מיפוי טטרדות לינאריות

17
םםםם םםםם םםםםםם, םםםםםם, םםםםם םםםםם םםםםם םםםםםם םםםםםםם םםםםםם םםםם םםם םםםםם ססססס. םםם םםםםם םם םםםםם םםםםם םםםםםםם םםםם ססססס. םםםםם םםםםםם םםםםםםם םםםםם םםםםםם םםם םם םםםםם)םםםםםםם םםםםם םםםםם( םםםםםםם םםםם סססססס. םםםם םםםםםם םםםםםםם םם םםםםםם םםםם םםם. םםםםם םםםםםם םםםםםםם

Upload: zach

Post on 05-Jan-2016

79 views

Category:

Documents


0 download

DESCRIPTION

מיפוי טטרדות לינאריות. M I – ההפרדה בין שני האללים נעשית בחלוקה I . M II – ההפרדה נעשתה רק בחלוקה II , לאחר שאירע שיחלוף. R.F. – חישוב המרחק בין הצנטרומר לגן המשוחלף: למה מחלקים ב- 2 ? - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: מיפוי טטרדות לינאריות

עבור סוגי פטריות, עובשים, ואצות שונים תוצרי המיוזה •.אסקוסהראשונה נמצאים ביחד בשק הנקרא

השק המכיל את ארבעת התאים שהתקבלו נקרא •.טטרדה

במידה וחלוקה מיטוטית נוספת מתרחשת )מתקבלים •.אוקטדהשמונה נבגים( השק עם תוצרי המיטוזה נקרא

משלב המיוזה הראשונה כל התהליך נעשה בשק.•

מיפוי טטרדות מסודרות

Page 2: מיפוי טטרדות לינאריות

מיפוי טטרדות מיפוי טטרדות לינאריותלינאריות

MI ההפרדה בין שני האללים נעשית בחלוקה –I.MII ההפרדה נעשתה רק בחלוקה –II.לאחר שאירע שיחלוף ,R.F. :חישוב המרחק בין הצנטרומר לגן המשוחלף –

?2למה מחלקים ב- בהם אירע שיחלוף – אירועי המיוזה מייצג את שיעור MIIמשום שמספר הטטרדות

. שיעור הכרומוסומים הרקומביננטיםוזה לא תואם להגדרת המרחק הגנטי, שהוא מהכרומוסומים שמתקבלים הם רקומביננטים.50%בכל אירוע שיחלוף רק

X 100

Page 3: מיפוי טטרדות לינאריות

שאלה לדוגמה: 

התבצעה. ניתוח טטרדה לניארית הראה הפרדה בין neurosproa a x Aהכלאת .8%האללים בחלוקה שנייה, בתדירות של

צייר האפשרויות להפרדה בין אללים בחלוקה שנייה.א.

תשובה:

תשובה: מייצגים את מספר הטטראדות הרקומביננטיות חלקי סה"כ הטטראדות 8%ב.

הקיימות. לכן כל מה שנשאר לנו הוא להכפיל ב ½, לכן המרחק בין הגן סנטימורגן.4לצנטרומר הינו

מה המרחק בין הגן לצנטרומר?ב.

Page 4: מיפוי טטרדות לינאריות

באורגניזמים מסוימים הנבגים נוצרים בשק במבנה שאיננו • ליניארי.

לא ניתן להשתמש במיקום הכרומוזום בתוך השק כמדד • לרקומבינציה.

נעקוב אחר הרכב הצאצאים בשק. •

מיפוי טטרדות לא מסודרות

Page 5: מיפוי טטרדות לינאריות

מיפוי טטרדות לא מסודרותמיפוי טטרדות לא מסודרות

ab X a+b+

RF=1/2(T+6NPD)

מסתכלים על הרכב הכרומוסום ולא על הסדר

NPD ואחריו ה-TT יהיה הגבוה ביותר אחריו ה- PDכמות ה-

יהיה תלוי במרחק של הגנים מהצנטרומרT וכמות ה-PD=NPD לא נמצאים בתאחיזה b ו-aבמידה והגנים

סה"כ צאצאיםX 100

Page 6: מיפוי טטרדות לינאריות

שאלה-

התקבלו הטטרדות הלא מסודרות הבאות: AB X abבהכלאת השמרים הבאים:

.1AB ,AB ,ab,ab 35

.2ab, AB, ab, AB 35

.3aB, Ab, Ab, aB 5

.4Ab, Ab, aB, aB 5

.5AB, Ab, aB, ab 20

PDPD

NPDNPD

TT

RF=(1/2(20+6X(5+5)))*100/100

RF = 40 m.u

? לא הגנים בתאחיזה.PD = NPD האם •

Page 7: מיפוי טטרדות לינאריות

Mutagenesis

Plate to select for phenotype of interest

Complementation groups

Page 8: מיפוי טטרדות לינאריות

Complementation groups

First, we need to catalogue our mutants to complementation groups

x xMate

xx

Diploid still shows mutant phenotype

Mutant#1 Mutant#2

Mutant#1 and Mutant#2are mutated in the same gene

Same complementation group

Diploid

Page 9: מיפוי טטרדות לינאריות

x xMate

Mutant#3 Mutant#4 Diploid

xx

Diploid dont show mutanbt phenotype

Mutant#3 and Mutant#4are mutated in different genes

Different complementation groups

Complementation groups

Page 10: מיפוי טטרדות לינאריות

2014שאלה ממבחן תאי שמר יוצרים בדרך כלל מושבות לבנות. כחלק מפרויקט במעבדה, סטודנט מצא מספר

מושבות מוטנטיות אדומות. הוא הכליא את המושבות האדומות זו עם זו ועם זן הבר הלבן(WT ) , .בכל המקרים התקבלו דיפלואידים לבנים

לאחר מכן אפשר הסטודנט לזנים הדיפלואידים לעבור מיוזה, ופתח כל טטרדה תחת המקרוסקופ, באופן שאפשר לכל אחת מארבעת הספורות בכל טטרדה לגדול באופן עצמאי

וליצור מושבה. טטרדות )לא מסודרות(. 100לאחר מכן בדק הסטודנט את התוצאות שהתקבלו מ-

W,מושבה לבנה- R.מושבה אדומה -

:1הכלאה WT WT x:

הדיפלואיד לבן וכל

הטטרדות W4:R0הינן

)בכל אסקוס ארבעת

ספורות הינן הלבנות(

ספורצבעה

WA

WB

WC

WD

:2הכלאה :1WTxמוטנט

הדיפלואיד לבן וכל הטטרדות

הינן W2:R2

)בכל אסקוס התקבלו שתי ספורות מכל

צבע(.

:3הכלאה : 2WTxמוטנט

הדיפלואיד לבן וכל הטטרדות

הינן W2:R2

)בכל אסקוס התקבלו שתי

ספורות מכל צבע(. ספורצבע

ה

WA

WB

RC

RD

:4הכלאה 1xמוטנט:2מוטנט

הדיפלואיד אדום וכל הטטרדות

W0:R4הינן )בכל אסקוס

ספורות ארבעת ה(אדומותהינן

ספורצבעה

RA

RB

RC

RD

:5הכלאה 3 מוטנטx 1מוטנט

הדיפלואיד לבן ומתקבלים:

טטרדות הינן 88W0:R4

W2:R2 טטרדות הינן 2 טטרדות הינן 10

W1:R3

Page 11: מיפוי טטרדות לינאריות

על סמך הנתונים המוצגים בשאלה זו, קבע אם ההצהרות הבאות הינן  א.נכון, ב.לא נכון, ג.לא ניתן לדעת. הסבר בקצרה )שורה אחת(.

הינם דומיננטים.1,2,3א. המוטנטים

הינם אללים של אותו גן.2 ומוטנט 1ב. מוטנט

הינם אללים של אותו גן.3 ומוטנט 1ג. מוטנט

. 3 אחוז למוטנט 1ד. מוטנט

:PDT אילו מבין סוגי הטטרדות הבאות הינן 5ה. בהכלאה W4:R0 W2:R2 W0:R4 W1:R3 W3:R1

_____ גנוטיפ :_______________

:NPD אילו מבין סוגי הטטרדות הבאות הינן 5ו. בהכלאה W4:R0 W2:R2 W0:R4 W1:R3 W3:R1

_____ גנוטיפ :_______________

:TT אילו מבין סוגי הטטרדות הבאות הינן 5ז. בהכלאה W4:R0 W2:R2 W0:R4 W1:R3 W3:R1

_____ גנוטיפ :_______________

Page 12: מיפוי טטרדות לינאריות

שלבי פיתרון השאלה :

על כמה גנים מדובר ?1. קומבינציות שונות של שקים.3 מתקבלות 5מאחר ובהכלאה שני גנים.

. איזה גנוטיפ יוצר מושבה לבנה ? 2ABמאחר והכלאה בין כל מוטנט ל – WT( מניבה רק דיפלואיד לבן WT וגם הכלאה בין )

שני מוטנטים אדומים מניבה דיפלואיד לבן )משמע דרושים שני הגנים בצורתם הדומיננטית ליצירת צבע לבן(.

(?3 והכלאה 2. איזה סוגי הכלאות אפשריות בין זן מוטנטי אדום לזן הבר הלבן )הכלאה 3

ABXaB ABXAb ABXab PDT AB ,AB ,ab,ab AB ,AB ,Ab,Ab AB ,AB ,aB,aBהטטרדות שיתקבלו

NPD aB, Ab, Ab, aB W2:R2 W2:R2 לאחר מיוזה : AB, Ab, aB, ab TT

ab אך לא aB או Ab יכולים להיות או 2 ומוטנט 1לפי השקים המתקבלים, מוטנט

Page 13: מיפוי טטרדות לינאריות

: 2 למוטנט 1. איזה סוגי הכלאות אפשריות בין מוטנט4 AbxAb AbxaB aBXaB

PDT Ab ,Ab ,aB,aB Ab , Ab ,Ab,Ab aB , aB ,aB,aBהטטרדות שיתקבלוNPD AB, ab, ab, AB W0:R4 W0:R4 לאחר מיוזה :

AB, Ab, aB, ab TT

2 ומוטנט 1 אנחנו מסיקים שמוטנט W0:R4לפי השק שבפועל התקבל שהוא ביחס של וזה גם לא משנה(b או aבעלי מוטציה באותו אלל )לא יודעים אם

: 3 למוטנט 1. איזה סוגי הכלאות אפשריות בין מוטנט5 AbxAb AbxaB aBXaB

PDT Ab ,Ab ,aB,aB Ab , Ab ,Ab,Ab aB , aB ,aB,aBהטטרדות שיתקבלוNPD AB, ab, ab, AB W0:R4 W0:R4 לאחר מיוזה :

AB, Ab, aB, ab TT

3 ומוטנט 1הפעם בגלל שקיבלנו בפועל את שלושת סוגי השקים אנחנו מסיקים שמוטנט הם מוטנטים באללים שונים זה מזה.

PD>TT>NPD אחוזים זה לזה ע"פ היחסים בין סוגי השקים B וA. נוודא שהגנים 688 <2 אכן הגנים בתאחיזה כי

Page 14: מיפוי טטרדות לינאריות

:1הכלאה WT WT x:

כל הטטרדות W4:R0הינן

ABxAB

גנוטיפ

ספורהצבע

ABWA

ABWB

ABWC

ABWD

זהה 2הכלאה :3להכלאה

:1WTxמוטנטכל הטטרדות

W2:R2הינן

aBxAB גנוטי

פספורהצבע

ABWA

ABWB

aBRC

aBRD

:4הכלאה 1xמוטנט:2מוטנט

כל הטטרדות W0:R4הינן

aBxaB גנוטיפ

ספורהצבע

aBRA

aBRB

aBRC

aBRD

:5הכלאה :3 מוטנטx 1מוטנט

טטרדות הינן 88W0:R4

W2:R2 טטרדות הינן 2 טטרדות הינן 10

W1:R3

aBxAbNPDספורהצבע

ABWA

ABWB

abRC

abRD

PTספורהצבע

AbRA

AbRB

aBRC

aBRD

TTספורהצבע

ABWA

abRB

AbRC

aBRD

פיתרון סופי :

Page 15: מיפוי טטרדות לינאריות

 על סמך הנתונים המוצגים בשאלה זו, קבע אם ההצהרות הבאות הינן א.נכון, ב.לא נכון, ג.לא ניתן לדעת. הסבר בקצרה )שורה אחת(.

הינם דומיננטים.1,2,3א. המוטנטים לא נכון, המוטנטים הינם רציסיבים היות וזן הבר לבן, המוטנטים אדומים ,

והדיפלואיד לבן. הינם אללים של אותו גן.2 ומוטנט 1ב. מוטנט

נכון, היות והדיפלואיד אדום ניתן להסיק שכל אחד מההפלואידים מכיל מוטציה באותו גן. הינם אללים של אותו גן.3 ומוטנט 1ג. מוטנט

WT לא נכון, מדובר במוטנטים בגנים שונים. כל אחד מההאפלואידים נושא עותק של הגן

המוטנט בהפלואיד שמנגד ולכן בהכלאתם מקבלים דיפלואיד לבן. . 3 אחוז למוטנט 1ד. מוטנט

PDT>NPD נכון,

:PDT אילו מבין סוגי הטטרדות הבאות 5ה. בהכלאה W4:R0 W2:R2 W0:R4 W1:R3 W3:R1

aB גנוטיפ :aBAb

Ab

Page 16: מיפוי טטרדות לינאריות

:NPD אילו מבין סוגי הטטרדות הבאות 5ו. בהכלאה W4:R0 W2:R2 W0:R4 W1:R3 W3:R1

ab גנוטיפ :abABAB

:TT אילו מבין סוגי הטטרדות הבאות 5ז. בהכלאה W4:R0 W2:R2 W0:R4 W1:R3 W3:R1

aB גנוטיפ :abABAb

Page 17: מיפוי טטרדות לינאריות

2014שאלה ממבחן

בטטרדות סדורות הינה:Mii. התדירות המאכסימלית של חלוקות מסוג 1 

)a 50%התדירות המאכסימאלית שניתן למדוד הינה)b במידה ומדובר במדגם גדול של תאים, ניתן יהיה למדוד תדיריות הקרובות100%ל-)cלא ניתן לקבוע את הערך הנ״ל באופן כללי. תלוי בנתוני השאלה)d-33%התדירות המאכסימאלית שניתן למדוד הינה כ)e-66%התדירות המאכסימאלית שניתן למדוד הינה כ