informator instytutu biotechnologii · katedra biologii molekularnej 4. katedra bionanomateriałów...
TRANSCRIPT
INFORMATOR
INSTYTUTU BIOTECHNOLOGII
WYDZIAŁU BIOTECHNOLOGII
I NAUK O ŚRODOWISKU
Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego Jana Pawła II
w Lublinie
Lublin 2015
2
Spis treści
1. Instytut Biotechnologii KUL – jego utworzenie i organizacja
2. O studiach
3. Katedra Biologii Molekularnej
4. Katedra Bionanomateriałów
5. Katedra Fizjologii i Biotechnologii Roślin
6. Katedra Fizjologii Zwierząt i Toksykologii
7. Katedra Biochemii i Chemii Środowiska
Kontakty
Instytut Biotechnologii
Wydział Biotechnologii i Nauk o Środowisku
Katolicki Uniwersytet Lubelski Jana Pawła II
ul. Konstantynów 1 "I”
20-708 Lublin
Dyrektor Instytutu Biotechnologii
dr hab. Ewa Skórzyńska-Polit, prof. KUL
tel. 81 454 54 15
www.kul.lublin.pl
email: [email protected]
Sekretariat
mgr Iwona Kuta-Wysmulska
tel. 48 81 475 94 02
email: [email protected]
Komitet Redakcyjny
Aleksandra Seta-Koselska
Paweł Adamek
Ewa Skórzyńska-Polit – przewodniczący
3
1. Instytut Biotechnologii KUL – jego utworzenie i organizacja
Biotechnologia jest bardzo dynamicznie rozwijającą się,
nowoczesną dziedziną o dużym znaczeniu praktycznym,
wykorzystującą i integrującą zdobycze wielu lat badań różnych
dyscyplin nauk przyrodniczych takich jak biologia, fizyka czy
chemia oraz technicznych. Z wytworami biotechnologii mamy do
czynienia na każdym kroku, stosuje się je w przemyśle, ochronie
środowiska, medycynie i w produkcji żywności.
Biotechnologia staje się kluczową dziedziną nauki, służącą
poszukiwaniu nowych środków leczniczych, szczepionek i środków
diagnostycznych. Jej istotę stanowi zastosowanie organizmów,
systemów i procesów biologicznych do potrzeb przemysłu. Przemysł
biotechnologiczny intensywnie rozwija się od ponad 30 lat w wysoko
uprzemysłowionych krajach europejskich. Pragnieniem naszego
Instytutu jest aktywne uczestnictwo w rozwijaniu tego przemysłu
również w Polsce, między innymi poprzez kształcenie specjalistów
w tej dziedzinie w ramach kierunku studiów stacjonarnych:
BIOTECHNOLOGIA.
Instytut Biotechnologii KUL został powołany do życia
w Wydziale Matematyczno-Przyrodniczym decyzją Senatu
Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego dn. 1 października 2009
roku. Instytut utworzyły Katedry wchodzące wcześniej w skład
Instytutu Ochrony Środowiska: Katedra Biologii Molekularnej
(powołana do życia 1 września 1998 r.), Katedra Fizjologii Zwierząt
i Toksykologii (utworzona w 1992 r.), Katedra Biochemii i Chemii
Środowiska (powstała w roku akademickim 1998/1999) oraz Katedra
Fizjologii i Biotechnologii Roślin (utworzona 1 marca 2009 r.).
Następnie została utworzona Katedra Bionanomateriałów (powołana
do życia 1 marca 2010 roku).
W tym czasie trwała budowa nowoczesnego Budynku
Biotechnologii z funduszy UE.
Uroczyste otwarcie i poświęcenie budynku odbyło się w dn. 16
czerwca 2011 r. Zorganizowana została wtedy konferencja
Biotechnologia – szanse i zagrożenia, Lublin, 16-17.06.2011.
4
Pod koniec stycznia 2012 r. przeniesiono sprzęt i aparaturę
poszczególnych katedr do nowego budynku. Zajęcia dydaktyczne
i badania naukowe rozpoczęto w nowych laboratoriach od dnia
1 lutego 2012 r.
Nowy Wydział Biotechnologii i Nauk o Środowisku w składzie:
Instytut Biotechnologii oraz Interdyscyplinarne Centrum Badań
Naukowych został utworzony dn. 16 lutego 2013 r. Pierwszym
Dziekanem Wydziału w dn. 20 lutego 2013 r. został wybrany prof. dr
hab. Ryszard Szyszka. Dn. 21 lutego 2013 r. na stanowisko
Dyrektora Instytutu Biotechnologii został wybrany prof. dr hab. Piotr
Staszczuk. Od 8 października 2013 r. funkcje Dyrektora Instytutu
pełni dr hab. Ewa Skórzyńska-Polit, prof. KUL.
5
2. O studiach
Instytut Biotechnologii prowadzi trzyletnie studia zawodowe
I stopnia oraz dwuletnie studia magisterskie II stopnia. Przedmioty
objęte programem studiów podzielone są na moduły, w ramach
których student musi otrzymać odpowiednią liczbę punktów ECTS
i jest to podstawowym kryterium dopuszczenia do egzaminu
dyplomowego. Studenci zaliczają przedmioty w systemie
punktowym zgodnym z Europejskim Systemem Transferu Punktów
(ECTS), co umożliwia realizację części studiów na innych
uczelniach, krajowych i zagranicznych stosujących ten system.
Dla studentów organizowane są także specjalne kursy stacjonarne
i wyjazdowe (np. szkoły letnie), w których także biorą udział
specjaliści zagraniczni. Studenci wykonują prace dyplomowe
w różnych zespołach, np.: biochemii, biologii molekularnej,
bionanomateriałów, biochemii wirusów, toksykologii, immunologii,
enzymologii, biotechnologii roślin i biotechnologii środowiskowej.
Po uzyskaniu wymaganej liczby punktów, wykonaniu i napisaniu
pracy dyplomowej oraz egzaminie dyplomowym, absolwenci
uzyskują tytuł licencjata biotechnologii. Następnie mogą
kontynuować studia stacjonarne magisterskie (II stopnia).
Zasady rekrutacji:
Studia stacjonarne I stopnia
Nowa matura
Konkurs świadectw dojrzałości: punktowany wynik z biologii.
Stara matura
Egzamin pisemny: test z biologii.
Matura międzynarodowa
Zasady przyjmowania kandydatów posiadających dyplom matury
międzynarodowej (International Baccalaureate) wydany przez
Biuro IB w Genewie.
6
Studia stacjonarne II stopnia
Warunkiem ubiegania się o przyjęcie jest ukończenie studiów
I stopnia z biotechnologii lub studiów I stopnia/magisterskich na
kierunkach: biologia, mikrobiologia, ochrona środowiska.
Kwalifikacja na podstawie konkursu ocen na dyplomie.
Absolwenci naszego Instytutu mogą pracować w różnorodnych
laboratoriach naukowych, naukowo-wdrożeniowych,
diagnostycznych i przemysłowych. Instytut Biotechnologii KUL
skupia naukowców z wielu dziedzin nauk biologicznych
i chemicznych. Obecnie strukturę Instytutu tworzy pięć zespołów
naukowo-badawczych dysponujących wysokim potencjałem
intelektualnym i nowoczesną aparaturą naukową. Aby zapewnić
właściwe kształcenie biotechnologów uniwersytet posiada
nowoczesne zaplecze dydaktyczno-technologiczne, które w roku
akademickim 2011/2012 wzbogacone zostało o nowoczesny i dobrze
wyposażony w nowoczesną aparaturę naukowo-badawczą gmach
Instytutu.
7
3. Katedra Biologii Molekularnej
Kierownik – prof. dr hab. Ryszard Szyszka
Pracownicy:
dr hab. Danuta Kruszewska,
prof. KUL
dr hab. Hieronim Golczyk,
adiunkt
dr inż. Andrea Baier, adiunkt
dr Kamila Filipiak, asystent
dr Monika Jach, adiunkt
dr Monika Janeczko, asystent
dr Elżbieta Kochanowicz,
asystent
dr Konrad Kubiński, adiunkt
dr Maciej Mastyk, adiunkt
dr Marek Pilecki,
starszy wykładowca
dr Ewa Sajnaga, adiunkt
dr Robert Świder, asystent
mgr Ewa Alikowska, asystent
mgr Jarosław Ludian,
starszy referent techniczny
Pracownicy Katedry (od lewej): Ryszard Szyszka, Marek Pilecki,
Elżbieta Mazur, Rafał Zieliński, Ewa Sajnaga, Konrad Kubiński,
Monika Janeczko, Katarzyna Domańska
Od momentu powstania Instytutu Biotechnologii w ramach
katedry działają trzy grupy badawcze, których działalność
wypunktowano poniżej. Katedra wyposażona jest
w wyspecjalizowane pomieszczenia takie jak chłodnie (+4°C),
pokoje termostatowane, pracownia izotopowa. Pracownie te
8
wyposażone są w wysokiej jakości specjalistyczną aparaturę
naukową, taką jak: ultrawirówka i chłodzone wirówki
szybkoobrotowe, miniwirówki szybkoobrotowe, aparat do
wysokosprawnej chromatografii cieczowej HPLC/FPLC Äkta
Purifier, chromatografy do klasycznej chromatografii cieczowej,
wytrząsarkę termostatowaną do prowadzenia hodowli płynnych,
urządzenia do elektroforezy jedno- i dwukierunkowej, rozdziału
elektroforetycznego białek i DNA, techniki transferu
elektroforetycznego półsuchego i izoelektroogniskowania, aparaty do
prowadzenia reakcji PCR i RT PCR, autoklawy laboratoryjne,
komory laminarne, spektrofotometry, cytometr przepływowy, liczniki
scyntylacyjne i inne. Działalność badawcza katedry skupia się
w zakresie szeroko pojętej enzymologii.
Pracownie działające w ramach Katedry to:
Laboratorium Modelowania Molekularnego i Syntezy
Organicznej
Tematyka naukowa:
Projektowanie leków
Poszukiwanie nowych molekularnych celów terapeutycznych
Realizacja projektu „Inhibitory kinazy CK2”
Realizacja projektu „Inhibitory Sulfatazy Steroidowej”
Badania nad białkiem Syntazy tymidylanowej oraz szlaku syntezy
tymidylanu
Współpraca naukowa:
San Pablo CEU University
University of Cologne
Politechnika Gdańska
National Academy of Science, Ukraine – Institute of Cell Biology
Gdański Uniwersytet Medyczny
ADAMED, Pieńków k/Warszawy.
Lipopharm.pl
9
Pracownia Biochemii Białek i Enzymologii
Tematyka naukowa:
Badanie struktury, funkcji i regulacji kinaz białkowych (kinazy
białkowej CK2 i PKC)
Poszukiwanie modulatorów CK2 o znaczeniu antynowotworowym
Badanie wybranych enzymów systemu replikacyjnego wirusa
HCV
Inhibitory NTPazy/helikazy HCV jako potencjalne środki
antywirusowe.
Współpraca naukowa:
University of Maryland, Baltimore County, Baltimore, USA
Prof. dr hab. Zygmunt Kazimierzuk, SGGW; Instytut Medycyny
Doświadczalnej i Klinicznej PAN
Babita Agrawal, PhD, Univ. of Alberta, Edmonton, Canada
Sophia Kouyanou-Koutsoukou, PhD, National and Kapodestrian
University of Athens, Greece
Andriy Golub, PhD, Department of Combinatorial Chemistry,
Institute of Molecular Biology and Genetics of NAS of Ukraine,
Kyiv, Ukraine
Rostyslav Stoika, PhD, National Academy of Science, Ukraine –
Institute of Cell Biology
ADAMED, Pieńków k/Warszawy.
Pracownia Cytogenetyki Molekularnej
Tematyka naukowa:
Badania cyto-molekularne nad strukturą i organizacją genomu
eukariotycznego oraz nad przebiegiem cyklu komórkowego.
Opracowanie mapy genetycznej i poznanie struktury kariotypu/
chromosomów wybranych roślin medycznych/przemysłowych
jako element niezbędny dla programów genetycznego ulepszania
odmian/ras pod kątem ich użyteczności w przemyśle
farmaceutycznym lub kosmetycznym.
10
Badania nad chromosomową mutagenezą i zaburzeniami cyklu
komórkowego zachodzącymi spontanicznie i spowodowanymi
czynnikami zewnętrznymi, w tym skażeniem środowiska.
Zastosowanie technik mikroskopii fluorescencyjnej w badaniu
fosforylacji białek cytoplazmatycznych i jądrowych in vivo
w komórkach drożdży, liniach komórkowych/tkankach
nowotworowych oraz w komórkach roślinnych. Badania mają
znaczenie dla wyjaśnienia roli fosforylacji kluczowych białek
w cyklu komórkowym, m.in. dla opracowania inhibitorów kinazy
białkowej CK2.
Współpraca naukowa:
Instytut Fizjologii Molekularnej Roślin Maxa Plancka
w Poczdamie-Golm
Laboratorium Cytogenetyki i Cytometrii Instytutu Botaniki
Eksperymentalnej w Ołomuńcu
Biocentrum Uniwersytetu Ludwika Maksymiliana w Monachium
Zakład Biologii Komórkowej i Genetyki na Uniwersytecie Alcalá
de Henares w Madrycie
Realizowane w ramach katedry projekty naukowe i ekspertyzy:
1. Inhibitory kinaz białkowych jako potencjalne leki
przeciwnowotworowe i przeciwwirusowe, PBZ-MIN-
014/P05/2004 - 2005-2008,
2. Inhibition of HCV as an Opportunistic HIV Coinfection. National
Institute of Health, Bethesda, USA, No. 1R01GM087738-01A1,
2009,
3. ONCO - 3CLA – biotechnologiczny, kierowany lek przeciw-
nowotworowy (od 2012)
4. Realizacja projektu offsetowego Ministerstwa Gospodarki
„Projektowanie, synteza i badanie właściwości inhibitorów kinazy
CK2 jak i receptorów estrogenu” w latach 2009-2011,
5. Realizacja grantu NCN „Inhibitory Sulfatazy Steroidowej” na lata
2012-2015,
6. Projekt badawczy PARP pt. „Suplementy diety na bazie drożdży
Yarrowia lipolytica” (od 2012).
11
Publikacje Katedry Biologii Molekularnej
1. Baier A., Alikowska E., Szyszka R. 2015. Yeast Asf1 protein as
modulator of protein kinase CK2 activity. In: Ahmed K, Issinger
O-G, Szyszka R. (Eds.). Protein Kinase CK2 Cellular Function in
Normal and Disease States. Advances in Biochemistry in Health
and Disease 12. Springer International Publishing. DOI
10.1007/978-3-319-14544-0.
2. Demkowicz S, Kozak W, Daśko M, Masłyk M, Kubiński K,
Rachon J. 2015. Phosphate and Thiophosphate Biphenyl Analogs
as Steroid Sulfatase Inhibitors. Drug Development Research,
DOI: 10.1002/ddr.21245.
3. Kozak W, Daśko M., Wołos A, Masłyk M, Kubiński K,
Składanowski A., Misiak M., Rachon J., Demkowicz S. 2015.
Synthesis and steroid sulfatase inhibitory activities of N-alkanoyl
tyramine phosphates and thiophosphates. RSC Advances 5 (41):
32594-32603. DOI: 10.1039/C5RA01614B.
4. Zapico JM, Puckowska A, Filipiak K, Coderch C, de Pascual-
Teresa B, Ramos A. 2015. Org Biomol Chem. Design and
synthesis of potent hydroxamate inhibitors with increased
selectivity within the gelatinase family. 13(1):142-56. DOI:
10.1039/C4OB01516A.
5. Fabre B, Filipiak K, Díaz N, Zapico JM, Suárez D, Ramos A, de
Pascual-Teresa B. 2014. An integrated computational and
experimental approach to gaining selectivity for MMP-2 within
the gelatinase subfamily. Chembioche 15(3):399-412.
6. Filipiak K, Kubiński K, Hellman U, Ramos A, de Pascual-Teresa
B. 2014. Human protein kinase CK2 phosphorylates matrix
metalloproteinase 2 and inhibits its activity. Chembiochem
15(13):1873-6.
7. Filipiak K, Hidalgo M, Silvan JM, Fabre B, Carbajo RJ, Pineda-
Lucena A, Ramos A, de Pascual-Teresa B, de Pascual-Teresa S.
2014. Dietary gallic acid and anthocyanin cytotoxicity on human
fibrosarcoma HT1080 cells. A study on the mode of action. Food
Funct. 5(2):381-9.
8. Fuentes I., Stegemann S., Golczyk H., Karcher D., Bock R. 2014.
Horizontal genome transfer as an asexual path to the formation of
new species. Nature 511: 232-235. DOI: 10.1038/nature13291.
12
9. Golczyk H., Massouh A., Greiner S. 2014. Translocations of
chromosome end-segments and facultative heterochromatin
promote meiotic ring formation in evening primroses. Plant Cell
26: 1280-1293. DOI: 10.1105/tpc.114.122655.
10. Golczyk H., Greiner S., Wanner G., Weihe A., Bock R, Börner T.,
Herrmann R.G. 2014. Chloroplast DNA in mature and senescing
leaves - a reappraisal. Plant Cell 26: 847-854. DOI:
10.1105/tpc.113.117465.
11. Kozak W, Daśko M., Masłyk M., Pieczykolan J.S., Gielniewski
B., Rachon J., Demkowicz S. 2014. Phosphate tricyclic coumarin
analogs as steroid sulfatase inhibitors: synthesis and biological
activity. RCS Adv 4 (84): 44350-44358.
12. Pieczykolan JS, Kubiński K, Masłyk M, Pawlak SD, Pieczykolan
A, Rózga PK, Szymanik M, Gałązka M, Teska-Kamińska M,
Zerek B, Bukato K,Poleszak K, Jaworski A, Strożek W, Swider R,
Zieliński R. 2014. AD-O53.2-a novel recombinant fusion protein
combining the activities of TRAIL/Apo2L and Smac/Diablo,
overcomes resistance of human cancer cells to TRAIL/Apo2L,
Invest New Drugs 32 (6), 1155-1166.
13. Ward DN, Talley DC, Tavag M, Menji S, Schaughency P, Baier
A, Smith PJ. UK-1 and structural analogs are potent inhibitors of
hepatitis C virus replication. 2014. Bioorg Med Chem Lett.
15;24(2):609-12.
14. Zhang N, Zhang P, Baier A, Cova L, Hosmane RS. 2014. Dual
inhibition of HCV and HIV by ring-expanded nucleosides
containing the 5:7-fused imidazo[4,5-e][1,3]diazepine ring
system. In vitro results and implications. Bioorg Med Chem Lett.
24(4):1154-7.
15. Fabre B, Filipiak K, Zapico JM, Díaz N, Carbajo RJ, Schott AK,
Martínez-Alcázar MP, Suárez D, Pineda-Lucena A, Ramos A, de
Pascual-Teresa B. 2013. Progress towards water-soluble triazole-
based selective MMP-2 inhibitors. Org Biomol Chem.
14;11(38):6623-41.
16. Golczyk H. 2013. Cytogenetics of Tradescantia spathacea (syn.
Rhoeo spathacea): A review. Annales Universitatis Marie Curie-
Skłodowska. Sectio C 68 (1): 39-53. DOI: 10.2478/v10067-012-
0023-y.
13
17. Hartjen P, Höchst B, Heim D, von der Kammer H, Lucke J,
Reinholz M, Baier A, Smeets R, Wege H, Borowski P, Schulze
Zur Wiesch J. 2013. The NTPase/helicase domain of hepatitis C
virus nonstructural protein 3 inhibits protein kinase C
independently of its NTPase activity. Cell Mol Biol Lett.
18(3):447-58. DOI: 10.2478/s11658-013-0099-7.
18. Jach M., Łoś R., Maj M., Malm A. (2013) Probiotics –
technological and manufacturing aspects. Post. Mikrobiol. 52,
2,161-170.
19. Jach M., Sajnaga E., Kozak E., Malm A. 2013. Use of yeasts for
prevention and therapy. Curr. Issues Pharm. Med. Sci. , 26 (2),
198-202.
20. Sajnaga E., Jach M., Szyszka R. 2013. Biopierwiastki Sn, Mn, I,
Cr, Zn, Cu, Fe – funkcje biologiczne, zapotrzebowanie i
suplementacja. Drożdże wzbogacone minerałami. W: Na
pograniczu chemii i biologii, H. Koroniak i J. Barciszewski
(wyd). Wyd. Naukowe UAM, Poznań
21. Demkowicz S., Filipiak K., Maslyk M., Ciepielski J., de Pascual
Teresa S, Martín-Santamaría S, de Pascual-Teresa B, Ramos A.
2013. New Clicked Full Agonists of the Estrogen Receptor, RSC
Adv.: 3, 3697-3706.
22. Sajnaga E., Szyszka R., Kubiński K. 2013. Site-directed
mutagenesis in the research of protein kinases – the case of
protein CK2. W: Genetic manipulation of DNA and protein, D.
Figurski (Ed.). In Tech, 133-166.
14
15
4. Katedra Bionanomateriałów
Kierownik - prof. dr hab. Piotr Staszczuk
Pracownicy:
dr Ludomir Kwietniewski, adiunkt
mgr Magdalena Rycyk, asystent
mgr Paweł Adamek, asystent
dr Beata Jazurek-Zenatti, adiunkt
Pracownicy Katedry: (od lewej) dr Ludomir Kwietniewski, mgr
Magdalena Rycyk, prof. Piotr Staszczuk, mgr Dagmara Zimmerman,
mgr Paweł Adamek
16
Tematyka naukowa:
Otrzymywanie, badania właściwości fizykochemicznych (m. in.
adorpcyjnych i porowatości) oraz zastosowanie nanomateriałów w
zaawansowanej technologii:
materiały tlenkowe, materiały węglowe (m. in. ZnO, Ag, nanorurki
węglowe, fulereny, grafen)
materiały organiczne (leki) i polimerowe (kompozyty)
adsorbenty modyfikowane proteinami i enzymami (powierzchnie
inteligentne, tzw. smart surfaces)
kompozyty naturalne, mineralne, polimerowe, metalowe
określanie aktywności biologicznej substancji metodą
chromatograficzną
badanie mechanizmu retencji w RP-HPLC
Stosowane techniki pomiarowe:
Analiza termiczna TG, DTA, Q-TG, Q-DTA (aparat Derivatograph Q-
1500D z programem Derivat), DSC oraz metody łączone, sorptomat,
AFM, EDX, metody próżniowe, chromatografia gazowa i cieczowa
HPLC.
Współpraca naukowa:
Dr. D. Sternik, dr. M. Błachnio, UMCS, Lublin
Dr. G.W. Chądzyński, Politechnika Wrocławska
Dr. E. Kowalska, Instytut Elektroniki, Warszawa
Prof. V. Tertykh, National Academy of Science, Ukraine
Dr. V.V. Kutarov, Odessa University, Ukraine
Prof. R. Gladyshevskii, Lviv University, Ukraine
Dr. R.A. Zeigler, NASA, Huston, USA
Prof. E. Robens, Mainz University, Germany
Dr. S.A.A. Jayaweera, Tessidee University, England
Prof. Y.X. Zhu, Beijing University, China
17
Publikacje Katedry Bionanomateriałów:
1. P. Staszczuk, D. Zimmerman-Rysz, Studies of modified carbon
nanotubes by means of thermogravimetry Q-TG and sorptometry
techniques, J. Therm. Anal. & Cal., DOI 10.1007/s10973-014-
4209-1, vol. 118, Issue 2, pp. 1101-1110, 2014.
2. P. Staszczuk, M.Rycyk, Studies of Adsorption and Total
Heretogeneity Properties of Pure and Modified Carbon Nanotube
Surfacs, J. Thermal Anal.& Cal., DOI:10.1007/s10973-013-3164-
6, vol. 114, Issue 3, pp. 1125-1133, 2013.
3. G.W. Chądzyński, P. Staszczuk, D. Sternik, M. Błachnio, Studies
of physicochemical properties and fractal dimensions od MgB2
superconductor surface, J. Therm. Anal. & Cal., vol. 108(3), 2012,
985-989.
4. P. Staszczuk, Thermogravimetry Q-TG Studies of Surface
Properties of Lunar Nanoparticles, J. Thermal Anal.&Cal., vol.
106, no2, 2011, 853-857, DOI 10.1007/s10973-011-1765-5.
5. L. Kwietniewski, The Effect of the Chain Lenght of Bonded
Phase of Retention of Aromatic Solutes in RP LC with Pure
Water as Mobile Phase, J. Liquid Chromatogr. & Rel. Techn.,
33(20), 2010, 1854-1870.
6. L. Kwietniewski, Determination of Solute Retention in RPLC
with Pure Water as Effluent Using a Numerical Method Based on
the Ościk's Equation,J. Liquid Chromatogr. & Rel. Techn, 33(3),
2010, 305-323.
7. P. Staszczuk, D. Sternik, Guest Editors, Conference Issue
(Proceedings): 32nd
International Vacuum Microbalance and
Theremoanalytical Techniques Conference, Kazimierz Dolny,
Poland, June 22-24, 2009, J. Thermal Anal.& Cal., vol. 101, no.2.,
2010, 720-807.
8. P. Staszczuk, D. Sternik, Preface, J. Thermal Anal.& Cal.,
vol.101, no.2, 2010, 723-724.
18
5. Katedra Fizjologii i Biotechnologii Roślin
Kierownik – dr hab. Ewa Skórzyńska-Polit, prof. KUL
Pracownicy:
dr Aleksandra Seta-Koselska, adiunkt
mgr Agnieszka Betlej, asystent
mgr Paweł Patrzylas, asystent
mgr Mariusz Spaczyński, asystent
Pracownicy Katedry (od lewej): Aleksandra Seta-Koselska,
Agnieszka Betlej, Ewa Skórzyńska-Polit, Mariusz Spaczyński, Paweł
Patrzylas.
Katedra została powołana decyzją Senatu KUL w marcu 2009 r.
Kierownictwo Katedry zostało powierzone nowozatrudnionej dr hab.
Ewie Skórzyńskiej-Polit, zaś pierwszych dwoje asystentów zostało
zatrudnionych od września 2009 r. Cała trójka weszła do pustych
tymczasowych pomieszczeń Katedry, gdzie zaczęli organizowanie od
19
podstaw laboratorium fizjologii i biotechnologii roślin. W 2010 roku
została zorganizowana Pracownia fizjologii roślin (rozbudowana
następnie o pracownię biotechnologii roślin), a od 2011 roku działa
już Pracownia roślinnych kultur in vitro.
Tematyka badawcza w Katedrze dotyczy:
roślinnych substancji biologicznie czynnych,
metabolicznej i molekularnej odpowiedzi roślin na abiotyczne
czynniki stresowe.
W Pracowni roślinnych kultur in vitro prowadzone są badania nad
optymalizacją warunków hodowli i rozwoju w warunkach in vitro
roślin z rodziny Asteraceae (rudbekia, aksamitka), Phaseolus
coccineus odm. Jaś Piękny, oraz lnu zwyczajnego (Linum
usitatissimum L.). Prace mają na celu otrzymanie sterylnych
i wolnych od patogenów roślin, jak również kultur komórkowych
i tkankowych, wykorzystywanych następnie jako materiał wyjściowy
do badań nad pozyskiwaniem metabolitów wtórnych oraz badań
reakcji roślin na czynniki stresowe prowadzonych w Pracowni
fizjologii i biotechnologii roślin. Metabolity wtórne uzyskane z roślin
w warunkach in vitro będą mogły znaleźć zastosowanie jako leki,
środki ochrony roślin, naturalne inhibitory bądź stymulatory wzrostu
innych roślin i mikroorganizmów.
W Pracowni fizjologii roślin prowadzone są obecnie badania nad
mechanizmami obronnymi u roślin wyższych. Poznanie na poziomie
molekularnym odpowiedzi roślin na działanie czynników stresowych
ułatwi pracę nad naturalnymi biopreparatami wykorzystującymi
roślinne substancje biologicznie czynne.
W latach 2009-2014 r. w Katedrze pod opieką pracowników,
dwanaście osób uzyskało tytuł magistra oraz dwadzieścia sześć
obroniło prace licencjackie.
Aparatura naukowo-badawcza:
komora laminarna ESCO FCZ-4A1, autoklaw, szafy fitotronowe,
zestawy do elektroforezy poziomej i pionowej, aparat do wizualizacji
żeli Fusion FX7, termocykler do PCR Biometra, zestaw do blottingu,
inkubator CO2, spektofotometr UV-VIS Jasco z przystawką
termostatowaną, wagi analityczne, wytrząsarki, urządzenia
chłodnicze, wirówki, naczynie Dewara
20
Współpraca z ośrodkami krajowymi i zagranicznymi:
Wydział Biologii i Biotechnologii UMCS (Lublin),
Instytut Botaniki, Uniwersytet Jagielloński (Kraków),
Instytut Agrofizyki PAN (Lublin).
Realizowane w ramach katedry projekty naukowe:
1. Udział wodoronadtlenków kwasów tłuszczowych w reakcjach
nadwrażliwości (HR) u roślin wyższych – grant wewnętrzny
KUL.
2. Wyprowadzenie hodowli zawiesinowej Linum usitatissimum (L) –
grant wewnętrzny KUL
3. Wpływ egzogennych elicytorów na syntezę lignanów u lnu Linum
usitatissimum (L.) – grant wewnętrzny KUL
4. Wpływ elicytorów na aktywność enzymów zaangażowanych w
reakcje obronne u roślin – grant wewnętrzny KUL
5. Zmiany aktywności enzymów szlaku fenylopropanoidowego w
komórkach lnu Linum usitatissimum (L.) pod wpływem estru
metylowego kwasu jasmonowego (MeJA) oraz kwasu
salicylowego (SA) – grant wewnętrzny KUL
6. Wpływ kwasu giberelinowego (GA3) oraz kwasu abscysynowego
(ABA) na aktywność enzymów syntezy związków fenolowych w
komórkach lnu Linum usitatissimum (L.) – grant wewnętrzny
KUL
7. Elementy PCD u roślin wyższych w stresie metali ciężkich – grant
wewnętrzny KUL
8. Mitochondria roślinne – marker toksycznego oddziaływania
jonów metali? – grant wewnętrzny KUL
9. Zmiany aktywności enzymatycznych czynników anty-
oksydacyjnych w czasie śmierci komórki w warunkach stresu
metali ciężkich – grant wewnętrzny KUL
10. Zmiany w poziomie nieenzymatycznych czynników
antyoksydacyjnych w czasie śmierci komórki w warunkach stresu
metali ciężkich – grant wewnętrzny KUL
11. Aktywność SOD w obecności melatoniny i w warunkach stresu
abiotycznego u roślin wyższych – grant wewnętrzny KUL
12. Optymalizacja warunków hodowli in vitro aksamitki rozpierzchłej
(Tagetes patula L.) i aksamitki drobnej (Tagetes minuta) – grant
21
wewnętrzny KUL
13. Aktywność wybranych czynników antyoksydacyjnych u rudbekii
w odpowiedzi na Cd – grant wewnętrzny KUL
Wykaz publikacji:
1. Koselski M., Dziubinska H., Seta-Koselska A., Trebacz K. 2015,
A nitrate-permeable ion channel in the tonoplast of the moss
Physcomitrella patens. Planta DOI 10.1007/s00425-015-2250-3
2. Seta-Koselska A., Szczuka E., Spaczyński M., Skorzynska-Polit
E. 2015, Activity and localization of lipoxygenase in the ovule of
Larix kaempferi (Lamb.) Carr. during megasporogenesis, Plant
Growth Regulation 76:177-186
3. Seta-Koselska A., Szczuka E., Skórzyńska-Polit E., Domaciuk
M., Giełwanowska I. 2014, Roadside larch trees (Larix Mill.) and
its female generative organs as a biomonitor of air pollution. Pol.
J. Environ. Stud. 23: 867-874.
4. Patrzylas P., Seta-Koselska A., Spaczyński M., Betlej A.,
Skórzyńska-Polit E. 2014 .Autofagia u roślin w warunkach stresu
Postępy Biologii Komórki 41:445-462.
5. Spaczyński M., Seta-Koselska A., Patrzylas P., Betlej A.,
Skórzyńska-Polit E. 2012. Phytodegradation and biodegradation
in rhizosphere as efficient methods of reclamation of soil
contaminated by organic chemicals, Acta Agrophysica 19:155-
169.
6. Seta-Koselska A., Skórzyńska-Polit E., Betlej A., Patrzylas P.,
Spaczyński M. 2011. Pochodne kwasu jasmonowego w terapii
przeciwnowotworowej. [w] Na pograniczu chemii i biologii, H.
Koroniak, J. Barciszewski (Eds.), T. XXVI. Wydawnictwo
Naukowe UAM, Poznań, pp. 515-531.
7. Drążkiewicz M., Skórzyńska-Polit E., Krupa Z. 2010. Effect of
BSO-supplemented heavy metals on antioxidant enzymes in
Arabidopsis thaliana. Ecotoxicol. Environ. Saf. 73:1362-1369.
8. Patrzylas P., Skórzyńska-Polit E. 2010. Programowana śmierć
komórek roślinnych jako efekt działania czynników stresowych.
[w] Na pograniczu chemii i biologii, H. Koroniak, J. Barciszewski
(Eds.), T. XXIV. Wydawnictwo Naukowe UAM, Poznań, pp. 281-
315.
9. Seta-Koselska A., Skórzyńska-Polit E. 2010. Metabolizm
22
wodoronadtlenków kwasów tłuszczowych w szlaku
lipooksygenazowym u roślin wyższych. [w] Na pograniczu
chemii i biologii, H. Koroniak, J. Barciszewski (Eds.), T. XXIV.
Wydawnictwo Naukowe UAM, Poznań, pp. 517-537.
10. Skórzyńska-Polit E. Drążkiewicz M., Krupa Z. 2010. Lipid
peroxidation, anthocyanin content and activity of glutathione-S-
transferase in Arabidopsis thaliana under Cd and Cu stress. Acta
Physiol. Plant., 32:169-175.
11. Skórzyńska-Polit E. 2009. The apoplast -external barrier of plant
cell to biotic and abiotic stress (in above -ground part of plant)
[in] Compartmentation of responses to stress in higher plants, true
or false. Maksymiec W. (Ed.), Transworld Research Network,
ISBN: 978-81-7895-422-6, pp. 1-18.
12. Skórzyńska-Polit E. 2009. Lipoksygenaza roślinna – enzym
użyteczny w biotechnologii? [w] Na pograniczu chemii i Biologii,
tom XXII. Koroniak H., Barciszewski J. (Eds.), Wydawnictwo
Naukowe UAM, Poznań, pp. 177-193.
13. Seta A., Skórzyńska-Polit E., Szczuka E., Giełwanowska I. 2009.
Lipoksygenaza w komórkach roślinnych – budowa i funkcja. Post.
Biol. Kom., 36:69-83.
23
6. Katedra Fizjologii Zwierząt i Toksykologii
Kierownik – dr hab. Anna Rymuszka
Pracownicy:
dr Anna Sierosławska, starszy wykładowca
dr Adam Bownik, adiunkt
mgr Agnieszka Welman, starszy referent techniczny
Anna Rymuszka Anna Sierosławska Adam Bownik
Agnieszka Welman
Katedra Fizjologii Zwierząt i Toksykologii została utworzona
w 1992 r., początkowo jako Katedra Biologii Ogólnej, z inicjatywy
prof. dr hab. Marii Studnickiej.
Dn. 1 października 2009 roku Katedra weszła w skład
utworzonego w ramach Wydziału Matematyczno-Przyrodniczego
Instytutu Biotechnologii, a następnie, w roku 2012, wraz z całym
Instytutem Biotechnologii, została przeniesiona do nowo
24
utworzonego Wydziału Biotechnologii i Nauk o Środowisku.
W chwili obecnej tematyka badawcza Katedry obejmuje zagadnienia
związane z immunobiotechnologią, cytofizjologią i toksykologią
molekularną.
W latach 2009-2014 r. w Katedrze pod opieką pracowników,
powstały 23 prace magisterskie, a 35 osób obroniło prace
licencjackie.
Pracownie działające w ramach Katedry to:
Laboratorium Ekotoksykologii
W pracowni wykonywana jest identyfikacja jakościowa
i ilościowa różnego typu związków w próbkach biologicznych
i środowiskowych (HPLC, ELISA). Wykonywane są również
oznaczenia stopnia toksyczności ksenobiotyków za pomocą
biotestów (rośliny, wodne bezkręgowce, glony).
Wyposażenie pracowni stanowi:
chromatograf cieczowy Prominence Shimadzu, system szybkiego
odparowywania próbek w strumieniu azotu RapidVap LABCONCO,
spektrofotometr UV-Vis z przystawką na długie kuwety, fitotron,
myjka ultradźwiękowa Ultron U-505, homogenizator
ultradźwiękowy Omni Ruptor 4000, urządzenia chłodnicze
Pracownia cytologii
W pracowni prowadzone są prace w zakresie oceny
genotoksycznego oddziaływania substancji różnego pochodzenia
z użyciem komórek prokariotycznych i eukariotycznych.
Wykonywane są takie badania, jak test Amesa, test umuC, test
kometkowy, test mikrojądrowy.
Wyposażenie pracowni stanowi:
komora laminarna Hereus, spektrofotometr UV-Vis BioRad,
SmartSpec, kołyska laboratoryjna z inkubatorem Heidolph Inkubator
1000, zestaw do elektroforezy Comet Assay, inkubator Heraeus,
inkubator z wytrząsarką StatFax 2 200, Inkubator z wytrząsaniem SI-
45, cieplarka laboratoryjna Salvislab Incucenter IC80, inkubator CO2
LabLine, urządzenia chłodnicze
25
Pracownia hodowli komórkowych
W pracowni utrzymywane są hodowle komórek linii stałych oraz
hodowle pierwotne komórek uzyskiwanych z tkanek zwierząt
kręgowych. Możliwe jest również bankowanie komórek w ciekłym
azocie.
Wyposażenie pracowni stanowi:
komora laminarną ESCO Infinity, klasa II BIOHAZARD,
wyposażona w filtr SULPA, inkubator CO2 Mini Galaxy A, wirówka
z chłodzeniem MPW 370, mikroskop odwrócony Olympus, łaźnia
wodna, autoklaw HG-50, naczynie Dewara Air Liquide GT11,
lodówka
Laboratorium cytofizjologii z pracownią mikroskopową
W pracowni wykonywane i analizowane są różnego typu
preparaty mikroskopowe, w tym wybarwiane fluorescencyjnie.
Prowadzone są analizy w zakresie szerokiej gamy parametrów
biochemicznych płynów biologicznych. Możliwa jest ocena
różnorodnych parametrów cytofizjologicznych z zastosowaniem
technik opartych o pomiar luminometryczny/fluorymetryczny/
spektrofotometryczny. Izolowany jest materiał genetyczny (DNA,
RNA) do dalszej analizy. Wykonywany jest rozdział
elektroforetyczny białek.
Wyposażenie pracowni stanowią:
mikroskop fluorescencyjny odwrócony Nikon Eclipse Ti, mikroskop
fluorescencyjny Nikon Eclipse 80i, czytnik FluoStar Omega czytnik
mikropłytek o funkcjach spektrofotometru, luminometru
i fluorymetru, komora laminarna FASTER TWO, fluorescencyjny
licznik komórek NucleoCounter, urządzenie do izolacji kwasów
nukleinowych i białek Maxwell 16, analizator biochemiczny VetTest
8008, zestaw do elektroforetycznego rozdziału białek (Western-
blotting), waga analityczna Rad-Wag, wytwornica i kruszarka do
lodu, urządzenia chłodnicze
26
Współpraca z ośrodkami krajowymi i zagranicznymi:
University of South Bohemia in Ceske Budejovice, Faculty of
Fisheries and Protection of Waters, South Bohemian Research
Center of Aquaculture and Biodiversity of Hydrocenoses,
Research Institute of Fish Culture and Hydrobiology, Vodnany,
Czech Republic
Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, Katedra Epizootiologii
i Klinika Chorób Zakaźnych
Realizowane w ramach katedry projekty naukowe:
1. Grant NN304306940 Biologiczna ocena toksyczności sinicowych
zakwitów wód w wybranych zbiornikach Lubelszczyzny, 2011-
2013
2. Grant NN303606138 Cytotoksyczne oddziaływanie wybranych
cyjanotoksyn (mikrocystyny-LR oraz anatoksyny-a) na komórki
odpornościowe karpia (Cyprinus carpio L.), 2010-2012
3. Grant N308 02732/2393 Oddziaływanie cyjanotoksyn
(mikrocystyny-LR i anatoksyny-a) na układ odpornościowy
karpia (Cyprinus carpio L.), 2007-2009
4. Badania nad toksycznością zakwitów sinicowych występujących
w zbiornikach wodnych Lubelszczyzny – grant wewnętrzny KUL
5. Ekspertyza zamawiana: Oznaczenie genotoksyczności surowca
kosmetycznego testem Amesa, w ramach umowy z Laboratorium
Kosmetycznym Dr Irena Eris, 2011 r.
Wykaz publikacji:
1. Sieroslawska A., Rymuszka A., Adaszek Ł., 2015. Effects of
cylindrospermopsin on the phagocytic cells of a common carp
(Cyprinus carpio L.). Journal of Applied Toxicology DOI
10.1002/jat.3118 (IF 2013 – 3,174)
2. Sieroslawska A., Rymuszka A., 2015. Effects of
cylindrospermopsin a common carp leucocyte cell line. Journal of
Applied Toxicology 35: 83-89 (IF 2013 – 3,174)
3. Sieroslawska A., Rymuszka A., 2015. Cylindrospermopsin
induces oxidative stress and genotoxic effects in the fish CLC cell
line. Journal of Applied Toxicology 35: 426–433 (IF 2013 –
3,174),
27
4. Sieroslawska A., 2014. Evaluation of usefulness of Microbial
Assay for Risk Assessment (MARA) in the cyanobacterial
toxicity estimation. Environmental Monitoring and Assessment
186:4629-4636 (IF 2013 - 1,679)
5. Sieroslawska A., 2013. Assessment of the mutagenic potential of
cyanobacterial extracts and pure cyanotoxins. Toxicon 74: 76-82
(IF 2013 – 2,581)
6. Rymuszka A., Adaszek Ł., 2013. Cytotoxic effects and changes in
cytokine gene expression induced by microcystin-containing
extract in fish immune cells – an in vitro and in vivo study. Fish
and Shellfish Immunology, 34: 1524-1532 (IF 2013 – 3,32)
7. Rymuszka A., 2012. Microcystin-LR induces cytotoxicity and
affects carp immune cells by impairment of their phagocytosis
and the organization of the cytoskeleton. Journal of Applied
Toxicology, 33(11):1294-302 (IF 2013 – 3,174)
8. Rymuszka A., Adaszek Ł., 2012. Pro-and anti-inflammatory
cytokine expression in carp blood and head kidney leukocytes
exposed to cyanotoxin stress-an in vitro study. Fish and Shellfish
Immunology, 33: 382-388 (IF 2013 – 3,034)
9. Sieroslawska A., Rymuszka A., Velisek J., Pawlik-Skowrońska
B., Svobodova Z., Skowroński T. 2012. Effects of microcystin-
containing cyanobacterial extract on hematological and
biochemical parameters of common carp (Cyprinus carpio L.).
Fish Physiology and Biochemistry, 38: 1159-1167 (IF 2013 –
1,545)
10. Rymuszka A., Sierosławska A. 2011. Effects of neurotoxin –
anatoxin-a on common carp (Cyprinus carpio L.) innate immune
cells in vitro. Neuroendocrinology Letters, 32: 84-88 (IF 2013 –
1,296)
28
7. Katedra Biochemii i Chemii Środowiska
Kierownik - prof. dr hab. Zofia Stępniewska
Pracownicy:
dr Artur Banach, adiunkt
dr Agnieszka Kuźniar, adiunkt
dr Paweł Misztal, asystent
dr Anna Pytlak, adiunkt naukowy
dr Anna Szafranek-Nakonieczna, adiunkt
dr Agnieszka Wolińska, adiunkt
mgr Jakub Ciepielski, asystent
mgr Weronika Goraj, asystent
mgr inż. Andrzej Górski, samodzielny asystent naukowo-techniczny
mgr Anna Sochaczewska, asystent naukowo-techniczny
mgr Renata Sieńko, asystent naukowo-techniczny
Pracownicy Katedry (od lewej): Anna Szafranek-Nakonieczna,
Agnieszka Wolińska, Zofia Stępniewska, Jakub Ciepielski, Anna
Pytlak, Agnieszka Kuźniar, Weronika Goraj, Artur Banach.
29
Badania prowadzone w Katedrze obejmują następujące
zagadnienia:
I. Rozpoznanie potencjału biotechnologicznego mikroorganizmów
uczestniczących w formowaniu (metanogenów) i utlenianiu
(metanotrofów) metanu, w tym:
a. Określenie możliwości biotechnologicznych mikroorganizmów,
występujących w środowisku metanowym lub w obecności
pochodnych metanu (biosynteza i bioremediacja z udziałem
aerobowych metylotrofów; biofiltry metanu).
b. Optymalizację produkcji paliw ciekłych, kwasu
polihydroksymasłowego (PHB) - cennego biodegradowalnego
polimeru, ektoiny - ważnego w medycynie i kosmetyce
aminokwasu oraz witaminy B12 na bazie substratu metanowego
z udziałem aerobowych metanotrofów.
c. Utlenianie metanu przez endofityczne metanotrofy
w ekosystemach torfowiskowych wraz z rozpoznaniem
bioróżnorodności metanotroficznych endofitów, zasiedlających
różne gatunki roślin.
d. Ustalenie optymalnych warunków metanogenezy
z wykorzystaniem różnych podłoży węglowych.
e. Wyznaczenie różnorodności konsorcjów metanogenicznych
i metanotroficznych oraz przynależności filogenetycznej różnych
rodzajów Archea i Proteobakterii, niezwykle ważnych w
asymilacji i transformacji związków węgla (włączenie
najnowszych technik z zastosowaniem mikroskopii SEM, TEM,
FISH oraz zastosowanie programów niezbędnych w analizie
filogenetycznej.
II. Wykorzystanie ektoiny do łagodzenia skutków stresu
temperaturowego, osmotycznego, oksydacyjnego i radiacyjnego na
poziomie komórkowym i organizmów.
III. Określenie pojemności filtru glebowego w okresach
powodziowych i stosowania nawodnień ściekami.
a. Wyznaczenie zmian w składzie mikroflory glebowej jej
żywotności i produktów metabolicznych po wprowadzeniu ze
spływami powierzchniowymi i ściekami: pestycydów, leków,
detergentów lub polimerów.
30
b. Wyznaczenie tempa biodegradacji zanieczyszczeń stałych
i ciekłych oraz określenie aktywności mikroorganizmów w
środowiskach wodnych i glebowych w zmiennych warunkach
aeracji.
c. Wyznaczenie przynależności taksonomicznej (techniki
molekularne) badanych mikroorganizmów.
d. Rozpoznanie czynników działających destrukcyjnie na potencjał
biotechnologiczny ekosystemów lub ograniczających ich
zdolności do buforowania niekorzystnych zmian.
IV. Wykorzystanie roślin wodnych (Azolla caroliniana i Azolla
filiculoides, Lemna sp) oraz roślin energetycznych (Salix americana,
Salix viminalis) w remediacji zanieczyszczeń wywołanych
obecnością metali ciężkich (np. Cd, Ni, Pb, Hg).
V. Tworzenie bioogniw paliwowych, konstruowanych na bazie gleby
wzbogacanej w energetyczne materiały odpadowe (słomę, ścieki,
osady).
VI. Rozpoznanie bioróżnorodności środowisk glebowych z
uwzględnieniem oddziaływań antropogenicznych (w szczególności
rolnictwa) z zastosowaniem najnowszych technik molekularnych i
metagenomiki (DGGE, sekwencjonowanie nowej generacji).
Aparatura naukowo-badawcza:
analizator form węgla (TC, TOC i IC) i azotu całkowitego,(TN)
(TOC-VCSH) (Shimadzu), analizator przepływowy form
biogennych (AA3, Bran&Luebbe), mikroskop fluorescencyjny
(Nicon Eclipse 80i), - spektrometr absorpcji atomowej AAS (Z-8200,
Hitachi), spektrofotometry UV-VIS (UV-1600, Shimadzu) I UV-VIS-
NIR (UV-3600, Shimadzu), chromatografy gazowe ( CP-3800,
Varian; GC2010, Shimadzu), chromatografy gazowy sprzężony z
detektorem masowym GCMS-QP2010Plus, Shimadzu, bioreaktory
(BiostatA plus, Sartorius ), chromatograf cieczowy HPLC (Pro-Star,
Varian), termocyklery (Bio-Rad, Biometria, Sensoquest), zestawy do
elektroforezy (Bio-Rad, Cleaver), DGGE (Bio-Rad), wirówki (Micro
120, Hettich; 3-18R, Sigma), koncentrator próżniowy (RVC 2-18,
Christ), inkubator z wytrzasaniem (Innova 42R, New Brunshiwck
Scientiffic), inkubatory (Memmert, Hereaus, Termaks, Pol-Eko),
31
komory laminarne (Esco), stacja do produkcji ultraczystej wody
(Milli-Q, Millipore), mineralizator (Ethos One, Milestone)
Współpraca z ośrodkami krajowymi i zagranicznymi:
Katedra Mikrobiologii Uniwersytetu w Nijmegen (Holandia)
Instytut Podstaw Biologii RAN (Rosja ),
Purdue Calumet Water Institute, Purdue University (USA),
Lancaster University (Wielka Brytania),
Christian-Albrecht University Kilonia (Niemcy),
Hohenhein University -Stuttgart (Niemcy),
Instytut Ekologii, Karpat Ukraińska Akademia Nauk (Lwów),
Instytut Wykorzystania Zasobów Naturalnych i Ekologii, Mińsk,
Białoruska Akademia Nauk,
Śnieżniczanka
Kopalnia węgla kamiennego „Bogdanka”.
Biowet „Puławy”
Dyrekcja Poleskiego Parku Narodowego
Realizowane w ramach katedry projekty naukowe:
N N305 326939 – 2010-2013 - Rozpoznanie aktywności i próba
identyfikacji bakterii metanotroficznych zasiedlających skały
przywęglowe kopalni Górnośląskiego Zagłębia Węglowego”
N N305 299440 – 2011-2014 - Rola symbiontów
metanotroficznych Sphagnum sp. w obniżeniu emisji metanu w
rejonie Poleskiego Parku Narodowego
IP2010 001070 – 2010-2011 -Wpływ sposobu użytkowania i
warunków hydrologicznych na uruchomienie biogenów i kondycję
roślin w obszarach zalewowych Małopolskiego Przełomu Wisły.
2011/01/N/NZ9/06811- 2011-2012 - Potencjał biotechnologiczny
układu endofitycznego Sphagnum - metanotrofy.
32
Publikacja Katedry
1. Wolińska A., Banach A., Kuźniar A., Stępniewska Z., Kłos M.,
2014. DNA Contents in Soil Contaminated with Heavy Metals.
The Global Environmental Engineers 1, 29-35.
2. Stępniewska Z., Goraj W., Kuźniar A., 2014. Przemiany metanu w
środowiskach torfowych. Leśne Prace Badawcze 75 (1), 101-110.
3. Stępniewska Z., Kuźniar A., Pytlak A., Ciepielski J., 2014.
Ektoina – przeciwstresowa cząsteczka przyszłości. Kosmos 1
(302), 25-35.
4. Wolińska A., Szafranek-Nakonieczna A., Banach A., Rekosz-
Burlaga H., Goryluk-Salmonowicz A., Błaszczyk M.,
Stępniewska Z., Górski A., 2014. Biological degradation of
agricultural soils from Lublin region (SE Poland).
Int.J.Curr.Microbiol.App.Sci 3(11), 558-571.
5. Szafranek-Nakonieczna A., Stępniewska Z., 2014. Aerobic and
anaerobic respiration in profiles of Polesie Lubelskie peatlands.
Int. Agrophysics 28, 219-229.
6. Stępniewska Z., Goraj W., Kuźniar A., Pytlak A., Ciepielski.,
Frączek P., 2014. Biosynthesis of Ectoine by the Methanotrophic
Bacterial Consortium Isolated from Bogdanka Coalmine (Poland).
Applied Biochemistry and Microbiology 50(6), 594-600.
7. Stępniewska Z., Goraj W., Sochaczewska A., Kuźniar A., Pytlak
A., Malec M., 2014. Changes in atmospheric CH4, O3, NO2, SO2
concentration dynamics in Lublin in the years 2007-2009. Acta
Agrophysica 21(3), 361-373.
8. Banach A., Banach K., Stępniewska Z., 2014. Laboratory
feasibility tests improve decision support for wetland eco-
engineering; Lake Bartków Lug (Poland) as test case. Ecological
Engineering 71, 256-267.
9. Pytlak A., Stępniewska Z., Kuźniar A., Szafranek-Nakonieczna
A., Wolińska A., Banach A., 2014. Potential for Aerobic Methane
Oxidation in Carboniferous Coal Measures. Geomicrobiology
Journal 31, 737-747.
10. Wolińska A., Stępniewska Z., Ciepielski J., 2014. Bioelectricity
Production from Soil Using Microbial Fuel Cells. Appl Biochem
Biotechnol. 173(8), 2287-96.
33
11. Bownik A., Stępniewska Z., Skowroński T., 2014. Protective
effects of ectoine on heat-stressed Daphnia magna. J Comp
Physiol B. 184(8), 961-76.
12. Stępniewska Z., Pytlak A., Kuźniar A., 2014. Distribution of the
methanotrophic bacteria in Western part of the Upper Silesian
Coal Basin (Borynia-Zofiówka and Budryk coal mines).
International Journal of Coal Geology 130, 70-78.
13. Stępniewska Z., Sochaczewska A., Goraj W., Kuźniar A.,
Szafranek-Nakonieczna A., 2014 Analiza porównawcza stężenia
metanu ze stacji monitoringu KUL i Kasprowy Wierch w latach
2007-2012. Instytut Podstaw Inżynierii Środowiska PAN Zabrze.
Tom 2, 273-278.
14. Stępniewska Z., Kuźniar A., 2014. Cultivation and detection of
endophytic aerobic methanotrophs isolated from Sphagnum
species as a perspective for environmental biotechnology. AMB
Express 1-9.
15. Bwnik A., Stępniewska Z., Skowroński T., 2014. Effects of
ectoine on behavioural, physiological and biochemical parameters
of Daphnia magna. Comp. Biochem. Physiol. C. 168, 2-10.
16. Stępniewska Z., Pytak A., Kuźniar A. 2013, Methanotrophic
activity in Carboniferous coalbed rocks. International Journal of
Coal Geology 106, 1-10. 17. Rodriguez, J.J.; Filipiak, K.; Maslyk, M.; Ciepielski, J.;
Demkowicz, S.; de Pascual-Teresa, S.; Martin-Santamaria,
S.; de Pascual-Teresa, B.; Ramos, A.; 2012, Towards beta-
selectivity in functional estrogen receptor antagonists;
Organic & Biomolecular Chemistry; 10(36), 7334-7346. 18. Wolińska A., Stępniewska Z., Bułaś A., Banach A. 2012,
Evaluation of Factors Influencing the Biomass of Soil
Microorganisms and DNA Content. Open Journal of Soil Science
2, No.1.
19. Wolińska A., Stępniewska Z., Wołoszyn A. 2012,
Characterization of Microbial Community in Selected Mineral
Soils after Long-Term Storage. Journal of Biodiversity and
Ecological Sciences, 5.
34
Budynek Biotechnologii (wnętrze)
35