S):

S = Yhi..2/nhi. = 38,95

2/2 + 51,802/2 + ... + 76,152/3 = 391407,2030

h i

JK-periode penetasan belum terkoreksi (H):

H = Yh...2/nh.. = 3144,70

2/139 + 3489,952/149 + ... + 3692,702/159 =

h

=387030,8670

Lanjutan:

JK-total belum terkoreksi (T):

T = Yhijk2

j = 20,452 + 18,502 + ... + 14,70452 = 402647,0775

h i j k

Dhi: N = 785; h = 6; s = 210; d = 362

Koef komponen ragam:

k1 = 1/(d-s) [N (n2

hij/nhi.)]

h i j

k2 = 1/(s-h) [ (n2

hij/nhi.) ( nhij2/nh..)]

h i j h i j

k3 = 1/(s-h) [N (n2

hi./nh..)]

h i

Lanjutan:


k4 = 1/(h-1) [ ( n2

hij/nh..) ( nhij2/N)]

h i j h i j

k5 = 1/(h-1) [ (n2

hi./nh..) ( nhi.2/N)]

h i h i

k6 = 1/(h-1) [N (n2

h../n)]

h

Perhitungan:


k1 = 1/(362-210) [785 483,68095)] = 1,98236

k2 = 1/(210-6) [483,68095 15,75562] = 2,29375

k3 = 1/(210-6) [785 26,80650] = 3,71663

k4 = 1/(6-1) [15,75562 2,65860] = 2,61940

k5 = 1/(6-1) [26,80650 4,54395] = 4,45251

k6 = 1/(6-1) [785 134,45223] = 130,10955

Tabel Analisis Ragam:

SK Simbol db JK KT KTH

________________________________________________________________

Antar H H-FK 5 1878,9144 375,78288 GE2+2,6194GD

2+4,45251GS2

+130,10955GH2

Antar S/H S-H 204 4376,3360 21,45263 GE2+2,29375GD

2+3,71663GS2

Antar D/S/H D-S 152 3652,7913 24,03152 GE2+1,98236GD

2

Antar anak T-D 423 7587,0832 17,93637 GE2

________________________________________________________________

Komponen ragam: GE2 = 17,93637

GD2 = 3,07469

GS2 = -0,95148

GH2 = 2,72101

Pendugaan nilai h2:

hS2 = 4 GS

2 / (GS2 + GD

2 + GE2) = -3,80592/20,05958 = -0,18973

hD2 = 4 GD

2 / (GS2 + GD

2 + GE2) = 12,29876/20,05958 = 0,61311

hS+D2 = 2 (GS

2 + GD2) / (GS

2 + GD2 + GE

2) = 4,24642/20,05958 = 0,21169

contoh nested design

Documents