perancangan primer.doc
TRANSCRIPT
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
1/21
PERANCANGAN PRIMER
Laporan Praktikum Bioteknologi Farmasi
Disusun oleh :
Nama : Desy Diana Sari
Nim : 142210101111
BAGIAN BIOLOGI FARMASI
FAKULAS FARMASI
UNI!ERSIAS "EMBER
#$%&
1
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
2/21
'AFAR ISI
COVER..............................................................................................................................1
DAFTAR ISI......................................................................................................................2
A I !ENDA"#$#AN.................................................................................................%
1.1 $a&ar ela'an(....................................................................................................%
1.2 Rumusan )asalah...............................................................................................4
1.% Tu*uan.................................................................................................................4
A II TIN+A#AN !#STA,A.......................................................................................-
A III )ETODE............................................................................................................
A IV "ASI$ DAN !E)A"ASAN.........................................................................10
4.1 ,ri&eria !emilihan !rimer yan( ai'............................................................10
4.2 Nama !ro&ein yan( Di/ilih an ,ri&erianya..................................................10
4.% !rimer yan( Dia/a& ser&a Disesuai'an en(an ,ri&erianya an
S/esii'asinya...........................................................................................................11
A V !EN#T#!..........................................................................................................14
DAFTAR !#STA,A......................................................................................................1-
$A)!IRAN....................................................................................................................1
2
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
3/21
BAB I PEN'A(ULUAN
a) Latar Belakang
io&e'nolo(i men(a3u /aa /enera/an sis&em iolo(i5 or(anisme hiu/5 a&au
&urunannya alam memua& a&au memoii'asi /rou' a&au /roses un&u' /en((unaan
'husus. io&e'nolo(i i(una'an i era(ai ian( &ermasu' /er&anian5 ilmu ma'anan5
an !harma3eu&i3al. !erusahaan armasi men((una'an io&e'nolo(i un&u' oa&
manua'&ur5 pharmacogenomics5 &era/i (en5 an /en(u*ian (ene&i'.
ioinorma&i'a ialah ilmu yan( mem/ela*ari /enera/an &e'ni' 'om/u&asi un&u'
men(elola an men(analisis inormasi haya&i. ian( ini men3a'u/ /enera/an me&oe6
me&oe ma&ema&i'a5 s&a&is&i'a5 an inorma&i'a un&u' meme3ah'an masalah6masalah
iolo(i5 &eru&ama yan( &er'ai& en(an /en((unaan se'uens DNA an asam amino.
Con&oh &o/i' u&ama ian( ini meli/u&i /an('alan a&a un&u' men(elola inormasi
haya&i5 /enye*a*aran se'uens 7 sequence alignment 85 /rei'si s&ru'&ur un&u' meramal'an
s&ru'&ur /ro&ein a&au/un s&ru'&ur se'uner RNA5 analisis ilo(ene&i' 5 an analisis
e's/resi (en.
!er'eman(an *arin(an in&erne& *u(a menu'un( er'eman(nya ioinorma&i'a.
!an('alan a&a ioinorma&i'a yan( &erhuun('an melalui in&erne& memuah'an
ilmu9an alam men(um/ul'an hasil se'uensin( 'e alam /an('alan a&a &erseu& ser&a
mem/eroleh se'uens iolo(i sea(ai ahan analisis. Selain i&u5 /enyearan /ro(ram6
/ro(ram a/li'asi ioinorma&i'a melalui in&erne& memuah'an ilmu9an alam
men(a'ses /ro(ram6/ro(ram &erseu& an 'emuian memuah'an /en(eman(annya.
!an('alan Da&a se'uens iolo(i a/a& eru/a /an('alan a&a /rimer un&u'
menyim/an se'uens /rimer asam nu'lea& an /ro&ein5 /an('alan a&a se'uner un&u'
menyim/an mo&i se'uens /ro&ein5 an /an('alan a&a s&ru'&ur un&u' menyim/an a&as&ru'&ur /ro&ein an asam nu'lea&. !an('alan a&a u&ama un&u' se'uens asam nu'lea&
saa& ini aalah enan' 7Ameri'a Seri'a&85 E)$ 7&he Euro/ean )ole3ular iolo(y
$aora&ory5 Ero/a85 an DD+ 7DNA Da&a an' o +a/an5 +e/an(8. !enelusuran
$AST 7 BLAST search8 /aa /an('alan a&a se'uens memun('in'an ilmu9an un&u'
men3ari se'uens ai' asam nu'lea& mau/un /ro&ein yan( miri/ en(an se'uens &er&en&u
yan( imili'inya.
!D 7 Protein Data Bank 5 an' Da&a !ro&ein8 ialah /an('alan a&a &un((al yan(
menyim/an moel s&ru'&ur &i(a imensi /ro&ein an asam nu'lea& hasil /enen&uan
3
http://id.wikipedia.org/wiki/Ilmuhttp://id.wikipedia.org/wiki/Komputasihttp://id.wikipedia.org/wiki/Matematikahttp://id.wikipedia.org/wiki/Statistikahttp://id.wikipedia.org/wiki/Informatikahttp://id.wikipedia.org/wiki/DNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_aminohttp://id.wikipedia.org/wiki/Basis_datahttp://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://id.wikipedia.org/wiki/RNAhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Filogenetika&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Genhttp://id.wikipedia.org/wiki/Internethttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Program&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Basis_datahttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_nukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.htmlhttp://www.ebi.ac.uk/embl/http://www.ddbj.nig.ac.jp/http://id.wikipedia.org/wiki/Jepanghttp://www.rcsb.org/pdb/http://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_nukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Ilmuhttp://id.wikipedia.org/wiki/Komputasihttp://id.wikipedia.org/wiki/Matematikahttp://id.wikipedia.org/wiki/Statistikahttp://id.wikipedia.org/wiki/Informatikahttp://id.wikipedia.org/wiki/DNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_aminohttp://id.wikipedia.org/wiki/Basis_datahttp://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://id.wikipedia.org/wiki/RNAhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Filogenetika&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Genhttp://id.wikipedia.org/wiki/Internethttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Program&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Basis_datahttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_nukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.htmlhttp://www.ebi.ac.uk/embl/http://www.ddbj.nig.ac.jp/http://id.wikipedia.org/wiki/Jepanghttp://www.rcsb.org/pdb/http://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_nukleat
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
4/21
e's/erimen&al 7en(an 'ris&alo(rai sinar6;5 s/e'&ros'o/i N)R 5 an mi'ros'o/i
ele'&ron8. !D menyim/an a&a s&ru'&ur sea(ai 'oorina& &i(a imensi yan(
men((amar'an /osisi a&om6a&om alam /ro&ein a&au /un asam nu'lea&.
*) Rumusan Masala+
Aa/un rumusan masalah alam la/oran ini an&ara lain :
1. A/a sa*a 'ri&eria /emilihan /rimer yan( ai' <
2. A/a nama /ro&ein yan( i/ilih an 'ri&erianya <
%. A/a sa*a /rimer yan( ia/a& ser&a sesuai'an en(an 'ri&erianya an s/esii'asinya<
,) u-uan
Aa/un rumusan masalah alam la/oran ini an&ara lain :
1. )en(e&ahui 'ri&eria /emilihan /rimer yan( ai'.
2. )en(e&ahui /ro&ein yan( i/ilih an 'ri&erianya.
3. )enen&u'an /rimer yan( ia/a& ser&a isesuai'an en(an 'ri&erianya an
s/esii'asinya.
4
http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Kristalografi_sinar-X&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Spektroskopi_NMR&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Mikroskopi_elektron&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Mikroskopi_elektron&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Koordinat_tiga_dimensi&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Atomhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Kristalografi_sinar-X&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Spektroskopi_NMR&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Mikroskopi_elektron&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Mikroskopi_elektron&action=edithttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Koordinat_tiga_dimensi&action=edithttp://id.wikipedia.org/wiki/Atom
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
5/21
BAB II IN"AUAN PUSAKA
A) Pengertian
!CR aalah rea'si /olimerase eran&ai5 yai&u rea'si yan( melia&'an en=im
/olimerase yan( ila'u'an se3ara erulan(6ulan(. >an( iulan(6ulan( aalah /roses
/emisahan un&ai (ana DNA men*ai un&ai &un((al5 hiriisasi /rimer un&u'
men(a9ali re/li'asi DNA ilan*u&'an en(an /roses /enamahan asa /aa 3e&a'an
DNA oleh en=im /olimerase5 un&u' mela'u'an 'e(ia&an ini iu&uh'an &aun( !CR
yan( ersia& re/onsi en(an /eruahan suhu an mesin &hermal 3y3ler5 sua&u mesin
yan( mam/u menai''an an menurun'an suhu en(an 3e/a&5 an ahan6ahan un&u'
memua& rea'si !CR.
B) u-uan PCR
Saa& ini !CR *u(a serin( i(una'an un&u' memua& ra(men DNA s/esii'
un&u' iinsersi'an se3ara lan(sun( 'e alam sua&u ?e'&or5 sehin((a &ia' memerlu'an
&aha/an s'reenin( sua&u /er/us&a'aan DNA.
C) Komponen PCR
1. DNA
DNA yan( ima'su isini aalah DNA yan( erun(si sea(ai 3e&a'an
7template8. #n&u' a/li'asi !CR5 'emurnian DNA mem/en(aruhi hasil.DNA yan( &ia'
murni serin( menyea'an masalah re/rou'siili&as5 &u*uan u&ama *u(a i(una'an
un&u' ia(nosis. DNA yan( i(una'an harus imurni'an ahulu seelum i/roses
en(an !CR. DNA yan( i(una'an sea(ai 3e&a'an un&u' !CR seai'nya eas
nu'leuse5 eno6a&au e'so/ro&ease5 an DNA-binding protein.
2. !rimer
!rimer erun(si men(a9ali rea'si re/li'asi DNA /aa rea'si !CR. !rimer yan(
iu&uh'an un&u' !CR iasanya sa&u /asan( yai&u /rimer forward an backward .
!rimer !CR seniri aalah 'om/onen yan( san(a& menen&u'an 'eerhasilan !CR.
%. DNT! 7Deo@ynu3leo&ie &ri/hos/ha&e8
5
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
6/21
NT! meru/a'an lo' /eman(un mole'ul asam nu'lea& yan( &eriri ari AT!
7deo!denosine tr!phosphatase85 TT! 7deo!th!midine triphophatase85 CT!
7deo!c!tosine triphosphate85 an T! 7deo!guanosine triphosphatase8. Dalam
eera/a a/li'asi an /ro&o'ol !CR5 salah sa&u ari em/a& NT! &erseu& a/a& i(an&i
elemen analo(. )oii'asi ini er(una un&u' a/li'asi yan( erasis /as3a6!CR
7misalnya : se'uensin(5 /emua&an /roe un&u' Southern blotting 5 ll8
4. !olimerase DNA
,e&i'a &er*ai sin&esis DNA5 en=im /olimerase DNA a'an mela'u'an sele'si
nu'leo&ia yan( &e/a& un&u' i&amah'an 'e /rimer un&u' melan*u&'an DNA sesuai
en(an a&uran /asan(an asa a&son6Cri3' 7 A6T an 6C 8. Oleh 'arena i&u5
!olimerase DNA selalu men('a&alis sin&esis DNA alam orien&asi -B 'e %B. eera/a
/olimerase DNA *u(a memili'i a'&i?i&as e'sonu'lease a&au yan( serin( iseu& en(an
a'&i?i&as proofreading yan( a'an memeri'sa asa yan( &elah i&amah'an un&u'
menumuh'an un&ai DNA. ,e&i'a &er*ai /enamahan nu'leo&ia yan( &ia' &e/a&
a'&i?i&as /rooreain( &erseu& a'an memuan( asa yan( &ia' &e/a& &erseu&.
-. uer rea'si !CR
uer rea'si !CR iasanya men(anun( )(25 'a&ion mono?alen5 an eera/a
co-sol"ent# $o-sol"ent meman&u mens&ailisasi en=im /olimerase DNA5
mem/en(aruhi 'er*a en=im5 an a&au DNA melting temperature 7Tm8. Ion )ono?alen
se/er&i Na5 , 5 an N"4 mens&imulasi a'&i?i&as /olimerase DNA an melinun(i
mua&an ne(a&i (u(us osa& DNA5 sehin((a melemah'an 'e'ua&an ele'&roni' yan(
salin( menola' an&ara /rimer an DNA &ar(e&.
') Prinsip 'asar Reaksi PCR
!CR meru/a'an &e'hni' am/lii'asi DNA sele'&i in "itro yan( meniru
enommena re/li'asi DNA in "i"o. ,om/onen rea'si yan( i/erlu'an alam &e'ni' ini
aalah un&ai &un((al DNA sea(ai 3e&a'an5 /rimer 7se'uens oli(onu'leo&ia yan(
men('om/lemen&eri a'hiran se'uens 3e&a'an DNA yan( suah i&en&u'an85 NT!s
7deo!nucleotide triphosphates85 an en=im TA /olimerase yai&u en=im ari a'&eri
Termo?ilus aua&i'us.
!aa /rinsi/nya5 rea'si !CR 7 /ro&o'ol !CR 'on?ensional 8 memu&uh'an &i(a &aha/ :
6
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
7/21
1. Dena&urasi 7 %elting 8
!rinsi/nya aalah memisah'an DNA un&ai (ana men*ai 'om/onen un&ai &un((al5
sehin((a memun('in'an &er*ainya hiriisasi /rimer !CR un&ai &un((al /aa se'uen
&ar(e&nya 7 *i'a aa8
2. Annealing !rimer !CR
!aa &aha/ ini &er*ai hiriisasi /rimer !CR /aa se'uens &er(e&nya. Se3ara umum
suhu annealin( !CR iasanya erasal ari suhu annealing /rimer hasil 'al'ulasi
ma&ema&is i'uran(i -0 C 7 rumus: 4 @ 7 C8 2 @ 7 A T 8 8. Dihara/'an alam
suhu annealing &erseu& /rimer a/a& eri'a&an en(an &ar(e& 'om/lomen&arinya an
*i'a suah &erhiriisasi &ia' muah men(alami isosiasi. a'&u yan( iu&uh'an
un&u' &aha/an ini iasanya 1-60 e&i'.
%. Elon(asi 7 e's&ensi ran&ai DNA 8
Taha/ ini /en&in( un&u' men(am/lii'asi aerah yan( suah ihiriisasi oleh /rimer5
ari a'hiran 6- 'e a'hiran 6%. Sea(ian esar en=im /olimerase memu&uh'an suhu
elon(asi 20C.
E) Kriteria Pemili+an Primer .ang Baik
1. !rimer &ia' &erlalu /an*an( an /ene'. !rimer yan( ai' an&ara 1624 nu'leo&ia.
+i'a 'uran( ari 1- a'an menurun'an s/esiisi&asnya. "iriasi &ar(e&5 *i'a leih ari 40
a'an menurun'an a'&ii&as D A.
2. Suhu un&u' mel&in( /oin& an&ara -060 0C. *i'a suhu &ia' 3o3o' /aa 'eaaan
annealin(5 ma'a /rimer &ia' a'an muah &eri'a&. Oleh 'arena i&u5 /rimer harus
memili'i suhu yan( sesuai en(an /roses annealin(.
%. #*un( %B 'eua /rimer &ia' salin( er'om/lemen.
4. #ru&an nu'leo&ia yan( sama &ia' oleh leih ari 4 a(ar s/esii&as ai'.
-. Suhu an&ara /rimer or9ar en(an /rimer reser?e &ia' &erlalu *auh G - 0C.
. +umlah i'a&an uanin Si&osin 4060 H en(an mua&an ran('a/ yan( memili'i i'a&an
leih 'ua& ari/aa i'a&an 2 an&ara aenin an &imin. Den(an i'a&an 6C5 i'a&an /rimer
'ua&a an &ia' muah le/as ari DNA &em/la&e.
7
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
8/21
BAB III MEO'E
A. Tem/a& !ela'sanaan
!ra'&i'um io&e'nolo(i yan( memahas &en&an( /eran3an(an /rimer ila'u'an iruan( SC$ a'ul&as armasi i #ni?ersi&as +emer
. a'&u !ela'sanaan
!ra'&i'um io&e'nolo(i ila'sana'an /aa &an((al 2 )are& 201 hari rau *am
10.4061%.20.
C. Ala& an ahan
Ala& yan( i(una'an aalah se/eran('a& len('a/ 3om/u&er en(an assesorisnya an
'one'si in&erne&.
ahan yan( i(una'an aalah CDS (en ari or(anisme &er&en&u sea(ai mole'ul
DNA &ar(e&.
D. Cara ,er*a
1. )en3ari CDS (en &ar(e& ari si&us h&&/:999.n3i.nlm.nih.(o?
Mencari Primer
8
u'a laman h&&/:999.n3i.nlm.(o?
,e&i''an (en yan( mau i3ari se'uensnya /aa 'olom sear3h. !ilihnu'leo&ia /aa /ilihan all a&aases. Te'an &omol sear3h.
!ilih 3om/le&e (enome
,li' Fas&a5 a'an mun3ul &am/ilan as&a
u'a 'emali si&us h&&/:999.n3i.nlm.nih.(o? i&a yan( erea
Klik DNA & RNA
,li' !rimer6las&
Salin semua CDS (en yan( ima'su /aa 'olom en&er a33ession (i or
FASTA seuen3e. !ilih (enome 7all or(anisms8 sea(ai /ilihan a&aase.
$alu 'li' e& !rimer
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
9/21
2. )enen&u'an S/esiisi&as !rimer
BAB I! (ASIL 'AN PEMBA(ASAN
i) Kriteria Pemili+an Primer .ang Baik
!emilihan /rimer yan( a'an i(una'an /aa !CR harus memenuhi 'ri&eria a&au
/arame&er &er&en&u a(ar /rimer erun(si ma'simal5 /arame&er &erseu& ian&aranya :
9
Tun((u hin((a hasilnya 'eluar
u'a 'emali laman h&&/:n3i.nlm.nih.(o? i &a yan( erea
!ilih $AST
!ilih nu3leo&ie las&
)asu''an /rimer yan( in(in i3e' /aa 'olom en&er a33ession numer
7s85 (i 7s85 or FASTA seuen3e. !ilih nu3leo&ia /aa /ilihan a&aase.
$alu 'li' $AST
Tun((u eera/a saa&5 a'an i/eroleh /resen&ase 'esamaannya
http://ncbi.nlm.nih.gov/http://ncbi.nlm.nih.gov/
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
10/21
1. !rimer &ia' &erlalu /an*an( an /ene'. !rimer yan( ai' an&ara 1624 nu'leo&ia.
+i'a 'uran( ari 1- a'an menurun'an s/esiisi&asnya. "iriasi &ar(e&5 *i'a leih ari 40
a'an menurun'an a'&ii&as D A.
2. Suhu un&u' mel&in( /oin& an&ara -060 0C. *i'a suhu &ia' 3o3o' /aa 'eaaan
annealin(5 ma'a /rimer &ia' a'an muah &eri'a&. Oleh 'arena i&u5 /rimer harus
memili'i suhu yan( sesuai en(an /roses annealin(.
%. #*un( %B 'eua /rimer &ia' salin( er'om/lemen.
4. #ru&an nu'leo&ia yan( sama &ia' oleh leih ari 4 a(ar s/esii&as ai'.
-. Suhu an&ara /rimer or9ar en(an /rimer reser?e &ia' &erlalu *auh G - 0C.
. +umlah i'a&an uanin Si&osin 4060 H en(an mua&an ran('a/ yan( memili'i i'a&an
leih 'ua& ari/aa i'a&an 2 an&ara aenin an &imin. Den(an i'a&an 6C5 i'a&an /rimer
'ua&a an &ia' muah le/as ari DNA &em/la&e.
ii) Nama Protein .ang 'ipili+ /an Kriterian.a
!ro&ein yan( i/ilih yai&u SRE!1. Sterol &egulator! 'lement Binding
Proteins 7SRE!s8 meru/a'an a'&or &rans'ri/si yan( eri'a&an en(an Sterol
&egulator! 'lement 7TCACNCCAC8 /aa se'uen DNA. SRE!s /aa mamalia
i'oe'an oleh (en SREF1 an SREF2. erasar'an enome )amalia5 (en SRE!
ia(i men*ai ua yai&u SREF1 an SREF 2.
S&erol /era&uran elemen6men(i'a& a'&or &rans'ri/si 1 7SREF18 *u(a i'enal
sea(ai s&erol /era&uran elemen6inin( /ro&ein 1 7SRE!618 aalah /ro&ein yan( /aa
manusia i'oe'an oleh (en SRE!1.
Fungsi SREBP% : !ro&ein yan( i'oe'an oleh (en ini meru/a'an a'&or &rans'ri/si
yan( men(i'a& uru&an i /romo&or (en yan( erea5 yan( iseu& s&erol /era&uran
elemen61 7SRE18. Elemen ini aalah e3amer men(a/i& (en rese/&or $D$ an (en lain
yan( &erlia&5 misalnya5 s&erol iosin&esis. !ro&ein isin&esis sea(ai /re'ursor yan(
mele'a& /aa memran nu'lir an re&i'ulum eno/lasma. !ro&ein ma&an( &ranslo3a&es
'e in&i an men(a'&i'an &rans'ri/si en(an men(i'a& SRE1 &erseu&. S&erol
men(hama& /emelahan /re'ursor5 an en&u' nu'lir ma&an( en(an 3e/a&
i'a&aolisme5 sehin((a men(uran(i &rans'ri/si. SRE!613 men(a&ur (en yan(
i/erlu'an un&u' me&aolisme (lu'osa an asam lema'5 /rou'si li/i ser&a e's/resinya
10
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
11/21
ia&ur oleh insulin. SRE!61a men(a&ur (en yan( erhuun(an en(an /rou'si lema'
an 'oles&erol an a'&i?i&asnya ia&ur oleh &in('a& s&erol alam sel.
iii) Primer .ang 'i/apat serta 'isesuaikan /engan Kriterian.a /an
Spesi0ikasin.a)
Aa/un /rimer yan( i/eroleh ari /ro&ein SRE!1 aa %5 an&ara lain :
1. !asan(an /er&ama ari /rimer &eriri ari For9ar !rimer an Reser?e !rimer.
• Nu'leo&ia ari For9ar !rimer aalah CATTCCATCACTAAC.
!an*an( ari or9ar /rimer seanya' 20 nu'leo&ia5 hal ini sesuai en(an
'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u /an*an( nu'leo&ia an&ara 1624. !an*an(
/rou'nya aalah %J-. Sean('an *umlah C --500 H sesuai en(an 'ri&eria
/rimer yan( ai' yai&u *umlah i'a&an (uanine an si&osin 4060 H an nilaiTm -J5J sesuai en(an 'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u suhu un&u' mel&in(
/oin& an&ara -060 0C. "asil las& aalah 100 H sehin((a memenuhi
s/esii&as /rimer yan( ai'.
• Nu'leo&ia ari Reser?e !rimer aalah TATCCTTCCAATCCT.
!an*an( ari reser?e /rimer seanya' 20 nu'leo&ia5 hal ini sesuai en(an
'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u /an*an( nu'leo&ia an&ara 1624. !an*an(
/rou'nya aalah %J-. Sean('an *umlah C --500 H sesuai en(an 'ri&eria
11
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
12/21
/rimer yan( ai' yai&u *umlah i'a&an (uanine an si&osin 4060 H an nilai
Tm -J5J sesuai en(an 'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u suhu un&u' mel&in(
/oin& an&ara -060 0C. "asil las& aalah 100 H sehin((a memenuhi
s/esii&as /rimer yan( ai'.
2. !asan(an 'eua ari /rimer &eriri ari For9ar !rimer an Reser?e !rimer.
• Nu'leo&ia ari For9ar !rimer aalah ATACTCTATTC.
!an*an( ari or9ar /rimer seanya' 20 nu'leo&ia5 hal ini sesuai en(an
'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u /an*an( nu'leo&ia an&ara 1624. !an*an(
/rou'nya aalah 00. Sean('an *umlah C 0500 H sesuai en(an 'ri&eria
/rimer yan( ai' yai&u *umlah i'a&an (uanine an si&osin 4060 H an nilai
Tm -J5J sesuai en(an 'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u suhu un&u' mel&in(
/oin& an&ara -060 0C. "asil las& aalah 100 H sehin((a memenuhi
s/esii&as /rimer yan( ai'.
• Nu'leo&ia ari Reser?e !rimer aalah CAAACAACTACACCT.
!an*an( ari reser?e /rimer seanya' 20 nu'leo&ia5 hal ini sesuai en(an
'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u /an*an( nu'leo&ia an&ara 1624. !an*an(
/rou'nya aalah 00. Sean('an *umlah C --500 H sesuai en(an 'ri&eria
/rimer yan( ai' yai&u *umlah i'a&an (uanine an si&osin 4060 H an nilai
Tm -J5J sesuai en(an 'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u suhu un&u' mel&in(
/oin& an&ara -060 0C. "asil las& aalah 100 H sehin((a memenuhi
s/esii&as /rimer yan( ai'.
%. !asan(an 'e&i(a ari /rimer &eriri ari For9ar !rimer an Reser?e !rimer.
• Nu'leo&ia ari For9ar !rimer aalah CCTCACTCCAATTTC.
!an*an( ari or9ar /rimer seanya' 20 nu'leo&ia5 hal ini sesuai en(an
'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u /an*an( nu'leo&ia an&ara 1624. !an*an(
/rou'nya aalah 1%. Sean('an *umlah C 0500 H sesuai en(an 'ri&eria
/rimer yan( ai' yai&u *umlah i'a&an (uanine an si&osin 4060 H an nilai
Tm -J5J sesuai en(an 'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u suhu un&u' mel&in(
/oin& an&ara -060 0C. "asil las& aalah 100 H sehin((a memenuhi
s/esii&as /rimer yan( ai'.
12
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
13/21
• Nu'leo&ia ari Reser?e !rimer aalah CAACAACTCTCTCAT.
!an*an( ari reser?e /rimer seanya' 20 nu'leo&ia5 hal ini sesuai en(an
'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u /an*an( nu'leo&ia an&ara 1624. !an*an(
/rou'nya aalah 1%. Sean('an *umlah C 0500 H sesuai en(an 'ri&eria
/rimer yan( ai' yai&u *umlah i'a&an (uanine an si&osin 4060 H an nilai
Tm 0504 sesuai en(an 'ri&eria /rimer yan( ai' yai&u suhu un&u' mel&in(
/oin& an&ara -060 0C. "asil las& aalah 100 H sehin((a memenuhi
s/esii&as /rimer yan( ai'.
13
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
14/21
BAB ! PENUUP
1)% Kesimpulan
Aa/un 'esim/ulan yan( ia/a& ari /ra'&i'um ini5 an&ara lain :
1. ,ri&eria !emilihan !rimer yan( ai' an&ara lain : /an*an( /rimer 1624 nu'leo&ia5
suhu leleh 7&m8 /rimer -060 0C en(an selisih Tm an&ara /rimer 'uran( ari -0C5
uru&an nu'leo&ia yan( sama &ia' oleh leih ari 4 'arena a'an menurun'an
s/esiisi&as5 'anun(an C seai'nya 4060 H an u*un( %B 'eua /rimer &ia'
salin( er'om/lemen.
2. !ro&ein yan( i/ilih yai&u SRE!1. S&erol /era&uran elemen6men(i'a& a'&or
&rans'ri/si 1 7SREF18 *u(a i'enal sea(ai s&erol /era&uran elemen6inin(
/ro&ein 1 7SRE!618 aalah /ro&ein yan( /aa manusia i'oe'an oleh (en
SRE!1.
%. !rimer yan( i/eroleh ari /ro&ein SRE!1 ari 'e&i(a /rimer &elah memenuhi
semua 'ri&eria un&u' /rimer yan( ai' an s/esiisi&as yan( ai'.
1)# Saran
Aa/un saran un&u' /ra'&i'um ini5 an&ara lain :
1. ,uran(nya len('a/nya inormasi yan( ia/a& ari (en/ro&ein &er&en&u sehin((a (en
yan( i3an&um'an yan( memua& inormasi len('a/. Sehin((a en(an 'elen('a/an
inormasi ari (en/ro&ein ma'a /ra'&i'an leih muah memahami.
2. A/li'asi yan( i/a'ai 'uran( a/a& i/ahami. Sehin((a a'an leih ai' *i'a aa
a/li'asi aru yan( memua& /ra'&i'an leih muah memahami.
14
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
15/21
'AFAR PUSAKA
h&&/:e?iarmasi.lo(.une*.a3.i
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
16/21
LAMPIRAN
1. CDS (en &ar(en ari /ro&ein SRE!1
16
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
17/21
2. !rimer ari /ro&ein SRE!1
%. For9ar /rimer 1
17
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
18/21
4. Reser?e /rimer 1
-. For9ar !rimer 2
18
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
19/21
. Reser?e !rimer 2
19
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
20/21
. For9ar !rimer %
20
-
8/19/2019 PERANCANGAN PRIMER.doc
21/21
. Reser?e !rimer %
21