次世代シークエンシング

次世代シークエンシング 　(NGS) 用試薬

NxSeq™ DNA サンプル調製キット

NxSeq™ DNA サンプル調製キット

NxSeq™ 40 kb Mate-PairクローニングキットNxSeq™ 40 kb Mate-Pairクローニングキット

●所要時間は他社製品の半分～ 2/3

●キメラやフォールスジャンクションが減少

●NGS のコストを削減

●40 kb の長間隔でmate-pair な NGS 用ゲノム

　ライブラリーを作製

●アダプター付加不要：pNGS ベクターには　

　Illumina, Roche 454, Ion Torrent＊用プライ　

　マー部位が組込み済み

●全ゲノムシークエンシングプロジェクトの

　新規導入に最適

＊Ion Torrent 用は 2012 年末発売予定

…しかも、データ品質はそのまま！

Lucigen A社 B社

70

110 分

40

175 分

100 75

235 分

165 70

所要時間比較～DNAの断片化からサイズ選択まで～

待ち時間および作業時間

= Terminator

cosN

ori 2

IncC

pNGSTMFOS

40 kb Insert

ori V

rep

E

par A par B

par C CmR

IlluminaIon Torrent Ion Torrent

454Illumina454

*

図 2. pNGS FOS ベクター

図 1. 他社製キットとの所要時間比較

2 時間以内にライブラリー調製！

NxSeq™ DNA サンプル調製キット次世代シークエンシング用

DNAライブラリー調製の未来型！

●ライブラリー調製が 2時間以内●キメラやフォールスジャンクションが減少●コスト削減可●100 ng DNA サンプルからスタート

…しかも、データ品質はそのまま！

次世代シークエンシング（NGS）では、末端平滑化、A- テーリング、アダプターライゲーションを効果的に行える、高性能ライブラリー

構築キットが求められます。Lucigen 社の NxSeq™ DNA サンプル調製キットは、高効率の A- テーリングとライゲーションが最適化され

ており、シークエンシング操作で最大性能を発揮します。さらに、NxSeq™ キットの操作は市販品のなかでも最も効率的なワークフロー

となっており、2時間以内にライブラリーを調製できます。

0

1500

0

1500

0

1500

1000000 2000000 3000000 4000000

B社

1000000 2000000 3000000 4000000

A社

1000000 2000000 3000000 4000000

NxSeq™

図 3. DH10B ゲノム DNAライブラリーの被覆度比較。Lucigen 社の NxSeq™ DNA Sample Prep Kit2 と、A社およびB社の次世代シークエンシング用ライブラリー調製キットを使用してDH10B E. coli ゲノム DNAから NGS ライブラリーを構築した。全サンプルをバーコード化し、Illumina GAIIx に供した。プロットは被覆範囲の深度を示す。すべてのキットで同等な性能が確認できた。

E. coli

本キットは下記の機器でご利用いただけます。●Roche 454 (NxSeq™ DNA Sample Prep Kit 1＊)●Illumina (NxSeq™ DNA Sample Prep Kit 2)●Ion Torrent　近日発売！

構成内容●NxSeq Enzyme Mix●NxSeq 2X Buffer●NxGen™ High Concentration Ligase＊Kit1 のみ Suspension Buffer と　Sizing Solution を含む

次世代シークエンシング

商品リスト商品リスト

Lucigen

NEBA社

Illumina

B社

他社製品の1.5～2倍速い！～DNAの断片化からサイズ選択まで～

断片化DNA

0 1 Hr 2 Hrs 3 Hrs 4 Hrs

末端平滑化/A-テール調製

A-テール調製

末端平滑化調製

末端平滑化調製

ライゲーション調製

ライゲーション調製

ライゲーション調製

A-テール調製

精製インキュベーションインキュベーション

5 40 5 30 30 Minutes

Minutes105 5 530 9060 30

5 530 30 Minutes5 3030 30 15

2 hrs 55 minA社

B社

1 hr 50 minLucigen

3 hrs 55 min

操作時間待ち時間サイズ選択

インキュベーション インキュベーション

インキュベーション インキュベーション

インキュベーション

インキュベーション

図 4. NxSeq™ DNA サンプル調製キットと他社製品の作業内容と所要時間の比較

精製 精製 精製

精製 精製

Lucigen Corporation メーカー略号：LUC品名 対応プラットフォーム 品番 包装 希望販売価格

11000-1 10 RXN ¥44,00011000-2 20 RXN ¥83,00012000-1 10 RXN ¥40,00012000-2 20 RXN ¥76,00042028-1 5 RXN ¥89,00042028-2 10 RXN ¥169,00042028-3 20 RXN ¥321,000

NxSeq™ DNA サンプル調製キット1

NxSeq™ DNA サンプル調製キット2

Roche 454

Illumina

NxSeq™ 40 kb Mate-Pair クローニングキット

　● 希望販売価格 ･･･ 「希望販売価格」は参考であり、販売店様からの販売価格ではございません。 記載の希望販売価格は２０１2年8月１日現在の希望販売価格です。 予告なしに改定される場合がありますので、ご注文の際にご確認下さい。消費税は含まれておりません。　● 使 用 範 囲 ･･･ 記載の商品は全て、「研究用試薬」です。 人や動物の医療用・臨床診断用等としては使用しないよう、十分ご注意ください。

NxSeq™ 40 kb Mate-Pairクローニングキット次世代シークエンシングに

長間隔でmate-pair なライブラリーを！●40 kb の長間隔でmate-pair な NGS 用ゲノムライブラリーを作製●アダプター付加不要：pNGS ベクターには各社プライマー部位が組込み済み●全ゲノムシークエンシングプロジェクトの新規導入に最適

pNGS FOS ベクター（図 2）は組込み式の Roche 454 および Illumina

プライマー結合サイトを有し、アダプターのライゲーションが不要で

す。40 kb の paired- end ライブラリーを使用して、正確なゲノムアセ

ンブリーを可能にする決定的な scaffold を作製できます。転写フリー

のベクターなため非常に安定なクローンで、時間と不確実性が低下し、

これまでより低バイアスで高い配列包括度が達成できます。

本商品により、ライブラリー構築の作業がこれまでより容易になります。独自のワークフロー

ステージ リード数 %

パイプライン 8,683,854

フィルターリード 6,506,126

マップ化したリード 5,173,778 79.2

ペア配列が得られたリード 4,685,996 90.6

長間隔、mate-pair 3,018,576 64.4

ヒト由来細胞株（GM15510, Coriell）について、pNGS FOS ベクターを

用いて巨大スケールで長間隔かつmate-pairなシークエンシングを行い、

クローニングとシークエンシングの効率を調べたところ、フィルター

リードの 64%が適切にゲノムへマッピングされたことが分かりました

（表 1）。これは、既存の系に比べ何倍も高効率で、次世代シークエンシ

ング（NGS）プラットフォームを使用する際にゲノムの正確なアセンブ

リーが可能となることを示しています。

表 1. 長間隔かつmate-pair なシークエンスの割合

図 5. NxSeq™ 40 kb Mate-Pair クローニングキットのワークフロー●断片化して40 kbにサイズ分けし、pNGS FOSベクターにライゲーション、　ラムダパッケージング。●4 bp 制限酵素（Rsal, CviQl, Bfal, FsqBl）で切断。●制限酵素サイトを再構成して、mate-pair ジャンクションを形成。●Roche 454 または Illumina プライマーで増幅し、シークエンス解析。

高効率 40 kb Paired-end シークエンシング

商品リストは中面にございます Rsa FsqCvi Bfa

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