分解シグナルをつけてバックグ ラウンドを下げた細...
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蛍光タンパク質による観察は、一般的にどのように改善されるか?
• 顕微鏡の性能を上げる(一般的に高価)
– 光源の強度を上げる → 細胞へのダメージ
– カメラの感度を上げる
– 露光時間を長くする → 解像度が下がる
• 蛍光タンパク質の性能を上げる
– → 飛躍的な性能向上は望めない
PYK1 promoter PYK1 terminatorATG STOP
GFP*
蛍光緑に見えるコロニー
細胞のキャパシティの限界までGFPを発現させる
*yEGFP3: Cormack et al., 1997
30-1-100
Kintaka et al. Sci. Rep. 2016
CC: 細胞膜局在GFP
GFP
Cyt: 細胞質GFP
GFPMTS
MTS: ミトコンドリア輸送GFP
GFP
SS: 小胞輸送GFP
SS
GFP
NLS: 核輸送GFP
NLS
GFP CC
GFP
NES: 核外輸送GFP
NES
局在化 (輸送) キャパシティの限界までGFPを発現する
Kintaka et al. Sci. Rep. 2016
CC: 細胞膜局在GFP
GFP
Cyt: 細胞質GFP
GFPMTS
MTS: ミトコンドリア輸送GFP
GFP
SS: 小胞輸送GFP
SS
GFP
NLS: 核輸送GFP
NLS
GFP CC
GFP
NES: 核外輸送GFP
NES
局在化 (輸送) キャパシティの限界までGFPを発現する
Kintaka et al. Sci. Rep. 2016
14.7 4.1 1.0 16.1 0.7 %
2,000,000 m/c 350,000 m/c
Total proteome = 50,000,000 molecules/cell
5500-5-100*1900-5-255
Mitochondria (Om45-GFP)
ER(Spf1-GFP) 6,901 m/c4,289 m/c
いわゆる局在マーカーは、暗い
2,000,000 / 4289 = 466 fold 350,000 / 6901 = 50 fold
キャパシティの限界まで発現したら?
Exposure time (msec) – Gain - Sensitivity
100-1-100 500-1-100
MTSAdh3
-GFP
Om45-GFP
500-1-100 1900-5-255
キャパシティの限界近くまで発現させると、明るい(肉眼でもよく見える)
Exposure time (msec) – Gain - Sensitivity
RpsL 1 MATVNQLVR---KPRARKVAKSNVPALEACP 28AT+NQ+ R PR +K+ S P L+ CP
Mrps12 1 MLSRFMSNTWCTPLRQAQRLFSSTTTMQATATLNQIKRGSGPPRRKKI--STAPQLDQCP 58
RpsL 29 QKRGVCTRVYTTTPKKPNSALRKVCRVRLTNGFEVTSYIGGEGHNLQEHSVILIRGGRVK 89 Q++GV RV PKKPNSA RK CRVRLTNG V++YI GEGH+ QEHS++ +RGGR +
Mrps12 59 QRKGVVLRVMVLKPKKPNSAQRKACRVRLTNGNVVSAYIPGEGHDAQEHSIVYVRGGRCQ 119
RpsL 90 DLPGVRYHTVRGALDCSGVKDRKQARSKYGVKRPKA* 126DLPGV+YH +RGA D SGV +R +RSKYG K+P
Mrps12 120 DLPGVKYHVIRGAGDLSGVVNRISSRSKYGAKKPSKS* 157
MitoFatesによる予測
ミトコンドリアリボソームタンパク質Mrps12のミトコンドリア局在化
シグナル(MTSMrps12)
Mrps12とRpsL (大腸菌) のアラインメント
MaturedPrecursor
MTS-GFP
GFPMitochondria
(Mitotracker Red CMXRos)
GFP
Bright field
MTS-GFP
GFP
MTSMrps12-GFPの大量発現はミトコンドリアに障害を起こす
Kintaka et al. Sci. Rep. 2016
SS-GFPの大量発現は小胞輸送に障害を起こす
GFP
SS-moxGFP
GFPER
(mRFP-Sec12)
STE24 Vector
GFP
moxGFPSS-GFP
SS-moxGFP
ste24Δ Vector
GFP
moxGFPSS-GFP
SS-moxGFP
Signal-GFP
1. クロギングした分子
2. 毒性のあるプレカーサー
オルガネラ
細胞質
Signal-GFP-Deg プロテアソーム依存的な分解
オルガネラ
細胞質
細胞質のプリカーサーをcODC1デグロンにより特異的に分解する
cODC1デグロン (Deg)Jungbluth et al. 2010
-LPMSCAQESITSLYKKAGSENLYFQ*Degron Linker TEV site
• マウス・オルニチンカルボキシラーゼ (ODC)のC
末にあるデグロン
• プロテアソームに直接認識される
MTSMrps12
-GFP
GFP Mitochondria(Mitotracker Red CMXRos)
MTSMrps12-GFP-Deg
10 µm
Bright field
Degの付加により、MTSMrps12-GFPのミトコンドリア局在が観察できた
Kintaka et al. Sci. Rep. 2016
MTS-GFP
Degによりミトコンドリア局在化観察が改善された
MTSMdh1
MTSMmf1
MTSMdh1-Deg
MTSMmf1-DegMTS-GFP-deg細胞質でのバックグランドを下げ毒性を減らす
Unpublished
PPYK1 MTSMrps12-GFP PPYK1 MTSMrps12-GFP-Deg PPYK1-500 MTSMrps12-GFP
1000-3-100 1000-3-100* 5000-5-100
PPYK1 GFP PPYK1-500 GFP-Deg
30-1-100 1000-2-100
発現量を下げただけでは局在が改善しない場合もある
Unpublished
260 msec – 25% 260 msec – 25%
SS-moxGFP SS-moxGFP-Deg
デグロンの付加によりSS-GFPの局在化が改善された
Unpublished
→ デグロンの付加により、分泌性タンパク質の生産が向上するかもしれない
500-1-100*
SS-moxGFP-HDEL SS-moxGFP-Deg-HDEL
1000-1-100*
デグロンの付加により小胞体観察が改善された
...LYKLPMSCAQESITSLYKKAGSHDEL*
Unpublished
500-1-100100-1-100
ペルオキシソームへの局在化も改良する
GFP-ePTS1 GFP-Deg-ePTS1
...LYKLPMSCAQESITSLYLGRGRRSKL*ePTS1 (peroxisome localization signal) ; DeLoache et al., 2016
Unpublished
作成した蛍光タンパク質 (ベクター)
• 細胞質・ミトコンドリア・ペルオキシソーム・輸送小胞・小胞体
• GFP (moxGFP)・mRuby3
• 多コピー (pTOW40836)・シングルコピー (pRS413)
• 高い分解能を求めている場合
• 長時間の観察を行いたい場合
• 局在化シグナルの活性を知りたい場合
• あまりいい蛍光顕微鏡システムを持っていない場合
• 教育現場
利用が想定される状況
今後の研究方針
• 酵母以外の細胞、特に哺乳類細胞でも使用可能かを調査
• 局在化シグナルや蛍光タンパク質のさらなる改善
• 蛍光タンパク質以外のタンパク質の局在が改善されるかを調査
企業との連携の実績
• 今のところありません