İstanbul üniversitesi moleküler biyoloji ve genetik bölümü · pdf...
TRANSCRIPT
BiyoteknolojiBiyoteknoloji SektSektöörrüü
DoDoçç. Dr. Filiz G. Dr. Filiz Güürelrelİİstanbul stanbul ÜÜniversitesiniversitesiMolekMoleküüler Biyoloji ve Genetik Bler Biyoloji ve Genetik Bööllüümmüü
BiyoteknolojiBiyoteknoloji bbiyolojik sistem ve iyolojik sistem ve ssüürereççleri kullanarak sorunlara leri kullanarak sorunlara çöçözzüüm m bulunmasbulunmasıı ve yararlve yararlıı üürrüünler nler üüretilmesidirretilmesidir..
BiyoteknolojininBiyoteknolojinin amacamacııBir yBir yöönnüüyle yatyle yatıırrıımcmcııya para kazandya para kazandıırrıırken; rken; didiğğer yer yöönnüüyle tyle tııptapta, , ziraatteziraatte, hayvanc, hayvancııllııkta, kta, ilailaçç ve gve gııda endda endüüstrisinde bir strisinde bir ççok sorunlara ok sorunlara çöçözzüümler bulunmaktadmler bulunmaktadıır. r.
Biyoteknoloji Sektörü
Sağlık ve Gen Teknolojileri
Tarımsal Biyoteknoloji
Hayvancılık Biyoteknolojisi
Endüstriyel Biyoteknoloji
SaSağğllııkk
Genomikçalışmalar Hücre tedavileri İlaç tasarımları
(Famakogenomik)ilaç
üretimiGenetik tanı
TarTarıımsal msal BiyoteknolojiBiyoteknoloji
TransgenikTransgenik bitkilerbitkiler
Metabolik/FizyolojikDeğişimler
Geliştirme(Islah) Üretim
HayvancHayvancııllııkk
Hayvan Islahı Üretim Yaban/Evcil hay. gen kaynaklarının korunmasıve moleküler tanımlama
Hayvansal ilaçve aşı üretimi
Biyoteknolojide Yeni Alanlar
Biyoçipler Biyoenformatik Biyonanoteknoloji
KonularKonular
√ Biyoteknolojik ilaç üretimleri → ABD, Avrupa Birliği√ Büyük Üreticiler (Big Pharma) ve biyoteknoloji
endüstrisi√ Genom projesi ve patentler√ Tarımsal biyoteknoloji ve GDO’lar
2003’de 46.3 milyar dolarlık global gelirin dağılımı
ABD-%77
Avrupa-%16
Kanada-%4
Asya-%3
ABD:ABD:““Piyasaya dayalPiyasaya dayalıı kendi kendine yeterlilikkendi kendine yeterlilik””
İİngiltere:ngiltere:““BuluBuluşş, deney ve , deney ve ççooğğulculukulculuk””
Japonya, GJaponya, Güüney Kore:ney Kore:““Global stratejik Global stratejik ööğğrenme ve irenme ve işşbirlibirliğğii””
ABDABD--19531953--WatsonWatson--CrickCrick taraftarafıından DNAndan DNA’’nnıın n ççift sarmal yapift sarmal yapııssıı NatureNature’’dadayayyayıınlandnlandıı
19801980: Genlerin ilk kez : Genlerin ilk kez klonlanmasklonlanmasıındanda Herbert Boyer Herbert Boyer veve Stanley Stanley CohenCohen’’ee patent hakkpatent hakkıı verildiverildi
19761976--GenentechGenentech19781978--BiogenBiogen19801980--AmgenAmgen19811981--ImmunexImmunex19811981--ChironChiron19811981--GenzymeGenzyme
Avrupa Birliği2005’de 25 yeni üye katılmıştır. Şirketlerin sayısal olarak dağılımı:
Almanya %22Almanya %22İİngiltere %17ngiltere %17Fransa %11Fransa %11İİsvesveçç %7%7İİsrail %9srail %9İİsvisviççre %5re %5Hollanda %5Hollanda %5Danimarka %5Danimarka %5
Şirket Sayısı 1613 1415Çalışan Sayısı 67530 187500Gelirler 10.4 M Euro 27.2 Milyon EuroARGE Harcamaları %69 %39
Hükümet, “bioregio”, “bioprofile” ve ”biochance” gibi teşvik edici programlarla endüstriyi desteklemektedir.
2005 yılında biyoteknolojiye 802.7Miyon Euro ayrılmıştır (136.5ME sadece genom araştırmaları içindir)
Biyoteknoloji endüstrisi başlıca Bavyera ve Baden Württemberg bölgelerinde gelişmiştir.
Örn. Wilex Biotechnology Şirketi kanserin yayılmasına yol açan spesifik bir proteini durduran ilaç üzerinde çalışıyor.
ALMANYAALMANYA
DDüünya nya üüzerinde 325 milyondan fazla kizerinde 325 milyondan fazla kişşi, 160 i, 160 onaylonaylıı ilailaçç ve ave aşışı geligelişştirilmesinde tirilmesinde ççalalışışmaktadmaktadıır.r.
200200’’den fazla hastalden fazla hastalığıığın tedavisinde n tedavisinde kullankullanıılacak lacak >>350 ila350 ilaçç ve ave aşışı iiççin klinik in klinik denemeler yapdenemeler yapıılma alma aşşamasamasıında.nda.
İİlalaçç SektSektöörrüü : 1980 : 1980 →→ 20042004
BigBig PharmaPharma KavramKavramıı
Bunlar büyük üreticilerdir. Geliri 3 milyar Geliri 3 milyar $$’’ıınn üüzerinde olan ve ARzerinde olan ve AR--GEGE’’yeye ayayıırdrdııklarklarııpay en az 500 milyon pay en az 500 milyon $$ olan ilk 30 olan ilk 30 şşirkettir.irkettir.
“2010 yılında ilaç (farmasötik) araştırmalarının çoğu biyoteknolojişirketleri tarafından yapılacaktır”
Deutche Bank
İİlk 10 lk 10 ŞŞirketin 2004 Gelirleriirketin 2004 Gelirleri
43,0002,3882,50019,380ABDJohnson & Johnson10
50,6003,2361,69719,680ABDAbbott Laboratories9
64,2003,8133,80321,427İNG-İSVEÇAstraZeneca8
62,6005,8134,01022,939İSVMerck & Co.7
64,7035,3444,09825,163İSVHoffmann-La Roche6
81,3925,7674,20728,247İSVNovartis5
96,4396,5264,92731,615FRSSanofi-Aventis4
100,6197,8865,20437,318İNGGlaxoSmithKline3
109,9008,5095,20347,348ABDBristol-Myers Squibb2
115,00011,3617,68452,516ABDPfizer1
ÇalışanSayısı
Net Gelir(Mil$)
ARGE(Mil$)
Brüt Gelir(Mil$)ÜlkeŞirket2004
GeliştirmePazarSatış
Büyük Üreticiler
YatırımFikirler
Biyotek Endüstrisi
DeneyFikrin Kabul EdilmesiTanımlanmasıİlacın üretimiHayvan DeneyleriFormülasyonÜretimKlinik DenemelerYasal Onaylanma SüreciPiyasaya Sunulması
Biyoteknolojik Bir İlacın Geliştirilmesi
$
Terapötiklerin hastalıklara göre dağılımı
Çeşitli %25
Otoimmün %5
Kanser %28
Kalp-damar hast %11
Nöroloji %12Diyabet %3
Enfeksiyonhast %16
Moleküler GenetikGenomik
BiyoteknolojiEndüstrisi
Patent?
Mayıs 2006’da tamamlananinsan genom projesi çağımızın en önemli bilimsel gelişmelerindenbiridir. Proje yoğun bir bilgibirikimi sağlamasının yanısıragenetik temelli bir çok yeniçalışma alanı yaratmış, tıptatanı ve tedaviye bakış açısınıdeğiştirmiştir. Diğer bir deyimle, içinde bulunduğumuz post-genomik çağda artık medikalçalışmalar genom bazlıveritabanları dikkate alınarakyapılacaktır.
GENOMICS
1998’de Perkin-Elmer Corporation tarafından kurulan bu şirketin ilk başkanı Genom Araştırmaları Enstitüsünden (TIGR) Dr. J. Craig Venter idi. Venter ve Hamilton Smith TIGR’de ilk genom projesi Haemophilus influenzaebakterisinin dizi analizini yapan araştırıcılardır.
Genlerin patentlenmesi
Celera başlangıç olarak üzerinde çalıştığı 200-300 genin patentini alacağını yayınladı. Daha sonra bu sayıyı 6500 gen/ gen bölgesi’ne çıkarmıştır. Aynı zamanda “Bermuda antlaşması” kapsamında bu genlerle ilgili bilgileri HGP den daha az sıklıkta olmakla birlikte halka açacağını beyan etmiştir,
Ancak, 2000 yılında ABD hükümeti bu istemin mümkün oImayacağını, halkın genom bilgilerinden serbestçe yararlanması gerektiğini bildirmiştir.
Patent Konusu
♦ Halkın bilgisine sunulmak üzere İnsan Genom Projesi sonucunda elde edilen tüm DNA dizileri anında internetortamındaki veritabanlarına işlenmektedir.
♦ Birleşik Devletler Patent ve Ticari Marka Ofisi (USPTO)’ne göre; bir gen dizisi patentlenemez ancak doğal durumunda herhangi bir canlıdan izole edilmiş bir genin “eğer” başvuran kişi tarafından bir buluş için “özgül, önemli ve güvenilir bir faydası olduğu” gösterilebilirse patent hakkı alabilir.
İnsan Genom Projesi
HAP-MAP Projesi
İnsan Kanser Atlası
Encode projesi
HE Projesi
Hap-MAP Projesi
SNPSNP’’lerinlerin analizi: Etnik farklanalizi: Etnik farklııllııklar,klar,İİnsanlar arasnsanlar arasıı farklar farklar kikişşilerin ilailerin ilaççlara/lara/ççevresel faktevresel faktöörlere yanrlere yanııttıı
Kişiye Özel İlaç ÜretimiHastalıkların Hızlı Tanısı
PerlegenPerlegen ve ve AffymetrixAffymetrix
10 merkezde 5 farklı teknoloji kullanılarak saptanan10 milyon SNP (Ağustos 2006 itibariyle) veritabanına işlenmiş ve
%40’ının polimorfik olduğu belirlenmiştir.Proje kapsamında hedef: 2,000,000 dan fazla ilave SNP nin
Perlegen ve 500 bininin Affymetrix firması tarafından tiplendirilmesidir.
Affymetrix, Sequenom, Illumina
Moleküler GenetikGenomik
BiyoteknolojiEndüstrisi
Silikon üzerinde DNA çipleri, Affymetrix
SNP’leri hızlısaptayan sistemler ve transkriptanalizleri üzerinde çalışmalar yapmaktadırlar.
Sistem geliştirme, örnekler
Applied Biosystems Group Şirketi tarafından- 24 saat içinde 400.000 SNP’yi analiz edebilen birsistem geliştirilmiştir (SNPlex System).
Illumina’nın geliştirdiği -Six human genome- SentrixBeadChip adlı bir sistemle 6 farklı örnekte 48.000 transkriptin analizi yapılabiliyor.
ABD-hedefler
Eğitim sürecinin artırılması
Yasal düzenlemelerin ticareti hızlandırması
Yeni şirketler vemeslekler
Toplumun bilimsel faydalanmasının
yükseltilmesi
BiyoteknolojiBiyoteknoloji ŞŞirketi ve Risklerirketi ve Riskler
BilimselBilimselKlinik Klinik
denemelerdenemeler
ParasalParasal
RekabetRekabet
İİnsannsan
Yasal Yasal DDüüzenlemelerzenlemeler
BilimselBilimsel :: üretilecek ilacın yada tedavi yolunun varolanlardan “daha üstün” olması gerekir.
Parasal:Parasal: Üretime yönelik çalışmalar her zaman tahmin edilenden daha uzun sürmekte ve maliyet yüksek olmaktadır. Bu nedenle maliyeti doğru tahmin etmek, güçlü ortaklar ve sermayeye gereksinim vardır.
Klinik:Klinik: Üretilen ilaç veya tedavi yoluyla ilgili klinik denemelerin kısa zamanda ve belirli bir bütçeyle sonuçlanması şirket açısından önem taşır. .
İİnsan Faktnsan Faktöörrüü: : Etkin bir teknik eleman grubu, bilimsel geçmişi olan ancak parasal ve stratejik konularda uzman bir lider olmalıdır.
Rekabet:Rekabet: Şirketin rekabetle başa çıkabilecek teknik donanımı ve yasal düzenlemeleri bilen danışmaları olması gerekir.
Yasal DYasal Düüzenlemelerzenlemeler: Sınırlı sayıda hedefe yönelik çok sayıda araştırma vardır. Bu nedenle her türlü yararlı fikirleri ve patent haklarını yasal düzenlemeler korur.
Tarımsal Biyoteknoloji
2005 yılında 8 milyar $2010 yılında 25 milyar $
Uzun dönemde 100-150 milyar dolarlık potansiyel ticaret hacmi
Bitkilere DNA transferi
Chilton ve ark. (1977)Fromm ve ark. (1985)John Sanford (1990)
FlavrFlavr--savr domates 1988savr domates 1988
İnvertazKarotenoid içeriğiBitki/Yaprak şekliSüperoksit dizmutazOdun kalitesiBesin kalitesiFarmasötiklerTohumda aa içeriğiNişasta biyosenteziBit. olmayan karbohid.Vazo ömrüOlgunlaşma zamanıCowpea tripsin inhib.Amonyum asimilasyonuFotosentetik özellikler
Kollajen (insan)Depo proteinleriDepo metabolitlerin dağılımı
Sitratİşlenme kalitesiPigment üretimiKitinazKağıt üretimiFosfat metabolizmasıKalkonMalt kalitesiYağ içeriğiDallanma enzimleriÇiçeklenme özelStoma sayısıOksinSindirim kalitesiLignin biyosenteziAsparaginPişme kalitesiEtilen biyosentesiAntimikrobiyal proteinFotosentezKarbohidrat içeriğiAntikorNitrojen asimilasyonuAmino asit metabolizması
ÜRETİMISLAHDEĞİŞİMLER
Kaynak: http://gmoinfo.jrc.it
Tek Yıllık Bitkiler-Muz (Musa spp)-Arpa (Hordeum vulgare)-Duckweed (Lemna spp)-Gladiolus spp-Mısır (Zea mays)-Soğan (Allium sepa)-Ananas (Ananas spp)-Çeltik (Oryza sativa)-Sorgum (Sorghum spp)-Turfgrass -Buğday (Triticum) Patentler: Japon Tob.Inc., Patentler: Japon Tob.Inc.,
Bayer Crop, Paradigm Gen, Bayer Crop, Paradigm Gen, Queensland Univ., Guelph Univ. Queensland Univ., Guelph Univ.
Çift Yıllık Bitkiler-Acacia spp -Pelargonium-Fasulyeler(Phaseolus) - Biber (Piper spp)-Brassica spp -Kavak (Populus spp)-Kakao -Güller (Rosa spp)-Camelina sativa -Soya (Glycine spp)-Carnations -Salatalık -Çilek -Chrysanthemums-Citrus -Şeker pancarı-Kahve (Coffea spp) -Domates-Pamuk (Gossypium spp) -Odunsu bitkiler-Eucalyptus-Gyamopsis spp-kavun (Cucumis spp)-Bezelye (Pisum spp)
Patentler: Patentler: ççeeşşitli itli şşirket ve irket ve üüniversitelerniversiteler
Koniferler-Çam ağaçları
Deniz Algleri
-Fitoplanktonlar-Deniz yosunları (yeşil, kahverengi, kırmızı, mavi-yeşil algler)
-Nori (Porphyra spp)-Gracilaria-Laminaria (Alginat eldesinde)
-Simbiyotik dinoflagellata
Patentler: Northeastern Patentler: Northeastern ÜÜniversitesiniversitesi
Patentler: North Car. Univ., Genesis R&D CorpPatentler: North Car. Univ., Genesis R&D Corp.
Mantarlar (Fungi)-Mantar-Küf
(Organik asit, enzim ve ilaç hammadde üretimi)-Agaricus bisporus-Pleurotus spp-Tuber spp.-Morchella spp
Patentler : Unilever Inc. ve Penn State Univ.Patentler : Unilever Inc. ve Penn State Univ.
√ Yatay gen geçişleri
√ Şirketlerin pazar paylarınıyitirmesi√ Uygun olmayan arazide /
şartlarda tarım
√ Sosyo-ekonomik√ Daha az kimyasal madde kullanımı ile toprak ve suyun korunması
√ Çevresel√ Değişimler (metabolik/fizyolojik)
√ İnsan Sağlığı√ Islah (Sindirim kalitesi, hastalıklara direnç, verim)
OlasOlasıı RisklerRisklerTarTarıımda Neden GDO?mda Neden GDO?
Glyphosate (Roundup®) toleransıolan soya fasulyesi (Monsanto)
Roundup Ready®Toleranslı bitkiler
Roundup Ready®Herbisiti
2006 Global Transgenik Ekim Alanı500 milyon hektar
22 ülkede 10 milyon çiftçi
%57, Soya fasulyesi
%25, Mısır
%13, Pamuk
%5, Kanola
Transgenikbitkiler
Trans. olmayan mısır Böcek dirençli Trans. mısır
20062006
ABDABDArjantinArjantinBrezilyaBrezilyaKanadaKanada
HindistanHindistanÇÇinin
ParaguayParaguay
TransgenikTransgenik ekimiekimi
MonsantoMonsanto
DowDow
DuDu PontPont
SygentaSygenta
AventisAventis
NovartisNovartisPatentlerin Patentlerin %41%41’’ii
Tohum Sektöründeki Şirketlerve Tekelleşme
“ Bol Gıda, Sağlıklı Çevre’
90’lı yıllarda ilk transgenik ürünleri piyasaya sürdü.
100 den fazla ülkede faaliyet
Çok uluslu bir şirket
Yıllık ciro 7.5 milyar dolar, piyasa değeri 29 milyar dolar
Pamuk patentlerinin %89 unu ve buğday patentlerinin %27’sini almıştır.
gergerççekleriekleri
DenetimDenetim
GDO
Birleşmiş Milletler Sanayi Kalkınma Teşkilatı(UNIDO) Birleşmiş Milletler Gıda ve Tarım Örgütü (FAO) Dünya Sağlık Örgütü (WHO)Uluslararası Gen Mühendisliği ve Biyotek Merkezi (ICGEB) Ekonomik İşbirliği ve Kalkınma Teşkilatı (OECD) Birleşmiş Milletler Çevre Programı (UNEP) Biyolojik Çeşitlilik Sözleşmesi (CBD)Uluslararası Hayvan Hastalıkları Ofisi (OIE) Uluslararası Org Tarım Hareketleri Federas. (IFOAM)
Entransfood Projesi, AB; 11.5M Euro
Türkiye ve Biyoteknoloji
Üniversite Şirketler
BiyoteknolojideÖrgütsel Altyapı
Mali DestekKurumları
Kurumsal Yapılar
Türkiye ve Biyoteknoloji
Üniversitelerİlgili bölümler
Şirketler(90)
BiyoteknolojideÖrgütsel Altyapı
KOSGEBDPT
TTGVTÜBİTAK
TÜBA
TÜBİTAK’da Bitki ve Endüstriyel Biyoteknolojiprojeleri yapılmış, halen lisansüstü düzeyde eğitimler veriliyor.
Ankara Üniversitesi 2001 - 2006 yılları arasında DPT'nin de 12 trilyon liralık desteği ile bir biyoteknoloji projesi başlatarak bir Moleküler Biyoloji ve Teknoloji Araştırma Geliştirme Merkezi kurdu.
Tüsiad Biyoteknoloji Raporu (2000).
Teknoparklar
GELİŞMELER (1990-2006)
TÜBİTAK-MAM TeknoparkıHacettepe TeknoparkıODTÜ TeknoparkıAnkara CyberparkSelçuk Üniversitesi Teknoparkı
Gerek sektördeki şirket sayısının azlığı gerekse teknoloji geliştirme ve patent sayılarındaki verimsizlik nedeniyle Türkiyede biyoteknolojideki şekillenme henüz yeterli düzeyde değildir.
Son yıllarda, örgütsel altyapının kurulması ve etkin şekilde çalışması için TÜBİTAK ve çeşitli Üniversitelerin ilgili bölümleri önemli çabalar sarfetmektedir.
KOSGEB , DPT ve TTGV gibi kurumların maddi destekleri üniversite-sanayi işbirliğini güçlendirerek önümüzdeki yıllarda önemli katkılar sağlayabilecektir.
Türkiye ve GDO’lar
1986 yılından beri GDO ekimi denetimli/denetimsiz yapılmaktadır.İthal soya tohumlarının %90’ı ve mısırın %80’i ABD ve Arjantin’den gelmekte.
Yasalar
8 Kasım 2006’dan itibaren transgenik bitki tohumlarınınülkeye girişi ve ekimi yasaldır.
Transgenik bitkilerle ilgili ilk mevzuat 1998 yılında üniversitelerinde katıldığı ve Tarımsal Araştırmalar Genel Müdürlüğünce yapılan “Transgenik Bitkiler ve GüvenlikÖnlemleri’’ toplantısıyla başlatıldı
1993’te yürürlüğe giren “Biyoçeşitlilik Sözleşmesi”ne Türkiye’de katıldı. Buna göre, “Her ülke kendi sınırları içinde bitki, hayvan ve mikroorganizmaların yaşamsal çeşitliliğinden sorumludur’’. Biyoçeşitliliğin devamıniteliğindeki Cartagena Biyogüvenlik Protokolü 2004 yılında yürürlüğe girdi.
Tarım ve Köyişleri Bakanlığı Tohumculuk konusunda yeni düzenlemeler yapmaktadır.
Türkiye = potansiyel gen havuzu
Biyoteknolojik çalışmalarda önemli potansiyel oluşturabilecek yüksek çeşitlilik gösteren bitkisel ve hayvansal gen kaynaklarının korunması
önem taşımaktadır.
İÜ-Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
ÇALIŞMA ALANLARIBitki biyoteknolojisiMaya moleküler biyolojisi ve biyoteknolojisiHastalıkların moleküler tanısıOksidatif stres ve doğal antiviral bileşiklerGenetik tiplendirme