Tinjauan Pustaka

Polymerase chain reaction (PCR) adalah suatu proses pembentukan cetakan DNA secara

berulang kali dengan menggunakan prosedur dan waktu yang tertentu (Wolfe1993: 137).

PCR menggunakan teknik amplifikasi (perbanyakan) secara spesifik pada suatu segmen DNA

secara in vitro dengan menggunakan DNA polimerase, cetakan (template),DNA genom, dan

primer oligonukleotida yang akan menempel pada segmen yang akan diamplifikasi. Prinsip dasar

dari teknik PCR tersebut merupakan adanya enzim DNA polimerase yang digunakan untuk

membuat cetakan dari segmen DNA yang diinginkan. . Metode ini ditemukan oleh Kary B.

Mullis pada tahun 1985, seorang saintis dari perusahaan CETUS Corporation. Peralatan

laboratorium untuk analisa dengan metoda PCR sekarang berkembang dengan sangat cepat.

Salah satu alat yang sering digunakan untuk analisa PCR adalah Realtime PCR, namun setiap

reaksi realtime PCR memakan biaya yang tidak sedikit. Realtime PCR memiliki berbagai

keunggulan. Selain amplifikasi atau perbanyakan DNA fragmen yang dapat diamati seketika

(secara realtime), dengan teknik ini kita pun dapat menentukan konsentrasi DNA yang

terdapat pada sample (http://sciencebiotech.net/tag/realtime-pcr/). Komponen PCR

Selain DNA template yang akan digandakan dan enzim DNA polymerase, komponen lain

yang dibutuhkan adalah (biology-community.blogspot):

1. Primer

Primer adalah sepasang DNA utas tunggal atau oligonukleotida pendek yang menginisiasi

sekaligus membatasi reaksi pemanjangan rantai atau polimerisasi DNA.PCR hanya mampu

menggandakan DNA pada daerah tertentu sepanjang maksimum 10000 bp saja, dan dengan

teknik tertentu bisa sampai 40000 bp. Primer dirancang untuk memiliki sekuen yang

komplemen dengan DNA template, jadi dirancang agar menempel mengapit daerah tertentu

yang kita inginkan.

2. dNTP (deoxynucleoside triphosphate)

dNTP alias building blocks sebagai ‘batu bata’ penyusun DNA yang baru. dNTP terdiri atas 4

macam sesuai dengan basa penyusun DNA, yaitu dATP, dCTP, dGTP dan dTTP.

3. Buffer

Buffer yang biasanya terdiri atas bahan-bahan kimia untuk mengkondisikan reaksi agar

berjalan optimum dan menstabilkan enzim DNA polymerase.

Prinsip kerja PCR adalah menggandakan potongan DNA tertentu dari seluruh

untaianDNA, baik yang berasal dari DNA sel inti (nukleus) maupun organel sel seperti

DNAmitokondria (mtDNA) atau Ribosom (rDNA). Untuk mendapat potongan DNA,

diperlukanPrimer yang berfungsi untuk menandai dimana ujung DNA yang akan digandakan.

Primer  biasanya berpasangan, yaitu Primer forward untuk menandai ujung depan untai DNA dan

Primer Reverse untuk menandai dari ujung belakang. Karena DNA terdiri dari 2 untai pilinan

ganda (double strand), maka DNA Primer forward  bekerja pada strand yang satu sementara Primer

Reverse bekerja pada untai pilinan yang satunya. Sejak ditemukannya metode PCR,

perkembangan dunia biologi molekular dan bioteknologi semakin pesat. Beberapa contoh

penerapan PCR antara lain, analisis tindakan kriminal dengan sedikit sampel darah, sperma,

sidik jari atau jaringan, deteksi DNA atau RNA virus yang sulit terdeteksi, seperti HIV,

analisis filogenetik dalam taksonomi ,identifikasi polimorfisme DNA ,penentuan urutan

nukleotida.

Ini sumbernya kia, buat Dapus.

Jika ada yang salah betulkan saja ya.

Makasih kiaaaaaaaaaaaaaa

http://biology-community.blogspot.com/2010/06/polymerase-chain-reaction.html

Wolfe, S.L. 1993. Molecular and cellular biology. Wadsworth Publishing Company,

Belmont: xviii + 1145 hlm.

(http://sciencebiotech.net/tag/realtime-pcr/).