Как стареют белки у c.elegans...
TRANSCRIPT
![Page 1: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/1.jpg)
Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?Д Оргунова1*, В Шиманский1*, Д Северинов1*, О Дикан1*, Т Забродская1*, И Тимофеев1*, П Синицын1
1 Летняя школа по биоинформатике 2019, Долгопрудный, Россия* Эти авторы внесли одинаковый вклад в эту статью
![Page 2: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/2.jpg)
2
![Page 3: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/3.jpg)
C.elegans: эксперимент
● WT - 1, 6, 12, 17 и 22 дней● DAF16 mutant - 1, 6, 12 и 17 дней● DAF2 mutant - 1, 6, 12, 17, 22 и 27 дней
3
![Page 4: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/4.jpg)
C.elegans: Дисперсия экспрессии и возраст
4
![Page 5: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/5.jpg)
C.elegans: Воспроизводимость результатов
Обнаружено 5607 белков.
5
![Page 6: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/6.jpg)
C.elegans: PCA plot
6
![Page 7: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/7.jpg)
C.elegans: aging clock and approximation
7
![Page 8: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/8.jpg)
C.elegans: heatmap+clusterization+GOenrichment
8
![Page 9: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/9.jpg)
R.norvegicus:
9
http://dx.doi.org/10.1016/j.cels.2015.08.012Ori et al.
![Page 10: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/10.jpg)
R.norvegicus: PCA RNAseq vs RIBOseq
Technology component
Tissue component
- Brain RNA
- Brain RIBO
- Liver RNA
- Liver RIBO
![Page 11: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/11.jpg)
Technology component
Tissue component
- Brain Prot
- Brain RIBO
- Liver Prot
- Liver RIBO
R.norvegicus: PCA Transctiptomic vs Proteomic
- Brain RNA
- Liver RNA
![Page 12: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/12.jpg)
R.norvegicus: multiple scatter plot
12
Brain 24 month
0.902Brain
24m and 6m
0.0797
Brain and Liver 6m
0.871
![Page 13: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/13.jpg)
R.norvegicus: tissue specific expression
13
Brain Liver
![Page 14: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/14.jpg)
R.norvegicus: PCA
14Tissue component
Age component
6 month
- Brain
- Liver
24 month
6 month
24 month
![Page 15: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/15.jpg)
R.norvegicus: age specific expression
15
24 month 6 month
![Page 16: Как стареют белки у C.elegans R.norvegicusbioinformaticsinstitute.ru/sites/default/files/project_sinitsin... · Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022051904/5ff5746ca16053761f1dac6e/html5/thumbnails/16.jpg)
Memasik suda vstav’
16