乙肝病毒 ymdd 变异和 1896 位点变异 的检测
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乙肝病毒 YMDD 变异和 1896 位点变异 的检测. 病毒变异是生物遗传进化的基本因素之一。乙型肝炎病毒( HBV )变异是在慢性感染过程中为适应生存环境而自然发生的,也可发生于应用药物或接种疫苗后。已发现 HBV 序列的变异在基因组各个区域均可发生。. 通常把病毒株分为野毒株( wide strain )和变异株( variation strain )。变异株即发生了突变、插入或缺失、移框突变等变异的病毒株。一些变异株对临床预后和病毒学反应具有重要意义 。. 乙肝病毒常见的变异:. 前 C/C 基因变异 : 1896 位的变异 和 1899 位的变异 - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
乙肝病毒乙肝病毒 YMDDYMDD 变变异和异和 18961896 位点变异位点变异
的检测的检测
病毒变异是生物遗传进化的基本因素之一。乙型肝炎病毒( HBV )变异是在慢性感染过程中为适应生存环境而自然发生的,也可发生于应用药物或接种疫苗后。已发现 HBV 序列的变异在基因组各个区域均可发生。
通常把病毒株分为野毒株( wide strain )和变异株( variation strain )。变异株即发生了突变、插入或缺失、移框突变等变异的病毒株。一些变异株对临床预后和病毒学反应具有重要意义 。
乙肝病毒常见的变异:乙肝病毒常见的变异:前 C/C 基因变异 :
1896 位的变异和 1899 位的变异P 基因变异 :
拉米呋啶引起 YMDD 变异X 基因的变异前 S/S 基因变异
乙肝病毒乙肝病毒 YMDDYMDD 变变异异
是由于长期使用拉米呋啶 (Lamivudine, LAM) 做抗乙肝病
毒治疗 , 使 HBV P 区编码的DNA 聚合酶基因在 739 或 741位点发生突变 , 其编码的 HBV逆转录酶活性部位 YMDD 发生了改变。
YMDDYMDD 变异通常有变异通常有 22 种形式种形式 ::
一种为 P 区 741 位鸟嘌呤被胸腺嘧啶取代 (G→T) ,则其编码的 550 位的蛋氨酸变为亮氨酸 (YMDD→YIDD);
另一种为第 739 位腺嘌呤被鸟嘌呤取代 (A→G) ,则其编码的 550 位的蛋氨酸变为缬氨酸 (YMDD→YVDD )。
YMDDYMDD 变异的意义变异的意义 ::
YMDD 结构域是 HBV 进行逆转录的生物活性部位,也恰恰是拉米夫定干扰 HBV 复制的药物结合位点,这 2 种变异均导致了拉米夫定与多聚酶亲合力的下降或消失 ,而导致对拉米夫定的耐药。体外实验证实, YMDD 变异株对拉米夫定的敏感性降低为野生株的万分之一 。
YMDDYMDD 变异的检测变异的检测
使用试剂:使用试剂: 杭州博赛基因诊断技术有限
公司的“乙型肝炎病毒核酸荧光定量检测及 YMDD 变异检测试剂盒”。于 2005 年 7 月中旬获得国家药监局授予的新药证书。国药证字 S20050052 。
该产品有以下优点该产品有以下优点1. 国内唯一一款获得批准文号的检测
YMDD 变异诊断试剂;2. 国内唯一一款实现 HBV DNA 定量与
YMDD 变异双检功能的试剂;3. 闭管检测:直接在反应管中对 PCR 扩
增产物进行荧光数据采集和分析;4. 结果判断简捷、明确:通过双色荧光
通道检测所得 Ct 值可直接分辨出是否发生 YMDD 变异;
试验原理试验原理
采用乙型肝炎病毒特异引物,利用核酸扩增、荧光标记探针,结合 Taqman MGB 技术,对人血清或血浆中乙型肝炎病毒核酸( HBV DNA )定量检测,同时对 YMDD 位点变异进行检测。
操作步骤操作步骤1.样本采集:抽取病人静脉血
2.0ml ,取血清 0.2ml送检。血清标本在 2~8℃可放置 72小时, -70 ℃可长期保存,标本不宜反复冻融。
2.样本、对照品的处理和加样3.PCR 扩增4. 结果判断
结果判断结果判断Ct 值 结果判断
A 管 Ct > 38, B 管 Ct> 38
HBVDNA阴性
A 管 Ct≤38, B 管 Ct≤38 YMDD 野生型A 管 Ct≤38, B 管 Ct >38
YMDD 变异型
结果判断结果判断
蓝 :A 管曲线 红 :B 管曲线 野生型
结果判断结果判断
蓝 :A 管曲线 红 :B 管曲线 变异型
干扰素耐药的原因干扰素耐药的原因①免疫耐受:母婴垂直传播 HBV 感染后,机体免疫系统发育阶段与 HBV 感染相伴随,误将 HBV认作自身成分,而难以发挥排斥清除反应。
②病毒基因变异:主要是第 1896 位点变异,这种变异株对干扰素治疗不敏感。
③基因整合:病毒基因整合在细胞内,难以清除,可在停药后复制、表达,造成反跳和复发。
④干扰素抗体:机体可能对外源性的干扰素产生中和抗体,降低干扰素疗效。
前前 CC 区区 18961896 位点变位点变异异
是 HBV 中最常见的变异。 1896型突变株可逃逸机体的细胞免疫,干扰素治疗不敏感 , 增强病毒基因组的包装,病毒复制增强,致病性增加。迅速及时进行 A1896 位点突变检测,可以帮助医生诊断 HBeAg阴性是由于 HBV 突变还是一种康复表现。 帮助确定干扰素的治疗。
HBV1896HBV1896 位点变异检测位点变异检测
使用杭州博赛基因诊断技术有限公司的“乙型肝炎病毒 1896位点变异荧光 PCR 检测试剂”。其原理、操作与 YMDD 变异试剂基本相同。
结果判断结果判断Ct 值 结果判断
A 管 Ct > 38, B 管 Ct> 38
HBV阴性
A 管 Ct≤38, B 管Ct≤38
1896 野生型
A 管 Ct≤38, B 管 Ct >38
1896 变异型
2006 .09
谢
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