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Page 1: €¦ · Web view6.3 按客户所撰写文章拟投杂志的要求提供分辨率和大小合格的图表; 6.4根据客户需要组织≥1次代谢组学分析培训班培训。

第一包:急性心梗、心衰、动脉瘤代谢组检测服务1.服务范围:对 150 个样品进行提取、LC-MS 非靶向代谢组检测、非靶向脂质组检测、LC-

MS 靶向氨基酸及衍生物检测和相应数据分析。2.检测要求2.1 样本提取2.1.1 LC-MS 非靶向代谢组检测样品提取:血样在 4℃缓慢解冻后进行分装;另外取每个样品适量,混合后制备成 QC 样

品,所有样品-80℃保存待用。样品制备时,4℃环境下每 100μl 样品中加入

400μl 预冷的甲醇/乙腈(1:1,v/v)溶液,混旋,-20℃静置

10min,14000rcf,4℃离心 15min,取上清冻干待用。 2.1.2 非靶向脂质组检测样品提取:血样在 4℃缓慢解冻后取适量样品,加入适量 MTBE/甲醇溶液,涡旋,3000

rpm 离心 10 min,取 800 µL 有机相,氮气吹干后,-80℃保存待用。2.1.3 LC-MS 靶向氨基酸及衍生物检测样品提取:取样品后,在 4℃缓慢解冻后进行分装;每份样品加入 800μl 甲醇/乙腈(1:1,

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v/v),涡旋混旋,低温下分别进行超声,-20℃孵育 1h 沉淀蛋白质,

13000rpm,4℃离心 15min,取上清冻干,-80℃保存待用。2.2 检测内容:2.2.1 LC-MS 非靶向代谢组对样本中基础代谢物相对定量分析(QC RSD<

30%的 peak 占比大于 70%)2.2.2 非靶向脂质组定性、相对定量非靶向检测样本中脂类代谢物 (QC RSD

<30%的 peak 占比大于 70%)2.2.3 LC-MS 靶向氨基酸及衍生物检测样本中 25 种氨基酸及其衍生 2.3 样本要求血浆样品>1.5 mL

2.4 质谱条件2.4.1 LC-MS 非靶向代谢组质谱条件:正离子模式(ESI+)、负离子模式

(ESI-);2.4.2 非靶向脂质组定性、相对定量非靶向检测质谱条件:正离子模式

(ESI+)、负离子模式(ESI-), 正离子模式:M+H/M+NH4,负离子模式:

M-H/M-CH3COO;

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2.4.3 LC-MS 靶向代谢组检测质谱条件:正离子 MRM 采集模式;3.数据分析要求3.1 非靶向代谢组学、脂质组学数据:质谱数据采用软件 XCMS 软件进行数据

提取、以及代谢物标准品数据库检索。分析软件为:SIMCA-P 软件;进行主成

分分析(PCA),偏最小二乘判别分析(PLS-DA),正交偏最小二乘判别分析

(OPLS-DA)。采用 t-test 或 One-way ANOVA 对代谢物进行显著性分析。3.2 LC-MS 靶向代谢组学数据:使用 Analyst software 软件对 MRM 原始数

据进行提取,得到各代谢物的峰面积。3.3 归一化:根据样品类型选择合适的归一化方法。3.4 数据产出统计及所测代谢物的定性、定量/半定量分析;定量计算:根据目

标色谱峰积分面积换算。3.5 数据质量: LC-MS QC RSD<30%的 peak 占比大于 70%

3.6 生物信息学分析3.6.1 KEGG 通路注释3.6.2 KEGG 通路富集分析3.6.3 层次聚类分析

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4.项目周期每批次样本检测≤3 个月5. 项目验收要求5.1 QC RSD<30%的 peak 占比大于 70%

5.2 将 QC 样本总离子流图进行谱图重叠比较,要求各 QC 样品色谱峰的响应

强度和保留时间基本重叠。5.3 计算各组平均值及 T-testp 值5.4 PCA 分析:提供 PCA 得分图5.5 PLS-DA 分析:提供 PLS-DA 得分图5.6 OPLS-DA 分析:提供 OPLS-DA 得分图6.售后服务6.1 数据验收合格后,提供≥1 年的售后服务;6.2 提供技术培训及咨询服务,要求提供售后服务方案;6.3 按客户所撰写文章拟投杂志的要求提供分辨率和大小合格的图表;6.4 根据客户需要组织≥1 次代谢组学分析培训班培训。第二包:心梗及心衰代谢组靶向验证服务1.服务范围:

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对 290 个样品进行提取、NMR 代谢指纹图谱检测、UHPLC-MS 代谢指纹图谱

检测、总脂肪酸组成检测、游离脂肪酸检测、磷脂检测、胆碱代谢通路检测、

胆固醇代谢通路检测、肠道菌群共代谢通路检测、炎症相关代谢通路检测和相

应数据分析。2.基本要求:具备高通量的 NMR 检测和 UHPLC-MS 检测和分析能力。3.检测要求3.1 样本要求3.1.1 血样>500 μL

3.1.2 组织>100MG

3.1.3尿样>2ML

3.2 样本提取和衍生化3.2.1 NMR 检测样本提取:血样使用甲醇深沉法除去蛋白等大分子,离心后取

上清,加入含内标 TSP 和氘代试剂的 Na+/K+缓冲液对样品 pH 值进行调整,转

移到 5mm核磁管中待测;尿样使用自主研发的试剂盒除去 Ca2+、Mg2+,加

入含内标 TSP 和氘代试剂的 Na+/K+缓冲液对样品 pH 值进行调整,转移到

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5mm核磁管中待测;组织样本加入甲醇水提取液,使用研磨仪打碎后,经过

多次冰浴超声离心,合并取上清,冷冻干燥后重溶于含内标 TSP 和氘代试剂的

Na+/K+缓冲液,转移到 5mm核磁管中待测。3.2.2 GC-MS 检测样品提取:血样加入内标液,甲酯化后反复萃取,合并上清

挥干,重溶于有机相中,转移到尖底瓶中待测;组织加入提取液、内标液和研

磨珠进行研磨后,甲酯化后反复萃取,合并上清挥干,重溶于有机相中,转移

到尖底瓶中待测;3.2.3 UHPLC-MS 检测样品提取:血样、尿样加入内标液,加入甲醇水提取液

离心取上清进行衍生化,再溶解在有机相中,转移到带内衬管的尖底瓶中待测;

组织加入提取液和研磨珠进行研磨后,加入内标液,进行衍生化,再溶解在有

机相中,转移到带内衬管的尖底瓶中待测。3.3 检测:3.3.1 NMR 定性、定量非靶向检测样本中 80余种代谢物(TSP 半峰宽

≤1.2Hz,一维H 谱单个样本检测时间≤12 分钟,同一样本的重复性

≥90%)

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3.3.2 UHPLC-MS 定性、半定量非靶向检测样本中 100余种痕量代谢物(单个

样本检测时间≤15 分钟,同一样本的重复性≥80%)3.3.3 GC-MS 定性、定量靶向检测样本中胆固醇代谢通路中的 37 种总脂肪酸

组成和 21 种游离脂肪酸(单个样本检测时间≤15 分钟,同一样本的重复性

≥80%)3.3.4 定性、定量靶向检测样本中胆碱代谢通路中的 110余种溶血磷脂酰胆碱,

胆固醇代谢通路中的 120余种磷脂、37 种胆汁酸和 24 种固醇,肠道菌群共代

谢通路中的 49 种有机羧酸,炎症相关代谢通路中的 120余种类花生酸和 48

种激素(单个样本检测时间≤15 分钟,同一样本的重复性≥80%)3.4 检测要求3.4.1 NMR脉冲序列:预饱和压制水峰的 NOESYGPPR1D

3.4.2 UHPLC-MS 质谱条件:负离子模式(ESI-),多反应监测(MRM)3.4.3 检测数据量:NMR 每个样本数据大小 720KB,UHPLC-MS 每个样本数

据大小 20M

3.4.4 数据质量:NMR QC 重复率≥90%,UHPLC-MS QC 重复率≥80%

4.检测结果统计要求

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4.1 基本数据质控:NMR 数据进行相位、基线较正。4.2 数据产出统计及所测代谢物的定性、定量/半定量分析。5.结果产生要求5.1 标准数据分析:5.1.1NMR 数据预处理:相位较正、基线较正、定标;5.1.2切除无效部分:切除溶剂峰、易干扰分析的外部添加物质如 EDTA抗凝

剂形成的峰;5.1.3 归一化:根据样品类型选择合适的归一化方法,血样相对体积归一化,

组织相对重量归一化,尿样总面积归一化;5.1.4 主成分分析(PCA):将高维空间的数据点向合适的低维正交空间做投

影,同时使原数据的变异得到最大程度的保留;5.1.5 偏最小二乘判别分析(PLS-DA):通过偏最小二乘法找到与分组信息

(Y变量)相关性最强的主成分,即找到对组间区分贡献最大的主成分。与

PCA 相比, PLS-DA 具有更好的分类效果;5.1.6排列实验验证:对 PLS-DA 模型的有效性进行检验,通常情况下认为交

叉验证 Q2Y > 0.4 时模型有较好的预测能力,如果排列实验所有随机排列后

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模型的 R2Y 值和 Q2Y 值都比实际模型对应的 R2Y 值和 Q2Y 值要小,则表明

实际模型是成立的,即组间的差异具有统计学显著性,否则实际模型就是无效

的;5.1.7 正交化偏最小二乘判别分析(OPLS-DA):将 PLS-DA 与正交信号校正

相结合的一种多变量统计方法,通过正交化处理,OPLS-DA 的第一主成分只

包含对组间区分有贡献的信息而去除了与组间区分无关的结构噪音等信息。结

果用得分图和相关系数负载图来表示,主要用于挖掘NMR 数据(X变量)和分

组信息(Y变量)之间的相关信息;5.1.8 CV-ANOVA:给出与传统统计学中类似的 P 值,当 P < 0.05 时,表明

OPLS-DA 模型是有效的;5.1.9差异性代谢物定性定量分析:根据相关系数负载图中显示的差异性代谢

物,在 NMR 二维谱图中,根据 H 和 C 的连接关系进行定性分析;在 NMR 一

维谱图的积分数据中,根据已知浓度的内标进行定量分析。5.1.10 UHPLC-MS 预实验:建议标准曲线;5.1.11 定量计算:根据目标色谱峰积分面积换算。

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5.2 高级信息分析5.2.1 能量代谢分析5.2.2 中心碳代谢分析5.2.3 代谢流分析5.2.4 胆碱代谢通路分析5.2.5 胆固醇代谢通路分析5.2.6 肠道菌群共代谢通路分析5.2.7炎症相关代谢通路分析5.2.8 多组学数据整合6.项目周期2 个月以内7.售后服务7.1 数据验收合格后,提供≥1 年内售后服务;7.2 提供技术培训及咨询服务,要求提供售后服务方案;7.3 按客户所撰写文章拟投杂志的要求提供分辨率和大小合格的图表;7.4 根据客户需要组织≥1 次代谢组学分析培训班培训。

第三包:主动脉瘤全外显子测序服务

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1.服务内容:对采购人提供的 400例样本进行提取建库测序分析。2.平台要求:2.1 供应商需自主拥有≥20台 Illumina高通量测序仪器设备。2.2 供应商需具备高性能计算平台,总内存≥300TB,总存储≥50PB。2.3 供应商需有≥1000人的自建中国人种数据库,用于中国人种突变频

率注释。2.4 供应商具有 ISO9001 质量管理体系认证。3.团队要求:3.1核心团队≥5人及以上;

3.2 成员需有≥10 个;

3.3 产品、技术、分析团队整体人数≥50人。4.样本提取:低温运输样本,对寄送的组织或血液样本,使用 CTAB 法提取基因组

DNA。DNA 样本需要进行琼脂糖凝胶电泳进行质量检测,条带清晰,无 RNA

污染,无蛋白污。采用 Qubit 对 DNA浓度进行精确定量,DNA 总量≥0.6

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μg,浓度≥20ng/μl。5.建库测序:5.1 采用试剂盒捕获全部外显子及侧翼区,构建 180-280 bp DNA 文库。5.2 使用高通量测序平台进行 PE150 测序。5.3 平均样本测序数据量≥10G,平均测序深度≥100X。5.4 测序质量要求:Q20>90%,Q30>80%;碱基类型分布均匀,无

GC 分离;外显子区域的精准覆盖率(>10X)不低于 90%。5.5 每个文库数据产出不低于目标数据量的 98%。5.6 建库测序周期不超过 27 个自然日。6.信息分析流程6.1 数据质控对原始数据进行去除接头序列及低质量 reads 的处理;数据产出统计及测

序数据的成分和质量评估。6.2 序列比对将质控后的有效测序数据通过 BWA 比对到参考基因组,统计测序深度及

覆盖度。

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6.3变异检测及注释6.3.1 比对后利用 SAMtools识别 SNP 和 InDel,并采用国际惯用的过滤

标准对 InDel结果进行过滤。采用 CoNIFER 软件来检测 CNV。6.3.2变异筛选和统计之后,对筛选出的 SNV、InDel、CNV 三种变异分

别进行变异信息的注释,包括千人基因组计划、ExAC、Novo-Zhonghua等

数据库的注释信息。6.4 高级分析6.4.1 基于变异有害性的筛选6.4.1.1突变位点筛选:筛选的突变过滤千人基因组数据库、ESP6500 数

据库和 gnomAD 数据库;保留外显子区或剪接位点区的变异;去除未预测为

影响剪接且处于高度保守区的同义突变,去除 repeat区的非移码 InDel;

SIFT,Polyphen,MutationTaster,CADD 软件预测位点有害性。6.4.1.2 突 变 位 点 有 害 性 分 类 : 依 据 ACMG 标 准 将 变 异 分 为

pathogenic(致病的 ) 、 likely pathogenic(可能致病的 ) 、 uncertain

significance(致病性不明确的)、likely benign(可能良性的)、benign(良性

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的) 。6.4.1.3结构变异 CNV 有害性分析:使用数据库 DGV 和 CNVD 进行变异

注释,依据注释情况对 CNV 进行分类。6.4.2 基于选样信息的筛选6.4.2.1 显性/隐性遗传模式分析:根据提供家系图进行显性遗传模式或隐

性遗传模式筛选。6.4.2.2新生突变筛选:核心家系进行 de novo SNP/InDel/CNV筛选,

并计算 SNP/InDel筛选突变速率。6.4.2.3共有突变筛选:散发样本进行共有突变筛选,筛选比例是 10%以

上的患者中共有的突变。6.4.3 基于基因功能和表型的筛选6.4.3.1候选基因富集分析:对候选基因进行 GO功能富集和 KEGG途径

富集分析。6.4.3.2 基因与疾病表型关联分析:针对筛选出的候选基因,依据其与疾

病的关联强弱进行排序,并构建基因-表型-疾病之间的关联图。6.4.3.3 蛋白功能互作网络分析:对候选基因集进行蛋白网络互作分析,

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寻找相互作用的共调控基因。6.4.4位点水平关联分析6.4.4.1 统计 case-control 中突变和不突变的 allele 数量,进行 Fisher

检验。6.4.4.2绘制 Manhattan 图和 QQ 图。6.4.4.3 p 值显著位点所在基因与疾病相关性分析。6.4.4.4 对特别感兴趣的位点进行连锁不平衡分析,绘制 LocusZoom 图和

连锁不平衡图。6.4.5 基因水平关联分析6.4.5.1过滤筛选:依据文献过滤筛选条件及客户自定义的过滤筛选条件

筛选低频有害的变异位点。6.4.5.2 统计 case-control 中某基因上突变和不突变的 allele 数量,进行

Fisher 检验。6.4.5.3绘制 Manhattan 图和 QQ 图。6.4.5.4p 值显著位点所在基因与疾病相关性分析。7.项目周期:每批样本从样本质检合格后,≥60 个自然日内完成所有建库

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测序及数据处理工作,并提供结题报告。8.数据存贮周期:≥36 个月9.数据验收标准:9.1 交付所有测序原始数据、QC过滤后数据,全部分析结果及项目分析报

告。9.2单个样本数据量不少于 10G raw data。10.售后服务10.1 成果交付两年内,供应商提供免费的项目咨询服务。

第四包:主动脉瘤一代测序服务1.服务范围:对 18000 个样品进行 ABI 3730XL 测序反应。2.检测要求2.1 可针对 PCR 产物、菌液和质粒样品。2.2 预检2.2.1 样品编号:对样品核准并编号2.2.2电泳:2.2.2.1 将样品码放顺序,依次开盖或掀膜;

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2.2.2.2 使用 0.5-10μl 的可调节八道移液器取 2ul 样品加入到酶标板相应孔的

6ul溴酚兰溶液中,移液器吹打混匀 3 次,在酶标板上标明原板板号,再进行

电泳操作;2.2.2.3 使用 0.5-10μl可调节八道移液器,以 8 个样品为一组分别将上述 8ul

混合液全部加入到 1%的琼脂糖凝胶中,使用 0.2-10μl 的电动可调节单道移液

器加 10ng/ul Marker DL2000 2ul,调节电压至 185V 电泳时间 25min

2.2.2.4电泳结束后,照胶,在胶图上做相应标记。3.实验步骤3.1 提取:菌液样品,先根据抗性加对应的抗生素再采用质粒提取试剂盒。3.2 检测:琼脂糖凝胶电泳查看质粒DNA 提取情况和浓度。3.3.纯化3.3.1把原管中未纯化的 PCR 产物样品逐一按顺序移取至 1.2%琼脂糖凝胶

(切胶专用 TAE)中(每个样品在原管中剩余约 3ul);3.3.2 用 0.5---10ul 单 道 可 调 移 液 器 在 每 排 中 加 入 DL2000

Marker(10ng/ul)2ul 以标定目的片段分布情况;3.3.3 在紫外灯下用切胶专用刀片切下含目的片段最亮的凝胶,凝胶体积越小

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越好,并尽可能缩短紫外灯照射时间,将切下的凝胶小块放入预先标记样品孔

号的 1.5ml 离心管中;3.3.4 采用 PCR 产物纯化试剂盒。3.4 样本稀释据综合纯化后的样品原液浓度、体积及样品片段大小,将样品条带与 Marker

进行比较,根据表一所示计算加水量。4.上机检测。4.1 测序要求4.1.1 测序方法:Sanger 测序法。4.1.2 数据测序质量:碱基质量 Q20 标准,有效读长不少于 700bp。5.测序结果5.1 测序结果包含报告单、word 文档的序列和原始峰图 ab1 格式。5.2从原始峰图文件中可查看碱基突变情况、突变类型(无突变、杂合突变、

纯合突变)、突变位点的区域序列等等,结合峰图查看软件 chromas 和分析

结果可快速准确查看到突变位点在峰图中的具体情况。

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6.项目周期依据项目进展分批次送样本测序,收到样本后 24 小时内以邮件方式返回测序

结果。7.验收标准和方式7.1 质控7.1.1 所有检测过程都有严格的 SOP,保证结果的准确性和可追溯性;7.1.2 需保证每一个成功测序反应的色谱图文件峰形清晰的长度在 750bp 以上;7.2 验收标准7.2.1完成 18000 个反应的测序工作,碱基质量 Q20+>750bp。7.2.2 提交项目完成报告,说明项目完成情况。8.售后服务8.1免费提供测序引物设计;8.2.免费拼接序列;8.3答疑响应时间≥8 小时;

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8.4 对测序结果不佳的样本免费进行检测。第五包:主动脉瘤、心梗、心衰RNA测序服务

1.检测内容:对 500 个样品进行提取、检测、文库构建、PE150 测序和进行

数据分析2.检测要求2.1 样本 RNA 提取2.1.1 样本处理2.1.1.1 组织样本:50mg 组织在液氮中充分研磨后加入 1mL TRizol;

2.1.1.2细胞样本:单层培养细胞,吸去培养液,加入适量的 TRizol,每

10cm2 加入 1mL TRizol,;细胞悬液,离心收集细胞。每 5×106细胞加入1mL TRizol ;

2.1.1.3 血液样本:直接取新鲜的血液,加入 3倍体积 TRizol,充分振荡混匀;2.1.2 将匀浆样品在 15~30℃放置 5min,使得核酸蛋白复合物完全分离;2.1.3 4℃ 12000 rpm(~13400g)离心 10min,取上清;2.1.4 每使用 1mL TRizol 加 2mL 氯仿,盖好管盖,剧烈振荡 15 sec,室温

放置 3min;

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2.1.5 4℃ 12000 rpm(~13400g)离心 10~15min,取中层和上层无色的水

相,转移到新管中;2.1.6新管中加入等体积异丙醇,混匀,室温放置 20~30min;2.1.7 4℃ 12000 rpm(~13400g)离心 10min,去上清,离心后在管侧和管

底形成胶状沉淀;2.1.8 加入 1ml 75%乙醇洗涤沉淀;2.1.9 4℃ 5000 rpm(~2300g)离心 3min,倒出液体,注意不要倒出沉淀,

剩余的少量液体短暂离心,然后用枪头洗出,注意不要吸弃沉淀;2.1.10室温放置约 2~3min晾干,根据实验需要,加入 30~100µL RNase-

Free ddH2O,反复吹打、混匀,充分溶解 RNA。2.2 .样本要求2.2.1 RNA 样本2.2.1.1真核:总量≧1.5µg(单次建库),浓度≧50ng/µl ,RIN≥7, 28S/18S≥1.0

2.2.1.2风险量要求:总量≧200ng(单次建库),浓度≧20ng/µl。2.2.2 组织样本:新鲜动物组织干重 ≥50mg。2.2.3细胞样本:新鲜培养细胞(细胞数) ≥2×105cell 建议最优送样量

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为 1×107cell。2.2.4 血液样本:分离白细胞或有核细胞(须在血液采集后半小时内进行,

血液不能冻存),然后再进行 RNA 提取。3.检测结果统计要求3.1 测序片段被高通量测序仪测得的图像数据经 CASAVA 碱基识别转化为

序列数据(reads),文件为 fastq 格式,其中主要包含测序片段的序列信

息以及其对应的测序质量信息。3.2 测序获得的原始数据中包含少量带有测序接头或测序质量较低的

reads。3.3 为了保证数据分析的质量及可靠性,需要对原始数据进行过滤。主要包

括去除带接头(adapter)的 reads、去除含N(N 表示无法确定碱基信息)的

reads、去除低质量 reads(Qphred <= 20 的碱基数占整个 read 长度的

50%以上的 reads)。3.4 对 clean data 进行 Q20,Q30 和 GC 含量计算。 3.5 所有分析均是基于 clean data 进行的高质量分析。4.扩展延伸分析

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4.1 基本信息分析4.1.1 原始序列数据、测序数据质量评估原始数据为 fastq 格式,为了保证数据分析的质量及可靠性,需要对原始

数据进行过滤。并对 clean data 进行 Q20,Q30 和 GC 含量计算。 4.1.2参考序列比对分析应用 Top Hat 的 spliced mapping 算法对预处理后的 reads 进行

Genome mapping ,允许将不能全长匹配的 reads 分割进行

mapping,较适用于真核 (有内含子间区 )转录组测序数据;比对允许 2 个

错配,每个错配,每 reads允许 multi hits≤2 。Mapping 生成的比对结

果为 BAM 文件。4.2 高级信息分析4.2.1 基因表达水平分析,RNA-seq 相关性分析4.2.2差异表达分析将 bam 文件转换为 bed 文件,统计 bed 文件中的 readcount ,然后进行

假设检验概率计算,最后进行多重假设检验校正,得到 FDR 值(错误发现

率 ),得到差异表达分析结果,筛选得到差异基因。

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4.2.3差异基因GO 富集分析差异基因的分子功能(Molecular Function )、生物过程( Biological

Process Biological )、和细胞组成( Cellular Component )进行注

释、富集分析。4.2.4差异基因 KEGG 富集分析KEGG 富集程度通过Rich factor、Qvalue 和富集到此通路上的基因个数

来衡量。其中 Rich factor 指该 pathway 中富集到的差异基因个数

(Sample number Sample number )与注释基因个数(Background

number)的比值。Rich factor越大,表示富集程度越大。4.2.5可变剪切分析用 ASprofile 软件对 Cufflinks 预测出的基因模,对每个样品的可变剪切事

件分别进行分类和表达量统计。

4.2.6新转录本预测

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预测 antisense transcript 以及 intron transcript。通过测序蓄力在基因

组上富集的方向性进行反义转录本预测,如果有富集区域方向与基因转录

本方向相反且达到一定的富集阈值,即可认为其为 antisense

transcript。将完全位于 intron transcript区的一段富集片段作为 intron

transcript。4.2.7SNP 和 InDel 分析通过测序数据得到基因组每个位点的碱基富集情况,然后统计每个点富集

的碱基种类,得出可能存在的变异。4.2.8 蛋白互作网络分析及差异基因转录因子分析

5.项目周期:≤45天6.售后服务6.1 售后可提供 3 个月的免费个性化分析服务6.2 样品可以根据客户要求返还6.3 对测序结果不佳的样本免费进行检测

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7. 验收标准Q30 ≥ 80%;数据量≥5G;

第六包:microRNA检测服务1. 检测内容:检测 300 个样品中 10 个 miRNA

2. 检测要求: 2.1灵敏度:可检测 50pg RNA 中的 miRNA

2.2实用性:检测所有成熟miRNA

2.3兼容性:验证引物,试剂配套 2.4 重复性:R2 > 0.99

2.5特异性: 可准确区分 miRNA 成熟链和前体、高度同源的 miRNA也能

被准确检测 2.6 检测数量:3000 个 2.7 个性化:可接受个性化定制 2.8 检测物种:无限制 2.9 样品类型:组织、细胞、血浆、血清、体液、外泌体等 2.10 质控方法:RT、内参、外参监控 2.11引物设计:人源的引物库,特异性 RT引物以及特异性 Forward引物,

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全部使用专利算法设计,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条

带均呈单一条带,且与扩增产物相符3.分析方法: 3.1 原始数据处理分析 3.2 ct 值数据分析 3.3 内参、外参基因表达量分析 3.4 miRNA 表达量分析 3.5 靶基因调控预测分析3.6 miRNA功能分析靶基因调控预测分析3.7miRNA与靶基因mRNA 3’UTR 分析

5.8miRNA与mRNA、LcRNA 相互作用分析4.项目周期:≤25工作日5.售后服务 5.1 提供样品的采集、保存、运输方法指导,并协助样品的采集、保存以

及运输 5.2 提供数据处理、作图培训服务 5.3 提供 2 年技术服务培训及服务

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5.4 提供 3 次生物信息分析培训5.5 提供数据存储 12 个月服务5.6 提供 2 次/年数据调取服务第七包:组学数据深度挖掘服务

1.研究目的: 基于医保数据对我国心血管疾病患者的患病情况进行分析,并提供我国心血

管疾病患者患病情况分析报告。2.项目实施阶段及交付物:2.1 制定数据分析方案2.1.1 主要实施阶段2.1.1.1完成整个数据分析方案的制定工作主要包括研究设计方案(具体参数

包括:研究设计类型、起始及结束时间、洗脱期时长等)、数据提取方案(具

体参数包括:数据表名称、移交核查机制等)、数据清理方案(具体参数包括:

清理流程)、统计分析方案(具体参数包括:主要统计量,分析方法等)等部

分。2.1.1.2 根据医保数据分析方案,确定项目所需数据要求,实施研究方案数据

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的预探索,评估搜索时间。2.1.2 主要研究方法2.1.2.1研究设计一般基于中国基本医疗保险系统的队列研究采用描述性研究

方法。确定研究的起始时间,洗脱期时间,明确本研究的研究对象及纳入排除

标准。参数设置包括研究起始结束时间、所选地区、数据库亚类(城镇职工或

城镇居民)、纳入标准和排除标准等。2.1.2.2研究中的目标患者指就诊的参保人员中诊断为危重心血管疾病的新发

或继发患者。研究中定义的新发指某个体在医保数据库就诊记录中洗脱期内首

次被诊断为目标疾病。在全国医疗保险数据库中,疾病诊断信息一般通过 6 个

相关变量识别,包括 3 个诊断名称变量(主要诊断名称、次要诊断名称 1、次

要诊断名称 2)和 3 个诊断编码变量(主要诊断编码、次要诊断编码 1、次要

诊断编码 2)。病例的确定主要通过诊断名称确定,辅以诊断编码进行判断,

当诊断名称缺失时以诊断编码作为补充。确定明确诊断和疑似诊断患者的标准。2.1.3阶段交付物本阶段的交付物为满足以上描述的研究数据分析方案。

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2.2 数据提取和整理阶段2.2.1 主要实施阶段本阶段通过以下两个步骤进行实施:2.2.1.1 按照数据提取方案,根据疾病特征制定关键字字典,按照需方要求根

据专家定义的疾病关键字及 ICD编码等信息筛选医保数据库危重心血管疾病相

关诊断的病人,并进行数据清洗和整理;2.2.1.2 将整理好的数据集交付高级分析师,支持高级分析师完成数据统计分

析工作。根据高级分析师的要求,调整或补充分析数据集。2.2.2 主要研究方法针对已有数据库中门(急)诊及住院患者、城镇居民住院患者医疗保险信息,

包括参保人员及单位基本信息、定点医疗机构信息、疾病诊断信息、医疗费用

结算信息以及部分年份医疗费用明细信息等。以地市为单位进行统筹,少数地

区按照省或县统筹,数据每月上报。2.2.2.1 数据库(表)结构城镇居民、城镇职工的信息分别建库。人员参保信息和就诊结算信息分库存储。

同一地区同一月份内参保信息和就诊信息通过个人唯一编号链接。

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2.2.2.2研究中一般涉及的库表名称及代码如下:2.2.2.2.1城镇职工基本医疗保险参保人员信息表 KY02:包括参加城镇职工基

本医疗保险人员的基本信息、参保缴费信息等。2.2.2.2.2城镇职工基本医疗保险门诊大病、门诊统筹、住院、家庭病床费用

及结算信息表 KY04:包括参加城镇职工基本医疗保险人员的门诊大病、门诊

统筹、住院、家庭病床费用信息和基金结算信息等。2.2.2.2.3城镇居民基本医疗保险参保人员信息表 KY08:包括参加城镇居民基

本医疗保险人员的基本信息、参保缴费信息等。2.2.2.2.4城镇居民基本医疗保险门诊大病、门诊统筹、住院、家庭病床费用

及结算信息表 KY09:包括参加城镇居民基本医疗保险人员的门诊大病、门诊

统筹、住院、家庭病床费用信息和基金结算信息等。2.2.2.3 数据清理2.2.2.3.1剔除无效报销个体;2.2.2.3.2剔除非暴露人口;2.2.2.3.3剔除无效报销记录。2.2.2.4 数据的移交与核查

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2.2.2.4.1 制定数据提取计划后,根据研究需求进行医保数据的检索、提取、

加密、汇总。提取的数据由公司数据提取人员审查后,移交给项目中数据分析

者,进行下一步的整理和分析工作。移交研究者的数据中不包含任何能够识别

个体身份的信息,分析时将依据重新生成的一套加密个人编码识别同一个体记

录。2.2.2.4.2 在诊断字段的筛选确认过程中,为保证准确性,由两名研究者独立

进行筛选并校对。对提取的数据存在疑问时,研究者和数据管理方应及时沟通,

对数据进行反复核查,排除不符合要求的数据,增加需补充的信息,每次数据

提取和核查的程序及结果均予以记录2.2.2.4.3 提供给研究者的数据经双方确认无误后,将对数据进行锁定,锁定

后的数据文件不再改动。数据锁定后发现的问题,经确认后在分析程序中进行

修正。2.2.3阶段交付物2016 年库内参保人数已达 5.6亿,本研究中拟搜索的参保人群不少于 5亿,

关键字定义由需方根据疾病分类提供,一般情况下,搜索所涉及的 ICD编码不

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少于 10 个,文本诊断的关键字不少于 10 个,患者数量由研究期内全国范围内

参保人数中检索出的病例数量决定,以发病率 10万分之 10 的疾病为例,患者

数量一般不少于 5000人,经过缺失数据算法处理的患者数量一般不少于 1.5

万人,本阶段的交付物包括:危重心血管疾病患者的汇总基础数据危重心血管疾病患者汇总的就诊流向数据危重心血管疾病层患者参保情况的汇总数据2.3 数据分析并交付终期报告2.3.1 主要实施阶段本阶段通过以下两个步骤进行实施:2.3.1.1高级分析师进行数据分析,完成分析报告的撰写,分析报告一般包括

如下内容:2.3.1.1.1研究目的及相关内容背景综述2.3.1.1.2研究设计和分析方法描述2.3.1.1.3 主要研究结果的图表展示:本研究的主要研究图表包括基本数据多

维度的描述性研究,相关影响因素的关联分析,以及费用相关的统计分析。

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2.3.1.1.4敏感性分析的相关结果2.3.1.1.5研究结果的解读建议2.3.1.2 后续结果的查缺补漏。2.3.2 主要研究方法2.3.2.1 数据基本情况描述2.3.2.1.1 统计各地区各年份参保人员数量、危重心血管疾病患者病例数;2.3.2.1.2针对下列指标进行描述性分析:参保人员及患者的年龄、性别、地

区和时间的分布,及医疗机构类型,就诊方式,疾病诊断亚型,住院天数,手

术方式,就诊费用,手术费用等。连续变量采用均值和标准差,分类变量采用

百分比进行描述,汇总方法采用随机效应模型为进行整合;2.3.2.1.3描述危重心血管疾病患者病例的年龄、性别、地区分布。2.3.2.2可能涉及的主要统计量2.3.2.2.1粗发病率因为医保数据库属于动态队列,计算发病率(incidence rate)时使用人时作

为分母计算。计算公式:发病率=报销的新发目标患者人数参保总人年 ×105/10万

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2.3.2.2.2 标化发病率以全国第六次人口普查结果作为标准人口,用直接标准化的方法对粗发病率进

行标化,以便于比较。2.3.2.2.3影响因素分析对各省份标化发病率进行地区间比较根据性别、年龄等进行人群分组,主动脉夹层发病的发病服从 Poisson 分布,

各组间的比较采用 z 检验。用泊松回归计算性别、年龄等因素对 AD发病影响

的效应值。2.3.2.2.4 总费用及人均治疗支出总费用指指参保患者本次就诊的全部费用合计。人均治疗支出=∑以目标诊断就诊的各次总费用同期目标患者总人数

2.3.2.2.5明细费用及构成比明细费用计算内容包括:药品费:包括“甲类药品费用”,“乙类药品费用”;诊疗费:包括“检查费”,“治疗费”,“手术费”,“麻醉费”,“材料

费”;

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费用构成比=总费用中某类服务费用该患者花费总费用 ×100%

2.3.2.2.6医保支付比例医 保 支 付 比 例 =

∑患者以目标诊断就诊时各次就诊基本医疗保险统筹基金支付金额∑患者以目标诊断就诊时各次总费用 ×100%

2.3.2.3 质量控制2.3.2.3.1研究过程严格遵照方案进行,研究过程中所有的数据和方案执行、

修改的情况应如实记录。研究者和数据管理方均指派人员定期监督研究进程,

保障研究如期开展。2.3.2.3.2 数据管理者对数据提取过程进行监视,将提取的信息移交研究人员

前应对数据进行核查,以保障数据的准确性、完整性、保密性。2.3.2.3.3 数据提取人员经统一培训,使用规范化提取程序、统一数据输出结

构,研究者对提取程序和输出结果进行再次核实,以使分析结果真实、可靠。2.3.2.3.4诊断筛选过程由两名人员独立平行完成,应尽可能保证入选 /排除标

准的一致性,筛选结果经临床专家核查。2.3.2.3.5 正式研究开展前先提取部分省份的数据进行预分析,检查数据质量。2.3.3终期交付物

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基于医保数据的危重心血管疾病数据深度挖掘分析报告,分析报告一般包括

如下内容:2.3.3.1研究目的及相关内容背景综述2.3.3.2研究设计和分析方法描述2.3.3.3 主要研究结果的图表展示,本研究的主要研究图表包括:2.3.3.4 基本数据多维度的描述性研究;2.3.3.5 相关影响因素的关联分析;2.3.3.6费用相关的统计分析。2.3.3.7敏感度分析的相关结果2.3.3.8研究结果的解读建议2.4 提供第一阶段的研究数据分析方案2.5 提供第二阶段的汇总数据信息包括:2.5.1危重心血管疾病患者的汇总基础数据2.5.2危重心血管疾病患者汇总的就诊流向数据2.5.3危重心血管疾病层患者参保情况的汇总数据3. 售后服务:

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3.1 在保证期内,免费进行疑难问题解答,对服务结果进行指导,并通过专业

人员上门、往来信函、电话、传真、电子邮件,解答甲方在实际工作中碰到的

各种技术问题;3.2 咨询投诉响应时间:4 小时内回复,48 小时内指派合格的专业人员进行回

复。其他无法迅速解决的问题应在一周内解决或提出明确解决方案;3.3 如所提供服务的质量不能满足甲方提出的要求,甲方可以要求服务提供商

进行相应的整改;第八包:专利代理及推广服务1.服务内容1.1 对课题立项研究方向进行行业微导航分析,给出行业分析报告;1.2 根据课题研究结果进行合理专利布局,归纳整理发明专利申请文件;1.3 对相关在先专利进行合理分析,给出研究成果转化的专利法律风险分析报

告。2. 人员要求2.1专业背景为医药生物且具备硕士以上学历的专职代理人不少于 3人。3.具体要求:

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3.1国内专利申请事务方面,具体包括:3.1.1申请文件撰写、提交、请求实质审查及答复初审/实质审查意见通知书,3.1.2处理费用减免手续优先审查程序,3.1.3申请复审和答复复审通知书,3.1.4 各项费用的监控和代缴服务,3.1.5档案管理、提供年度报告等服务。3.2国内专利维护运营事务方面,具体包括:3.2.1 年费监控和代缴,3.2.2专利申请权、专利权的转让事务,3.2.3专利权实施许可的有关事务,3.2.4处理专利权无效程序的有关事务,3.2.5处理专利权的侵权纠纷的有关事务。3.3国际专利服务方面,具体包括:3.3.1 通过国际专利条约(PCT 条约、巴黎公约)递交国际申请,3.3.2协助办理国际申请进入国家阶段后的各项事务,例如文本翻译、提交、

通知书的翻译和转达、费用代缴和周期监控,3.3.3协助申请人筛选合适的国外代理机构/律所,处理相关事务。

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3.4 检索、分析、导航等其他专项服务方面,入选机构应能在专利技术检索、

技术主题可授权分析、侵权风险分析及专利技术导航等其他涉及知识产权服务

的领域为研究所提供相关服务,包括:3.4.1特定的技术主题立项时的可专利性检索;3.4.2 对于技术成果是否侵犯他人在先权利的侵权风险分析;3.4.3特定技术领域的技术热点分析;3.4.4特定产业专利导航报告。熟悉医保数据结构和指标,有对大量医保数据

进行挖掘分析的经验;3.5 近 1 年承担过科研院所、大专院校或医疗机构的类似项目,并提供项目列

表,含项目名称、单位名称、联系人姓名、联系方式;3.6 服务实施周期:≤1 年;3.7 服务提供商需按照合同相关规定,对项目内容保密。4. 售后服务:4.1 在保证期内,免费进行疑难问题解答,对专利分析结果进行指导,并通过

专业人员上门、往来信函、电话、传真、电子邮件,解答甲方在实际工作中碰

到的各种技术和法律问题;

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4.2 咨询投诉响应时间:4 小时内回复,48 小时内指派合格的专业人员进行回

复。其他无法迅速解决的问题应在一周内解决或提出明确解决方案;4.3 如所提供服务的质量不能满足甲方提出的要求,甲方可以要求服务提供商

进行相应的整改;4.3.1 如服务提供商不能按照甲方的要求进行整改,或整改后的服务质量仍不

符合甲方的要求,则甲方有权减少支付服务费用;4.3.2 涉及费用增加的,双方可另行签署书面合同。

第九包:构建基因工程小鼠模型服务1.服务范围:按要求构建相应基因工程小鼠模型。2 基本要求:2.1具备实验动物生产相关资质2.2具备每年可构建基因敲除鼠、转基因鼠模型 10000例以上的能力,学术引用累计超过 500篇。2.3具备活体实验鼠检测、隔离中心等技术平台。3. CRISPR/Cas9 基因工程小鼠模型构建项目要求3.1 CRISPR/Cas9 基因工程小鼠模型构建流程和周期:

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图 1 CRISPR/Cas9 基因工程小鼠模型构建流程和周期3.2 服务的项目类型:完全性基因敲除大(小)鼠、点突变大(小)鼠、条件性基因敲除大(小)鼠、基因敲入大(小)鼠3.3 CRISPR/Cas9 基因工程小鼠方案设计及构建3.3.1 CRISPR/Cas9 基因工程小鼠模型构建过程

1、gRNA载体构建2、质粒体外转录mRNA

3、显微注射及 F0 代鼠出生 4、F1 代鼠繁殖和鉴定

3.4建系原则与流程3.4.1 通过对靶基因设计、构建 gRNA 质粒并转录为 RNA,与Cas9 mRNA 一起原核显微注射获得测序鉴定阳性的 F0 代杂合子鼠。3.4.2 F0 代鼠与野生型鼠进行交配,获得 PCR 和测序鉴定阳性的 F1 代杂合子鼠。3.4.3 选择来自同一只 F0 代鼠,敲入位点一致的 F1 代鼠,达到性成熟后进行同胞交配,可获得 F2 代鼠。对获得的 F2 代鼠进行 PCR 及测序鉴定。理论上,F2 代鼠中 25%位敲入位点一致的纯合子鼠,有 50%为只有一条染色体敲入的杂合子鼠,有 25%为野生型鼠。4.TurboKnockout 技术基因工程小鼠模型构建项目要求4.1TurboKnockout 技术基因工程小鼠模型构建流程和周期

图 2 TurboKnockout 技术基因工程小鼠模型构建流程4.2 服务的项目类型:完全性基因敲除、条件性基因敲除、点突变、基因敲入 、KO-First

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4.3 TurboKnockout 技术基因工程小鼠模型构建过程1、载体构建2、质粒制备3、ES打靶-电转4、ES打靶-PCR筛选5、ES打靶-细胞复苏传代6、ES打靶-Southern Blot

7、囊胚注射8、代孕鼠制备及胚胎移植4.4繁殖鉴定方案要求

图 3 TurboKnockout 条件性敲除小鼠繁殖鉴定方案要求图4.5 条件性基因敲除小鼠建系原则与流程4.5.1与 Cre 小鼠杂交:TurboKnockout-floxed 小鼠与组织特异性的 Cre 小鼠杂交,获得去除 Neo抗性且单条染色体有缺失的阳性 F1 代组织特异性 cKO

杂合子小鼠(+/-);4.5.2挑选一对 F1 代小鼠进行自交, 通过 PCR 鉴定筛选得到组织特异性去除

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基因的 F2 代 cKO纯合子小鼠(-/-)。5.转基因技术基因工程小鼠模型构建项目要求5.1转基因技术基因工程小鼠模型构建流程和周期:

图 4转基因技术工程小鼠构建流程5.2 服务的项目类型:过表达转基因大(小)鼠、RNAi转基因大(小)鼠、microRNA转基因大(小)鼠、可诱导性/组织特异性转基因大(小)鼠、BAC

转基因大(小)鼠5.3转基因技术基因工程小鼠模型详细构建过程1载体构建和质粒制备2受精卵的准备3 原核显微注射4 代孕鼠制备及胚胎移植5 出生 F0 小鼠的鉴定5.4建系原则与流程5.4.1 原核显微注射导入的目的基因是将目的基因随机整合到小鼠或者大鼠的基因组,因此首代转基因鼠(F0)将会有不同的整合位点。整合基因的拷贝数可能在不 同的首代转基因鼠中也不同。因此,每只 F0 代鼠需要作为一个独立的谱系研究,并且与其它 F0 代鼠分开进行繁殖。由于外源基因一般只整合在二倍体动物的其中 一条染色体上,属于半合子,其后代只有一部分个体带有整合的基因,需要进行筛选鉴定。5.4.2 原核显微注射获得 PCR阳性 F0 代杂合子鼠。5.4.3F0 代鼠达到性成熟后(8 周)与野生型鼠进行交配,获得 F1 代鼠。5.4.4 对交配获得的 F1 代鼠进行基因型鉴定,理论上,F1 代鼠中有 50%为转

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基因杂合子鼠,50%为野生型鼠。6.结题报告6.1 交付成果6.1.1 CRISPR/Cas9 技术基因工程小鼠:每个项目交付不少于 3只阳性 F1 代小鼠,包括 F0 代小鼠。6.1.2 TurboKnockout 技 术 基因工程小鼠: 每 个 项 目 交付不少于 4 只TurboKnockout鼠。6.1.3 转基因技术基因工程小鼠:每个项目交付不少于 3只阳性 F0 代小鼠。6.2阳性小鼠 PCR鉴定步骤6.2.1 基因组 DNA 提取,Triton X-100 和蛋白酶混合物裂解液,裂解样品过夜6.2.2 次日,高温灭活蛋白酶,离心收集上清,作为 PCR 模板进行扩增6.2.3电泳检测并胶回收 PCR片段6.2.4 测序鉴定并分析结果,把阳性鼠标号记下6.2.5裂解鼠尾提取 DNA,使用试剂盒提取。6.2.6 PCR扩增。7.售后服务7.1 技术负责人负责方案设计,全程跟进项目进展;7.2 指定专员专人负责项目跟进及进度汇报(2 周/次);7.3随时解答采购人对项目进展与技术细节的咨询。第十包:病毒转染试剂盒

1.慢病毒试剂盒1.1病毒总量:108 - 109TU

1.2病毒滴度:108- 109TU/ml

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1.3病毒注射方法:尾静脉注射1.4病毒注射量:5 x107 TU/只(小鼠)1.5 周期:20-25工作日(不含模版获取)1.6病毒生产资质要求:1.6.1实验室:BSL-2认证实验室1.6.2 生产标准:FDA、《中国药典》病毒疫苗制剂标准1.7病毒纯化方法:1.7.1 低温超速离心:1.7.1.1转速:200,000g

1.7.1.2 温度:4℃

1.7.2切向流:1.7.2.1 中空纤维柱:300KD

1.7.3 离子交换层析:1.7.3.1阴离子交换柱:10%盐离子浓度梯度洗脱1.7.4凝胶层析:1.7.4.1 V 样/V柱:1:10

1.8病毒滴度检测方法:

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1.8.1荧光定量法:1.8.1.1稀释梯度:8梯度1.8.1.2 重复数:5 组1.8.2药物筛法:1.8.2.1稀释梯度:8梯度1.8.2.2 重复数:5 组1.8.3绝对定量 qPCR 法:1.8.3.1 标准品:纯化 DNA

1.9病毒质量参数:1.9.1 质粒残留:≤4E+8 copy/ml

1.9.2宿主 DNA残留:≤10 ng/ml

1.9.3 BSA残留:≤50 ng/ml

1.9.4支原体:阴性1.9.5 内毒素:合格1.9.6衣原体:阴性1.9.7真菌:阴性1.9.8RCL:阴性

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1.10病毒应用范围:用于体外细胞实验和动物实验1.11 试剂盒数量:8套 2. 腺病毒试剂盒招标参数2.1病毒总量:1010 -1011PFU/ml

2.2病毒滴度:1010PFU

2.3病毒注射方法:尾静脉注射2.4病毒注射量:109PFU/只(小鼠)2.5 周期:45工作日(不含模版获取)2.6病毒生产资质要求:2.6.1实验室:BSL-2认证实验室2.6.2 生产标准:FDA、《中国药典》病毒疫苗制剂标准2.7病毒纯化方法:2.7.1 低温密度梯度超速离心:2.7.1.1转速:30000rpm

2.7.1.2 温度:4℃

2.7.2 离子交换层析:

2.7.2.1 ource 15 Q:10%盐离子浓度梯度洗脱

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2.7.3凝胶层析:2.7.3.1 V 样/V柱:1:10

2.8病毒滴度检测方法:2.8.1TCID50 法:2.8.1.1稀释梯度:8梯度2.8.1.2 重复数:5 组2.9病毒质量参数:2.9.1 质粒残留:≤4E+8 copy/ml

2.9.2宿主 DNA残留:≤10 ng/ml

2.9.3 BSA残留:≤50 ng/ml

2.9.4支原体:阴性2.9.5 内毒素:合格2.9.6衣原体:阴性2.9.7真菌:阴性2.10 病毒应用范围:用于体外细胞实验和动物实验2.11 试剂盒数量:8套3. 腺相关病毒试剂盒招标参数

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3.1病毒总量:1012 -1013vg/ml

3.2病毒滴度:1012 -1013vg

3.3病毒注射方法:尾静脉注射3.4病毒注射量:1011 vg/只(小鼠)3.5 周期:25工作日(不含模版获取)3.6病毒生产资质要求:3.6.1实验室:BSL-2认证实验室3.6.2 生产标准:FDA、《中国药典》病毒疫苗制剂标准3.7病毒纯化方法:3.7.1密度梯度超速离心:3.7.1.1转速:300,000g

3.7.1.2密度梯度:10%,20%,30%,40%

3.7.2切向流:3.7.2.1 中空纤维柱:100KD

3.7.3阳离子交换层析:3.7.3.1 阳离子交换柱(HP):10%盐离子浓度梯度洗脱3.7.4阴离子交换层析:

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3.7.4.1阴离子交换柱(Q):10%盐离子浓度梯度洗脱3.7.5凝胶层析:3.7.5.1 V 样/V柱:1:10

3.8病毒滴度检测方法:3.8.1绝对定量 qPCR 法:3.9病毒质量参数:3.9.1 质粒残留:≤4E+8 copy/ml

3.9.2宿主 DNA残留:≤10 ng/ml

3.9.3 BSA残留:≤50 ng/ml

3.9.4支原体:阴性3.9.5 内毒素:合格3.9.6衣原体:阴性3.9.7真菌:阴性3.9.8RCL:阴性3.10 病毒应用范围:用于体外细胞实验和动物实验3.11 试剂盒数量:4套4. 质粒试剂盒招标参数

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4.1 质粒浓度:>1000ng/ul(总量 500ug 以上),>300ng/ul(总量

500ug 以下)4.2 质粒总量:10ug-2mg

4.3 周期:15工作日(不含模版获取)4.4 质粒生产管理体系:ISO9001

4.5 质粒纯化方法:无内毒素抽提试剂盒4.6 质粒质量标准:4.6.1 A260/280 范围:1.8-2.0

4.6.2 目的序列:无错义、插入、缺失、颠倒、移码等突变4.7试剂盒数量:5套 5. 由于实验过程中存在不确定性,要求投标公司在投标文件中增加可销售

的相关试剂附录表,表中应标明:通用名、方法学、规格、单位、单价等信息。

招标人在采购前可根据实际需要,更换等值的所需试剂,更换试剂仅限附录表

内内容。6.售后服务6.1.质量保证:中标厂商提供的试剂、耗材应符合招标参数要求的质量保

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证期,在保证期内,免费进行疑难问题解答,标准实验培训等服务。如果确属

试剂质量问题,免费进行同等数量更换。6.2 咨询投诉响应时间:1 小时内响应,24 小时内指派合格的技术人员进

行回复。其他无法迅速解决的问题应在一周内解决或提出明确解决方案。6.3.验收:厂家提供详细的验收标准、验收手册和合格证书,中标厂商应

严格按照试剂、耗材保存温度提供运输,由甲方组织验收。6.4.培训:

一般情况下,到货后厂家需根据院方时间,安排不少于 5人、每人不少于

20 小时,免费培训。要求提供具体培训方案。第十一包:心衰自身抗体和中和抗体1.心衰自身抗体

1.1.抗原标准1.1.1 抗原类型:原核表达1.1.2 抗原纯度:80%

1.1.3 纯度检测:SDS-PAGE 检测1.1.4 抗原浓度:≥0.5mg/ml

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1.1.5 内毒素:0.3-0.5EU/1ml

1.1.6 纯化方法:亲和纯化1.1.7 Elisa效价:1:30000

1.1.8 抗原种属:Balb/c 小鼠1.1.9 亚型对照:Normal Mouse IgG

1.1.10 阳性对照:心肺组织、细胞1.1.11 反应种属:人、小鼠1.1.12 适用样品:组织、细胞1.1.13 特异性:与自身抗体特异性结合1.1.14 二抗类型:anti Mouse(H+L)IgG

1.2.保存标准1.2.1 保存条件:-80℃

1.2.2 保存形式:pH:7.2-7.5 的 PBS

1.3.供货标准1.3.1 定制化:根据客户需要定制指定的抗体1.3.2 运输条件:干冰运输1.3.3 供货数量:45mg

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1.3.4 包装形式:1mg/支1.3.5 交货周期:≤180天1.3.6 应用范围:科学研究

2.中和抗体2.1.抗原标准2.1.1 抗原来源:原核表达2.1.2 抗原纯度:80%

2.1.3 纯度检测:SDS-PAGE 检测2.1.4 抗原浓度:≥0.5mg/ml

2.1.5 内毒素:0.3-0.5EU/1ml

2.1.6 抗原纯化:亲和纯化2.1.7 Elisa效价:1:30000

2.2.抗体标准2.2.1 抗体纯度:80%

2.2.2 纯度检测:SDS-PAGE 检测2.2.3 内毒素:0.3-0.5EU/1ml

2.2.4 免疫物种:C57 小鼠

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2.2.5 应用范围:WB、IP、FC、Neu

2.2.6 纯度检测:SDS-PAGE 检测2.2.7 抗体纯化:免疫亲和纯化2.2.8 亚型对照:Normal Mouse IgG

2.2.9 阳性对照:心肺组织、细胞2.2.10 反应种属:人、小鼠2.2.11 适用样品:组织、细胞、血液2.2.12 应用效价:WB:1:1000;IP:1:100;FC:1:100

2.2.13 特异性:阳性条带单一2.3.保存标准2.3.1 保存条件:-20℃

2.3.2 保存溶液:叠氮化钠:0.02%

甘油:50%

pH:7.2-7.5 的 PBS

2.4.供货标准2.4.1 定制化:根据客户需要定制指定的抗体

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2.4.2 运输条件:蓝冰冷藏2.4.3 抗体数量:15mg

2.4.4 交货周期:≤180天2.4.5 包装形式:1mg/支2.4.6 应用范围:科学研究3.由于实验过程中存在不确定性,要求投标公司在投标文件中增加可销售

的相关试剂附录表,表中应标明:通用名、方法学、规格、单位、单价等信息。

招标人在采购前可根据实际需要,更换等值的所需试剂,更换试剂仅限附录表

内内容。4.售后服务4.1.质量保证:中标厂商提供的试剂、耗材应符合招标参数要求的质量保

证期,在保证期内,免费进行疑难问题解答,标准实验培训等服务。如果确属

试剂质量问题,免费进行同等数量更换。4.2 咨询投诉响应时间:1 小时内响应,24 小时内指派合格的技术人员进

行回复。其他无法迅速解决的问题应在一周内解决或提出明确解决方案。4.3.验收:厂家提供详细的验收标准、验收手册和合格证书,中标厂商应

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严格按照试剂、耗材保存温度提供运输,由甲方组织验收。4.4.培训:

一般情况下,到货后厂家需根据院方时间 ,安排不少于 5人、每人不少于

20 小时,免费培训。要求提供具体培训方案。

第十二包:蛋白组代谢组试剂耗材1.采购范围:采购对样品进行 LC-MS 非靶向代谢组、LC-MS 非靶向脂质组、蛋白组学

检测及分析的相关试剂耗材。2.要求:2.1LC-MS 非靶向代谢组学代谢物分离色谱柱2.1.1 适 用 于 TripleTOF 5600 (AB SCIEX) 或 TripleTOF 5600+ (AB

SCIEX) 超高效液相色谱系统2.1.2针对中等及强极性代谢物,如糖类、有机酸、氨基酸等,可进行有

效液相分离,有利于实现目标小分子和基质中干扰物的分离,降低基质效应。2.1.3 采购数量:7 根2.1.4规格:1.7um,2.1*150mm 或 1.7um,2.1*100mm

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2.1.5 质量保证:提供的试剂耗材≥12 个月的质量保证期2.2LC-MS 非靶向脂质组代谢物分离色谱柱2.2.1 适用于 Q-ExactiveOrbitrap (Thermo Fisher)超高效液相色谱

系统2.2.2针对脂质小分子的分离,其中目标脂质分子包括八大类( LIPID

MAPS®系统命名):脂肪酸类(如亚油酸、花生酸等)、甘油脂类(如

TG、DG 等) 、甘油磷 脂 类 (如 PC、PE、PG、PA 等) 、鞘脂 类 (如

Cer、SM等)、固醇脂类(如固醇酯等)、糖脂类(如 MGDG、SQDG等)、

孕烯醇酮脂类(如CoA等)和多聚乙烯类(抗生素等)。2.2.3 采购数量:2 根2.2.4规格:1.7um,2.1*150mm

2.3 蛋白组学标记定量实验肽段同位素标记试剂盒2.3.1 适用于体外等重同位素标记的蛋白质相对定量技术。2.3.2 通过多个同位素试剂标记多肽末端氨基或赖氨酸侧链氨基基团,经

Q-ExactiveOrbitrap (Thermo Fisher)高精度质谱仪串联分析,同时对多

种样品中蛋白质进行定性和定量分析。

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2.3.3 采购数量:50 个 kit

2.3.4规格:5套2.4 蛋白组学肽段分离色谱柱2.4.1 通过水域蛋白分离技术(PRST)的 QC 测试和优化2.4.2 适用于纳升流速 HPLC 液相系统 Easy nLC 进行蛋白肽段分离,基

于蛋白质分子的分子量、疏水性、等电点进行分离。2.4.3 采购数量:2 根2.4.4规格:1.7um,0.075*250mm

3.由于实验过程中存在不确定性,要求投标公司在投标文件中增加可销售

的相关试剂附录表,表中应标明:通用名、方法学、规格、单位、单价等信息。

招标人在采购前可根据实际需要,更换等值的所需试剂,更换试剂仅限附录表

内内容。4.售后服务4.1.质量保证:中标厂商提供的试剂、耗材应符合招标参数要求的质量保

证期,在保证期内,免费进行疑难问题解答,标准实验培训等服务。如果确属

试剂质量问题,免费进行同等数量更换。

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4.2 咨询投诉响应时间:1 小时内响应,24 小时内指派合格的技术人员进

行回复。其他无法迅速解决的问题应在一周内解决或提出明确解决方案。4.3 按客户所撰写文章拟投杂志的要求提供试剂耗材技术参数4.4 验收:厂家提供详细的验收标准、验收手册和合格证书,中标厂商应

严格按照试剂、耗材保存温度提供运输,由甲方组织验收。4.5 培训:

提供 1 次参加人数 50人以上的为时 1天的蛋白组学、代谢组学分析培训

班。要求提供具体培训方案。