anaisil dse l aproliferacion celular por · pdf fileproblemas del analisis del dna por...
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ANALISIS DE LA PROLIFERACION CELULARPOR CITOMETRIA DE FLUJO
0 50 100 150 200 250Fluorescence Intensity (IRFL)
020406080
100120140160
Freq
uen
cy
Parámetros Indicadores de Proliferación Celular
G1
MG2
S G0
Células quiescentes
Posición en el ciclo celular:
• DNA• RNA• Proteínas totales• Membranas• Orgánulos• Masa celular
Células en ciclo
Cinética del ciclo celular:
• Síntesis de DNA• Antígenos de proliferación• División celular
Regulación del ciclo celular:
• Proteínas reguladoras
Consecuencias del ciclo celular
• Número de células• Historia replicativa• Diferenciación fenotípica• Muerte celular
Análisis Citométrico de la Proliferación Celular
• Análisis monoparamétrico del contenido en DNA
• Análisis multiparamétrico del DNA:
• DNA + parámetros estructurales
• DNA + parámetros funcionales
• Análisis de otros parámetros asociados a proliferación
Análisis Citométrico de la Proliferación Celular
Análisis monoparamétrico del contenido en DNA:
• Estimación de la distribución de las fases del ciclo
• Suele ser técnicamente más simple
• Requiere un control estricto de los métodos
• Requiere análisis matemático complejo
• Se utiliza con mucha frecuencia
0 1023DNA
0256
Events
Análisis Citométrico de la Proliferación Celular
Análisis multiparamétrico del contenido en DNA:
• Mayor complejidad técnica
• Mayor grado de información biológica
Fluorescence
Forwa
rd S
catt
er
Análisis Citométrico de la Proliferación Celular
• Análisis multiparamétrico del DNA:
•Identificación de subfases en el ciclo celular
• Análisis de la cinética del ciclo celular
• Análisis de la regulación del ciclo celular
• Compartimentación funcional del ciclo celular
•Identificación de subpoblaciones específicas
• Relación entre activación y proliferación
• Relación entre proliferación y diferenciación
Análisis Citométrico de la Proliferación Celular
• Análisis de otros parámetros asociados a proliferación:
• Recuento absoluto del número de células:
• Muestreado volumétrico
• Fluoroesferas de concentración calibrada
• Análisis del aumento de masa celular:
• Morfología
• Contenido en proteína total
• Análisis del reparto de masa en la escisión celular:
• Fluorocromos trazadores
Contenido nuclearde DNA
Emisión de fluorescencia
Salida de voltaje del fotomultiplicador
Conversión analógica-digital
Intensidad de fluorescencia
488 nm 610 nm
Número de CanalNú
mer
o de
Cél
ulas
Tiempo
Vol
taje
Voltaje
Eve
ntos
Colorante fluorescente unido estequiométricamente
Principios del Análisis Citométrico de DNA
GG22MM GG00
GG11
ss
0 200 400 600 800 1000
GG00GG11
ss GG22 MM
Contenido en DNA
Con
taje
2C2C 4C4C
Análisis citométrico del ciclo celularAnálisis citométrico del ciclo celular
Purdue University Cytometry Laboratories
0 200 400 600 800 1000
INTENSIDAD DE FLUORESCENCIA
0 7
5 1
50 2
25 3
00
Análisis citométrico del Ciclo CelularAnálisis citométrico del Ciclo Celular
2C2C 4C4C
Purdue University Cytometry Laboratories
NU
MER
O D
E C
ÉLU
LAS HISTOGRAMA DE DNA
EN UNA POBLACION ASINCRONICA
CUESTIONES EN EL ANALISIS DEL DNAPOR CITO M ETRIA DE FLUJO
PROBLEMAS DEL ANALISIS DEL DNAPOR CITOMETRIA DE FLUJO
1. ANTES DEL CITO M ETRO
2. EN EL CITOMETRO
3. DESPUES DEL CITOMETRO
1. ANTES DEL CITO M ETRO
• PREPARACION DE LA MUESTRA• Células aisladas
• Núcleos aislados
• Material fresco vs fijado
• TINCION: FLUOROCRO M O S
• MANTENIMIENTO DE LA INDIVIDUALIDAD CELULAR
• ENRIQUECIMIENTO DE MUESTRAS DILUIDAS
• PREPARACION AUTOMATICA DE MUESTRAS
OBTENCION DE SUSPENSIONES CELULARES O NUCLEARES
Células en suspensión natural: sangre periférica, cultivos
Tejidos blandos: médula ósea, ganglio
Tejido fijado y parafinado
Lisis de la membrana y destrucción del citoplasma
Tumores sólidos en fresco
Cultivos en monocapa
TECNICAS DE DISOCIACION
OBJETIVO
• Obtención de poblaciones representativas• Rendimiento suficiente
• Preservación de la superficie celular
METODOS DE DISOCIACION
•Disociación mecánica
•Disociación enzimática
•Disociación mixta
TUM O RES SOLIDOS
Desmosomas intercelulares
Carcinomas de células escamosas
Unión al estroma y lámina basal
Adenocarcinomas
DISPERSION MECANICA
• Trituracion con bisturí
• Raspado de superficie externa
• Aspiración con aguja fina
DISPERSION ENZIMATICA• Con proteasas
• Con colagenasas
• Con cocktails de enzimas proteolíticos
COMPARACION DE LOS METODOS DE DISOCIACION
MECANICA
Rendimiento adecuado
Viabilidad aceptable
Preservación de antígenos de superficie
Alteración de membrana
Posibles daños latentes
Mejor rendimiento
Mayor viabilidad
Alteración de antígenos de superficie
Posible alteración de la representatividad
ENZIMATICA
TINCION ESPECIFICA DEL DNA
• Fluorocromos utilizados
• Especificidad de unión
• Calidad de tinción
Análisis citométrico del contenido en DNA
Fluorocromos utilizados:
• No permeables :
• Yoduro de propidio, bromuro de etidio
• SYTOX, SYBR Green
• Etidio monoazida
• Permeables:
• Hoechst 3341
• DAPI
•7-Amino actinomicina D
Análisis citométrico del contenido en DNA
Fluorocromos intercalantes
Fluorocromos que se unen al surco menor
Otros fluorocromos
Yoduro de Propidio Bromuro de Etidio
Hoescht 33342 DAPI
7-AAD LDS-751
ww
w.pr
obes
.co
m
Análisis citométrico del contenido en DNA
Fluorocromos de cianina
Naranja de Acridina
Fluorocromos de acridina
ww
w.pr
obes
.co
m
Fluorocromos de DNA
ww
w.pr
obes
.co
m
Especificidad de unión/calidad de tinción
0 1023
0256
Events
0 1023DNA
0256
Events
Tinción insuficiente
+ 10 minutos/37ºC
DNA
DNA
Especificidad de unión/calidad de tinción
Fluorescence
For
war
d Sc
atte
r
Forward Scatter
Side
Sca
tter
Análisis citométrico del contenido en DNA
Mantenimiento de la individualidad/homogeneidad:
• Eliminación de desechos (debris, background) :
• Uso de discriminadores (FL3)
• Software de substracción de ruido de fondo
Fijación de la suspensión celular:
• Fijación/permeabilización
Eliminación de agregados celulares:
• Filtración de suspensiones
• Sustracción de agregados por hardware
• Sustracción de agregados por software
Sustracción de agregados
Integral Fluorescence
Pea
k Fl
uore
scen
ce
Agregados
Eliminación por hardware (cociente Pico/Integral)
2. EN EL CITO M ETRO
• CALIBRACION DEL INSTRUMENTO
• Fluorosferas
• Partículas biológicas
• CONDICIONES ADECUADAS DE ANALISIS
• Velocidad de flujo
• Alimentación de fotomultiplicadores
• SELECCION DE POBLACIONES ADECUADAS
• CONTROLES Y STANDARDS
Selección de poblaciones
Forward Scatter
Side
Sca
tter
Purdue University Cytometry Laboratories
3. DESPUES DEL CITO M ETRO
•INTERPRETACION DE RESULTADOS:• Correlación con otras observaciones citométricas• Correlación con fenómenos de diferenciación y muerte celular• Correlación con datos clínicos
• METODOS DE SUSTRACCION DE BACKGROUND:• Núcleos cortados• Núcleos rotos• Presencia de poblaciones de interés en el background
• METODOS DE AJUSTE DE LAS FASES DEL CICLO CELULAR:• Programas de dominio público: Cylchred• Programas comerciales: MultiCycle; ModFit
Análisis citométrico del contenido en DNA
Adipocitoshumanos
Cultivo decélulas
Población proliferante asincrónica
Población quiescente
Análisis monoparamétrico del DNA
Perturbación del ciclo celular: Acúmulo en fase S
Control Exp-1
Exp-3Exp-2
Fase % G0/G1: 71.3
S : 22.8G2/M : 5.9
Fase % G0/G1: 60.5
S : 35.7G2/M : 3.8
Fase % G0/G1: 61.2
S : 33.6G2/M : 5.2
Fase % G0/G1: 55.1
S : 41.4G2/M : 3.5
Estudio del ciclo celular en sincronizaciónEstudio del ciclo celular en sincronización
Purdue University Cytometry Laboratories
METODOS DE ANALISIS DEL DNA
1. Análisis monoparamétrico
2. Análisis multiparamétrico:- DNA/morfología- DNA/RNA- DNA/Proteínas totales- DNA/Proteínas específicas- DNA/Otros componentes
Análisis multiparamétrico del DNA
• DNA/Morfología (Light Scatter)
G0
SG2/M
G1
G0
G0 postmit
G2
M
G1
S
Análisis multiparamétrico del ciclo celular
• DNA/Proteínas reguladoras (Ciclinas)
Purdue University Cytometry Laboratories
Análisis multiparamétrico del ciclo celular
• DNA/Proteínas reguladoras (Ciclinas)
Purdue University Cytometry Laboratories
Análisis multiparamétrico del DNA• DNA/Bromo-desoxi-Uridina (BrDU)
• BrDU es un análogo de timidina que se incorpora al DNAen las células en fase de síntesis
• Se revela mediante:• Anticuerpos anti-BrDU (FITC)•Inducción de roturas fotolíticas con Hoechst (SBIP)
ww
w.pr
obes
.co
m
Análisis multiparamétrico del DNA• DNA/Bromo-desoxi-Uridina (BrDU)
• BrDU es un análogo de timidina que se incorpora al DNAen las células en fase de síntesis
• Se revela mediante:• Anticuerpos anti-BrDU (FITC)•Inducción de roturas fotolíticas con Hoechst (SBIP) w
ww.
prob
es.c
om
Análisis multiparamétrico del DNA• DNA/Bromo-desoxi-Uridina (BrDU)
Purdue University Cytometry Laboratories
Análisis Citométrico de la Proliferación Celular
• Análisis de otros parámetros asociados a proliferación:
• Recuento absoluto del número de células:
• Muestreado volumétrico
• Fluoroesferas de concentración calibrada
• Análisis del aumento de masa celular:
• Morfología
• Contenido en proteína total
• Análisis del reparto de masa en la escisión celular:
• Fluorocromos trazadores
Análisis Citométrico de la Proliferación Celular
•Análisis del reparto de masa en la escisión celular:
• Fluorocromos trazadores: CFDA-SE
ww
w.pr
obes
.co
m
Análisis de la Heterogeneidad Celular
Análisis de la Proliferación CelularAnálisis del Ciclo Celular
Diagnóstico / Pronósticoen Oncología
Monitorización del Tratamiento
0 50 100 150 200 250Fluorescence Intensity(IRFL)
020406080100120140160
Freq
uenc
y
Diagnóstico y pronóstico del cáncer:Detección de poblaciones celulareseuploides o aneuploides.
del ciclo celular.Estimación de los tiempos de tránsito por el ciclo celular.
Aplicaciones Clínicas de la Citometría de Flujo
Análisis Citométrico del Contenido de DNA
0 50 100 150 200 250
Intensidad de Fluorescencia (DNA)
020406080
100120140160
F
recu
enci
a
Población Aneuploide
Ciclo Tetraploide
Ciclo Diploide
Clinical Flow Cytometry:Principles and Applications
Bauer KD, Duque RE, Shankey TV (editors)
Williams & Wilkins, Baltimore1993
Guidelines for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Shankey TV, Rabinovitch PS, Bagwell B, Bauer KD,
Duque RE, Hedley DW,
Cytometry 14:472-477, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Samples
Adequate neoplastic material
Permanent morphologic record keptTumor heterogeneityFresh/frozen vs. paraffin-embedded
TV Shankey et al., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Fresh/frozen vs. Paraffin-embeddedAdditional biochemical markers for multiparameter analysis
Improved estimation of S-phase
Fixation artifacts, esp. near diploidQuestionable S-phase estimates
TV Shankey et al ., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Sample Processing
Cell disaggregation
Monitoring cell/nuclei yieldChoice of dye
TV Shankey et al ., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Sample Processing
Biological standards -chicken erythrocytes, trout erythrocytes, human lymphocytes
Assignment of DNA peaks: first peak (left) assumed to be DNA diploid G0/G1 peak
TV Shankey et al ., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Instrument Performance
Instrument linearityNumber of events analyzed
>10,000 for S-phase<10,000 for DNA Index
TV Shankey et al ., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Ability to Detect SubPopulations
Coefficient of VariationPercent of population aneuploid
DNA Index of aneuploid peak
TV Shankey et al ., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Problem of Aggregates
Hardware gatingvs.
Software compensation
TV Shankey et al ., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Data/Histogram Analysis
high CV'sdebrisaggregates
Report as INADEQUATE
TV Shankey et al ., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Data/Histogram Analysis
CV's of <8% required for S-phaseMinimal debris desiredDebris subtraction modelingAggregates obscure tetraploid G0/G1
TV Shankey et al., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Definition of DNA Aneuploidy
DNA Diploid vs DNA Aneuploid
Two distinct peaks requiredAneuploid population >5-10%
(>15% for S-phase determination)
TV Shankey et al., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
S-phase, not S+G2/M, recommended for estimates of tumor cell proliferation
Total S-phase vs. tumor S-phase ?
Problem with diploid/near diploid cells
TV Shankey et al., Cytometry 14:472-277, 1993.
Considerations for Implementation of Clinical DNA Cytometry
Clinical Use of S-Phase Values
Avoid use of published values of numerical cut points for prognosis
Define laboratory range of valueslow, intermediate, high tertilesfor diploid and aneuploid tumors
TV Shankey et al., Cytometry 14:472-277, 1993.
Breast Ovarian
Colorectal Endometrial
Non-small cell lung Bladder
Head and neck ProstateRenal
Malignancies Where DNA Index byFlow Cytometry Has Prognostic
Significance
Breast Lymphoma
Colorectal Bladder (stage?)
Prostate
Malignancies Where S-Phase Fraction byFlow Cytometry Has Prognostic Significance