2

ВСТУП1. Мета дисципліни – сформувати систему здатностей та вмінь в областідосліджень екологічних передумов розповсюдження вірусів людини тварин, рослин імікроорганізмів для вирішення різних завдань, насамперед у галузі охорониздоров'я, сільського господарства та екології.

2. Попередні вимоги до опанування або вибору навчальної дисципліни:

1. Успішне опанування курсів "Вірусологія", "Віруси людини і тварин""Молекулярна біологія вірусів", "Бактеріофагія", "Екологія".

2. Вміти самостійно застосовувати знання з загальної вірусології,бактеріофагії, екології та ін. дисциплін, виконувати лабораторні тапрактичні роботи, працювати з науково-методичною літературою.

3. Володіти елементарними навичками роботи з матеріалами та обладнанням,що використовуються у вірусологічній лабораторії.

3. Анотація навчальної дисципліни:"Екологія вірусів" – це інтегральна наука, що виникла на стику вірусології і

екології. Екологія вірусів вивчає їхні взаємозв’язки з довкіллям у всій йогорізноманітності та наслідки цих взаємовідносин як для вірусів, так і для довкілля, втому числі людини, тварин, рослин і мікроорганізмів. Виникнення цього науковогонапряму у вірусології зумовили дві обставини: всезростаючі темпи антропогенногоперетворення біосфери внаслідок науково-технічного прогресу і необхідністьпрогнозувати появу/розвиток епідемічних спалахів вірусних хвороб. Вивченняскладного ланцюга подій, що випливають із взаємодії вірусів із довкіллям, якепостійно змінюється, проводиться з використанням екологічного підходу.

З розвитком екології вірусів пов'язано вирішення глобальних проблем людства –контроль розповсюдження патогенних вірусів, розробка засобів боротьби з ними,поліпшення стану охорони здоров'я й якості навколишнього середовища.

4. Завдання (навчальні цілі): 1) сформувати уявлення про основні принципи екології вірусів та роль вірусів у

біосфері, ознайомити з можливостями застосування екологічних знань уборотьбі з вірусними інфекціями;

2) показати важливість вірусів у біосфері; 3) навчити аналізувати екологічні передумови розповсюдження вірусних

інфекцій людини, тварин, рослин;4) опанувати теоретичні основи методів екології вірусів; 5) дати студенту уявлення про сучасні тенденції та напрямки фундаментально-

наукових та прикладних досліджень у галузі екології вірусів та суміжних з неюнауках, для майбутньої профорієнтації.

3

Згідно з вимогами стандарту дисципліна забезпечує набуття студентамикомпетентностей:

інтегральна: Здатність вирішувати завдання в галузі біологічних наук і на межі предметних галузей, що передбачає застосування теорій та методів природничих наук і характеризується комплексністю та невизначеністю умов.

загальні: Знання та розуміння предметної області екології вірусів; Навички використання інформаційних і комунікаційних технологій; Здатність спілкуватися державною мовою як усно так і письмово; Здатність вчитися і оволодівати сучасними знаннями з екології вірусів; Здатність до абстрактного мислення, аналізу і синтезу знань з бактеріофагії; спеціальні (фахові, предметні): Розуміння молекулярних механізмів збереження та реалізації генетичної

інформації у вірусів Здатність до визначення та аналізу ролі вірусів у біосфері та можливості

використання у промисловості, медицині та сільському господарстві.

5.Результати навчання за дисципліною:

Результат навчання(1. знати; 2. вміти; 4. автономність та

відповідальність)Форми (та/або методи

і технології)викладання і

навчання

Методиоцінювання та

пороговийкритерій

оцінювання (занеобхідності)

Відсоток упідсумковій

оцінці здисципліниКод Результат навчання

1.1 Знати особливості взаємодії вірусівз їхніми хазяями, класифікацію вірусних інфекцій на різних рівнях

Лекція Модульнаконтрольна

робота

33

1.2 Знати екологічні передумови передачі та розповсюдження вірусів різних організмів

Лекція

1.3 Знати вплив умов довкілля на віруси і їхні геноми

Лекція Модульнаконтрольна

робота

33

1.4 Знати екологічні особливості окремих вірусів людини, тварин, рослин, бактерій

Лекція

2.1 Вміти працювати з приладами, виконувати необхідні аналізи, давати оцінку результатам

Лабораторнаробота

Звіт полабораторній

роботі,контрольна

робота

10

4

2.2 Володіти сучасними уявленнями про стійкість вірусів у довкіллі і методи дослідження впливу факторів довкілля на віруси

Лабораторнаробота

Звіт полабораторній

роботі,контрольна

робота

10

4.1 Вміти самостійно працювати з науковою та навчально-методичною літературою, здійснювати пошук та узагальнювати науково-технічну інформацію.

Самостійна робота Контрольнаробота

14

6. Співвідношення результатів навчання дисципліни із програмними результатами навчанняРезультати навчання дисципліни (код)

Програмні результати навчання (назва)1.1 1.2 1.3 1.4 2.1 2.2 4.1

Демонструвати спілкування в діалоговому режимі з колегами та цільовою аудиторією, ведення професійної наукової дискусії, письмово відображувати та презентувати результати своїх досліджень українською мовою

+

Демонструвати володіння основними термінами в галузі екології вірусів

+ + + +

Вміти аналізувати передумови розповсюдження вірусів

+ + + + + +

Демонструвати знання фундаментальних біологічних процесів, будови та функцій живих організмів

+ + + + + +

Застосовувати відповідні методи детекції вірусів у різних екосистемах

+ +

Вміти визначати та аналізувати основні фізичні, хімічні та біологічні чинники, які впливають на віруси

+ + +

Вміти застосовувати набуті знання у подальшому навчанні та професійній діяльності

+

Шляхом самостійного навчання освоїти нові знання тасучасні методи експериментальних досліджень для вирішення проблемних завдань

+

Демонструвати знання основних принципів збереження навколишнього середовища й зміцнення здоров’я, формування ціннісних орієнтацій щодо здорового способу життя

+

5

7. Схема формування оцінки.

7.1 Форми оцінювання студентів:

- семестрове оцінювання: 1. Модульна контрольна робота 1 – РН 1.1; 1.2. – 26 балів/ 11 балів2. Модульна контрольна робота 2 – РН 1.3; 1.4 – 26 балів/ 11 балів3. Лабораторні роботи – РН 2.1; 2.2; 3.1 – 32 балів/ 16 балів 4. Усні відповіді / доповнення РН 4.1 – 16 балів/ 8 балів

- підсумкове оцінювання: у формі заліку Підсумкова оцінка за залік виставляється як сума всіх форм семестрового оцінювання.

Студент отримує залік («зараховано») лише за умови успішного виконання всіх лабораторних робіт(по кожній не менше 50% від максимально можливої кількості балів), успішного виконання завдань 2модульних контрольних робіт (по кожній не менше 50% правильних відповідей).

7.2 Організація оцінювання:

Модульні контрольні роботи 1 і 2 проводяться після завершення лекцій з розділів 1 і 2 відповідно.Проміжне тестування проводиться упродовж лекційного курсу. Звіти по лабораторних роботаху формі опитування проводяться після кожної лабораторної роботи.

7.3 Шкала відповідності оцінок

Зараховано / Passed 60-100Не зараховано / Fail 0-59

6

8. Структура навчальної дисципліни.

Тематичний план лекцій та лабораторних занять

№п/п

Номер і назва темиКількість годин

лекціїлабораторні

заняттяСамостійна

робота*

Розділ 1

1Тема 1. Історія, загальні поняття та методи

досліджень екології вірусів 6 4 20

Лекція 1. Предмет та завдання екології вірусів.Екологічна ніша вірусів 4

Самостійна робота Історія розвитку екологіївірусів

10

Лабораторна робота 1. Виділення бактеріофагівз довкілля

4

Лекція 2. Роль вірусів у біосфері 2Самостійна робота Вплив людської діяльностіна екологію вірусів 10

2Тема 2. Вчення про природноосередкові вірусні

інфекції 8 20

Лекція 3. Явище природної осередковості2

Самостійна робота Географічнерозповсюдження вірусів – збудників зоонозів 10

Лекція 4. Віруси – збудники особливонебезпечних зоонотичних хвороб

6

Самостійна робота Емерджентні вірусніінфекції 10

Розділ 2

4Тема 3. Екологія збудників антропонозних

інфекцій 6 2 20

Лекція 5. Вплив умов довкілля нарозповсюдження ентеропатогеннихвірусів

4

Самостійна робота Стійкість ентеровірусів удовкіллі. Джерела контамінації вірусамихарчових продуктів

10

Лекція 6. Вплив умов довкілля нарозповсюдження респіраторних вірусів 2

Самостійна робота Екологічні передумовирозповсюдження ВІЛ 10

Лабораторна робота 2. Вплив фізико-хімічнихфакторів на віруси

2 20

7

5Тема 4. Екологія вірусів мікроорганізмів і

рослин 6 6 20

Лекція 7. Екологія бактеріофагів 2

Самостійна робота Біорізноманіття іособливості життєвих циклів вірусівмікроорганізмів.

10

Лабораторна робота 7. Індукція помірнихбактеріофагів з бактеріальних культур

2

Лекція 8. Особливості розповсюдження вірусіврослин.

4

Самостійна робота Екологія віроїдів 10

Лабораторна робота 3. Моніторинг віруснихінфекцій рослин закритого грунту

4

ВСЬОГО 26 12 80

*За наявності змін до графіку навчального процесу див. додаток 1.

Загальний обсяг 120 год., в тому числі:Лекцій – 26 год.Семінари – нема.Практичні заняття – нема.Лабораторні заняття – 12 год.Тренінги – нема.Консультації – 2 год.Самостійна робота – 80 год.

8

9. Рекомендовані джерела:

Основні: (Базові)1. Abedon, S.T. (2008). Bacteriophage Ecology: Population Growth, Evolution, and Impact of

Bacterial Viruses. Cambridge University Press, Cambridge, UK.

2. Christon J. Hurst. Viral ecology.-Academic press, 2000

3. Cann A.J. Principles of Molecular Virology. –Academic Press, London, 2001. – 234 p.4. Flint S.J., Enquist L.W., Krug R. M. Et al. Princirles of virology: molecular biology, pathogenesis,

and control.- Washington, D.C.:ASM Press.- 2000.5. Mahy B.W.J. A Dictionary of Virology. – Academic Press, London, 1997. – 348 p.6. Mathews R.E.F. Fundamentals of Plant Virology. - Academic Press, San Diego, USA, 1992. – 408

P.7. Virus taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses: Ninth report of the International

Committee on Taxonomy of Viruses /[A. King, M. Adams, E. Lefkowitz et all.] – London: Academic Press, 2012. – 1327p.

8. Загальна епідеміологія. Н.О. Виноград, З.П. Василишин, Л.П. Козак, Т.А. Романенко.

Навчальний посібник. Київ. Медицина. 2010.

9. Бойко А. Л. Основи екології та біофізики вірусів.- К.:Фітосоцоцентр, 2003.

10. Одум Ю. Экология (в 2-х томах).- М.:Мир, 1986.

11. Калініна О.С., Панікар І. І., Скибіцький В.Г. Ветеринарна вірусологія. Підручник. — К.:

Вища освіта, 2004. - 432 с.

Додаткові:

12. Айала Ф., Кайгер Дж. Современная генетика: В 3т.- М.: Мир, 1987.-1001с.13. Алдерс Б., Брей Д., Льюис Дж. и др. Молекулярная биология клетки. В 3 томах.- М.: Мир,

1994.- 1565 с.14. Молекулярная биология / Под ред. А.С. Спирина.- М.: Высшая школа, 1990.- 352 с.15. Стент Г., Келиндер Р. Молекулярная генетика. – М.: Мир, 1981.- 648 с.16. Свердлов Е.Д. Очерки современной молекулярной генетики //Молекулярная генетика,

микробиология и вирусология.- 1995.- №2.- С. 3-15; №3.- С. 3-17; №4. – С. 19; 1996. - №4. –С. 32; 1997. - №2. – С. 3-28.

17. Хоукинс Дж. Структура и экспрессия гена. – К.: Наукова думка, 1991. – 164 с.18. Molecular Basis of Virus Evolution / Ed. by A. Gibbs/.- Univ.Press, Cambridhe, UK, 1995 – 603

P.19. Encyclopedy of Virology /Ed. by A. Granoff, R. Webster/ - Academic Press, San Diego, 2000.–

3252 p.

10. Додаткові ресурси:

1. www.virology.net2. www.virology-education.com/3. https://talk.ictvonline.org/ictv-reports/ictv_online_report/4. www.virology.com.ua

ДОДАТОК 1(план самостійної роботи студентів (СРС) у відповідності до графіку навчальногопроцесу у період 2017-2018 н.р.)

Перелік завдань для самостійної роботи

Розділ 1Розділ 1

Вплив людської діяльності на екологію вірусів

1. Історія встановлення екології вірусів 2.Вплив людської діяльності на екологію вірусів.3. Типи взаємодій вірус-господар.

Рекомендована література: [4-7].

1. Основний етап-підготовка презентації за одним із завдань: вплив урбанізаціїна розповсюдження вірусів, роль сільськогогосподарства/торгівлі/туризму(мобільності населення) у розповсюдженнівірусів.

Розділ 2Розділ 2

Передача вірусів через їжу та воду

1. Передача вірусів через їжу та воду. 2.Стійкість ентеровірусів у довкіллі.3. Джерела контамінації вірусами харчових продуктів.

Рекомендована література: [1-3].

Основний етап-підготовка презентації за наведеними питаннями для однієїродини вірусів, які передаються через їжу із переліку: Adenoviridae,Picornaviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Reoviridae

Графік консультацій:

22.01.2018 – понеділок - з 12 год по 17год (моб.тел., ел.пошта)29.01.2018 – понеділок - з 12год по 17год (моб.тел., ел.пошта)5.02.2018 – понеділок - з 12год по 17год (моб.тел., ел.пошта)12.02.2018 – понеділок - з 12год по 17год (моб.тел., ел.пошта)19.02.2018 – понеділок - з 12год по 17год (моб.тел., ел.пошта)

Форми контролю - контроль засвоєння матеріалу буде здійснюватися на базівідповідей на тестові питання (5 балів, березень) і реферат у вигляді презентації назадану тему (10 балів). Контроль роботи студента над рефератом буде здійснюватися

10

протягом лютого. Студенти повинні будуть надсилати на електронну поштувизначені частини реферату до понеділка кожного тижня. Середньозважений бал, наданий студенту за виконання завдань із СРС, додається досуми середніх балів, набраних з інших видів навчальної роботи з дисципліни.

11