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Clarity BioSolutions For Synthetic DNA/RNA
オリゴ核酸向け前処理・分析ツールClarity シリーズ
オリゴ核酸の前処理
前処理の最適化（生体試料からの精製）生体試料中からの DNA や RNA/siRNA、脂質複合体などの精製には、液液抽出と固相抽出の組合せが一般的ですが、所要時間が長い・操作手順が多いなどの問題点もありました。近年、加速する核酸関連物質の分析において前処理～分析のハイスループット化が望まれています。この度、生体組織中からの核酸関連物質精製に関して固相抽出のみを使用した新たなご提案が可能となりました。
組織のホモジナイズ
組織のホモジナイズ
サンプルとフェノクロを混合 水層を除去 再調整
溶出
溶出
再調整
固相カートリッジの平衡化
サンプルロード
サンプルロード 洗浄１ 洗浄 2
固相カートリッジの洗浄
血漿など
組織
血漿など
固相カートリッジの平衡化
LLE
SPE・1～2時間の前処理
・操作手順が多い
・自動化や多検体処理に不向き
・約15分の前処理
・操作手順をより簡便に
・自動化や多検体処理が容易
従来法（液 - 液抽出と固相抽出）
Clarity®OTX™ を用いた新提案（固相抽出のみ）
LC/MS(/MS)
再調整
LC/MS(/MS)
組織
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Clarity®OTX™ を用いた生体試料中のオリゴ核酸精製
Clarity OTXは以下の試料に対応（一例です）
Clarity OTX前処理キット内容物
スターターキット オプションターゲットの種類 サンプルの種類
DNA 血漿中
アプタマー 血清中
siRNA 尿中
脂質複合体 唾液中
リポソーム被包体 組織中 50 サンプル分の SPE と試薬を含むスターターキット
操作方法
Clarity OTXで精製後の分析例
Clarity OTXラインナップ
4ステップで簡単精製
Equil.Buffer
MeOH
STEP1
ElutionBuffer
Wash
Buffer
Genomic DNALipidsProteins
Oligo & metabolitesSalts
Sugars
SPEの平衡化
STEP2高分子タンパク・糖・塩・DNAはスルーし除去されます
STEP3脂質や低分子タンパクを除去します
STEP4オリゴヌクレオチドや、その代謝物を溶出させ→ LC orLC/MS（/MS）
サンプルをロード
移動相 A : 200mM HFIP/ 14mM TEA/ 2% MeOH/ 水 移動相 B : 200mM HFIP/ 14mM TEA/ 98% MeOH/ 水グラジエント条件 : 90%A/10%B⇒35%A/65%B (0 ～ 10min)流量 : 0.25 mL/min カラム温度 : 40 ℃ 検出 : UV @ 260 nm
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P/N 製品名 仕様・入数 希望小売価格（税抜）8B-S103-EBJ Clarity OTX 100mg/3mL(50本入り )8E-S103-EGA Clarity OTX 100mg/96-well plate(1 枚入り )AL0-8579 Clarity OTX Lysis-Loading Buffer v2.0 1LKS0-8494 Clarity OTX Extraction Kit 100mg/3mL Cartridges (50本 ) And BuffersKS0-9253 Clarity OTX Extraction Kit 100mg/96 Well Plate(1 枚 ) And Buffers
劇
KS0-8494 は劇物に該当します。「毒物および劇物取締法」に基づいてお取り扱いください。（毒物劇物一般販売業に登録の販売店よりご購入ください。）
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固相抽出Clarity®QSP™ を用いた有機合成後のオリゴ核酸精製
合成反応後のクルードな状態
合成反応後のサンプル 夾雑物の除去および脱トリチル後のサンプル
Clarity QSPを用いた精製
Clarity QSPラインナップ
特徴・利点
サンプルロードWash
脱トリチル基 溶出
夾雑物 トリチル基の付いたオリゴ核酸 90 ～ 95％の収率および精製度
・90～95％の収率および精製度・30分で96サンプルの精製が可能・単純な作業であらゆるオリゴ核酸に対応（DNA, RNA, siRNA, Phosphorothioates etc.）
・自動化のための劇的な処理能力の上昇96well プレート型
チューブ型
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目的の合成反応物
P/N 製品名 仕様・入数 希望小売価格（税抜）8B-S042-LFF Clarity QSP 5g/60mL Cartridge(16本入り )8B-S102-SBJ Clarity QSP 150mg/3mL Cartridge(50本入り )8B-S102-UBJ Clarity QSP 60mg/3mL Cartridge(50本入り )8E-S102-DGB Clarity QSP 50mg/96-well plate(1 本入り )AL0-8280 Clarity QSP DNA Loading Buffer 1LAL0-8282 Clarity QSP RNA-TBDMS Loading Buffer 1L
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オリゴ核酸分析用カラムClarity®シリーズ
近年、機能性核酸として遺伝子発現を抑制するアンチセンスDNAやsiRNA、標的蛋白質と特異的に結合するアプタマーなどを利用した核酸医薬品の開発が注目されています。 またそれらオリゴ核酸の純度確認や精製、代謝物分析などには液体クロマトグラフィーが有効です。ここでは、あらゆるオリゴ核酸（DNA、siRNA、チオ化オリゴなど）に対応可能な LCカラム“Clarity”シリーズをご紹介します。
分析対象物の分子サイズが大きくなると移動速度が遅くなり充填剤内部での拡散が起こりやすくなります。コアシェルカラムを用いることにより充填剤内拡散およびカラム内拡散を抑制できるのでシャープなピークが得られます。
逆相カラム
Clarity Oligo-XT™ 使用 pH範囲の広い（1-12）コアシェル型 C18 カラム
Clarity Oligo-MS™ コアシェル型 C18 カラム
Clarity Oligo-RP™ 使用 pH範囲の広い（1-12）全多孔性 C18 カラム
従来の充填剤
拡散しやすい
Clarity Oligo-XT™
拡散が少ない
オリゴ核酸分析におけるコアシェルのメリット
Clarity Oligo-XT およびOligo-MS
・ Core-Shell Technology を採用した C18 カラム・ オリゴ核酸の高速・高分離分析を実現・ 粒子径は 5 µm、2.6 µm、1.7 µm・ Clarity Oligo-XT™の使用 pH範囲は 1～ 12
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Clarity®カラムを用いたオリゴ核酸の分析例
Clarity Oligo-XT カラムラインナップ例
Clarity Oligo-XT™(C18カラム )
＊Clarity Oligo-XT 以外のカラムについてはお問合せください
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P/N カラム名 カラムサイズ 希望小売価格（税抜）00B-4747-AN Clarity 1.7 µ Oligo-XT 100A 50 x 2.1 mm00D-4747-AN Clarity 1.7 µ Oligo-XT 100A 100 x 2.1 mm00B-4746-AN Clarity 2.6 µ Oligo-XT 100A 50 x 2.1 mm00B-4746-E0 Clarity 2.6 µ Oligo-XT 100A 50 x 4.6 mm00D-4746-AN Clarity 2.6 µ Oligo-XT 100A 100 x 2.1 mm00D-4746-E0 Clarity 2.6 µ Oligo-XT 100A 100 x 4.6 mm00B-4745-AN Clarity 5 µ Oligo-XT 100A 50 x 2.1 mm00F-4745-E0 Clarity 5 µ Oligo-XT 100A 150 x 4.6 mm00D-4745-P0-AX Clarity 5 µ Oligo-XT 100A AXIA Packed 100 x 21.2 mm00F-4745-P0-AX Clarity 5 µ Oligo-XT 100A AXIA Packed 150 x 21.2 mm00F-4745-U0-AX Clarity 5 µ Oligo-XT 100A AXIA Packed 150 x 30.0 mm00G-4745-P0-AX Clarity 5 µ Oligo-XT 100A AXIA Packed 250 x 21.2 mm
移動相 A : 100mM HFIP/ 4mM TEA/ 2% MeOH/ 水 移動相 B : 100mM HFIP/ 4mM TEA/ 98% MeOH/ 水グラジエント条件 : 90%A/10%B⇒80%A/20%B (0 ～ 10min)流量 : 1.5 mL/min カラム温度 : 60 ℃ 検出 : UV @ 260 nm サンプル : Poly(dT) 12-24mer
・ pH 1-12 の範囲で使用可能・ 60 mer のオリゴ核酸まで対応
お問い合わせください
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Clarity®Oligo-MS™
Clarity Oligo-RP™
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https://solutions.shimadzu.co.jp/glc
島津ジーエルシー 検 索
P/N カラム名 カラムサイズ 希望小売価格（税抜）00B-4480-AN Clarity 1.7 µm Oligo-MS 100A 50 x 2.1 mm00D-4480-AN Clarity 1.7 µm Oligo-MS 100A 100 x 2.1 mm00B-4479-AN Clarity 2.6 µm Oligo-MS 100A 50 x 2.1 mm00D-4479-AN Clarity 2.6 µm Oligo-MS 100A 100 x 2.1 mm00D-4479-E0 Clarity 2.6 µm Oligo-MS 100A 100 x 4.6 mm
P/N カラム名 カラムサイズ 希望小売価格（税抜）00B-4441-B0 Clarity 3µm Oligo-RP 50 x 2.0 mm00B-4441-E0 Clarity 3µm Oligo-RP 50 x 4.6 mm00D-4441-B0 Clarity 3µm Oligo-RP 100 x 2.0 mm00D-4441-E0 Clarity 3µm Oligo-RP 100 x 4.6 mm00F-4441-B0 Clarity 3µm Oligo-RP 150 x 2.0 mm00F-4441-E0 Clarity 3µm Oligo-RP 150 x 4.6 mm00D-4442-N0 Clarity 5µm Oligo-RP 100 x 10.0 mm00F-4442-E0 Clarity 5µm Oligo-RP 150 x 4.6 mm00G-4442-E0 Clarity 5µm Oligo-RP 250 x 4.6 mm00G-4442-N0 Clarity 5µm Oligo-RP 250 x 10.0 mm00F-4445-N0 Clarity 10µm Oligo-RP 150 x 10.0 mm
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