procesamiento de imÁgenes cientÍficas

PROCESAMIENTO DE IMÁGENES CIENTÍFICAS MARCO ANTONIO JIMÉNEZ SANTOS 1 y GABRIEL CAMARENA GUTIERREZ 2 Metodología Científica 1 ; Unidad de Morfología y Función 2 . FES Iztacala UNAM. Av. de los Barrios 1, Tlalnepantla 54090 México. [email protected] En el procesamiento de imágenes científicas y en el análisis de imágenes, una imagen es algo diferente a una fotografía normal digital de una escena hermosa que disparó durante su últimas vacaciones. En el contexto de la ciencia, las imágenes digitales son muestras de la información, mediante muestreo en los puntos de vértice de redes n-dimensionales. La percepción visual humana es muy buena para ciertas tareas, como la corrección de contraste, para detectar diferencias sutiles en los colores brillantes, pero muy mala con otras cosas, como discernir los colores oscuros , o clasificar colores sin una referencia adecuada. Por eso es muy importante tener en cuenta que los valores de píxel son números, no son los colores. Por ejemplo, cuando se graba una imagen usando un microscopio confocal, los valores que podemos encontrar en una coordenada determinada no son los valores de color, sino que se refieren a la cuenta de fotones. Los pixeles no son cuadros pequeños ¿Por qué JPEG no se debe utilizar en imágenes científicas? JPEG es la abreviatura de Joint Photographic Experts Group, que fueron los creadores de un método para usar la compresión con pérdida para imágenes fotográficas. Este formato se utiliza comúnmente en las páginas web y con el apoyo de la inmensa mayoría de cámaras fotográficas digitales y los escáneres de imagen, ya que puede almacenar imágenes en archivos relativamente pequeños a expensas de la calidad de la imagen. "La compresión con pérdida" significa que en el proceso de reducción, la cantidad de archivos de cierto tamaño de la información de la imagen se descarta. En el caso de archivos JPEG, esto podría no ser fácilmente evidentes para un observador, pero será importante para fines de procesamiento de imágenes. En formato JPEG de compresión con pérdida, por lo tanto, la imagen almacenada no es la misma que la original, y no es adecuada para hacer el trabajo de imagen. Mientras que la compresión JPEG tira a la basura información que el ojo no puede detectar fácilmente, esto se traduce en artefactos considerables de imagen. Cualquier intento de cuantificar las imágenes, se verán afectados de manera incontrolable por la presencia de los artefactos. Formatos sin pérdida son TIFF o PNG disponibles para ImageJ. TIFF mantiene cualquier calibración aplicada a las imágenes, pero las imágenes no están comprimidas. Los archivos PNG son más pequeños pero no almacenan los datos de calibración. Una vez que una imagen se ha guardado como JPEG comprimido no hay manera de volver a la original. Por lo tanto, un archivo viejo JPEG comprimido que se grabe de nuevo como TIFF o PNG todavía contiene todos los elementos originales de compresión JPEG. ImageJ es un programa de procesamiento de imagen digital de dominio público programado en Java, desarrollado en el National Institutes of Health. El software permite resolver muchos problemas de procesamiento y análisis de imágenes, desde imágenes en vivo de las células en tres dimensiones, procesamiento de

procesamiento de imÁgenes cientÍficas

Documents