基礎醫學大樓 r1448

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顯顯顯顯顯顯 顯顯顯顯顯顯 Imaging Imaging Core Core 黃黃黃 黃黃黃黃黃黃 R1448

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基礎醫學大樓 R1448. 顯微影像核心 Imaging Core. 黃呈彦. 服務項目 : 儀器設備 離線軟體 敎用以及諮詢 委託操作. 申請及使用資格. 開放時間. 收費標準. 罰則. 螢光顯微鏡 fluorescence Microscopy(Zeiss). Imager A1(A1). Axioplan-2 (A2). Reflector: DAPI , FITC , TRITC. Reflector: DAPI , FITC , TRITC. - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: 基礎醫學大樓 R1448

顯微影像核心顯微影像核心ImagingImaging CoreCore

黃呈彦 基礎醫學大樓 R1448

Page 2: 基礎醫學大樓 R1448

服務項目 : 儀器設備 離線軟體 敎用以及諮詢 委託操作 開放時間收費標準申請及使用資格

罰則

Page 3: 基礎醫學大樓 R1448

螢光顯微鏡 fluorescence Microscopy(Zeiss)

Reflector: DAPI,FITC,TRITCLens: 10X, 20X, 40X 100X(oil)

Lens: 10X,20X,40X, 100X(oil)

Software: AxioVision Software: PictureFrame

Imager A1(A1) Axioplan-2 (A2)

Reflector: DAPI,FITC,TRITC

Page 4: 基礎醫學大樓 R1448

數位影像整合系統(MicroBrightField)Reflector:GFP,RFP

Lens: 4X,10X,20X, 40X(oil),60X(oil),100X(oil)Software: SI-color,SI-mono, Neurolucida

Page 5: 基礎醫學大樓 R1448

活細胞影像系統 (Live Imaging)ASTEC Leica

LED : GFP Reflector:DAPI,FITC,TRITCLens: 10X Lens: 10X,20X,40XSoftware: CCM Software: MetaMorph

Page 6: 基礎醫學大樓 R1448

雷射共軛焦顯微鏡 Confocal Microscopy(Leica)

SP2 SP5

Laser: Ar,HeNe,GreNe Laser:405,Ar,HeNe,GreNe

Lens: 10X, 20X, 63X(oil) Lens: 10X,20X(oil), 40X(oil),63X(oil),100X(oil)

Software: LAS AF Lite Software: LAS AF Lite

Page 7: 基礎醫學大樓 R1448

DsRed ER + DAPI

DIC

SP2 SP5DsRed ER

Transmission

Page 8: 基礎醫學大樓 R1448

全內反射螢光顯微鏡 TIRF+live (Zeiss)

Laser:405,488,561,635Lens: 10X, 20X, 40X(oil), 63X(oil), 100X(oil)Software: AxioVision 4.8

Fluorescence TIRF

Page 9: 基礎醫學大樓 R1448

Las AF Lite release

離線軟體 (Software)

AxioVision 4.8 release

MetaMorph 7.7

Volocity (5.5): 3D image quantitation and 4D tracing

AxioVision 4.8 Image Pro Plus 6.0

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Visulization & Restoration : Allowers the user to import Z stacks of flourescently labeled 2D images acquired using a confocal or wide field microscope and create an interactive 3D rendering.

PerkinElmer

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Quantitation:3D colocalization, ratio and FRET images analyses.4D (3D time lapse) tracing.

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儀器敎用以及諮詢教育訓練課程教學影片出借 : Confocal SP5 Live imaging (ASTEC & Leica)

儀器與軟體使用教學與諮詢操作手冊

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http://www.mc.ntu.edu.tw/staff/ard/

儀器開放對象為醫學院與附設醫院各系所及相關研究單位。

夜間使用:

親自操作儀器 :

R1448 管理員認證

參加 教育訓練 R1405 紙本預約 R1448 使用儀器 R1405 交繳費單日間使用五次以上且無不良紀錄者 使用儀器時需刷卡進出委託操作:洽 R1448 管理員預約研發分處第一共研網頁

申請及使用資格

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日間開放時段:AM 8:30~ PM 17:00

開放時間

夜間開放時段:PM 16:30~ PM 10:30

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收費標準 ( 以 1 小時為計價單位 )儀 器 設 備 (Fluorescence microscopy) 自行操作Zeiss Axiophot 2 40 / hrZeiss AXIO Imager. A1 , AX10 40 / hr

儀器設備 (Live image) 自行操作ASTEC 50元 /hrLeica DM IRE 2 50元 /hr

儀器設備 自行操作顯微照相數位化整合系統 50元 /hr

管理員教學 : 每人 100/hr 無委託操作。

無委託操作。管理員教學 : 每人 200/hr

委託操作 : 200/hr( 設定時間 ) 。管理員教學 : 每人 200/hr

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預約之後因故未使用,並且未於登記使用日前 24 小時取消預約者,須付 50% 費用。

儀器設備 全內反射顯微鏡 4D 影像追蹤軟體 (Volocity)

自行操作 300 / hr 8:30~13:00 50/hr, 13:00~17:00 100/hr操作員操作 600/ hr

儀器設備 共軛焦顯微鏡 Leica SP5 及 Leica SP2

Leica SP5使用 aserLeica SP5不使用 aser

Leica SP2不使用 UV

自行操作 SP5 450 / hr SP5 300 / hr SP2 150 / hr

委託操作 : 200/hr管理員教學 : 每人 200/hr

管理員教學 : 每人 500/hr

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罰則一、若於預約時段開始 15 分鐘內未使用,則喪失該時段優先使用權,並視同違約一次,達三次違約者,停止其預約登記權利一個月。二、有下列情形者計違規一次: (1 ) 未經教育訓練就自行使用儀器。 (2 ) 以自己名義登記給他人使用。 (3 ) 自行加裝電腦軟硬體或更動系統設定。 (4 ) 違反操作規定第柒項之任一項。三、違規者第一次口頭警告,第二次取消使用儀器一個月,第三次永久取消儀器使用權。四、若因自行操作不當造成儀器損壞,則提報研發分處會議議處,使用者即刻停權,並由該實驗室負責人負全部維修與賠償責任,並支付所有費用。五、其他規定未盡完全者,悉依臺大醫學院研究發展分處第一共同研究室與本校 其他相關規定辦理。

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共軛焦顯微鏡,螢光顯微鏡,數位整合顯微鏡之預約登記,收取繳費單與開立收據, TIRF 繳費R1405 李學良 技士 (88505)

活細胞影像系統預約登記,收取繳費單與開立收據R1405 陳佳圓 助教 (88501)

R1448 黃呈彦 博士 (88930)

實機操作與軟體教用,軟硬體設備維護,樣品製備諮詢,夜間與TIRF 使用認證, TIRF 預約登記[email protected]

管理員

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We thank the staff of the imaging core at the First Core Labs, National Taiwan University College of Medicine, for technical assistance.

致謝第一共研影像核心

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第一共研生醫資源中心詹琍婷

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Outline 提供索取生物材料

提供相關技術支援服務人類疾病模式生物中心服務窗口

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◎ 生醫資源中心目前所收集之生物材料種類簡介:一、各種基因功能分析之質體、載體:( ~470 個)(1) 可於細菌、昆蟲及哺乳動物細胞中表現之質體(2) 可於細胞膜、細胞核、粒腺體…等特定位置標定之質體(3) 可表現 CFP、 GFP、 YFP、 RFP… 等質體(4) 各種基因功能分析之質體(5) 可表現各種 siRNA、miRNA 之質體(6) Adenoviral、 lentiviral及 retroviral vectors(7) 酵母菌相關之各種質體二、細胞株:(1) 各種適用於轉染及表現特殊蛋白質之細胞株(2) 哺乳動物之肝癌、乳癌、腸癌、淋巴癌…等細胞株(3) 血液及神經相關細胞三、微生物: E.coli competent cell ( DH5and BL21(DE3) ),Staphylococcus及 Streptococcus 之標準菌株

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四、 Yeast two-hybrid cDNA library ( pACT2):(1) human fetal kidney (2) human fetal liver (3) Mouse kidney (4) Mouse liver(5) Mouse testis

五、抗體:各種自公司購得及 7 種由院內老師實驗室自製之抗體

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資料庫內容將不對外公開 , 若您曾提供生物材料至本中心,可來信要求瀏覽資料庫內容 陳美麟 小姐,分機 88283

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提供實驗技術教學錄影帶組織細胞初步培養篩選基因穩定表現細胞株純化質體質體建構純化蛋白質酵母菌雙向雜交篩選建構基因資料庫

mini- /midi- kitCsCl banding

BL21 (DE3)Baculovirus

cDNA libraryGenomic DNA library

技術支援服務項目

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申請生物材料:申請人將欲索取之材料的編號告知資料管理員 ( 陳美麟 小姐,分機 88283 或 [email protected]) 。

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申請技術支援服務:填寫申請書,用電子信件方式寄送到生醫資源中心信箱 (email: [email protected]) ,收件人:詹琍婷。

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索取生物材料

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申請表

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台大醫學院第一共同研究室 人類疾病模式生物中心The Center for Human Disease Modeling

人類疾病的酵母菌模式核心實驗室Yeast Core Facility for Human Disease Model諮詢:鄧述諄 博士 ( 微生物所 ) 、李芳仁 博士 ( 分子醫學所 ) 林育誼 博士 (生物化學暨分子生物學所 ) 呂金盈 醫師 (台大醫院檢驗醫學部 )

人類疾病的線蟲動物模式核心實驗室C. elegans Core Facility for Human Disease Model諮詢:潘俊良醫師 ( 分子醫學所 ) ,詹世鵬博士 ( 微生物所 )

人類疾病的果蠅模式核心實驗室Drosophila Core Facility for Human Disease Model諮詢:李秀香博士 ( 分子醫學所 ) 、吳君泰醫師 ( 分子醫學所 )

人類疾病的小鼠動物模式核心實驗室Mouse Core Facility for Human Disease Model諮詢 : 黃祥博醫師(醫研部) 陳佑宗博士(臨床基因所) 游益興博士、林淑華博士 ( 醫技所)

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服務內容:人類疾病的酵母菌模式核心實驗室諮詢及評估。基因改造。酵母菌雙向雜交測試。 特殊實驗須面議。 人類疾病的線蟲動物模式核心實驗室協助線蟲操作之基礎訓練。協助自國際機構 (C. elegans Genetics Center/USA, National BioResource Project/Japan)取得基因變異或基因剔除之線蟲品系。指導或協助進行線蟲變異表現型之性狀分析。協助取得線蟲之核糖核酸干擾 (RNAi)載體。指導或協助進行線蟲之核糖核酸干擾實驗。 人類疾病的果蠅模式核心實驗室果蠅訊息傳遞路徑搜尋工具組幫忙尋找基因功能。 人類疾病的小鼠動物模式核心實驗室協助完成基因剔除 (KO)小鼠。協助完成基因置入 (KI)小鼠。協助完成表現人類突變基因的小鼠。協助將自國際機構 (KOMP, EUCOMM, NORCOMM etc.) 取得的基因剔除 ES 細胞株製成小鼠。協助完成條件式組織特異基因剔除小鼠 (Conditional KO)。提供雙螢光工具鼠 (Dr. 陳佑宗 ) 。組織細胞分離及初代培養 (Dr.游益興 ) 。

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目前路徑搜尋工具組由 49個是非題組成Protein degradation (4)•Proteasome DTS mutant•Uba1 RNAi transgenic fly•Autophagy (atg1, atg7 RNAi)

Kinases (14) •CKI (DN, RNAi)•GSK3 (DN, CA)•PKA (DN, CA)•S6K (Kinase death, CA)•Mst•LIM domain kinase

Signaling (11)•Notch•Hedgehog•Wnt•EGFR•JAK/Stat (Upd)•PI3K (CA)•mTOR•Hippo•robo

Cell death (4)•p53•Foxo-p•Grim•dIAP

Cell motility (8)•Cdc42 (DN, CA)•Rho (DN, CA)•Rac (DN, CA)•Pak (CA)•Myosin light chain

Cell cycle (2)•Dp•PCNA

Histone (2)•CG8445, H2A Dub•Poly-Bromo

Microtubule (2)•Tau•Lis1

Vesicle trafficking (2)•DN-Rab5•DN-dymanin

1 個疾病基因, 49個是非題從開始做到完成要1 個助理,每天約 1 小時, 4 個月, 4000NT

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研發分處共同儀器

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申請模式生物技術服務:填寫申請書,用電子信件方式寄送到生醫資源中心信箱 (email: [email protected]),收件人:詹琍婷 博士。分機: 88931