collaboration with microbiology laboratory in investigation of n.i....

Collaboration with Microbiology Laboratory in Investigation of N.I.

การประสานงานกบหองปฏบตการจลชววทยาในการสอบสวนการตดเชอในโรงพยาบาล

22 December 2014

Dr. Suwanna Trakulsomboon Faculty of Medical Technology

Rangsit University Tel 081 2557 185

[email protected]; [email protected]

mailto:[email protected]


บทบาทของหองปฏบตการจลชววทยาตอ การเฝาระวงการตดเชอในโรงพยาบาล

Roles of Microbiology Laboratory in

Infection Control

1 พ.ค. 2556 ดร. สวรรณา ตระกลสมบรณ

คณะเทคนคการแพทย มหาวทยาลยรงสต [email protected]

Tel 087- 9111648


Health Protection Agency The Agency was created in April 2003 in UK

to provide better protection against infectious diseases and other dangers to health

Core functions are to: •Identify and respond to health hazards and emergencies •Anticipate and prepare for emerging and future threats • Alert and advise the public and Government on health protection •Provide specialist health protection services • Support others in their health protection roles

Laboratory of Health Care Associated Infection • The Infection Control Unit at Colindale is able to provide the following

services and carry out investigations of suspected outbreaks of hospital infection.

Specialist services: • Disinfection • Sterilisation • Ventilation assessment • Decontamination of laboratory equipment • Laundry decontamination • Outbreaks of HAI site investigation • Outbreaks of HAI surveillance and investigation • Surveillance of HAI • Infection control • Nursing aspects of infection control • Audit of infection control activity • Infection transmission : mechanisms and prevention • Education of ICNs • Infection control policies • Infection control research support

Health Protection Agency About 2,700 people work for the HPA including:

•Specialists in communicable disease control Tackle outbreaks of infectious diseases Prevent the spread of disease through vaccination other measures • Public health specialists •Infection control nurses •Emergency planning advisers •Microbiologists – •Epidemiologists – who monitor the spread of disease •Toxicologists •Laboratory scientists and technicians •Information specialists •Information technologists

Laboratory of HealthCare Associated Infection • Reference and Diagnostic Testing Services • Epidemiological Typing Unit (ETU)

• LHCAI's Reference and Diagnostic Services are provided by the

Epidemiological Typing Unit (ETU). ETU is the national centre for the phenotypic and molecular epidemiological type identification of bacterial species associated with infections acquired in hospitals. The main services provided are typing of Acinetobacter spp., Burkholderia spp., Enterobacter spp., Enterococcus spp., Klebsiella spp., Pseudomonas spp., Serratia spp. and Staphylococcus spp., and Stenotrophomonas maltophilia. The Unit also undertakes the molecular comparison of epidemiological linked isolates of other gram negative and gram positive species implicated in hospital outbreaks.

• The Unit is comprised of two typing sections, Staphylococcus Reference and Opportunist Pathogens. Both sections provide specialist reference functions, give advice on microbiological aspects of outbreak investigations and monitor national trends of distribution of strains.

• Serodiagnosis Section offering serodiagnostic tests for staphylococcal and streptococcal infections as well as for P. aeruginosa and B. pseudomallei (melioidosis).

• In the year ending March 2002 reports were issued on c. 22,500 specimens.

Roles of Medical Microbiology Laboratory in Infection

Procedures:

• Detection/isolation and identification

• Antimicrobial susceptibility test

• Others; organisms, antimicrobial agents

Objection:

Diagnosis, treatment, Prevention, Infection control

Clinical Microbiology Laboratory

Lab. procedures for diagnosis of infectious diseases

1.Morphologic identification

- Direct examination: Wet smear, KOH, India ink

- Staining: Gram stain, Acid fast stain (AFB),

Modified AFB stain (mAFB)

2. Culture isolation, Identification, susceptibility

- Growth media, Biochemical profile,

sensitivity test

3. Antigen/Antibody detection

4. Molecular detection

Common Infectious Diseases

Clinical Microbiology 1:

Common Pathogens Causing

Infectious Diseases Dr. Suwanna Trakulsomboon

Division of Infectious Disease and Tropical

Medicine

Department of Medicine

Faculty of medicine Siriraj Hospital

Mahidol University

Contents : Microorganisms : Taxonomy and Classification of Bacteria : Diagnosis of infectious disease : Clinical Microbiology : Selection of clinical specimen for bacterial culture : Culture interpretation : Common Pathogen causing Infectious Diseases Staphlococcus Streptococcus Enterococcus Neisseria Haemophillus Enterobacteriaceae Escherichia coli Shigella Salmonella Vibrio Pseudomonas aeruginosa Acinetobacter baumannii

Evolution of antimicrobial resistance:

What will happen next in the bugs

David Livermore. Health Protection Agency, UK.; 8thISAAR

Current

Concern

Antimicrobial

Resistance

Current Concern Antimicrobial resistance 1.Methicillin resistant organism

S.aureus, Staphylococcus species

2.Drug resistant S. pneumoniae (DRSP)

3.Fluoroquinolone resistant E.coli

4.Macrolide-resistant gram-positive cocci

5.Vancomycin resistant organisms

MRSA, Staphylococcus species, Enterococci spp (VRE)

6.Extended-spectrum beta-lactamases production

E.coli, K. pneumoniae

7.Carbapenem resistant organisms

P.aeruginosa, Acinetobacter spp, B. cepacia, Stenophomonas maltophilia,

Enterobacter spp, Klebsiella spp, E.coli (CRE)

Reviews of Antimicrobial Resistant

ANTIBIOTIC RESISTANCE THREATS

in the United States, 2013

Prioritized bacteria in this report into 3 categories:

urgent, serious, and concerning.

ANTIBIOTIC RESISTANCE

ANTIBIOTIC RESISTANCE; SPREADING

Bacteria & Antimicrobial agents

Establishing Best Practice Guideline for Prevention of Multidrug Resistant Organisms

Transmission in Hospitals บทบาทของบคลากรสหสาขาวชาชพในการปองกนการ

แพรกระจายเชอดอยาในโรงพยาบาล

Dr. Suwanna Trakulsomboon 17 March 2011

Division of Infectious Disease and

Tropical Medicine

Department of Medicine

Faculty of Medicine Siriraj Hospital

Mahidol University

Tel 02 4197301; [email protected]

Indications for performing susceptibility Tests

Routine:-

• Any organism that contributes to an infectious process warranting ATM chemotherapy.

Special test or research:-

•Studies of the epidemiology of resistance

•Studies of new antimicrobial agents

•Detection of emerging antimicrobial resistance in nosocomial microorganisms

Current Concern Antimicrobial resistance

1. Methicillin resistant organism Staphylococcus species, S.aureus (MRSA, MRCNS)

2. Drug resistant S. pneumoniae (DRSP) 3. Fluoroquinolone resistant E.coli 4. Macrolide-resistant gram-positive cocci (D-test) 5. Vancomycin resistant organisms MRSA, Staphylococcus species, Enterococci spp

6. Extended-spectrum beta-lactamases production E.coli, K. pneumoniae 8. Carbapenem resistant organisms P.aeruginosa, Acinetobacter spp, B. cepacia,

Stenophomonas maltophilia, Escherichia coli, Klebsiella spp, Enterobacter spp,

Ability of Lab to detect

emerging antimicrobial resistance Most Labs were able to detect:

1. Methicillin/oxacillin resistance in S. aureus (MRSA)

2. Hight-level vancomycin resistance in Enterococci (VRE)

3. Resistance to extended-spectrum cephalosporins in

E.coli / K. pneumoniae (ESBL) Many Labs had difficulty in recognizing

Mettalo-beta-lactamase producing organisms Reduced susceptibility to penicillin in

Streptococcus pneumoniae Carbapenem resistance in Enterobacteriacea

The most difficult phenotype for Labs to detect was Reduced susceptibility to vancomycin in staphylococcus

Tenover FC, et al. JCM 2001; 39:241-250

Antimicrobial Susceptibility Testing Methods

Qualitative techniques (S,I,R)

Disc diffusion method ; inhibition zone (mm)

Quantitative methods :

MIC and MBC determination (ug/ml, mg/L)

- Broth dilution - Agar dilution

- E-test (Agar gradient ; MIC determination)

MIC = Minimum inhibitory concentration

MBC=Minimum bactericidal concentration

Problems in reporting

antimicrobial susceptibility

for resistant organisms

Case Discussion

s

Role of laboratory in NI

1. Conduct laboratory research

for establishing infection control policy

2. Evaluate control measures

3. Evaluate New product introduced in IC

ทมาของโครงการ การใชนายาทาลายเชอเชดบนพนผวของสงแวดลอมรอบตวผปวยทตรวจพบเชอดอยาเปนมาตรการทสาคญในการลดการแพรกระจายของเชอดงกลาวในโรงพยาบาล เนองจากเชอแบคทเรย

กอโรคทปนเปอนในหอผปวยมหลายชนด และสภาพแวดลอมบรเวณดงกลาวประกอบดวยพนผวหลายประเภท เชน ผา, กระจก, โลหะ, ไม, ฯลฯ ประสทธภาพในการทาลายเชอของนายาแตละชนดอาจมความแตกตางกน

วธด าเนนการ 1. คณะผวจยไดตรวจสอบคณสมบตในการท าลายเชอดวยน ายา 6 วธ เพอลดปรมาณเชอกอโรค 4 ชนด ซงถกท าใหปนเปอนบนพนผวของวสด 4 ประเภท ไดแก ผา กระจก โลหะ และไม ในหองปฏบตการ รวมทงสน 96 ครง

2. เชอทใชทดสอบ เปนเชอกอโรค 4 ชนดซงแยกไดจากผปวยในโรงพยาบาลศรราช ไดแก Acinetobacter baumannii , Pseudomonas aeruginosa , Vancomycin- resistant Enterococus faecium (VRE), และ Methicillin- resistant Staphylococcus aureus (MRSA) เชอแตละชนดจะถกท าเปนสารละลายทมความเขมขนของเชอประมาณ 107

CFU/ml 3. วสดแตละประเภทจะถกท าใหปนเปอนเชอครงละ 1 ชนดอยางเทาเทยมกน ดวยการใชไมพนส าลปลอดเชอ ปายสารละลายเชอทเตรยมไวแลวจ านวน 1 มลลลตร ทาบนพนผวของวสดทศกษาขนาด 2 ตารางนวใหทว แลวปลอยใหแหงประมาณ 5 นาท หลงจากนนจงเชดท าความสะอาดพนผวดวยน ายาท าลายเชอตอไป

4. วธการท าความสะอาดพนผวดวยน ายา 6 วธ ไดแก

ดร.สวรรณา ตระกลสมบรณ*, ดวงพร จนตโนทยถาวร**, กาญจนา คชนทร**, นรชพณญ ปะท*, สสณห อาศนะเสน*

*สาขาวชาโรคตดเชอและอายรศาสตรเขตรอน, ภาควชาอายรศาสตร **งานโรคตดเชอ; คณะแพทยศาสตรศรราชพยาบาล, มหาวทยาลย มหดล

ประสทธภาพในการทาลายแบคทเรยกอโรคของนายาฆาเชอบนพนผวชนดตางๆ

วตถประสงค 1. ศกษาประสทธภาพของ การท าลายเชอดวยน ายา 6 วธ ในการลดปรมาณเชอกอโรคบนพนผวของวสดประเภทตางๆ 2.ความรทไดจากการศกษาน จะน าไปสการก าหนดแนวทางทเหมาะสมเพอเลอกใชวธท าความสะอาดวสดตางๆทอาจปนเปอนเชอดอยาในหอผปวย

ทมาของโครงการ การใชน ายาท าลายเชอเชดบนพนผวของสงแวดลอมรอบตวผปวยทตรวจพบเชอดอยาเปนมาตรการทส าคญในการลดการแพรกระจายของเชอดงกลาวในโรงพยาบาล เนองจากเชอแบคทเรยกอโรคทปนเปอนในหอผปวยมหลายชนด และสภาพแวดลอมบรเวณดงกลาวประกอบดวยพนผวหลายประเภท เชน ผา, กระจก, โลหะ, ไม, ฯลฯ ประสทธภาพในการท าลายเชอของน ายาแตละชนดอาจมความแตกตางกน

วธด าเนนการ

วธ A: เชดดวยกระดาษส าเรจรปทมสวนประกอบของ Nonyl phenol 8 mole ethoxylate 0.2%, Alkyl dimethyl benzyl ammonium chloride 0.7%, Didecyldimethyl benzyl ammonium chloride 0.7%, และ Polyhexamethylene biguanide hydrochloride 0.4% จนแหง

วธ B: พนน ายาทมสวนประกอบของ Nonyl phenol 8 mole ethoxylate 0.1%, Alkyl

dimethyl benzyl ammonium chloride 0.5%, Didecyldimethyl benzyl

ammonium chloride 0.5%, และ Polyhexamethylene biguanide hydrochloride 0.2%ใหเปยก แลวเชดดวยผาปลอดเชอจนแหง

วธ C: เชดดวยกระดาษส าเรจรปทมน ายาทมสวนประกอบของ Propan-1-ol 50%, Didecylmethyl ammonium chloride 0.00075% จนแหง

วธ D: พนน ายาทมสวนประกอบของ Propan-1-ol 50%, Didecylmethyl

ammonium chloride 0.00075% ใหเปยก แลวเชดดวยผาปลอดเชอจนแหง วธ E: หยด Ethyl alcohol 70% 1 มลลลตร บนพนผววสด แลวเชดดวยผาปลอดเชอจนแหง

วธ F: หยดสารละลาย Virkon 0.5% (1:200) 1 มลลตร บนพนผววสด แลวเชดดวยผาปลอดเชอจนแหง

5. หลงจากนน ผวจยจะใชไมพนส าลปลอดเชอ ปายพนผวบรเวณดงกลาวใหทว แลวน าไปวเคราะหหาปรมาณเชอทเหลออยตอไป


การท าความสะอาดผววสดชนดผา

0 1 2 3 4 5 6 7 8

กอนเชด

หลงเชดดวย น ายา A

หลงเชดดวย น ายา B

หลงเชดดวย น ายา C

หลงเชดดวย น ายา D

หลงเชดดวย น ายา E

หลงเชดดวย น ายา F

Number of viable cell (log10)

A. baumanii P.aeruginosa VRE MRSA

0 1 2 3 4 5 6 7 8

Number of viable cells (log10)

กอนเชด







การท าความสะอาดพนผวชนดกระจก


0 1 2 3 4 5 6 7 8


กอนเชด







การท าความสะอาดพนผวชนดโลหะ


0 1 2 3 4 5 6 7 8

Number of viable cells (log 10)

กอนเชด







การท าความสะอาดพนผวชนดไม


ผลการศกษา ปรมาณเชอทเหลออยบนพนผววสดแตละประเภท หลงจากทาความสะอาดดวยนายา ดงในกราฟแทงเชงซอน


สรปผลการศกษา •70% Ethyl alcohol (วธ E) และสารละลาย 0.5% Virkon (วธ F) มประสทธภาพในการท าลายเชอบนพนผวของวสดทงสชนดไดมากสด สามารถลดปรมาณเชอทปนเปอนบนพนผวของวสดทง 4 ประเภท คอ ผา กระจก โลหะ และไม จาก 107 CFU/ml เหลอนอยกวา 101 CFU/ml ซงเปนปรมาณต าทสดทตรวจวดได

•กระดาษส าเรจรปทมสวนประกอบของ Quaternary ammonium compound (วธ A) มประสทธภาพในการท าลายเชอบนพนผววสดทง 4 ประเภทไดดพอสมควร นาจะเปนทางเลอกทเหมาะสมในการท าลายเชอแบคทเรยดอยาบนพนผวทไมสามารถใช alcohol หรอ Virkonได

•น ายา หรอ กระดาษส าเรจรปทมสวนประกอบของน ายาฆาเชอ 50% Propan-1-ol เปนหลก มประสทธภาพในการท าลายเชอแบคทเรยบนพนผวประเภทผาและกระจก ไดคอนขางจ ากด

การท าความสะอาดผววสดชนดผา

0 1 2 3 4 5 6 7 8

กอนเชด







Number of viable cell (log10)


0 1 2 3 4 5 6 7 8


กอนเชด







การท าความสะอาดพนผวชนดกระจก


0 1 2 3 4 5 6 7 8


กอนเชด







การท าความสะอาดพนผวชนดโลหะ


0 1 2 3 4 5 6 7 8

Number of viable cells (log 10)

กอนเชด







การท าความสะอาดพนผวชนดไม


http://www.stjohnsupplies.co.uk/products/largeImage.asp?productId=F78074

การศกษาการปนเปอนของนายาทาลายเชอสาหรบลางมอและภาชนะบรรจทใชในโรงพยาบาลศรราช

• การใชน ายาท าลายเชอส าหรบลางมอใน รพ.ศรราช 4% Chlorhexidine และ 7.5% Povidone iodine เทแบงจากภาชนะบรรจเรมตนจากหนวยผลต ลงในภาชนะพรอมใช • การเตรยมภาชนะพรอมใชส าหรบเทแบงน ายาท าลายเชอแตละหนวยงานมความแตกตางเชน การลางท าความสะอาดผงใหแหง การลางท าความสะอาดไมผงแหง การอบแกส เปนตน • ภายหลงการเทแบงแลวจะเปลยนน ายาและภาชนะบรรจทก 3 วน • น ายาเหลอและถกทงจ านวนมากหลงใชครบ 3 วน • เพมภาระงานบคลากรในการท าความสะอาดและท าลายเชอ

เพอลดความสญเสยทเกดจากการปฏบตน จงมการทบทวนถงความจ าเปนของการเปลยนน ายาท าลายเชอ

แตปจจบนยงไมมหลกฐานการวจยทบงชวา ควรเปลยนน ายาท าลายเชอเมอไหรภายหลงการเทแบงใชงาน

ทมาของโครงการ


1.ศกษาการปนเปอนของนายาทาลายเชอสาหรบลางมอ หลงเทแบงใสในภาชนะบรรจพรอมใชในของหนวยงานในโรงพยาบาลศรราช คอ 4% Chlorhexidine และ 7.5% Povidone iodine 2. ศกษาการปนเปอนของภาชนะใสนายาทาลายเชอหรอสาหรบลางมอในหอผปวยและในหองผาตด 3. นาขอมลไปปรบเปลยนวธปฏบตเกยวกบนายาทาลายเชอสาหรบลางมอ เชน การทาความสะอาดภาชนะบรรจ, ระยะเวลาทเหมาะสมในการเปลยนนายาภายหลงการเทแบงมาใชงาน

1. สมหอผปวยเพอเกบตวอยางสงตรวจ 13 หอผปวย และหองผาตด 13 หอง 2. เกบขอมลวธการทาความสะอาดหรอการทาใหปราศจากเชอ ของภาชนะบรรจนายาทาลายเชอสาหรบลางมอ 3. ทดสอบการปนเปอนของแบคทเรยในนายาทาลายเชอและภาชนะบรรจโดย 3.1 Swab ดานในของภาชนะบรรจนายาททาความสะอาดหรอทาใหปราศจากเชอแลว หนวยงานละ 1-5 ขวด ตามจดทใชงาน 3.2 เกบนายาทาลายเชอจากภาชนะบรรจของหนวยงานทศกษา สงเพาะเชอในวนแรกทเทนายาใชและวนท 3 หลงการใชงานตามปกต หลงจากนนเปดฝาของภาชนะบรรจออกแตยงตงไวใกลเคยงบรเวณเดม แลวเกบตวอยางสงเพาะเชอในวนท 7, 14, 21 และ 28 ตามลาดบ3

วตถประสงค

การดาเนนงาน


1 . การปนเป อนของแบคท เรยในภาชนะทบรรจน ายาท าลายเชอ พบวาการท าความสะอาดภาชนะบรรจแลวไมท าใหแหงกอนเตมน ายาท าลายเชอจะพบเชอแบคทเรยกอโรคได 50% ในขณะทภาชนะทท าความสะอาดแลวผงใหแหงจะพบแบคทเรยกอโรคไดเพยง 21.7 % สวนภาชนะทบรรจทท าใหปราศจากเชอกอนใชงานจะไมพบแบคทเรยกอโรค

น า ย า 4% Chlorhexidine แ ล ะ 7.5% Povidone iodine สามารถใชตอเนองไดนาน 14 วน 2. ภาชนะทจะน ามาใชบรรจน า ย า 4% Chlorhexidine แ ล ะ 7.5% Povidone iodine ควรเปนภาชนะทไดรบการท าใหปราศจากเชอ กรณใชในหองผาตด หรอเปนภาชนะทลางใหสะอาด และผงใหแหงกอนน ามาบรรจน ายาในหอผปวยทวไป

ผลการศกษา

2. น ายาท าลายเชอส าหรบลางมอ 4% Chlorhexidine และ 7.5% Povidone iodine ทใชในหอผปวยและหองผาตด ตงแตวนแรกทเทแบงใชจนถงวนท 28 ไมพบการปนเปอนในทกตวอยาง

สรปผลและขอเสนอแนะ

คณะผวจย 1.ดร. สวรรณา ตระกลสมบรณ 2. นส.ฐนตา ทวธรรมเจรญ 3. นางนตยา ศรหาผล 4.นางกาญจนา คชนทร 5.นางวราภรณ พมสวรรณ 6. นางรชดา เจดรงส คณะแพทยศาสตรศรราชพยาบาล

Evaluation of Microbiological Data on Surgical Hand Scrubs among Health Care Workers in Operating Rooms,

Thailand

Usavadee Praditkul Asdornwised*, Suwanna Trakulsomboon**, Benjamas Prechakul**, Yong

Rongrungreng**, Varaporn Pumsuwan**, Sribenja Vaithayaphichet**.

• * Faculty of Nursing, Mahidol University, Bangkok, Thailand.

• ** Faculty of Medicine Siriraj Hospital, Mahidol University, Bangkok, Thailand.

Results • The study supports the evidence that the hands of surgeons

and scrub nurses carry microorganisms identified as sources of microbial contamination. Common organisms including

coagulase-negative staphylococci (CNS), methicillin- sensitive Staphylococcus aureus (MSSA),

methicillin- resistant Staphylococcus aureus (MRSA), A. baumannii, P. aeruginosa, and Enterobacter species These common organisms may cause surgical site infections.

S. aureus and CNS are the leading causes of surgical site infections.

• The majority of flora isolated were gram-positive cocci, including CNS = 85.9% in pres-crub 77.2% post-scrub

MSSA = 9.8% pre-scrub 2.2% post-scrub Gram-negative bacteria 32.6% pre-scrub

7.6% post-scrub

• All health care workers in operating rooms should follow the recommended practice for surgical hand scrubs to prevent surgical site infection

Results

การประเมนผลการลางมอเพอผาตด แบบใชแปรง ไมใชแปรง และแบบไมใชน าไมใชแปรง ในบคลากรทาง

การแพทยและพยาบาลทท างานในหองผาตดในโรงพยาบาลมหาวทยาลย ประเทศไทย

An Evaluation of Brush, Brushless, and Waterless Surgical Hand Scrubs Among Health Care Workers

in Operating Rooms, Thailand คณะผวจย:

Usavadee Praditkul*, MS. Ph.D.(Nursing); Benjamas Prechakul**, Suwanna Trakulsomboon#,

MD.; Supenya Warothai#, MD, Supakorn Rojananin#, MD, Daranee Piputtanakulchai**,

MS., Varaporn Pumsuwan** MS, Sribenja Vathayaphichet**,MS Faculty of Nursing*,

Faculty of Medicine #, Nursing Department**, Mahidol University, Bangkok, Thailand

Method A Method B Method C

22 baht 16 baht 12 baht Item Method

Easy C

Fast C

Easy for groveing B

Favor C

Cost for each Hand wash methods

Brush with 4% CHG = Method A Brushless with 4% CHG = Method B Brushless and waterless with 1% CHG and 61% ethyl alcohol and emollients = Method C Significant reduction in bacterial count No significant difference for Skin condition after hand wash for 3 weeks from each methods

Outline

1. Current challenges in infectious disease services 2. Role of clinical microbiology lab in

*Diagnosis and treatment of infectious disease *Surveillance of nosocomial infection and outbreak

investigation * Important responsibilities in hospital infection control

* Specific Lab support function 3. Potential problems related to Lab activities in

epidemiologic investigation

Current challenges in infectious disease services • Emerging or reemerging infectious diseases (SARS, H7N9, H5N1, West Nile virus, H1N1-2009, ...) (Anthrax, TB, MRSA, VRE, VRSA .....) • Increasing incidence of MDR organisms (MRSA, VRE, VRSA, ESBL, MBL, MDR A.

baumannii, KPC, CRE .....) • Limited health care cost reimbursement • Increased awareness of clients may lead to more

lawsuit (HIV case, MRSA, NI ........) • Quality assurance and audit from authorities

Role of clinical microbiology lab

1. Improving the clinical utility of microbiology data (Barenfanger. J Clin Microbiol Newsletter2003; 25:1-7) 2. Role of the microbiology laboratory in infectious disease

surveillance, alert and response. (Canton R. Clin Microbiol and Infect 2005;11:3-8) 3. Hunting Health Care Associated Infections from the Clinical

Microbiology Laboratory: Passive, Active, and Virtual Surveillance.

(Peterson LR, Brossette SE. J Clin Microbiol 2002;40:1-4) 4. Outbreak Investigations- A perspective. (Reingold AL. Emerging Infectious Diseases 1998;4:2127)


5. Role of Clinical Microbiology Laboratory in the Management and Control of Infectious disease and the Delivery of Health Care.

(Peterson LR, et al. Clin Infect Dis 2001;15:605-610) 6. Response of the Clinical Microbiology Laboratory to Emerging

(New) and Reemerging Infectious Diseases. (Cockerill FR III, Smith TF. J Clin Microbiol 2004;42:2359-2365. 7. Basic Microbiologic Support for Hospital Epidemiology. McGowan JE Jr, Metchock BG. Infect Control Hosp Epidemiol

1996;17:298-303. 8. Initial Investigation and Management of Outbreaks and Incidents

of Unusual Illnesses, A Guide for Local Laboratories. (Health Protection Agency ; UK; Version3, March 2004)

บทบาทของหองปฏบตการ

การตรวจทางหองปฏบตการจลชววทยาเพอสนบสนนการวนจฉยและรกษาโรคตดเชอ

Role of the Clinical Laboratory in Diagnosis and Treatment of Infectious disease

บทบาทของหองปฏบตการ ในการเฝาระวงโรคตดเชอและควบคมโรคระบาด Role of the Clinical Microbiology Laboratory

in the NI Surveillance and Outbreak Investigation

Outbreak Investigation Streps in Epidemiologic and Laboratory Investigation

Investigation step 1. Recognize the problem • case definition • verification clinical data 2. Complete case finding • Assess reliability • Assess completeness of report • Obtain additional data 3. Define occurrence Is this unusual? Calculate attack rate compare

with baseline rates Attact rate>usual rate-epidemic

rate

Laboratory’s role 1. Lab surveillance/ early

warning (Microbiologic confirmation) 2. Characterize isolates

accurately • Search lab database for more

cases • Review Lab methods • Demographics 3. Provide sequential data on

occurrence, store isolates

Outbreak Investigation Streps in Epidemiologic Evaluations

Investigation step 4. Characterize the outbreak • Patient demography • Location • Time 5. From hypothesis about cases • Mode of spread • Reservoirs • Vectors 6. Initial control measures 7. Continue surveillance (follow

up surveillance) Evaluate control measures

Laboratory’s role 4. Determine how many strains are involved. (Epidemiological strain identification, typing) 5. Conduct supplementary

studies • Do environment and or personnel cultures are

needed? 6. Initial Lab aspects of control measures 7. Maintain Lab surveillance and early warning

Role of the clinical laboratory in infection control

Important responsibilities in hospital infection control

1. Participating in ICC 2. Identifying accurately nosocomial pathogens

3. Characterization antimicrobial susceptibility of nosocomial pathogens

4. Timely reporting Lab data relevant to infection control 5. Routinely conducting a few useful microbiologic studies

of hospital environment 6. Investigations of specific hospital infection problems

7. Performing typing studies whether organisms are similar or different


Specific Lab support functions

1. Interaction of Lab with infection control program

2. Epidemiologic uses of Lab finding

3. Epidemiological typing of microorganisms

Interaction of Lab with infection control program

1. Consultant to IC program and a ICC member 2. Ensure high-quality performance in the Lab

3. Organization Lab test results easily accessible and timely manner design Lab‘s record-keeping

system 4. Provide training on basic microbiology for IC staff

5. Monitor Lab results for unusual findings

6. Use environment cultures judiciously (recommended routinely only monitoring autoclaves

and water used for dialysis fluid)

7. Store isolates that may require further identification for epidemiologic purposes 8. Take proper action when contamination of a

commercial product is suspected

Surveillance of nosocomial infections

1 Requirements for a surveillance system 2. Trained personnel

3. Accepted definitions and criteria for NI, risk factors and others 4. Readily available sources of data for identifying infections

5. Accurate and complete denominator data

6. Analysis and dissemination of data to those need it 7. Confidentiality of the data

8. Selection of patients for monitoring 9. Strategies for identifying infected patients

10. Use surveillance data for continuous quality improvement

Results of various laboratory tests are required for diagnosis of infection.

Therefore, the clinical laboratory has many important roles

in diagnosis and management of infectious disease.

Moreover, the laboratory has always played a key role in

controlling nosocomial infections.


The hospital laboratory

plays major role in care of patients with infection (diagnosis, treatment, surveillance, control and prevention)

These mission cannot be carried out effectively

without proper attention to communication with the medical staff who directly care for patients

The interface between clinician and microbiologist is critical

or logical in diagnosis and treatment of infectious diseases Rosenblatt JE; Am J Clin Pathol 1988;90:355-357.


Potential problems related to Lab activities in

Epidemiologic investigation

1. Misdiagnosis of outbreak (pseudo outbreak)

2. Inadequate quality control

3. Overuse of the Lab’s resources

Potential problems related to Lab activities in Epidemiologic investigation

1. Misdiagnosis of outbreak (pseudo outbreak)

* Clusters of ‘false infections’ or * False clusters of ‘true infections’ * Inaccurate or inconsistent microbiologic procedures * Ineffectively sterilized or contaminated reagents or equipments


2. Inadequate quality control

* Organisms involved in outbreak usually

are isolated at different time

* Lab results are particularly susceptible to day-to-day variation or batch-to-batch variation

* (IQC, EQA, HA, LA, ISO15189)


3. Overuse of the Lab’s resources

*Too many cultures from personnel or environment

* Basic infection control measures can solve

some outbreak without additional microbiologic data or

epidemiologic investigation

* Typing system must be used selectively, even during outbreak


Sources of pseudo-outbreaks of nosocomial infection

1. Clinical data or clinician • Wrong clinical diagnosis

• Positive cultures represent colonization rather than

infection (supportive Lab data may required)

• Failure to differentiate community-acquired from nosocomial infection

• Contamination during specimen collection


Sources of pseudo-outbreaks of nosocomial infection 2. Lab

• Contamination during specimen transport •Contamination during processing

(media, reagents, equipment) •Use inadequate methods

3. Case-finding

•Increased surveillance efficiency • Improved Lab techniques for identification

4. Chance clustering


The alert and response in infectious disease surveillance programmes

should be performed with

the implementation of

natural workflows in microbiology Lab

Role of the microbiology laboratory in infectious disease

surveillance, alert and response. (Canton R. Clin Microbiol and Infect 2005;11:3-8)

Role of clinical microbiology lab Natural workflow of microbiology laboratory includes 1. Specimen management (essential for accurate work) Selection, collection, labelling, transportation, storage biosafety 2. Specimen processing techniques Rapid, easier to perform, clinical and economic benefits (Molecular techniques; direct impact on rapid response for

emerging pathogen) 3. Results and data flow Sufficient internal data management, storage capacity,

Automatic alert unusual results Integrate in regional, national and international databases

Summary To achieve hospital accreditation standards

IC staff (Lab staff) must understand how to support and cooperate with

Lab staff (IC team) and maintain infection control as an integrated part of

clinical laboratory.

Investigation of suspected outbreak

1 0.9% Sodium Chloride Intravenous Infusion 100ml B BRAUN (Thailand) N= 73 4 Lots

2 2% Chlorhexadine in 70% Alcohol Pharmacology; Siriraj N= 71 -

3 Heparin 5000 IU/ml; 5 ml LEO N= 5 1 Lots

4 Heparin 100 unit/ml in NSS Pharmacology; Siriraj N= 70 8 Lots Lot Exp 11 กย09, 20 กย 09, 23 กย09, 26 กย 09, 2 ตค 09, 3 ตค 09, 10 ตค 09, 18 ตค 09

5 Others N=14

6 Over all N= 233

7 Blood from Port A Cath N= 86 samples

N= 74 patients

Bacillus spp = 5 patients

Culture investigation during A. baumannii septicemia suspeted outbreak at เคมบ าบด in Siriraj Hospital 2009;update 2 Nov 09

Summary Culture Results

Lot DD 5684 Exp 11/ 2011

All samples ; No growth

A. baumannii = 14 patients

No growth = 56 patients

Lot Exp, 1/6/2012, 3/6/2012, 15/7/2012, 19/07/2012

Investigation of suspected outbreak

No. Code Date Sample Name Patient Name HN Ward Culture result Conony count

1 AB058 10-ก.ย.-09 Blood from Port A นอ หญงอชยา ระหงษ 45-057176 OPD ชน 7 A. baumannii >1X105 CFU/ml

2 AB089 11-ก.ย.-09 Blood from Port A นางเครอรตน สวรรณวฒน 46-054245 OPD ชน 7 A. baumannii 1X102 CFU/ml

3 AB069 10-ก.ย.-09 Blood from Port A นางจนตนา เตมแสงชต 43-101203 OPD ชน 7 A. baumannii >1X105 CFU/ml

4 AB085 11-ก.ย.-09 Blood from Port A นางนภา เหลองอรณเลศ 41-063643 OPD ชน 7 A. baumannii >1X105 CFU/ml

5 AB081 10-ก.ย.-09 Blood from Port A นางนศาชล ทองสรอย 48-245981 OPD ชน 7 A. baumannii >1X105 CFU/ml

6 AB073 10-ก.ย.-09 Blood from Port A นางบญมา หอวรรธกล 42-165611 OPD ชน 7 A. baumannii >1X105 CFU/ml

7 AB065 10-ก.ย.-09 Blood from Port A นางมยร วงค า 51-182850 OPD ชน 7 A. baumannii 2X104 CFU/ml

8 AB077 10-ก.ย.-09 Blood from Port A นางสาวปรดา ตมทอง 50-122068 OPD ชน 7 A. baumannii 8X102 CFU/ml

9 AB251 2-ต.ค.-09 Blood from Port A นางสชาดา ลขตกาญจนกล 40-163908 OPD ชน 7 A. baumannii 6 X 104CFU/ml

10 AB144 16-ก.ย.-09 Blood from Port A นายไชยยงค ชวนะรานนท 48-112454 OPD ชน 7 A. baumannii 8X104 CFU/ml

11 AB136 16-ก.ย.-09 Blood from Port A นายชวลต สทธนราธร 45-074070 OPD ชน 7 A. baumannii 6X103 CFU/ml

12 AB105 11-ก.ย.-09 Blood from Port A นายชยโรจน รศมสชานนท 51-229919 OPD ชน 7 A. baumannii 2X103 CFU/ml

13 AB212 25-ก.ย.-09 Blood from Port A นายประเสรฐ จนพงษ 49-1012282 OPD ชน 7 A. baumannii 2.3 X 103 CFU/ml

14 AB132 16-ก.ย.-09 Blood from Port A นายวพฒน บญราศร 51-257076 OPD ชน 7 A. baumannii >1X105 CFU/ml

Culture investigation during A. baumannii septicemia suspeted outbreak at เคมบ าบด in Siriraj Hospital 2009:update 2 Nov 09

Guidance for Control of Infections with Carbapenem-Resistant/Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae

in Acute Care Facilities

Recommendations from CDC and (HICPAC) An aggressive infection control strategy, using Contact precautions Implementing CLSI guidelines for CRE detection In areas where CRE are not endemic:- 1) Review microbiology records preceding 6-12 months

to determine whether CRE have been recovered at the facility.

2) If the review finds previously unrecognized CRE,

perform a point prevalence culture survey in high-risk units to look for other cases of CRE.

3) Active surveillance cultures of patients with

epidemiologic links to persons from whom CRE have been recovered.

MMWR March 20, 2009/58(10);256-260

Guidelines for Control of Infections with Carbapenem-Resistant/Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae

in Acute Care Facilities

Recommendations from CDC and (HICPAC)

An aggressive infection control strategy, using Contact precautions Implementing CLSI guidelines for CRE detection In areas where CRE are endemic An increased likelihood exists for importation of CRE, and facilities should consider additional strategies to reduce rates of CRE Acute care facilities should review these recommendations and implement appropriate strategies to limit the spread of these pathogens.

MMWR March 20, 2009/58(10);256-260

http://www.asmob.com/screensaver60/preview.php?screensaver60id=15

collaboration with microbiology laboratory in investigation of n.i....

Documents