Loc Type Name RefSeq INSDC Size (Mb) GC% Protein rRNA

tRNA

Other RNA Gen

Pseudogene

master WGS

- AEMK00000000.1 6,950.71 42.3 - - - - - -

Nuc Chr 1 NC_010443.4 CM000812.4 315.32 41.3 4,267 - 21 1,708 3,573 343Nuc Chr 2 NC_010444.3 CM000813.4 162.57 42.9 4,220 - 25 1,094 3,131 253

Nuc Chr 3 NC_010445.3 CM000814.4 144.79 44.5 2,801 - 33 1,185 2,280 101

Nuc Chr 4 NC_010446.4 CM000815.4 143.47 42.2 2,607 - 58 1,180 2,065 94

Nuc Chr 5 NC_010447.4 CM000816.4 111.51 42.62,322 - 11 763 1,822 109

Nuc Chr 6 NC_010448.3 CM000817.4 157.77 45.4 3,999 2 14 1,283 2,890 122

Nuc Chr 7 NC_010449.4 CM000818.4 134.76 43.8 3,149 - 172 1,034 2,595 177

Nuc Chr 8 NC_010450.3 CM000819.4 148.49 40.4 1,630 - 2 812 1,437 99

Nuc Chr 9 NC_010451.3 CM000820.4 153.67 41.9 2,631 - 5 1,141 2,199 130

Nuc Chr 10 NC_010452.3 CM000821.4 79.1 43.2 948 - 5 613 1,024 103

Nuc Chr 11 NC_010453.4 CM000822.4 87.69 41.5 702 - 5 557 793 42Nuc Chr 12 NC_010454.3 CM000823.4 63.59 47.6 2,268 - 32 691 1,575 49

Nuc Chr 13 NC_010455.4 CM000824.4 218.64 40.9 2,933 - 3 1,280 2,382 171

Nuc Chr 14 NC_010456.4 CM000825.4 153.85 43.7 3,263 - 12 1,006 2,090 118Nuc Chr 15 NC_010457.4 CM000826.4 157.68 40.8 1,856 8 816 1,636 130

Nuc Chr 16 NC_010458.3 CM000827.4 86.9 41.1 722 - 6 530 799 60

Nuc Chr 17 NC_010459.4 CM000828.4 69.7 44.8 1,269 - 7 520 1,033 41

Nuc Chr 18 NC_010460.3 CM000829.4 61.22 43.4 940 - 17 541 863 36Nuc Chr X NC_010461.4 CM000830.4 144.29 41.3 2,000 - 6 445 1,295 159

Nuc Chr Y NC_010462.2 CM001155.2 1.64 41.1 37 - - 4 21 6

MT Chr MT NC_000845.1 AF034253.1 0.016613 39.5 13 2 22 - 13 -

Un - - 211.87 42.1 2,823 - 35 1,101 3,276 74

GENOME BABI

Reference genome:

Sus scrofa Sscrofa10.2. Submitter: The Swine Genome Sequencing Consortium (SGSC)

Genom haploid dari babi peliharaan diperkirakan 2.800 Mb. Sedangkan pada babi

hutan ukuran genom mirip dengan ukuran genom manusia yaitu sekitar 2.7Gb. Genom

diploid diselenggarakan di 18 pasang autosom dan dua kromosom seks. Skala seluruh genom

babi mungkin sebanyak tiga puluh lima ribu gen endogen, sehingga perubahan genetik tidak

terlalu signifikan dalam hal untuk mengubah sifat dasar babi yang terbentuk. Babi muncul

menjadi spesies mirip induknya, meskipun tidak sepenuhnya babi secara genom. NR6A1,

PLAG1 and LCORL merupakan 3 gen berbeda yang berpengaruh terhadap pertambahan

panjang (pertumbuhan) yang secara alami dimiliki oleh babi hutan Eropa (European wild

boar).

Babi Hutan (Sus scrofa) merupakan model organisme yang penting untuk penelitian

kesehatan karena paralel dengan manusia. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ukuran total

genom babi adalah 2,8 miliar pasangan basa dan mengandung 21.640 gen penyandi protein.

Hal ini mirip dengan mamalia lain, termasuk manusia. Menariknya, variasi dalam genom

babi, bahkan dalam keturunan komersial, lebih dari dua kali lipat manusia. Kemiripan antara

manusia dan babi juga ada fungsi ginjal, struktur pembuluh darah, dan tingkat pernapasan.

Babi digunakan sebagai model organisme dalam banyak bidang penelitian medis termasuk

obesitas, penyakit jantung, endokrinologi, alkoholisme, diabetes, nefropati, dan transplantasi

organ. Babi juga pertanian penting, karena babi merupakan sumber utama protein di seluruh

dunia.

Setiap babi memiliki sekitar 70 miliar sel, masing-masing berisi 38 kromosom dalam

inti setiap sel. Dua dari kromosom, yang disebut kromosom seks, sebagian besar mendikte

jenis kelamin babi: dua kromosom X-mengakibatkan babi berjenis kelamin betina sementara

satu kromosom X dan satu kromosom Y hasilnya babi laki-laki. Sisanya 36 kromosom yang

disebut autosom. Semua kromosom terdiri dari dua helai spiral antar-wined DNA, yang

terdiri gula, basa nitrogen dan fosfat. Basa nitrogen melekat pada gula pada C1. Adenin

selalu dikaitkan dengan timin, dan sitosin untuk guanin. Berdasarkan hasil penelitian, primer

p131 dan p408 pengapit lokus PRE-1 hanya terdapat pada genom babi.

Lampiran

Daftar Pustaka :https://www.pig333.com/what_the_experts_say/the-pig-genome_6769/ diakses pada 21-Jan-2013http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome?term=sus%20scrofa%20[Organism]&cmd=DetailsSearch