mycobacterium tuberculosis tenyészetének növekedését ... · ramp: az rns szintézist gátolja,...
TRANSCRIPT
Tudományos Diákköri Dolgozat
BARANYAI ZSUZSA
Mycobacterium tuberculosis tenyészetének növekedését gátló peptidkonjugátumok szintézise és
funkcionális jellemzése
Témavezetők: Dr. Bősze Szilvia, tudományos főmunkatárs Dr. Horváti Kata, tudományos munkatárs
Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar
Budapest, 2009
2
Tartalomjegyzék
1. BEVEZETÉS ............................................................................................................... 5
2. IRODALMI ÁTTEKINTÉS ............................................................................................ 7
2.1. A Mycobacterium tuberculosis kórokozó baktérium .................................................. 7
2.2. A tuberkulózis kezelésében alkalmazott legfontosabb antituberkulotikumok
és jellemzőik .................................................................................................................... 8
2.3. A rezisztens, gyógyszeres kezelésnek ellenálló baktériumtörzsek megjelenése ....... 11
2.4. A hatóanyagok célbajuttatása konjugátumok alkalmazásával ................................... 12
2.4.1. Anyagfelvétel a sejtmembránon keresztül.............................................................. 13
2.4.2. A hatóanyagok fertőzött makrofágokba történő célbajuttatására
elméletileg alkalmazható hordozómolekulák bemutatása ................................................ 14
2.4.3. A hatóanyag – hordozó egység között kialakítható kémiai kötések
típusainak bemutatása .................................................................................................... 16
2.4.4. A spacerek (távolságtartó egységek) szerepe a hatóanyag molekulák
hordozóhoz történő kapcsolása során ............................................................................. 18
2.4.4.1. A GFLG szekvencia spacer peptidként (távolságtartó egység)
való alkalmazása ............................................................................................................. 18
2.4.5. Antituberkulotikum – hordozó konjugátumok áttekintése ....................................... 20
2.5. Új, lehetséges antituberkulotikumok meghatározása in silico módszerek
alkalmazásával ................................................................................................................ 21
3. CÉLKITŰZÉS .............................................................................................................. 23
4. A KÍSÉRLETI MÓDSZEREK ELMÉLETI ALAPJAINAK ÁTTEKINTÉSE ...................... 24
4.1. Szilárdfázisú peptidszintézis ..................................................................................... 24
4.1.1. A Boc/Bzl módszer ................................................................................................ 24
4.1.2. Az Fmoc/tBu módszer ........................................................................................... 25
4.1.3. A peptidkötés kialakítása a szintézis során ............................................................ 25
4.1.4. A kapcsolási reakciók követése ............................................................................. 26
4.2. Szintetikus peptidekben a cisztein oxidációs állapotának meghatározása ................ 26
4.3. Minimális gátló koncentráció és telepszám meghatározása ...................................... 27
4.4. Az áramlási citometria .............................................................................................. 29
3
5. A KÍSÉRLETI MUNKA ................................................................................................. 31
5.1. A peptidek és peptidszármazékok szintézise ............................................................ 31
5.1.1. A H-GFLGC-NH2 peptidamid és származékainak szintézise
Boc/Bzl stratégiával ......................................................................................................... 31
5.1.2. A H-[TKPKG]2C-NH2 peptidamid és származékainak szintézise
Fmoc/tBu stratégiával ...................................................................................................... 33
5.1.3. Az in silico meghatározott hatóanyag jelöltek származékainak
(vegyület 102 és 103) konjugálása .................................................................................. 34
5.2. A hordozóban a cisztein oxidációs állapotának ellenőrzése a konjugálási reakciót
megelőzően ..................................................................................................................... 35
5.3. A hordozó peptiszármazék dimerizációjának követése a konjugálási
reakciót megelőzően ....................................................................................................... 35
5.4. A konjugálási reakcióban alkalmazott klóracetilezett SAK származék előállítása ..... 35
5.5. A 103-Aoa-OT10-Cys konjugálása ClAc-SAK-hoz .................................................... 36
5.6. A konjugátumok minimális gátló koncentrációjának és telepszámának
meghatározása ............................................................................................................... 36
5.7. A hordozómolekulák és a konjugátumok sejtekbe történő bejutásának,
felvételének vizsgálata áramlási citometriával ................................................................. 37
5.7.1. A Cf-GFLGC előállítása ......................................................................................... 37
5.7.2. A Cf-GFLGC konjugálása klóracetilezett SAK-hoz ................................................ 38
5.7.3. A Cf-GFLGC-SAK konjugátum karboxifluoreszcein tartalmának
meghatározása ............................................................................................................... 38
5.7.4. A Cf-GFLGC peptidszármazék sejtbejutásának vizsgálata MonoMac6
humán monocita sejtvonalon áramlási citometriával ........................................................ 38
5.7.5. A Cf-GFLGC-SAK peptidszármazék sejtbejutásának vizsgálata MonoMac6
humán monocita sejtvonalon áramlási citometriával ........................................................ 39
5.8. Tisztítási és analitikai módszerek ............................................................................. 40
5.8.1. Analitikai és preparatív RP-HPLC .......................................................................... 40
5.8.2. ESI-MS spektrometria............................................................................................ 40
5.8.3. A peptidek és a konjugátumok aminosavanalízise ................................................. 41
6. EREDMÉNYEK ........................................................................................................... 44
6.1. A GFLGC, az Aoa-GFLGC és az Aoa-OT10-Cys peptidek, peptidszármazékok
előállítása ........................................................................................................................ 44
6.2. 102-Aoa-GFLGC és 103-Aoa-OT10-Cys előállítása, az előállított vegyületek
vizsgálata ........................................................................................................................ 47
4
6.3. ClAc-SAK előállítása ................................................................................................ 53
6.4. A 103-Aoa-OT10-Cys-SAK előállítása ...................................................................... 53
6.5. A vegyületek, konjugátumok MIC és CFU értékei ..................................................... 54
6.6. Cf-GFLGC és Cf-GFLGC-SAK előállítása, és a kapott konjugátumok
sejtekbe történő bejutása ................................................................................................ 55
7. ÖSSZEFOGLALÁS ..................................................................................................... 62
Rövidítésjegyzék ............................................................................................................. 63
Irodalom .......................................................................................................................... 65
Köszönetnyilvánítás ........................................................................................................ 71
5
1. BEVEZETÉS
A gümőkór vagy tuberkulózis (tbc) egy fertőző betegség, melyet a Mycobacterium
tuberculosis (továbbiakban M. tuberculosis) baktérium okoz. A tuberkulózist okozó
baktériumot Robert Koch 1882-ben fedezte fel, kutatásaiért 1905-ben Nobel-díjat kapott [1]
(1. ábra). A betegség elsősorban a tüdő szöveteit érinti (pulmonáris tbc), a beteg tüdejében
rögök keletkeznek, innen a betegség magyar neve: gümőkór [2]. A baktérium
megtámadhatja a központi idegrendszert (meningitisz), a nyirokrendszert, a keringési
rendszert (miliáris tbc), az ivarszerveket, a húgyutakat, a csontokat és az ízületeket is.
1. ábra: (A és B) Robert Koch, a tuberkulózist okozó
baktérium felfedezője
A tuberkulózis a történelem során a legtöbb halálesetet okozó fertőző betegségek egyike.
A betegség gyógyítható, de napjainkban több mint kétmilliárd ember fertőzött a
baktériummal. A harmadik világ országaiban évente kilencmillió új fertőzést és kétmillió
halálesetet jelentenek. A fertőzöttek élete során kb. 10%-ban a fertőzés biztosan
megbetegedéshez vezet. A rezisztens, vagyis a gyógyszeres kezelésnek ellenálló
baktériumtörzsek okozta megbetegedések száma évről évre lassú növekedést mutat. 2006-
ra félmilliónyira tehető a multirezisztens esetek száma. A fejlettebb országokban főként az
immunrendszer csökkent védekezőképessége teszi lehetővé a tbc-s fertőzést. A legtöbb
megbetegedést Afrikának a Szaharától délre eső részéről, illetve Dél-Kelet-Ázsiából (India,
Kína) jelentik [3] (2. ábra). Ez a mutató a HIV és AIDS terjedése miatt évről évre
drasztikusan emelkedik. Világszerte az AIDS-es betegek 15%-a hal meg tuberkulózisban
[3-5].
A B
6
2. ábra: A tuberkulózis incidencia 2007-ben [3]
Magyarországon a tuberkulózis incidenciája tartósan a legmagasabb Szabolcs-Szatmár-
Bereg megyében, de kiemelkedik Hajdú-Bihar, Jász-Nagykun-Szolnok, Borsod-Abaúj-
Zemplén megye illetve Budapest is. Hazánkban a szűrési fegyelem lazulása mellett az
alkoholizmus, a romló szociális helyzet, a munkanélküliség játszanak szerepet az incidencia
emelkedésében. A szűrővizsgálattal kiemeltek korcsoportos vizsgálata azt mutatja, hogy a
legmagasabb arány az új tbc-s esetek között a fiatal és középkorú korcsoportokban van [6].
Egy tbc-ben szenvedő, kezeletlen személy évente kb. 10-15 embert fertőzhet meg [3].
Csak azok fertőznek, akiken már kitört a betegség, a látensek nem. A baktérium dormans
állapotban évekig lehet a szervezetben, amely csak az immunrendszer legyengülésére vár,
és már „robban” is.
Dolgozatomban röviden összefoglalom a tuberkulózist okozó baktérium jellemzőit,
valamint a betegség kezelésében alkalmazott antituberkulotikumokat és legfontosabb
jellemzőiket. Bemutatom a hatóanyagok szelektív célbajuttatásának lehetőségeit.
7
2. IRODALMI ÁTTEKINTÉS
2.1. A Mycobacterium tuberculosis kórokozó baktérium
A M. tuberculosis egy lassan szaporodó, intracelluláris, obligát aerob baktérium (3. ábra).
A baktérium 16-20 óránként osztódik. Ez más baktériumok osztódási idejéhez képest
lassúnak számít. A baktériumok osztódási ideje többnyire percekben mérhető – az
Escherichia coli húszpercenként osztódik, de a szintén mikobaktériumok közé tartozó
Mycobacterium leprae húsznaponként. A M. tuberculosis pálcika alakú baktérium, ami
ellenáll a gyengébb fertőtlenítőknek. Hetekig tűri a szárazságot, de csak a gazdaszervezeten
belül képes osztódni (in vitro tenyészetet csak hosszú idő után sikerült a baktériumból
létrehozni és fenntartani) [2].
3. ábra: A M. tuberculosis mikroszkópos képe Ziehl-Neelsen festést követően,
forrás: http://www.kimicontrol.com/edu-e.html
A M. tuberculosis 60% lipidet tartalmaz, ennek jelentős része a sejtfalban lokalizált. Ez
lehet az egyik fő oka annak, hogy a baktériumsejt nagymértékben rezisztens a hőmérséklet
változásaival szemben. A sejtfal külső rétegeinek peptidláncai képezik a sejtfal tömegének
15%-át és a biológiailag fontos antigének is itt találhatók. Ezek felelősek a celluláris
immunválasz kiváltásáért. A baktérium maga beszáradt exhalációs cseppecskékben,
köpetben 6 hónapig is életképes maradhat. Rendkívül ellenálló savakkal és lúgokkal
szemben is [7].
Stewart Cole és munkatársai 1998-ban közölték a M. tuberculosis H37Rv virulens
baktériumtörzs teljes genomjának szekvenciáját [8]. A projekt során kapott információkat az
interneten hozzáférhető TubercuList (http://genolist.pasteur.fr/TubercuList/) adatbázisban
gyűjtik. A frissített adatok szerint [9, 10] a teljes genom ~4,4 millió bázispárból áll és
összesen 4066 gént tartalmaz. Ebből 4009 fehérje kódoló gén, 57 gén RNS-t kódol. A
fehérjéket kódoló gének elnevezése Rv kóddal kezdődik (pl. Rv2654), ami a H37Rv törzsre
utal.
8
2.2. A tuberkulózis kezelésében alkalmazott legfontosabb antituberkulotikumok és
jellemzőik
A tuberkulózisos betegeket antibiotikumokkal, ún. antituberkulotikumokkal kezelik. A ma
alkalmazott alapvető hatóanyagokat nagyrészt még az 50-es években fejlesztették ki. A
megfelelően megválasztott kezelés az esetek döntő többségében teljes gyógyulást
eredményez. A legelterjedtebben használt antituberkulotikumok a következők [11, 12] (4.
ábra):
• első vonalbeli antituberkulotikumok: izoniazid (INH), rifampicin (RAMP), pirazinamid
(PZA), etambutol (ETB), sztreptomicin (SM)
• második vonalbeli antituberkulotikumok: aminoglikozidok, polipeptidek,
fluorokinolonok, tioamidok, cikloszerin (CS), p-aminoszalicilsav (PAS)
4. ábra: Az első vonalbeli antituberkulotikumok, és néhány másodvonalbeli
antituberkulotikum szerkezeti képlete [12]
9
A M. tuberculosis baktérium szaporodását döntően befolyásolja a környezet oxigén
szintje és kémhatása. A magas oxigéntenzió és az enyhén lúgos kémhatás mellett a tüdő
kavernákban a legmagasabb a baktérium anyagcseréjének aktivitása és szaporodási
frekvenciája is. Az antituberkulotikumok hatékonyságát a M. tuberculosis szaporodási
sebessége és a környezet kémhatása nagymértékben befolyásolja. A neutrális és enyhén
lúgos közegben, gyorsan szaporodó baktérium populációkkal szemben az INH a
leghatékonyabb, bár a RAMP és a SM is hatásosnak bizonyult. A RAMP a semleges pH-jú
sajtos gócokban lassan szaporodó baktériumokkal szemben is kimagasló aktivitással
rendelkezik. A PZA intracellulárisan savas kémhatásnál fejti ki hatását [13] (5. ábra).
5. ábra: A leggyakrabban alkalmazott antituberkulotikumok feltételezett hatása az egyes
baktérium populációkra [13]
10
Sok antituberkulotikumot használtak évtizedeken keresztül, anélkül, hogy ismerték volna
a hatásmechanizmusaikat. A hatásmechanizmus kiderítésére irányuló kutatások eredményét
mutatja be vázlatosan az 1. táblázat.
Tulajdonság Antituberkulotikum
zsírsav
bioszintézis
inhibitorok
INH: prodrug, a KatG géntermék aktiválja, mikolsav (a mikobakteriális
sejtfal fontos építőeleme) szintézist gátolja, NADH-val képez
származékot, ezáltal a metabolizmust is megzavarja
PZA: szerkezete hasonlít az INH-hoz, prodrug, aktiválódik
Tioamidok (etionamid, protionamid): prodrug
arabinogalaktám
és peptidoglikán
bioszintézis
inhibitorok
ETB: arabinozil-transzferáz inhibitor, növeli a sejtfal áteresztő
képességét azáltal, hogy nem tud létrejönni a mikolsav-arabinogalaktám
komplex
D-cikloszerin: gátolja a D-alanin-racemáz és D-alanin-ligáz enzimeket,
melyek szükségesek az UDP-muramil-pentapeptid szintéziséhez (sejtfal
kialakításában van szerepe)
fehérje szintézis
inhibitorok
SM: a baktérium riboszómájának 30S alegységéhez kötődik (az emberi
sejtek riboszómája különbözik, ezért szelektív a baktériumsejtekre)
Aminoglikozidok
Polipeptidek
DNS alapú
folyamtok
inhibitora
RAMP: az RNS szintézist gátolja, a DNS-függő RNS-polimeráz béta
alegységéhez köt, ezzel megakadályozza a transzkripció folyamatát
Fluorokinolonok: az ATP-függő DNS-girázt (topoizomeráz II) és az ATP-
függő topoizomeráz IV-et gátolják, ezért akadályozzák a DNS replikációt
és a transzkripciót (eukarióta sejtekben nincsenek ilyen enzimek)
dihidrofolát-
reduktáz
inhibitorok
PAS: kötődik a mikobakteriális dihidrofolát-reduktáz enzimhez, így
gátolja a DNS szintézist, mely sejthalálhoz vezet
1. táblázat: A főbb antituberkulotikumok irodalomban leírt lehetséges hatásmechanizmusa
[12]
11
A makrofágok olyan intracelluláris kórokozók gazdasejtjei lehetnek, mint a M.
tuberculosis. A tbc megbetegedést okozó baktérium a makrofágok fagoszómáiban (sejten
belüli membránnal határolt sejtalkotó, amely a fagocitózis során jön létre) képesek kikerülni a
szervezet védekező mechanizmusait. A makrofágok reaktív oxigéngyökök, nitrogén-oxidok,
lizozim, hidrolitikus enzimek segítségével bontják le a baktériumokat savas vezikulumaikban.
Az aktivált makrofágok nem képesek elpusztítani az összes bekebelezett baktériumot. Ha a
fertőzött makrofágok elpusztulnak, a kiszabaduló baktériumok újabbakat fertőzhetnek meg
[14]. A fertőzött makrofágok eljuthatnak a környező nyirokcsomókba, illetve a véráram útján
egyéb szövetekbe is. Intracellulárisan a M. tuberculosis alacsony anyagcsereszinten,
dormans állapotban hosszú ideig életképes marad. Az antituberkulotikumok többsége az
inaktivált makrofágokból kiszabaduló extracelluláris baktériumokra hat [13].
2.3. A rezisztens, gyógyszeres kezelésnek ellenálló baktériumtörzsek megjelenése
A helytelen, rendszertelen és nem kellő ideig tartó gyógyszerszedés a rezisztencia
kialakulásának leggyakoribb oka. Az 1990-es évek során világszerte új fenyegetésként jelent
meg a multirezisztens (multidrug-resistant, MDR) tuberkulózis, amely a két leghatékonyabb
gyógyszerrel, az INH-dal és RAMP-nel szemben ellenállóvá vált M. tuberculosis törzsek
megjelenését jelenti. A tuberkulózisos megbetegedések 5%-a MDR tuberkulózis. Ennek a
formának a kezelése a másodvonalbeli antituberkulotikumokkal lehetséges. Ezek az
antituberkulotikumok azonban az első vonalbeli hatóanyagokhoz képest lényegesen kevésbé
hatékonyak, alkalmazásuk sokkal több és kellemetlenebb mellékhatással jár [11, 14]. A MDR
törzsek csoportján belül megjelent egy ún. extenzíven rezisztens (extensively drug resistant,
XDR) forma, amely már nemcsak az elsővonalas készítményekkel, de a jelenleg használt
hat fajta második vonalas gyógyszer közül hárommal szemben is ellenálló. Évente 40 ezer
XDR megbetegedést jelentenek [3].
A rezisztens törzsek többsége genetikai változások és az utólagos szelekció útján jön
létre. A spontán létrejött ellenálló mutációk szelekcióját a gátlóanyag jelenléte biztosítja. A
kemoterápia során megjelenő gyógyszerrezisztencia lehetőségének minimumra
csökkentését azzal érik el, hogy a szövetekben és szervekben a hatóanyagnak olyan magas
szintjét alakítják ki, mely elnyomja mind a kórokozó eredeti populációjának, mind az
esetlegesen létrejött mutánsainak szaporodását. Továbbá két olyan hatóanyagot igyekeznek
egyszerre alkalmazni, melyek alkalmazásakor keresztrezisztencia nem alakul ki, illetve a két
hatóanyag megakadályozza a másikkal szemben kialakuló mutánsok szaporodását [15].
12
2.4. A hatóanyagok célbajuttatása konjugátumok alkalmazásával
A betegség kezelésében alkalmazott antituberkulotikumok korlátozott mértékben,
diffúzióval juthatnak be a fertőzött makrofágokba a sejtmembránon keresztül. A betegség
kezelése hosszú (minimálisan 6-12 hónap), ezért számolni kell az antituberkulotikumok
mellékhatásaival, így a szervezet egészét érintő nem specifikus toxicitásukkal. A szervezet
kiválasztórendszere gyorsan kiürítheti a gyógyszert a véráramból. A hatóanyag
konjugátumok alkalmazása csökkentheti a mellékhatásokat, mivel lehetőséget adhat a
hatóanyagok szelektív, specifikus célbajuttatására a fertőzött makrofágokba. Továbbá a
hatóanyag fokozatos felszabadulása a konjugátumokból retard (elnyújtott) hatást
eredményez és ezáltal a hatóanyag lassabban ürül ki a szervezetből.
Hatóanyagok és a természetes, vagy a szintetikus eredetű makromolekulák konjugálása
50 évvel ezelőtt kezdődött. Jatzkewitz dipeptid spacert (más szóval: távolságtartó egységet)
használt, hogy egy hatóanyagot polivinilpirrolidonhoz kapcsoljon [16]. Mások számos
vízoldható polimer – hatóanyag konjugátumot szintetizáltak [17], hatóanyagot konjugáltak
immunoglobulinokhoz. Leírtak olyan polimereket is, melyek irányítható célbajuttatóként
használhatóak [18].
A gyógyszerhordozó rendszerek különféle egységekből épülnek fel. Inert szintetikus
polimer hordozóra kapcsolják a hatóanyagot, aminosav vagy peptid spacerrel összekötve. A
rendszer tartalmazhat még célbajuttató egységet [19] (6. ábra).
6. ábra: Egy gyógyszerhordozó rendszer sematikus ábrája
13
2.4.1. Anyagfelvétel a sejtmembránon keresztül
A kemoterápiában használt kis molekulasúlyú gyógyszerek diffúzióval bejutnak bármilyen
típusú sejtbe a sejtmembránon keresztül. A szelektivitás hiánya csökkenti ezeknek a
vegyületeknek a hatékonyságát, továbbá nem kívánatos mellékhatások kialakulásához
vezet.
Az endocitózis során az anyagok felvétele korlátozott. Endocitózisnál a sejtet határoló
membrán egy része körbeveszi, mintegy „elnyeli” a makromolekulát, majd belül leválik egy
ún. intracelluláris hólyagot formálva, mely tartalmazza a bekerített makromolekulát. A
hatóanyagok konjugációja hordozókhoz segíthet abban, hogy a gyógyszerkonjugátumokat
specifikusan azokba a sejtekbe irányítsuk, amelyekben a kívánt hatást el akarjuk érni. A
makromolekulák az endocitózist követően lizoszómákba kerülnek, ahol a hidrolítikus
enzimek találhatóak. A polimerhordozó – hatóanyag kötés érzékeny a lizoszomális
hidrolízisre, elbomlása során felszabadul a hatóanyag a célsejt citoplazmájában. Ilyen
rendszerek tervezésénél két kritériumot kell figyelembe venni: (1) olyan gyógyszer – hordozó
kémiai kötést kell tervezni, mely elbomlik a lizoszomális hidrolízis során, viszont képes
ellenállni az enzimek működésének a véráramban; (2) fontos továbbá, hogy a konjugátum
(hatóanyag – hordozó rendszer) felvétele specifikus legyen, csak a célsejtekbe kerüljön be
hatóanyag, és minimálisan jusson be más sejtekbe. Az endocitózis szelektivitása javítható a
molekula súlyának változtatásával, de nagyobb szelektivitás érhető el, ha specifikus
célbajuttató egységet építenek be a makromolekulába. Célbajuttató részek lehetnek
peptidek, fehérjék, szénhidrátok, szénhidrát származékok és antitestek, amelyek a célsejtre
jellemző sejtfelszíni struktúrákat ismernek fel [19].
A sejtek felületén specifikus receptorok és antigének találhatók, melyek felismernek és
kapcsolatba lépnek bizonyos típusú molekulákkal [19]. A hatóanyagok szelektív transzportja
– antituberkulotikumok esetén – a fertőzött makrofágokba történhet receptor mediált
endocitózissal. A hatóanyag molekulát olyan célbajuttató egységhez kapcsoljuk, amely
specifikusan a makrofágok sejtfelszínén található struktúrához, receptorhoz kötődik. Ilyen
receptorok lehetnek a scavenger és a tuftsin receptorok [20, 21]. A kötődés után a
konjugátum bekerül a sejtbe, majd lizoszomális degradáción megy keresztül [22, 23].
A scavenger receptorok főként a makrofágok és a makrofágszerű sejtek felszínén
expresszálódnak, a mintázatfelismerő receptorok közé tartoznak. Elsősorban a módosult
LDL-t (low density lipoprotein, kis sűrűségű lipoprotein), – pl. oxidált LDL, acetilezett LDL –
veszik fel a keringésből [24, 25.]. Továbbá ezek a receptorok polianionos ligandumok [26],
endogén anyagok, anionos foszfolipidek, kollagén, zsírsavak, peptidek, apoptotikus sejtek,
mikrobális lipopeptidek [27, 28] megkötésére képesek, melyek ezután bejutnak a sejtbe
endocitózissal [29, 30].
14
A makrofágokon, monocitákon megtalálható tuftsin receptor is alkalmas hatóanyagok
célzott sejtbejuttatására. A tuftsin-konjugátum (a tuftsin a γ-globulinból származó frakció, egy
tetrapeptid [31]) kötődése a receptorához nem csak az endocitózist segíti elő, hanem a
makrofág aktiválódását is eredményezi. Az aktivált makrofág már képes az intracelluláris
parazitákat elpusztítani [20, 23, 32, 33].
2.4.2. A hatóanyagok fertőzött makrofágokba történő célbajuttatására elméletileg
alkalmazható hordozómolekulák bemutatása
Az első konjugátumoknál természetes makromolekulákat használtak hordozóként. A
szintetikus polimerek alkalmazása több előnnyel jár: (1) a molekulatömeg tartomány
befolyásolható, (2) eltérően sok természetes makromolekulától, ezek a szintetikus hordozók
általában nem immunogének, (3) a polimerláncok térhálósíthatók a gélképződési szint
eléréséig [19].
Fehérjék széles köre használható hordozóként: egy mélytengeri csiga hemocianinja
(keyhole limpet hemocyanin, KLH), marha szérum albumin (bovine serum albumin, BSA),
ovalbumin (OVA), tetanusz toxoid (TT) és tisztított fehérje kivonatok (purified protein
derivative, PPD). A természetes vegyületek alkalmas hordozók, mert növelik a kapcsolt
epitóp immunogenitását, de jelentős hordozóspecifikus ellenanyagválasz kialakulása miatt,
alkalmazásuk a humán terápiában nem ajánlott. Ezekkel a természetes eredetű hordozókkal
ellentétben a szintetikus polimereknek és szekvenciális oligopeptideknek általában nincs
immunogén hatása [34].
A szintetikus hordozókat polimerizációval előállított (pl. elágazó láncú polipeptidek, N-
vinil-pirrolidon – maleinsav kopolimer) és diszkrét molekulákra oszthatjuk. Az előbbi
csoporttal kapcsolatban problémaként felmerül a megfelelő jellemezhetőség, illetve a
reprodukálhatóság hiánya, ami a klinikai alkalmazásuk komoly gátja. A kémiailag jól
jellemezhető molekulák közül a legelterjedtebbek a lizin dendrimerek és a lizin tartalmú
szekvenciális oligopeptidek.
N-(2-hidroxipropil)-metakrilamid (HPMA) alapú szintetikus polimerek a daganatterápiában
bizonyultak megfelelő hordozónak. Az ilyen polimerek oldhatóak vizes közegben és
biokompatibilisek. Továbbá N-metakriloil oligopeptidek p-nitrofenilésztereinek
hozzákapcsolásával kombinálhatók sok olyan gyógyszerrel, melyek primer aminocsoportot
tartalmaznak [35].
A kisebb méretű lineáris peptidek gyógyászatban való alkalmazását nehezíti, hogy az élő
szervezetbe kerülve igen gyorsan lebomlanak, ezért nem jutnak el a kívánt hatás helyére. A
terápiás alkalmazhatóság céljából nagy jelentősége van a peptidek makromolekuláris
hordozókhoz való konjugálásának. Szintetikus hordozóként régóta alkalmaznak elágazó
15
láncú poli-α-aminosavakat, mert ezek a vegyületek megfelelőnek bizonyultak a természetes
fehérjék modellezésére. Szemben a természetes antigénekkel, egyszerű, könnyen variálható
szerkezettel rendelkeznek, ezáltal megkönnyítik az immunológiai eredmények értelmezését.
Polilizin gerincű, elágazó láncú szintetikus polipeptideket Sela és munkatársai alkalmaztak
először hordozóként [36]. Az oldalláncok N- vagy C- terminálisa egy optikailag aktív
aminosavat tartalmaz. Az oldallánc végén lévő aminosav jelentős hatással van a molekula
fiziko-kémiai, illetve biológiai tulajdonságaira.
A peptidkonjugátumok előállításához az MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoportban
kifejlesztett szintetikus polipeptidek alkalmasak hordozónak (általános képletük:
poli[Lys(Xi-DL-Alam)], (XAK), ahol i≅1, m≅2-4, és X: optikailag aktív aminosav). Ilyen polilizin
gerincű, elágazó láncú polipeptid a SAK és az EAK (7. ábra).
7. ábra: A SAK és EAK polipeptidek sematikus vázlata
A polilizin lánc kb. 100 lizinegységből épül fel, melyek ε-aminocsoportjaihoz átlagosan 3
DL-alaninból álló oligomer kapcsolódik. Az oldallánc N-terminálisához szerin illetve
glutaminsav van kötve. A kemotaktikus receptorok érzékenyek a ligandum szerkezeti
változásaira, megkülönböztetik a D-, L-aminosavakat [37]. Az EAK polipeptid amfoter
karakterű molekula, a SAK polikationos, vízoldékonysága nagy a hidroxil csoportot
tartalmazó szerin oldalláncok miatt. Hosszabb ideig stabilak a véráramban. Citotoxikus
aktivitásuk nincs vagy elenyésző [38].
Az MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoportban vizsgálták a makrofágok polimerfelvételét.
Összehasonlították a mintázatfelismerő scavenger receptoron keresztül a polilizin gerincű,
elágazó láncú molekulák sejtbejutását [28, 30].
16
Az 1970-es évek elején Najjar és munkatársai azonosítottak egy frakciót a
γ-globulinból (leukokinin), mely specifikusan kötődik a vér neutrofil granulocitáihoz, és
monocitáihoz. Ez a molekula egy tetrapeptid, a tuftsin, melynek szekvenciája embernél:
TKPR, kutyánál: TKPK. A szervezetben a tuftsint két enzim hasítja ki a
γ-globulinból [31]. A tuftsin befolyásolja a fagocitózist, a kemotaxist, magas koncentrációban
immunstimuláló, antimikrobális és daganatellenes hatása van. Ezek a tulajdonságok teszik a
tuftsint figyelemreméltó hordozó jelöltté a sejtspecifikus célbajuttatásnál [39]. Egyéb
természetes eredetű tuftsinanalóg tetrapeptidek (TRPR, TKPK, TRPK) is a tuftsinhoz
hasonló tulajdonságokkal rendelkeznek [31].
Az MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoportban a hordozóként alkalmazható szekvenciális
oligopeptidek egy új csoportját fejlesztették ki: az ismétlődő pentapeptid egységet tartalmazó
oligotuftsin származékokat: [TKPKG]n (n=2, 4, 6, 8). Ezek a vegyületek jól jellemezhetőek,
nem toxikusak, biodegradábilisak és tuftsinszerű biológiai tulajdonságokkal rendelkeznek
[34].
Hatékonyan használhatók hatóanyag hordozóként fertőzött makrofágok esetében – mint
a tuberkulózis vagy leishmaniasis – a liposzómához kapcsolt tuftsinszármazékok. A TKPR
antimikrobiális aktivitása jelentősen növekedett azáltal, hogy a C-terminálishoz zsírsav
származékot kapcsoltak etiléndiamin spaceren (távolságtartó egység) keresztül. A palmitoil
tuftsint tartalmazó liposzómák bejutnak a monocitákba, a makrofágokba és a
polimorfonukleáris (PMN) leukocitákba [40].
2.4.3. A hatóanyag – hordozó egység között kialakítható kémiai kötések típusainak
bemutatása
Az antituberkulotikum hatásának megőrzésében fontos a hatóanyag és a hordozó között
lévő kötés kémiai jellege. A hatóanyag tulajdonságai előnytelenül változhatnak, ha a
molekula nem funkcionálisan aktív, megfelelő kémiai szerkezettel szabadul fel. A
konjugációnál leggyakrabban amid, észter, éter, oxim, tioéter, hidrazon és hidrazin jellegű
kötéseket alkalmaznak (8. ábra).
Az amidkötés kialakítását általában a lépésenkénti szintézis során alkalmazzák, a
hordozó szabad aminocsoportja és a peptid aktivált karboxilcsoportja között jön létre. Ez a
reakció azonban csak védett peptidekkel kivitelezhető.
Diszulfidhídon keresztül való kapcsoláshoz nem-védett peptidszármazékok is
használhatók, de a konjugátumok stabilitása nem minden esetben megfelelő.
Tioéterkötés kialakításával kemoszelektív ligációra van lehetőség. Így kémiailag stabilabb
konjugátum állítható elő és a kapcsoláshoz nem kell védett peptideket alkalmazni. A
tioéterkötést tartalmazó konjugátumok szintézise során az epitóppeptidet ciszteinnel
17
hosszabbítjuk, és ezt a származékot oldatban reagáltatjuk a hordozón kialakított
haloacetilezett aminocsoporttal [34, 41]. A stratégia hátránya, hogy a cisztein tartalmú
peptidek diszulfidhíd kialakításával dimerizálódnak lúgos közegben. Ez a mellékreakció
különösen gyors abban az esetben, amikor a cisztein a peptid N-terminálisán van, és az
N-terminális szabad aminocsoportként van jelen. A gyors dimerizáció kiküszöbölhető az
N-terminális aminocsoport acetilezésével vagy a cisztein C-terminálisra kapcsolásával [42].
Hidrazon-, tiazolidin- és oximkötések kialakítása egy aldehidcsoport és egy gyenge bázis
tulajdonságú oldallánc között megy végbe, savas közegben. Ezek a gyenge bázisos
oldalláncok lehetnek aminooxicsoportok, hidrazincsoportok a peptid N-terminálisán [43]. Az
oximkötés létrejöttét gyorsítja a poláris aprotikus oldószerek (DMF, DMSO) használata. Az
oximkötés kialakítása során mellékreakciók is fellépnek. Az egyik ilyen reakció a többszörös
aceileződés [44, 45]. Megfelelő megoldás az etoxietilidén védőcsoport használata, mely
átmeneti oximkötést hoz létre (hasítás: 5% TFA 47,5% acetonitril, 47,5% víz, 1 óra) [46]. Az
aminooxiacetil csoport stabil oximot képezhet a laboratóriumban jelen lévő aldehidekkel és
ketonokkal, mint például az aceton, ezért ezen vegyületeket jelenlétét igyekeznünk kell
kiküszöbölni a reakció alatt [47].
8. ábra: A konjugálás során a hatóanyag és a hordozó molekula között kialakítható kötések
A konjugátumból a hatóanyag felszabadulhat hidrolízissel (pl. észter- és amidkötés),
enzimatikus degradációval vagy pH kontrollált reakcióval. Tam és munkatársai hidrazon-,
tiazolidin- és oximkötést tartalmazó peptid dendrimerek stabilitásának pH függését
vizsgálták. A tiazolidinkötésű vegyület stabil pH=3-9 oldatban; az oximkötésű származék
savas és semleges pH-n stabil; a hidrazonkötésű konjugátum savas (pH=3) és lúgos (pH=9)
oldatban disszociálódik [43, 48].
oxim tioéter diszulfidhídamid
hidrazontiazolidin hidrazin
-CH=N-O--NH-CO- -CH2-S-CH2- -CH2-S-S-CH2-
-NH-N=CH- -NH-NH-CH2-
NH
S
18
Zeng és munkatársai két epitóppeptidet kapcsoltak össze különböző kötésekkel, hogy
tanulmányozzák a kötések befolyását a biológiai aktivitásra. A tioéterkötés nem változtatott a
peptidek funkcionális aktivitásán, az oximkötés enyhén, a diszulfidhíd jelentősen
csökkentette a funkcionális aktivitást [41].
2.4.4. A spacerek (távolságtartó egységek) szerepe a hatóanyag molekulák
hordozóhoz történő kapcsolása során
A hatóanyag és a polimerhordozó összekötéséhez a peptidek alkalmasnak bizonyultak.
Különböző enzimekkel (pl. kimotripszin, tripszin, papain, katepszin B) végeztek
tanulmányokat, annak érdekében, hogy kiderítsék, milyen peptidek a legmegfelelőbbek erre
a célra. A lizoszomális enzimek között nagy számban találunk proteázokat. A hatóanyag és a
hordozó közé épített peptid spacerek degradálhatóak lizoszomális enzimekkel. Az elhasított
kötés rendszerint a hatóanyag és a szomszédos aminosav között van. A lizoszomális
hidrolízis hatásfokát a spacert alkotó aminosavak minősége, száma, valamint szerkezeti
tényezők befolyásolják [19].
Irodalmi adatok alapján (elsősorban a proteolitikus enzimek peptidekkel alkotott
komplexének szerkezetéről írt tanulmányok szerint) spacerként alkalmazhatóak az alábbi
peptidek, amelyekben az alkotó aminosavakat egybetűs kódokkal jelöltem: GG, GFG, GFF,
GLG, GVA, GFA, GLF, GLA, AVA, GFLG, GFFL, GLLG, GFYA, GFGF, AGVF, GFFG,
GFLGF, GGFLGF [19].
Funkcionális vizsgálatokat folytattak különböző polimer hordozók, hatóanyagok és
spacerek kombinációira. A GFLG szekvenciájú peptid spacer több kísérlet eredménye
alapján is megfelelőnek bizonyult [19, 35].
2.4.4.1. A GFLG szekvencia spacer peptidként (távolságtartó egység) való
alkalmazása
A hatóanyagot peptid spaceren keresztül kapcsolhatjuk a hordozóhoz. A spacer
konjugálása a hordozóhoz többféleképpen történhet. A ciszteinnel hosszabbított spacer
konjugálását a tiolcsoporton keresztül szelektíven végre lehet hajtani. A diszulfidkötést
tartalmazó konjugátumok biológiai rendszerekben való stabilitása sokat vitatott, előnyösebb
a tioéterkötés kialakításán keresztül való kapcsolás. A tioéterkötés előnye, hogy nem igényel
védett peptidet, kémiailag és biológiailag stabilabb kötést biztosít, nem antigén karakterű. A
tioéterkötés kialakítása történhet a ciszteinnel hosszabbított konjugálandó peptid
tiolcsoportja és a hordozó molekulán kialakított klóracetilezett aminocsoport között [34] (9.
ábra).
19
PEPTID-NH-CH-CONH2
CH2
SH
+ Cl-CH2-CO-NH-HORDOZÓ
PEPTID-NH-CH-CONH2
CH2
S-CH2-CO-NH-HORDOZÓ
-HCl
9. ábra: Tioéterkötés kialakítása klóracetilezett hordozó és cisztein tartalmú peptid között
Az MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoportban a Herpes simplex vírus glikoproteinjének
peptidepitópjait, Alzheimer-kór specifikus β-amiloid peptidet, és tumorellenes aktivitású
GnRH-III peptidet ciszteinnel hosszabbítottak és közvetlenül, vagy spacer közbeékelésével
klóracetilezett tetratuftsin származékhoz kapcsoltak tioéterkötésen keresztül. A konjugálás
eredményességét növelte a spacer, a GFLG vagy oligoglicin szekvenciájú peptidek
alkalmazása. Tanulmányozták a spacer régiónak a peptid dimerekhez vezető diszulfidhidak
kialakulásában betöltött szerepét. A spacer szekvencia beépítésével csökkenthető a
diszulfidhíd képződés valószínűsége, mert a spacer beépítése növelheti a konjugálási
reakció sebességét, így csökkentheti a melléktermékként keletkező dimerek mennyiségét. A
cisztein helyzete jelentősen befolyásolja a konjugálási reakciót és az intermolekuláris
diszulfid dimerek létrejöttét [34].
A Kutatócsoportban előállítottak GFLG spacerrel módosított tetratuftsin származékot (Ac-
[TKPK(ClAc-GFLG)G]4-NH2). A peptid szintézise során a lizin oldallánc védőcsoportok
különbözőek voltak, a szelektív kapcsolás miatt. A 2-es pozíciójú lizin ε-aminocsoportján
2-klórbenziloxikarbonil (ClZ), a 4-es pozíción 9-fluorenilmetiloxikarbonil (Fmoc)
védőcsoportot alkalmaztak. Az Fmoc-csoport szelektív hasítását követően a GFLG spacert a
4-es pozíciójú lizin oldalláncán építették be. A GFLG szakasz N-terminálisát klóracetilezték,
a ciszteinnel hosszabbított epitóppeptiddel kialakították a tioéterkötést [34].
20
2.4.5. Antituberkulotikum – hordozó konjugátumok áttekintése
Az irodalomban találunk példát antituberkulotikum hordozóhoz konjugálásáról: a PAS
molekulát konjugálták maleilezett marha szérum albuminhoz (MBSA). A makrofágokon
található MBSA kötőhelyek, sejtfelszíni receptorok segítségével a konjugátum hatékonyan
bejutott a sejtekbe. A lizoszómában hidrolízis útján felszabadult a hatóanyag aktív formája. A
kísérleteket egérből származó fertőzött peritoneális makrofágokon végezték. A vizsgálatok
alapján a konjugátum százszor hatékonyabban pusztította el az intracelluláris M.
tuberculosis baktériumokat, mint a szabad PAS. Tehát a konjugátum alkalmazásával a
hatékonyság eléréséhez nem szükséges akkora mennyiség, mint a szabad PAS esetén.
Hasonló eredményeket értek el acetilezett lipoproteinek hordozóként való alkalmazásával is
[49].
A RAMP antituberkulotikum alkalmazása során tuftsinnal konjugált, foszfatidilkolinból álló
liposzóma belsejébe juttatták be a hatóanyagot, és így meghosszabbodott terápiás hatást
értek el [40].
Az MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoportban INH antituberkulotikumot tartalmazó
peptidkonjugátumokat terveztek, és ezek biológiai aktivitását vizsgálták. Hordozóként
tuftsinszármazékokat (GTKPKG (T6), és [TKPKG]4 (OT20)) [42] és az M. tuberculosis
immundomináns 16 kDa fehérjének egy T-sejt epitóppeptidjét (91SEFAYGSFVRTVSLPV106)
választották [50, 51]. Az INH hordozóhoz konjugálása során kétféle szintézis módszert
alkalmaztak. A munka célja a kémiai kötés funkcionális aktivitásra kifejtett hatásának
vizsgálata volt. Egyik esetben az epitóppeptidet szerinnel hosszabbították, majd szelektíven
oxidálták NaIO4-tal. Az INH-t közvetlenül a peptidhez kapcsolták hidrazonkötés kialakításával
(10. ábra). A másik esetben az INH-t glioxilsavval módosították, a keletkezett
izonikotinoilhidrazono-ecetsavat NaBH3CN-del redukálták izonikotinoilhidrazino-ecetsavvá.
Az aktivált (DIC/HOBt) izonikotinoilhidrazino-ecetsav reagált a még gyantán lévő peptid
aminocsoportjával, amidkötés létrejötte során (11. ábra). Ezen vegyületek segítségével
tanulmányozták a kémiai átalakítások hatását az INH in vitro antituberkulotikus aktivitására.
Mindegyik konjugátum hatásosnak bizonyult a M. tuberculosis H37Rv tenyészeten [50].
21
10. ábra: Izoniazid konjugálása peptidaldehidhez hidrazonkötés kialakításával
11. ábra: Izoniazid-peptid konjugátum kialakítása szilárdfázison hidrazidkötés létrejöttével
2.5. Új, lehetséges antituberkulotikumok meghatározása in silico módszerek
alkalmazásával
A rezisztens és multirezisztens törzsek terjedése miatt egyre nagyobb szükség van új
típusú antibiotikumokra. Új hatóanyagok keresése történhet ún. in silico módszerek
segítségével. A baktérium anyagcseréjében kis molekulatömegű vegyületek létfontosságú
enzimekhez való kötődését (és ezen keresztül közvetve ezen enzimek gátlását)
dokkolóalgoritmusok alkalmazásával lehet jósolni. Az in silico módszer lényege, hogy ismert
háromdimenziós (NMR, vagy röntgenkrisztallográfia) szerkezettel rendelkező fehérjékhez
dokkolják egy több millió molekulából álló vegyülettár elemeit. A kísérletekben használt
NH2-CH-CO-PEPTID
CH2OHNaIO4
pH 8,2O=CH-CO-PEPTID
N
CO-NH-NH2
Ser-PEPTID izoniazid
pH 4,6
N
CO-NH-N=CH-CO-PEPTID
hidrazon
N
CO-NH-NH2
O=CH-COOH
N
CO-NH-N=CH-COOH
N
CO-NH-NH-CH2-COOH
izoniazid izonikotinoi lhidrazono-ecetsav
izonikotinoilhidrazino-ecetsav
glioxilsav
NaBH3CN
DICHOBt
NH2-PEPTID-
N
CO-NH-NH-CH2-CO-NH-PEPTID-
hidrazid
22
molekulatár a nyilvános Zinc adatbázis (Zinc – a free database for virtual screening,
http://zinc.docking.org/) [52, 53]. A M. tuberculosis túléléséhez fontos enzimekhez kötődő
vegyületeket egy újonnan kifejlesztett dokkolási algoritmus segítségével az ELTE
Számítógéptudományi Tanszékén Dr. Grolmusz Vince kutatócsoportjában határozták meg. A
ligandumok dokkolása a DUTPáz enzimhez történt, mely a baktérium anyagcseréjében
kulcsfontosságú szerepet játszik [54]. Az így talált molekulák in vitro antibakteriális hatása
meghatározható. Az in vitro antibakteriális hatást mutató vegyületek hatékonysága ezután
szintetikus optimalizálási lépések sorozatával javítható, így az eredeti kiindulási vegyületek
lehetséges gyógyszer jelölt molekulákká alakíthatók.
23
3. CÉLKITŰZÉS
A dolgozatban összefoglalt munka célja a fertőzött makrofágokba való szelektív
célbajuttatásra alkalmas hatóanyag – hordozó konjugátumok előállítása és
funkcionális vizsgálata volt:
• peptid típusú távolságtartó egység és hordozómolekulák előállítása szilárdfázisú
peptidszintézissel, a vegyületek kémiai jellemzése;
• új in silico meghatározott és in vitro antituberkulotikus hatású vegyületek
származékainak oligo-, illetve polipeptid típusú hordozómolekulákhoz kapcsolása,
a konjugátumok kémiai jellemzése;
• a hatóanyag-hordozó konjugátumok in vitro antituberkulotikus hatásának
vizsgálata M. tuberculosis H37Rv tenyészetén;
• fluoreszcensen jelölt konjugátumok előállítása és kémiai jellemzése;
• fluoreszcens származékok in vitro sejtbejutásának vizsgálata áramlási
citométerrel.
24
4. A KÍSÉRLETI MÓDSZEREK ELMÉLETI ALAPJAINAK ÁTTEKINTÉSE
Ebben a fejezetben foglaltam össze röviden az általam alkalmazott módszerek elméleti
hátterét. A kísérleti munkám leírásai, illetve a műszeres mérések körülményei az 5.
fejezetben olvashatók.
4.1. Szilárdfázisú peptidszintézis
A szintetikus munka során a peptideket szilárdfázisú peptidszintézissel állítottam elő. A
szilárdfázisú szintézis lényege, hogy az első aminosavat hozzákapcsoljuk egy szilárd
hordozóhoz, majd újabb aminosavat kapcsolunk az előzőhöz, és az egyenkénti kapcsolást a
kívánt lánchossz eléréséig folytatjuk. A szintézis C-terminális – N-terminális irányban halad,
mert így kisebb az epimerizáció előfordulásának valószínűsége. A szintézis során olyan
aminosavszármazékokat használunk, melyek nukleofil oldalláncaikon állandó
védőcsoportokkal, az α-NH2 csoportjaikon pedig átmeneti védőcsoportokkal vannak ellátva.
Egy aminosav kapcsolása előtt az előző aminosavszármazékról az átmeneti Nα-
védőcsoportot eltávolítjuk és a kapcsolni kívánt aminosavszármazék karboxil-terminálisát
aktiváljuk. A kész peptidet lehasítjuk a hordozóról, és ezzel egy időben távolítjuk el az
állandó oldallánc védőcsoportokat is. A szilárdfázisú módszer nagy előnye, hogy az
aminosavakat és egyéb reagenseket a reakció végén egyszerű szűréssel el lehet távolítani.
A lehasított peptid oldatát szintén szűréssel lehet megkapni. Az oldatból a peptid
hosszadalmas tisztítási lépések mellőzésével, viszonylag tisztán különíthető el. A
szilárdfázisú peptidszintézisnek két, széles körben elterjedt stratégiája van, a
terc-butiloxikarbonil/benzil (Boc/Bzl) módszer és a 9-fluorenilmetiloxikarbonil/terc-butil
(Fmoc/tBu) módszer.
4.1.1. A Boc/Bzl módszer
A Boc/Bzl módszer a különböző erősségű savakra érzékeny (átmeneti) és kevésbé
érzékeny (állandó) védőcsoportokon alapul. A terc-butiloxikarbonil (Boc) védőcsoport
lúgokkal és nukleofil reagensekkel szemben stabil, de szervetlen vagy szerves savakkal
eltávolítható [55]. Hasítóelegyként 33% trifluorecetsav (TFA) / 67% DCM V/V elegyet
alkalmazunk. Mivel az acidolízis során az Nα-aminocsoport trifluoracetát sója jön létre, ezért
a hasítás után semlegesítenünk kell. Ekkor tercier-amin hatására jön létre a szabad Nα-
aminocsoport. Semlegesítő elegyként a 10% diizopropiletilamin (DIEA) / 90% DCM V/V
elegyét használjuk. A Boc/Bzl módszernél az oldallánc védőcsoportok a benzil-alkohol éter-,
25
észter- ill. uretán- származékai [56]. Ezek az oldallánc védőcsoportok csak erős savak
jelenlétében hasíthatóak, tehát a Boc-csoport lehasítása során stabilak maradnak. A szilárd
hordozóról a peptidet és az oldallánc védőcsoportokat hidrogén-fluorid (HF) segítségével
távolítottuk el, teflon készülékben, gyökfogók jelenlétében.
4.1.2. Az Fmoc/tBu módszer
Az Fmoc/tBu szintézis stratégia kiküszöböli a Boc/Bzl stratégia hátrányait: 1. az állandó
és átmeneti védőcsoportok is savérzékenyek, 2. a speciális készüléket igénylő HF
alkalmazása [57]. Ezen módszer esetében az aminosavszármazékok átmeneti
védőcsoportja a 9-fluorenilmetiloxikarbonil-csoport (Fmoc), mely savakkal szemben stabil,
bázisokkal szemben viszont labilis. A hasítást 2% piperidin / 2% DBU / 96% DMF V/V
hasítóelegyével végezzük. A hasítás során dibenzofulvén átmeneti termék keletkezik, mely
reaktív, de a piperidinnel stabil adduktot képez, ezáltal elkerülhetőek az alkileződési
mellékreakciók. Bizonyos peptidszekvenciák esetében a kísérletek azt igazolták, hogy a 2%
piperidint és 2% 1,8-diazabiciklo[5.4.0]-undek-7-ént (DBU) tartalmazó eleggyel gyors,
hatékony hasítás érhető el, ezen kívül csökkenthető az enantiomerizáció valószínűsége és
nagyobb az effektív hasítás mértéke térbeli gátlás esetén [58-60]. Az állandó oldallánc
védőcsoportok (tBu, OtBu, Boc, Trt, stb.) hasítása és a peptidek gyantáról való eltávolítása
általában TFA-val történik [56]. Mivel a hasítás során reaktív karbokationok keletkeznek,
gyökfogók használata szükséges.
4.1.3 A peptidkötés kialakítása a szintézis során
A peptidkötést a gyantához kötött szabad N-terminálisú aminosav vagy peptid és a
karboxilcsoportján aktivált és aminocsoportján védett aminosavszármazék között alakítjuk ki.
A kapcsolás in situ aktív észter kialakításával történik. A használt kapcsolószerek a DIC és a
HOBt. A DIC O-acil-izourea származékot képez az aminosavszármazék karboxilcsoportjával
és ez acilezi a szabad aminocsoportot HOBt jelenléte nélkül, N,N’-diizopropil-urea
képződése mellett. A karbodiimidek felhasználhatók aktív észterek kialakításhoz is,
amelyeket in situ a reakcióelegyben 1-hidroxibenzotriazol (HOBt) segítségével alakítanak ki.
Ezáltal gyors kapcsolás érhető el és az aszparagin és glutamin esetében a dehidratáció
megelőzhető [61, 62].
26
4.1.4. A kapcsolási reakciók követése
A kapcsolás és védőcsoport eltávolítás végbemenetelét Kaiser (ninhidrin)-próba és
izatin-próba segítségével ellenőrizzük [63]. Kaiser-próba a szabad amino-terminálissal
rendelkező (primer aminocsoport) aminosav- és peptidszármazékok kimutatására alkalmas.
A keletkező vegyület sötét ibolya színű (abszorpciós λmax = 570 nm) primer aminocsoportot
tartalmazó α-aminosavak esetén (12. ábra). A szekunder aminocsoportot tartalmazó prolin
esetében a keletkező vegyület sárga színű (abszorpciós λmax = 440 nm), ezért a szilárdfázisú
peptidszintézisnél alkalmazott gyanták szintén sárga színe miatt nem érzékelhető. Az izatin-
próba a szabad iminocsoportok jelenlétét jelzi [64], ezt alkalmazzuk a prolin N-terminálisának
védőcsoport eltávolításának ellenőrzésére, valamint a prolin utáni aminosav kapcsolás
sikerességének ellenőrzésére.
O
O
2
OH
OH
OH
O
N
O
O
+
-RCHO
CHH2N
R
COOH
-CO2
-3 H2O
12. ábra: A ninhidrin a primer aminocsoportot tartalmazó α-aminosavakkal a fenti reakcióba
lép, a keletkező vegyület sötét ibolya színű
4.2. Szintetikus peptidekben a cisztein oxidációs állapotának meghatározása
Sok esetben a konjugátumokban a hordozót és a spacerpeptidet, vagy a hatóanyag
származékot tioéterkötésen keresztül kapcsoljuk egymáshoz. A tioéterkötés kialakítását a
cisztein tiolcsoportja és egy haloacetilezett csoport között végezzük. A szintetikus peptidek
cisztein tartalmának meghatározására a klasszikus aminosavanalízis módszere nem mindig
alkalmas, mert a cisztein a hidrolízis során cisztinné oxidálódhat. A megfelelő
jellemezhetőség érdekében pontosan ismernünk kell az adott vegyületben a cisztein
oxidációs állapotát. Az oxidáció a szintézis vagy a peptid tárolása során is bekövetkezhet,
így nem lehet megállapítani, hogy az oxidáció az analízis előtt vagy után történt. További
probléma a cisztein meghatározásánál az ioncserélő kromatográfiás elválasztást követő
ninhidrines származékképzés alapú módszer esetén, hogy a cisztein és a prolin retenciós
ideje közel azonos. Ezen problémák miatt szükséges egy módszer a szintetikus cisztein
tartalmú peptidek szabad tiolcsoportjának mérésére. Erre a célra megfelelőnek bizonyult a
szabad tiolcsoport és az N-etilmaleimid (NEM) reakciója (13. ábra). A reakció rövid idő alatt,
27
semleges vagy enyhén bázisos közegben végbemegy. A peptidet N-etilmaleimiddel
reagáltatva stabil S-(N-etilszukcinimido)-származék keletkezik, mely molekula RP-HPLC
körülmények között elválasztható a kiindulási peptidtől, és tömegspektrométerrel
azonosítható. A kvantitatív meghatározáshoz kevesebb, mint 0,1 µM peptid elegendő [65].
13. ábra: N-etilmaleimid reakciója ciszteintartalmú peptiddel
4.3. Minimális gátló koncentráció és telepszám meghatározása
Az antibiotikumok hatásának kvantitatív jellemzésére a minimális gátló koncentráció
(minimal inhibitory concentration, MIC) meghatározása szolgál. A MIC az a legkisebb
hatóanyag mennyiség, amely 1ml térfogatban gátolja a baktériumtörzs szaporodását.
Mértékegysége µg/ml, mg/l. A MIC érték meghatározását folyékony táptalajban ún. hígításos
leves módszerrel végezzük, ahol az adott antibiotikumra nézve csökkenő koncentrációjú
csöveket befertőzzük a baktérium megfelelő sűrűségű szuszpenziójával [2]. A minimális
gátló szintet annak a csőnek a vegyület koncentrációja jelenti, amelyben a kellő időtartamú
inkubálás után szabad szemmel még nem észleltünk növekedést. A minimális gátló
koncentráció értéke függ az alkalmazott táptalajtól, a táptalaj pH értékétől, az inokulum (az
oltáshoz felhasznált mikróba-sejttömeg) kolónia számától, az inkubáció hőmérsékletétől,
atmoszférájától és időtartamától. A baktériumok esetében ez a jelenség a mikroszervezetek
gyors adaptív tulajdonságával magyarázható, nem örökletes, modifikatív sajátság.
A MIC leolvasást követően a baktériumnövekedést nem mutató csövekből szilárd
táptalajra való kioltással meghatározható a telepszám (colony forming unit, CFU). A
telepszámlálásos módszerek alkalmazhatóságának alapfeltétele, hogy a táptalajokon kinőtt
telepek egyetlen sejt szaporodásából származzanak, és a telepek számolhatók legyenek,
vagyis a cél olyan lemeztenyészetek előállítása, amelyen az egyedülálló telepek száma 10-
300 közötti. A CFU/ml érték megadja, az adott minta esetében, az egységnyi térfogatban
jelenlévő életképes sejtek közelítő számát, amelyekből a számolható telepek kifejlődtek. A
módszer lényegét a 14. ábra foglalja össze.
+ N
O
O
Et
pH 7,0
N-etilmaleimid
N
O
O
Et
S
S-(N-et ilszukcinimido)-származékcisztein oldallánc
-NHCHCO-
H2C
SH
-NHCHCO-
H2CPBS
28
14. ábra: Minimális gátló koncentráció (MIC) és telepszám (CFU) meghatározásának
sematikus vázlata
29
4.4. Az áramlási citometria
Az áramlási citometria [66] alkalmazásával egyszerre mérhető önálló részecskék és
sejtek fényszórási és fluoreszcens tulajdonsága. A mérhető sejtek vagy részecskék átmérője
körülbelül 0,2 µm és 150 µm közé esik. Az áramlási citométer vázlatos felépítését mutatja be
a 15. ábra.
15. ábra: Egy áramlási citométer vázlatos felépítése, forrás: http://probes.invitrogen.com
Az áramlási citométer több lézert is tartalmazhat. Ezek lehetnek szilárdtest lézerek (355
nm, 405 nm, 488 nm) és gázlézerek (633 nm). A készülékben folyadékáram továbbítja a
sejteket. A hidrodinamikai fókuszálás biztosítja, hogy a sejtek vékony sugárban, egymás
után haladjanak és a lézersugár egyenként világítsa meg őket. A sejtek a lézersugár elé
kerülve kölcsönhatásba lépnek azzal, a lézersugár fénye részben szóródik, részben a sejtek
előre megfestett molekuláiból fénykibocsátást vált ki (16. ábra). Az ún. előre irányuló
fényszórás (forward scatter, FSC) a sejt relatív méretéről, míg az oldalra irányuló fényszórás
(side scatter, SSC) a relatív granuláltságáról, belső komplexitásáról ad információt. A
fluoreszcencia intenzitásból fluoreszcens anyagok, vagy fluoreszcens jelzéssel ellátott
vegyületek sejtbejutásáról kapunk információt. A sejtekben jelen vannak fluoreszcens
sajátságú molekulák (aminosavak, porfinvázas vegyületek, nukleinsavak, klorofill stb.), ezek
lézer
folyadékrendszer
optikai rendszer
detektorok
elektronika
30
adják a sejtek autofluoreszcenciáját, melyet az áramlási citométerrel detektálni lehet. A
legtöbb esetben a részecskéket és a sejteket ún. fluoreszcens festéssel teszik „láthatóvá” a
citométer számára. A megfelelő fluoreszcens festék (fluorofór) kiválasztása függ az
alkalmazott megvilágítás hullámhosszától, a fluorofórok abszorpciós és emissziós
tulajdonságától.
A sejtek és a lézerfény kölcsönhatása következtében emittálódó fényt az optikai rendszer
segítségével továbbítják a megfelelő detektorok felé.
A sejtek autofluoreszcenciájához viszonyítva a fluoreszcensen jelölt peptidszármazékok
felvételének mértéke detektálható. Fluoreszcens jelölésre sokféle fluorofór használatos. A
leggyakrabban használt az 5(6)-karboxifluoreszcein, a karboxirodamin, és ezek izotiocianát
és szukcinimidil-észter származékai. Elterjedtek még pl. danzilklorid, fluoreszkamin,
o-ftálaldehid, 9-fluorenilmetiloxikarbonil (Fmoc), kumarinszármazékok, nitrobenzofurán
származékok [67-70].
16. ábra: Egy sejt kölcsönhatása a lézersugárral, forrás: http://probes.invitrogen.com
előre irányuló szórás oldalirányú szórás fluoreszcencia
31
5. A KÍSÉRLETI MUNKA
5.1. A peptidek és peptidszármazékok szintézise
A következő szekvenciájú peptidamidokat állítottam elő manuális szilárdfázisú
szintézissel: H-GFLGC-NH2, és H-[TKPKG]2C-NH2. A H-GFLGC-NH2 peptidet Boc/Bzl stratégia,
a H-[TKPKG]2C-NH2 peptidet Fmoc/tBu stratégia alkalmazásával szintetizáltam.
5.1.1. A H-GFLGC-NH2 peptidamid és származékainak szintézise Boc/Bzl
stratégiával
A szintézishez 4-metilbenzhidrilamin (MBHA, kapacitása: 1,2 mmol/g) gyantát
használtam, az aminosavakat Nα-Boc-származék formájában kapcsoltam. A felhasznált Boc-
aminosavak közül csak a cisztein oldalláncán volt védőcsoport: 4-metilbenzil-védőcsoport (4-
MeBzl).
Az MBHA gyanta hidroklorid formában kerül kereskedelmi forgalomba, ezért a gyantát a
DCM-ben történő duzzasztás után 33% TFA / 67% DCM V/V hasítóelegyével kezeltem 5 +
30 percig, majd a DCM-mel való ötszöri mosást követően 10% DIEA / 90% DCM V/V
elegyével 5 x 1 percig semlegesítettem, ezután újból mostam ötször DCM-mel. A gyantához
az előkezelés után kapcsoltam az első Boc-aminosav származékot, a Boc-Cys(4-MeBzl)-
OH-t. A gyantakapacitásra számolva háromszoros moláris feleslegben adtam az
aminosavszármazékot, és az in situ aktív észter kialakításához szükséges kapcsolószereket
(DIC, HOBt) DCM-ben oldva. Az egy órás kapcsolási idő lejárta után DCM-es mosási lépés
következett. Ezután Kaiser-próbával ellenőriztem a kapcsolás sikerességét. Pozitív Kaiser-
próba esetén a kapcsolást meg kell ismételni. A Boc-védőcsoportot minden esetben a
gyanta előkezelésénél leírt hasítóeleggyel (33% TFA / 67% DCM V/V) távolítottam el, majd a
DCM-mel való mosást követően semlegesítettem 10% DIEA / 90% DCM V/V eleggyel. A
szintézis egy ciklusának menetét a 2. táblázat foglalja össze.
32
Művelet Reagens, oldószer Időtartam (perc)
Boc-védőcsoport
eltávolítása 2 x 2-4 ml hasítóelegy (33% TFA / 67% DCM V/V) 5 + 30
gyanta mosása 5 x 2-5 ml DCM 5 x 1
semlegesítés 5 x 2-5 ml elegy (10% DIEA / 90% DCM V/V) 5 x 1
gyanta mosása 5 x 2-5 ml DCM 5 x 1
kapcsolás
3 ekvivalens (gyanta kapacitásra számított)
Boc-aminosav / DCM ekvimoláris HOBt / DCM
ekvimoláris DIC / DCM
60
gyanta mosása 5 x 2-5 ml DCM 5 x 1
kapcsolási
reakció követése Kaiser (ninhidrin)-próba 5
2. táblázat: A Boc/Bzl stratégia szerint végzett szilárdfázisú peptidszintézis
egy ciklusának menete
A gyantán lévő peptid egy részére aminooxiecetsavat kapcsoltam. Lehasítottam az N-
terminális Boc-védőcsoportját, DCM-es mosás, semlegesítés, majd újabb mosás után 3
ekvivalens Boc-aminooxiecetsavat, HOBt-t, PyBOP-ot és 6 ekvivalens DIEA-t adtam NMP-
ben oldva. A kapcsolási reakció ideje 1 óra volt. A peptidhez kapcsolt aminooxiacetil
csoportról eltávolítottam a Boc-védőcsoportot a TFA tartalmú hasítóeleggyel.
A kapcsolás és védőcsoport eltávolítás végbemenetelét Kaiser-próba segítségével
ellenőriztem. A Kaiser-próbához szükséges oldatok összetétele: 1. ninhidrin / etanol 10:1
(m/V), 2. fenol / etanol 4:1 (m/V), 3. piridin / víz 98:2 (V/V) 4 µmol/liter KCN-dal. Egy kisebb
kémcsőbe kevés gyantaszemet rakunk és erre a 3 reagensből 1.-3. sorrendben 2-2 cseppet
adunk, majd a kémcsövet 105°C-on tartjuk 5 percig.
A szilárd hordozóról a peptidet, az aminooxiacetil-peptidet, és a peptidek oldallánc
védőcsoportjait hidrogén-fluorid (HF) segítségével távolítottam el. A hasítást teflon
készülékben végeztem, 0°C-on 1,5 óráig, gyökfogók (p-krezol, 1,4-DL-ditiotreitol)
jelenlétében. 0,5-1,0 g peptidre átlagosan 10 ml HF-ot számolva 0,5 g p-krezolra és 0,1 g
1,4-DL-ditiotreitolra volt szükség. Hasítás után a HF-ot a gyanta – peptid elegyről
ledesztilláltam, majd a hasítási terméket kicsaptam hideg éterrel, ezután szűrtem. A szűrés
után kevés A eluens (0,1% TFA / víz V/V) segítségével kioldottam a peptidet a szűrőn a
gyantaszemek közül. Az oldatot lefagyasztottam, majd liofilizáltam. Az amniooxiacetil-
peptidek szintézise és feldolgozása során mindvégig kerültem az aceton és egyéb ketonok,
aldehidek használatát.
33
5.1.2. A H-[TKPKG]2C-NH2 peptidamid és származékainak szintézise Fmoc/tBu
stratégiával
A szintézishez Rink Amide MBHA gyantát használtam, az aminosavakat Nα-Fmoc-
származék formájában kapcsoltam. A felhasznált Fmoc-aminosavak oldalláncai a 3.
táblázatban felsorolt védőcsoportokat tartalmazták.
aminosav funkciós csoport védőcsoport rövidítés
Lys amino terc-butiloxikarbonil Boc
Thr hidroxil terc-butil tBu
Cys tiol tritil Trt
Gly, Pro oldallánc védőcsoport nélkül
3. táblázat: Az Fmoc/tBu stratégia szerint végzett szintézishez használt Fmoc-
aminosavszármazékok oldallánc védőcsoportjai
A Rink Amide MBHA gyanta (kapacitása: 0,65 mmol/g) Fmoc-védőcsoporttal ellátva kerül
kereskedelmi forgalomba. Az Fmoc-védőcsoport eltávolítása érdekében a gyantát a DMF-
ben történő duzzasztás után 2% piperidin / 2% DBU / 96% DMF V/V hasítóelegyével
kezeltem 2 + 2 + 5 + 10 percig, majd DMF-fel ötször mostam. Az Fmoc/tBu stratégiánál nem
kell semlegesítési lépést alkalmazni. A gyantához az előkezelés után kapcsoltam az első
Fmoc-aminosav származékot, az Fmoc-Cys(Trt)-OH-t. A gyantakapacitásra számolva
háromszoros moláris feleslegben adtam az aminosavszármazékot, és az in situ aktív észter
kialakításához szükséges kapcsolószereket (DIC, HOBt) NMP-ben oldva. Az egy órás
kapcsolási idő lejárta után DMF-es mosási lépés következett. Ezután Kaiser-próbával
ellenőriztem a kapcsolás sikerességét. Pozitív Kaiser-próba esetén a kapcsolást meg kell
ismételni. A prolinhoz való kapcsolás ellenőrzéséhez az izatin-próbát alkalmaztam, mely
hasonló a Kaiser-próbához, de itt még van egy 4. reagens, melynek összetétele 3% izatin,
5% Boc-Phe-OH / benzilalkohol volt, melyet a Kaiser-próba reagnesei előtt csepegtettünk a
gyantaszemekhez.
Az Fmoc-védőcsoportot minden esetben a gyanta előkezelésénél leírt hasítóeleggyel (2%
piperidin / 2% DBU / 96% DMF V/V) távolítottam el, majd DMF-fel mostam. A szintézis egy
ciklusának menetét a 4. táblázat foglalja össze.
34
Művelet Reagens, oldószer Időtartam (perc)
Fmoc-
védőcsoport
eltávolítása
4 x 2-4 ml hasítóelegy (2% piperidin / 2% DBU /
96% DMF V/V) 2 + 2+ 5 + 10
gyanta mosása 5 x 2-5 ml DMF 5 x 1
kapcsolás
3 ekvivalens (gyanta kapacitásra számított)
Fmoc-aminosav / ekvimoláris HOBt / NMP
ekvimoláris DIC / NMP
60
gyanta mosása 5 x 2-5 ml DMF 5 x 1
kapcsolási
reakció követése Kaiser (ninhidrin)-, izatin-próba 5
4. táblázat: Az Fmoc/tBu stratégia szerint végzett szilárdfázisú peptidszintézis egy
ciklusának menete
A gyantán lévő peptidre Boc-aminooxiecetsavat kapcsoltam. Lehasítottam az
N-terminális Fmoc-védőcsoportját, DMF-es mosás után 3 ekvivalens Boc-aminooxiecetsavat,
HOBt-t és DIC-et adtam NMP-ben oldva. A kapcsolási reakció ideje 1 óra volt.
Az Fmoc/tBu módszernél az oldallánc védőcsoportokat, az N-terminális Boc-
védőcsoportot és a peptidet a gyantáról TFA-val távolítottam el. A hasítás során keletkező
reaktív karbokationok miatt 2,5% vizet, 2,5% TIS-t tartalmazó TFA elegyet használtam.
5.1.3. Az in silico meghatározott hatóanyag jelöltek származékainak (vegyület 102
és 103) konjugálása
A gyakorlati munkám során két, in silico meghatározott vegyület származékát kapcsoltam
peptidszármazékokhoz. A ligandumok szerkezetét nem mutatom be a dolgozatomban. A
vizsgált hatóanyag jelöltek (kódjuk: 102 és 103) in vitro antituberkulotikus hatással
rendelkeznek M. tuberculosis H37Rv törzsön. Mindkét hatóanyag jelölt heteroaromás
vegyület, és tartalmaznak aldehidcsoportot, melyeken keresztül oximkötéssel valósítható
meg a konjugálás.
A gyantáról lehasított, RP-HPLC segítségével megtisztított aminooxiacetil-GFLGC-NH2
(továbbiakban: Aoa-GFLGC-NH2) peptidszármazékhoz a 102-es kódú vegyületet kapcsoltam.
A kapcsolás oximkötés kialakításával történt. 10,4 mg Aoa-GFLGC-NH2-t feloldottam 1 ml
piridin / metanol / víz 1:4:1 V/V elegyében, majd 2 ekvivalens 102-es anyagot adtam hozzá.
A reakcióelegyet 24 órán át kevertettem. Az oldatból óránként mintát vettem, hogy a reakció
előrehaladását vizsgálhassam analitikai RP-HPLC segítségével.
35
A 103-as vegyületet az aminooxiacetil-[TKPKG]2C-NH2-hez (továbbiakban: Aoa-OT10-
Cys) kapcsoltam szintén oximkötésen keresztül. 45 mg Aoa-OT10-Cys-t feloldottam 0,5 ml
nátrium-acetát oldatban (pH=5,08). 3 ekvivalens 103-as anyagot feloldottam 0,5 ml DMF-
ben, majd az oldatokat összeöntöttem, a reakcióelegy oldószeraránya NaOAc / DMF 1:1
V/V. Az oldatból óránként mintát vettem és analitikai RP-HPLC-vel vizsgáltam a reakció
előrehaladását.
5.2. A hordozóban a cisztein oxidációs állapotának ellenőrzése a konjugálási
reakciót megelőzően
A megtisztított 103-Aoa-OT10-Cys-ből PBS pufferrel (pH=7,04) 1 mg/ml-es oldatot
készítettünk, majd felvettük az oldat analitikai RP-HPLC kromatogramját. Az oldathoz 1,1
ekvivalens NEM-törzsoldatot (10 mg/ml-es etanolos oldat) adtunk, és erről az elegyről is
készítettünk analitikai RP-HPLC kromatogramot.
5.3. A hordozó peptiszármazék dimerizációjának követése a konjugálási reakciót
megelőzően
A cisztein tartalmú peptidek bázikus közegben diszulfidhídon keresztül dimereket
képezhetnek, mely reakció verseng a tioéterkötés kialakulásával. A konjugálás előtt ezért
dimerizációs próbát végeztünk, hogy a reakció körülményeit meghatározhassuk. A
megtisztított 103-Aoa-OT10-Cys-ből 0,1 M TRIS pufferrel (pH=8,12) 0,5 mg/ml-es oldatot
készítettünk. Az oldatot kevertettük, és óránként mintát vettünk belőle. A mintákat analitikai
RP-HPLC-vel vizsgáltuk, hogy a cisztein oxidálódásának gyorsaságáról kapjunk információt.
5.4. A konjugálási reakcióban alkalmazott klóracetilezett SAK származék előállítása
A hordozón klóracetilcsoport jelenléte szükséges, hogy a ciszteinnel hosszabbított
peptideket tioéterkötésen keresztül konjugálhassuk hozzá. A hordozó molekulák
klóracetilezését klórecetsav-pentaklórfenilészter (ClAc-OPcp) reagens segítségével
állítottam elő. A reakcióban felhasznált poli[Lys(Ser0,90-DL-Ala2,60)] (SAK) jellemzői a
következők: Ser : Ala : Lys = 0,90 : 2,60 : 1,00 (aminosavanalízis alapján, 5.8.3. fejezet), a
monomer számított móltömege: 409,35 g/mol. 120 mg SAK-ot feloldottam 2 ml víz és 9 ml
DMF elegyében. A monomerre számított 2 ekvivalens ClAc-OPcp-t 9 ml DMF-ben oldottam
és hozzáadtam a feloldott SAK-hoz, így az oldószerarány víz / DMF 1:9 V/V. A
reakcióelegyet egy éjszakán át kevertettem. Ezután dialízishártyába (10000 MWCO)
36
öntöttem, és 24 óráig dializáltam. A dialízis után szűrtem, majd liofilizáltam. Az előállított
klóracetilezett SAK (továbbiakban: ClAc-SAK) klórtartalmát Schöniger-módszerrel határoztuk
meg [71]. Az előállított ClAc-SAK-ot az 5.5. fejezetben leírt konjugálási reakcióban
használtam fel. Ugyanilyen módszerrel állítottam elő egy másik kiiundulási poli[Lys(Ser0,92-
DL-Ala2,89)] (SAK) klóracetilezett származékát. Ennek a kiindulási polimernek a jellemzői a
következők: Ser : Ala : Lys = 0,92 : 2,89 : 1,00 (aminosavanalízis alapján, 5.8.3. fejezet), a
monomer számított móltömege: 431,70 g/mol. Ezt a ClAc-SAK-ot az 5.7.2. fejezetben leírt
konjugálási reakcióban használtam fel.
5.5. A 103-Aoa-OT10-Cys konjugálása ClAc-SAK-hoz
A konjugálási reakciót TRIS pufferben (pH=8,12) végeztem. A gyengén lúgos közegben
a hordozó (aminosavösszetétel: Ser : Ala : Lys = 0,90 : 2,60 : 1,00) ClAc-csoportja reagált a
cisztein tiolcsoportjával tioéterkötés kialakításával. A reakcióban felhasznált ClAc-SAK
klórtartalma 3,03% volt, melyet Schöniger-módszerrel [71] határoztunk meg. A dimerizáció
elkerülése érdekében a cisztein tartalmú peptidet itt is kis részletekben, adagoltam a
klóracetilezett hordozó oldatához. A reakcióelegyet 24 óráig kevertettem, majd ciszteint
adagoltam hozzá, amely reagálhat az elreagálatlan ClAc-csoportokkal, és a keletkezett
dimer peptideket is visszaredukálhatja. Ezután a reakcióelegyet 24 órán át dializáltam, majd
liofilizáltam. A konjugátum (103-Aoa-OT10-Cys-SAK) szubsztitúciófokát aminosavanalízissel
határoztuk meg.
5.6. A konjugátumok minimális gátló koncentrációjának és telepszámának
meghatározása
Kísérleteinket az Országos Korányi TBC és Pulmonológiai Intézet területén található
Bakteriológiai Laboratóriumban (Corden International Magyarország Kft.), Dr. Szabó Nóra
irányításával és Dávid Sándor közreműködésével végeztük. A steril hatóanyag oldatok az
ELTE-MTA Peptidkémiai Kutatócsoport sejttenyésztő laboratóriumában készültek.
Kísérleteinkben referencia vegyületként INH-t alkalmaztunk. A vizsgálatokhoz folyékony,
félszintetikus Sula táptalajt használtunk, a kémcsövek 5 ml steril tápfolyadékot tartalmaztak
[72-74]. Első lépésként a táptalajt tartalmazó csövekbe a vizsgálandó vegyület (102-es
vegyület, 103-as vegyület, OT10, SAK, 102-Aoa-GFLGC, 103-Aoa-OT10-Cys, 103-Aoa-
OT10-Cys-SAK) megfelelő koncentrációjú oldatából (0,1-50 µg/ml koncentráció-
tartományban, 10 koncentrációban) egyforma mennyiségeket, 100 µl-t pipettáztunk. A
végkoncentráció a referencia INH-ra nézve a következő sorozatnak megfelelő volt (γ [µg/ml]):
0,05; 0,1; 0,14; 0,16; 0,18; 0,20; 0,22; 0,24; 0,30; 0,40.
37
A vegyületekből a törzsoldatokat és a megfelelő higításokat steril körülmények között
készítettük. A vegyületek különböző koncentrációit 2 párhuzamosban teszteltük. A MIC és
CFU értékekeket minden esetben legalább két független kísérletben határoztuk meg.
M. tuberculosis H37Rv (ATCC 27294) 4 hetes friss tenyészetéből golyós lombikban 0,5
Mcfarland (amely közelítőleg 1,5×108 sejtszámnak felel meg [75] sűrűségű szuszpenzió
készült Sauton táptalajban. A vizsgálandó vegyületet tartalmazó és a kontroll csöveket a
baktériumszuszpenzió 103–104 hígításainak 100 – 100 µl-ével fertőztük be. A mintákat 28
napig, 37°C-os termosztátban inkubáltuk.
A 28 nap elteltével meghatároztuk a vizsgált vegyületnek azt a legkisebb koncentrációját,
amely szabad szemmel vizsgálva teljes gátlást okozott, a kontrol csövekben tapasztalható
zavarosodáshoz képest (baktériumok szaporodása). A növekedést szabad szemmel
vizsgálva nem mutató csövekből szilárd Löwenstein-Jensen táptalajokra oltottunk ki, és 4 – 6
hét múlva megszámláltuk a kinövekedett kolóniák számát (CFU) [76, 77]. A kolónia vagy
telepszámnak a megfelelő baktériumszuszpenzió hígítással való szorzatát hasonlítottuk
össze a kiindulásként alkalmazott 0,5 Mcfarland szuszpenzió telepszámával (1,5×108
CFU/ml).
5.7. A hordozómolekulák és a konjugátumok sejtekbe történő bejutásának,
felvételének vizsgálata áramlási citometriával
A hordozómolekulák, illetve a konjugátumok sejtbejutásának vizsgálatára az áramlási
citometria módszerét választottuk. Az áramlási citometriás vizsgálatokhoz az
5(6)-karboxifluoreszceinnel (továbbiakban: Cf) jelöltem a konjugátumokat. Az
5(6)-karboxifluoreszcein 488 nm-en gerjeszthető a készülék szilárdtest lézerével.
5.7.1. A Cf-GFLGC előállítása
A Boc/Bzl stratégiával előállított, még gyantán lévő GFLGC peptidhez fluoreszcens
jelölőmolekulát kapcsoltam. Az utolsó aminosav N-terminális Boc-védőcsoportjának
lehasítása után 2,5 ekvivalens feleslegben használtam az 5(6)-karboxifluoreszceint, a HOBt-t
és a DIC-et. A reakcióidő 1 óra volt. A kapcsolás végbemenetelét Kaiser-próbával
ellenőríztem (5.1.1. fejezet). A peptidszármazékot a gyantáról HF-os hasítással távolítottam
el (5.1.1. fejezet).
38
5.7.2. A Cf-GFLGC konjugálása klóracetilezett SAK-hoz
A klóracetilezéshez felhasznált poli[Lys(Ser0,92-DL-Ala2,89)] (SAK) jellemzői a következők:
Ser : Ala : Lys = 0,92 : 2,89 : 1,00 (aminosavanalízis alapján, 5.8.3. fejezet), a monomer
számított móltömege: 431,70 g/mol. 28,6 mg ClAc-SAK hordozó polimert feloldottam 0,1 M
TRIS pufferben (pH=8,15), és hozzáadagoltam a klórtartalomra számított 1 ekvivalens Cf-
GFLGC-t. A reakcióban felhasznált ClAc-SAK klórtartalma 1,17% volt, melyet Schöniger-
módszerrel [71] határoztunk meg. A dimerizáció elkerülése érdekében a cisztein tartalmú
peptidet kis részletekben adagoltam a klóracetilezett hordozó oldatához. Így a cisztein-peptid
koncentrációja a reakcióelegyben alacsony volt, hogy a peptid dimerizációjának a
valószínűségét csökkenthessük. A reakcióelegyhez, a Cf-GFLGC hozzáadagolása után, 2
ekvivalens ciszteint adagoltam. A cisztein reagálhat az elreagálatlan ClAc-csoporttal, és a
keletkezett dimer peptideket is visszaredukálhatja. Az oldatot 2 óra kevertetés után
dializáltuk 24 óráig, majd liofilizáltuk.
5.7.3. A Cf-GFLGC-SAK konjugátum karboxifluoreszcein tartalmának
meghatározása
Az előállított Cf-GFLGC 100 µg-ját 6 M HCl oldattal hidrolizáltuk 110°C-on, 24 órán át,
leforrasztott, evakuált csőben kalibrálósor felvételéhez, a Cf-tartalom meghatározásához a
konjugátumban. Analitikai RP-HPLC-vel (oszlop: Eurosphere-100, C18, 100 Å, 5 µm, grad:
45-99 B%, 20 perc) különböző koncentrációjú Cf-GFLGC hidrolizátumok kromatogramját és
a vizsgált Cf-GFLGC-SAK hidrolizátum kromatogramját vettük fel. A detektálást λger = 419
nm-es abszorpciós és λem = 519 nm-es emissziós hullámhosszon végeztük. A mért
csúcsterületek alapján készítettük a kalibrációs egyenest, melybe behelyettesítve megkaptuk
az elhidrolizált Cf-GFLGC-SAK karboxifluoreszcein tartalmát [29].
5.7.4. A Cf-GFLGC peptidszármazék sejtbejutásának vizsgálata MonoMac6 humán
monocita sejtvonalon áramlási citometriával
A logaritmikus növekedési fázisban lévő MonoMac6 sejteket 24 lyukú szuszpenziós
lemezre osztottuk (1,5×105 sejt / 0,75 ml fenolvörös nélküli RPMI-1640 szérummentes
médium). A vizsgálandó Cf-GFLGC peptidszármazékot fenolvörös nélküli RPMI-1640
szérummentes médiumban oldottuk. A törzsoldat végkoncentrációja 10-3 M volt. Ebből 10-
szeres tovafutó hígítással állítottuk elő a többi oldatot (10-3 M – 10-7 M). A sejtekről
centrifugálás (1250 rpm, 5 perc) után eltávolítottunk 500 µl médiumot, majd a kontrollokhoz
125 µl szérummentes médiumot és a kezelendő sejtekhez 125 µl Cf-GFLGC-oldatot adtunk.
39
1 óra inkubálás után (37°C, 5% CO2) a sejtszuszpenziót a szövettenyésztő lemez
mélyedéseiből FACS csövekbe vittük át. A csöveket centrifugáltuk (1250 rpm, 5 perc),
eltávolítottuk a médiumot. A vizsgált sejtek egyik feléhez 1000 µl szérummentes médiumot
adtunk, a másik feléhez 100 µl 1 mM tripszin oldatot adtunk. A tripszinnel kezelt sejteket 5
percig inkubáltuk 37°C-on, majd 900 µl teljes médiumot adtunk hozzá, hogy a tripszint
inaktiváljuk. A tripszin eltávolítja a sejtfelszínhez kötődő struktúrákat, így az aspecifikusan
kötődött Cf-GFLGC peptidet is. Az inaktiválás után a csöveket centrifugáltuk (1250 rpm, 5
perc). Ezután 1 ml fenolvörös nélküli RPMI-1640 szérummentes médiumot adtunk a
csövekhez, majd mosás után a sejteket 0,5 ml megegyező médiumban vettük fel. A sejteket
BD LSR II áramlási citométerrel analizáltuk (lézer: 488 nm, Coherent Sapphire szilárdtest
lézer, 22 mW, FL1 csatorna, szoftver: BD FACSDiva 5.0.3). A kapott eredményeket WinMDI
program segítségével értékeltük ki.
5.7.5. A Cf-GFLGC-SAK peptidszármazék sejtbejutásának vizsgálata MonoMac6
humán monocita sejtvonalon áramlási citometriával
A logaritmikus növekedési fázisban lévő MonoMac6 sejteket 24 lyukú szuszpenziós
lemezre osztottuk (1,5×105 sejt / 0,70 ml fenolvörös nélküli RPMI-1640 szérummentes
médium). A vizsgálandó Cf-GFLGC-SAK peptidszármazékot fenolvörös nélküli RPMI-1640
szérummentes médiumban oldottuk. A törzsoldat végkoncentrációja 3,04⋅10-3 M volt. Ebből
3-szoros tovafutó hígítással állítottuk elő a többi oldatot (3,04⋅10-3 M - 3,75⋅10-5 M). A
sejtekről centrifugálás (1250 rpm, 5 perc) után eltávolítottunk 450 µl médiumot, majd a
kontrollokhoz 125 µl szérummentes médiumot és a kezelendő sejtekhez 125 µl Cf-GFLGC-
SAK-oldatot adtunk. 1 óra inkubálás után (37°C, 5% CO2) a sejtszuszpenziót a
szövettenyésztő lemez mélyedéseiből FACS csövekbe vittük át. A csöveket centrifugáltuk
(1250 rpm, 5 perc), eltávolítottuk a médiumot. A vizsgált sejtek egyik feléhez 1000 µl
szérummentes médiumot adtunk, a másik feléhez 100 µl 1 mM tripszin oldatot adtunk. A
tripszinnel kezelt sejteket 5 percig inkubáltuk 37°C-on, majd 900 µl teljes médiumot adtunk
hozzá, hogy a tripszint inaktiváljuk. A tripszin eltávolítja a sejtfelszínhez kötődő struktúrákat,
így az aspecifikusan kötődött Cf-GFLGC-SAK peptidszármazékot is. Az inaktiválás után a
csöveket centrifugáltuk (1250 rpm, 5 perc). Ezután 1 ml fenolvörös nélküli RPMI-1640
szérummentes médiumot adtunk a csövekhez, majd mosás után a sejteket 0,5 ml
megegyező médiumban vettük fel. A sejteket BD LSR II áramlási citométerrel analizáltuk
(lézer: 488 nm, Coherent Sapphire szilárdtest lézer, 22 mW, FL1 csatorna, szoftver: BD
FACSDiva 5.0.3). A kapott eredményeket WinMDI program segítségével értékeltük ki.
40
5.8. Tisztítási és analitikai módszerek
A lehasított peptideket RP-HPLC segítségével választottuk el a szennyezésektől. A nyers
termékek homogenitását minden esetben analitikai RP-HPLC vizsgálattal ellenőriztük. A
célvegyületet a frakciók azonosítása (tömegspektrometria) után a retenciós idő
meghatározásával (RP-HPLC) is jellemeztük. Az elkészített peptidekkel aminosavanalízist
végeztünk.
5.8.1. Analitikai és preparatív RP-HPLC
A lehasított peptideket, a peptidszármazékokat és a konjugátumokat RP-HPLC
segítségével választottam el a szennyezésektől szobahőmérsékleten. Az elválasztást
Knauer rendszeren a következő oszlop alkalmazásával végeztem: Jupiter (C18 10x250 mm)
10 µm, 300 Å. Az elúcióhoz alkalmazott elegyek a következők voltak: A eluens: 0,1% TFA /
víz V/V; B eluens: 0,1% TFA / acetonitril-víz 80:20 V/V, vagy 0,1% TFA / MeOH-víz 90:10
V/V. A detektálás abszorbancia mérésével történt 214 nm-en vagy 220 nm-en, a folyási
sebesség 4 ml/perc volt.. Az alkalmazott gradienst a tisztítandó vegyület polaritása határozta
meg (általában: 5 percig ekvilibrálás, 5-60 B% 35 perc alatt). A főkomponenst tartalmazó
elegyet vákuum alatt bepároltam, a bepárlási maradékot lefagyasztottam, majd liofilizáltam.
A tisztított termék homogenitását analitikai RP-HPLC vizsgálattal ellenőriztem. Az analitikai
RP-HPLC vizsgálatok Knauer rendszeren a fentebb ismertetett eluensek alkalmazásával
történtek. Az analitikai oszlopon (Jupiter C18 4,6x250 mm, 5 µm szilika, 300 Å, Cf-tartalom
meghatározásnál: Eurosphere-100 C18 4x250 mm, 5 µm szilika, 100 Å) lineáris gradiens
elúciót alkalmaztunk. Az A eluensben oldott 0,5-1,0 mg/ml töménységű mintákból az
oszlopra 20 µl mennyiségeket injektáltunk. Az elválasztásokat szobahőmérsékleten
végeztük, a folyási sebesség 1 ml/perc volt. A detektálás a félpreparatív tisztítási eljárásnál
alkalmazottal megegyezően abszorbancia mérésével (λ= 214 nm vagy 220 nm) történt. Az
alkalmazott gradiens: 5 percig ekvilibrálás, 35 perc alatt 5-60 B%.
5.8.2. ESI-MS spektrometria
A tömegspektrumokat electrospray ionforrással, Bruker Esquire 3000+ típusú ioncsapdás
készüléken vettük fel. A mintákat 0,1% AcOH-t tartalmazó AcN / víz 1:1 V/V
oldószerelegyben oldottuk és 10 µl/perc áramlási sebességgel injektáltuk. A spektrumokat
pozitív módban, 50-3000 m/z tartományban, 13,000 m/z/sec mintavételi sebességgel vettük
fel. A tömegspektrometriai méréseket az MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoportban Horváti
Kata (tudományos munkatárs) végezte.
41
5.8.3. A peptidek és a konjugátumok aminosavanalízise
Az aminosavösszetétel és a konjugátum szubsztitúciófokának meghatározását
aminosavanalízissel végeztük. A konjugátum 100-250 µg-nyi mennyiségét 6 M HCl-dal,
110°C-on, 24 óra alatt hidrolizáltuk. A hidrolizátumból az aminosavösszetételt SYKAM 4300
automata aminosavanalizátor alkalmazásával határoztuk meg. Az aminosavanalíziseket az
MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoportban Dr. Medzihradszky Schweiger Hedvig végezte.
A szintetikus munka során használt vegyszereket, műszereket és oszlopokat az 5-7.
táblázatok foglalják össze.
42
Név, kapacitás Rövidítés Gyártó cég
terc-butiloxikarbonil- (Boc)
aminosavszármazékok Boc-aminosav
Nova Biochem
(Läufelfingen, Svájc) 4-metilbenzhidrilamin-gyanta (1,2 mmol/g) MBHA
4-(2’, 4’-dimetoxifenil-Fmoc-aminometil)-
fenoxiacetamido-norleucil-MBHA-gyanta
(0,65 mmol/g)
Rink Amide MBHA
9-fluorenilmetiloxikarbonil-
aminosavszármazékok Fmoc-aminosav
Reanal (Budapest,
Magyarország) trifluorecetsav TFA
Kaiser-reagens alkotói (ninhidrin, etanol,
fenol, piridin, KCN)
diklórmetán DCM Molar (Budapest,
Magyarország) N,N-dimetilformamid DMF
N-metilpirrolidon NMP Merck (Budapest,
Magyarország)
klórecetsav-pentaklórfenilészter ClAc-OPcp laboratóriumban előállított
N,N’-diizopropilkarbodiimid DIC
Fluka, Sigma-Aldrich
(Budapest, Magyarország)
1-hidroxibenztriazol HOBt
benztriazol-1-il-oxi-trisz-pirrolidino-
foszfónium-hexafluorofoszfát PyBOP
N,N-diizopropiletilamin DIEA
5(6)-karboxifluoreszcein Cf
p-krezol
1,4-DL-ditiotreitol DTT
hidrogén-fluorid HF
piperidin
1,8-diazabiciklo[5.4.0]undek-7-én DBU
triizopropilszilán TIS
N-etilmaleimid NEM
metanol MeOH
foszfát puffer PBS
2-amino-2-hidroximetil-propán-1,3-diol TRIS
szövettenyésztő médium RPMI 1640
5. táblázat: A szintetikus munka során használt aminosavszármazékok, gyanták, oldószerek,
reagensek
43
Elnevezés Gyártó cég
Knauer RP-HPLC rendszer Knauer (Bad Homburg, Németország)
Bruker Daltonics Esquire 3000+
tömegspektrométer Bruker (Bremen, Németország)
SYKAM 4300 automata aminosavanalizátor SYKAM (Eresing, Németország)
HF teflonkészülék Peninsula Laboratories, INC. (Belmont, CA,
USA)
liofilizátor Virtis (Warminster, PA, USA)
áramlási citométer BD LSR II BD Biosciences (San Jose, CA, USA)
Snake skin dialízishártya Pierce Biotechnology (Rockford, IL, USA)
Sedival fénymikroszkóp Carl Zeiss (Jena, Németország)
25 cm2, 75 cm2, 175 cm2 szövettenyésztő
flaska
Sarstedt (Nümbrecht, Németország) 24 lyukú szuszpenziós szövettenyésztő
lemez
1ml, 5ml, 10ml, 25 ml szerológiai pipetta
5 ml áramlási citometriás cső
6. táblázat: A szintetikus munka során alkalmazott műszerek
Elnevezés Jellemzők Gyártó cég
Phenomenex -
félpreparatív
fordított fázisú, módosított szilika töltet
Jupiter (C18 10x250 mm) 10 µm, 300 Å Phenomenex (Torrance,
CA, USA) Phenomenex-
analitikai
fordított fázisú, módosított szilika töltet
Jupiter (C18 4,6x250 mm) 5 µm, 300 Å
Eurospher-
analitikai
fordított fázisú, módosított szilika töltet
(C18 4x250 mm) 5 µm, 100 Å
Knauer (Bad Homburg,
Németország)
7. táblázat: A szintetikus munka során alkalmazott RP-HPLC oszlopok, töltetek
44
6. EREDMÉNYEK
6.1. A GFLGC, az Aoa-GFLGC és az Aoa-OT10-Cys peptidek, peptidszármazékok
előállítása
Előállítottam a C-terminálison cisztein aminosavval hosszabbított GFLGC szekvenciájú
spacerként (távolságtartó egység) alkalmazott peptidamidot szilárdfázisú peptidszintézissel
Boc/Bzl stratégiával (5.1.1. fejezet). A 17. ábra mutatja a tisztított peptid analitikai RP-HPLC
kromatogramját (a) és tömegspektrumát (b, c).
0 10 20 30 40-0,1
0,0
0,1
0,2
0,3
0,4
t / min
A (
220n
m)
GFLGC
a.
Rt=24,1 perc
45
b.
495.2
+MS, 0.6-2.0m in (#27-#90)
0
1
2
3
7x10Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
17. ábra: a. A tisztított GFLGC peptid analitikai RP-HPLC kromatogramja (körülmények:
Phenomenex Jupiter oszlop, C18, 300 Å, 1 mg/ml, λ = 220 nm, grad: 5-60 B%, 35 perc)
és b. tömegspektruma (Mmo (számított)=494,2), c. izotópeloszlása
A GFLGC spacer N-terminálisra Boc-aminooxiecetsavat kapcsolva előállítottam az Aoa-
GFLGC peptidszármazékot (5.1.1. fejezet) (18. ábra). A 19. ábra mutatja a tisztított peptid
analitikai RP-HPLC kromatogramját (a) és tömegspektrumát (b, c).
18. ábra: A Boc-aminooxiecetsav reakciója a peptid szabad N-terminálisával
495.2
496.1
497.2
+MS, 0.6-2.0min (#27-#90)
0
1
2
3
47x10
Intens.
490 492 494 496 498 500 m/z
c.
[M+H]+
Boc-NH-O-CH2-COOH
Boc-aminooxiecetsav
Boc-NH-O-CH2-CO-NH-PEPTIDNH2-PEPTID
Boc-aminooxiacet il-peptidpeptid
+- H2O
46
b.
0 10 20 30 40-0,1
0,0
0,1
0,2
0,3
0,4
A (
214
nm)
t / min
Aoa-GFLGC
156.2495.4
568.4
+MS, 0.0-0.3min (#2-#14)
0
1
2
3
6x10Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
19. ábra: a. A tisztított Aoa-GFLGC peptidszármazék analitikai RP-HPLC kromatogramja
(körülmények: Phenomenex Jupiter oszlop, C18, 300 Å, 1 mg/ml, λ = 214 nm,
grad: 5-60 B%, 35 perc) és b. tömegspektruma (Mmo (számított)=567,3), c. izotópeloszlása
[M+H]+
Rt=24,6 perc
a.
568.4
569.3
570.4
+MS, 0.0-0.3min (#2-#14)
0
1
2
3
6x10Intens.
564 566 568 570 572 574 m/z
c.
47
a.
Előállítottam szilárdfázisú peptidszintézissel, Fmoc/tBu stratégiával a C-terminálison
ciszteinnel hosszabbított OT10-Cys oligotuftsin származékot (5.1.2. fejezet). Az OT10-Cys
N-terminálisára is Boc-aminooxiecetsavat kapcsoltam, így előállítva az Aoa-OT10-Cys-t
(5.1.2. fejezet) (18. ábra). A 20. ábra mutatja a nyers peptid tömegspektrumát (a, b). Ezt a
peptidet tisztítás nélkül használtam fel a konjugáláshoz.
305.2
406.5
609.0
+MS, 0.0-0.0min (#1-#2)
0
1
2
3
4
6x10Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
20. ábra: a. A nyers Aoa-OT10-Cys tömegspektruma (Mmo (számított)=1215,8), b. izotópeloszlás
6.2. 102-Aoa-GFLGC és 103-Aoa-OT10-Cys előállítása, az előállított vegyületek
jellemzése
A 102-es vegyületet az Aoa-GFLGC-hez, a 103-ast az Aoa-OT10-Cys-hez konjugáltam
oximkötés kialakításával (5.1.3. fejezet) (21. ábra). A reakció közben az oldatból óránként
mintát vettem és analitikai RP-HPLC-vel követtem a reakció előrehaladását. A
kromatogramok elemzése alapján megállapítottam, hogy a reakció egy óra alatt lejátszódott.
Az előállított és tisztított konjugátumok analitikai RP-HPLC kromatogramját és
tömegspektrumait a 22. és 23. ábrákon mutatom be.
21. ábra: Aldehidcsoportot tartalmazó hatóanyag jelöltek és aminooxiacetil-peptid
konjugálása oximkötés kialakításával
+--CHO NH2-O-CH2-CO-PEPTID --CH=N-O-CH2-CO-PEPTID
- H2O
609.0
609.5
610.0
610.4
+All, 0.3-0.8min (#11-#30)
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
5x10Intens.
606 607 608 609 610 611 612 m/z
b. [M+2H]2+
[M+3H]3+
[M+4H]4+
48
b.
0 10 20 30 40-200
0
200
400
600
800
1000
1200
1400
A (
214
nm)
t / min
102-Aoa-GFLGC
230.3381.9 636.6
779.7
+MS, 0.2-0.5min (#9-#27)
0
2
4
6
6x10Intens.
250 500 750 1000 1250 1500 1750 2000 2250 m/z
22. ábra: a. A tisztított 102-Aoa-GFLGC konjugátum analitikai RP-HPLC kromatogramja
(körülmények: Phenomenex Jupiter oszlop, C18, 300 Å, λ = 214 nm, grad: 5-60 B%, 35 perc)
és b. tömegspektruma (Mmo (számított)=778,6), c. izotópeloszlása
a.
779.7
780.6
781.6
782.6
+MS, 0.2-0.5min (#9-#27)
0
2
4
6
6x10Intens.
776 778 780 782 784 m/z
c.
Rt=32,5 perc
[M+H]+
[’102’+H]+
49
b.
0 10 20 30 40
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
A (
220
nm)
t / min
103-Aoa-OT10-Cys
218.2
361.5
481.6
721.5
+MS, 0.0-0.4min (#3-#20)
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
1.25
7x10Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
23. ábra: a. A tisztított 103-Aoa-OT10-Cys peptidszármazék analitikai RP-HPLC
kromatogramja (körülmények: Phenomenex Jupiter C18 oszlop, 300 Å, λ = 220 nm, grad: 5-
60 B%, 35 perc) és b. tömegspektruma (Mmo (számított)=1441,1), c. izotópeloszlás
721.5
722.0
+MS, 0.0-0.4min (#3-#20)
0
1
2
3
4
5x10Intens.
719 720 721 722 723 724 m/z
c.
[M+3H]3+
[M+4H]4+
[M+2H]2+
a. Rt=20,1 perc
50
b.
A 103-Aoa-OT10-Cys konjugátumban meghatároztuk a cisztein oxidációs állapotát NEM-
reagens segítségével (5.2. fejezet). A kromatogramok alapján megállapítható, hogy a
cisztein a konjugátumban szabad tiolcsoportot tartalmaz. A peptidet N-etilmaleimiddel
reagáltatva stabil S-(N-etilszukcinimido)-származék keletkezett, amelyet az analitikai RP-
HPLC körülmények között elválasztottunk a kiindulási peptidtől, és tömegspektrométerrel
azonosítottuk (24. ábra).
0 10 20 30 40
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
A (
220
nm)
t / min
N-etilmaleimid
szukcinimid származék
338.5
392.7
523.4
664.0 766.0
+MS, 0.0-0.1min (#2-#6)
0
1
2
3
4
5
5x10Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
24. ábra: a. A 103-Aoa-OT10-Cys és a NEM reakciója után felvett analitikai RP-HPLC
kromatogram (körülmények: Phenomenex Jupiter C18 oszlop, 300 Å, λ = 220 nm, grad: 5-60
B%, 35 perc), és b. a keletkezett szukcinimid-származék tömegspektruma (Mmo
(számított)=1566,2)
[M+4H]4+
[M+3H]3+
a.
Rt1=12,3 perc
Rt2=20,9 perc
51
A 103-Aoa-OT10-Cys dimerizációs sebességét vizsgáltuk TRIS pufferben (5.3 fejezet).
Azt az eredményt kaptuk a kromatogramok analízise alapján, hogy TRIS pufferben 3 óra
elteltével a konjugátum 80%-a dimer formában van jelen (25. ábra). A 26. ábrán látható a
dimerizálódott 103-Aoa-OT10-Cys tömegspektruma.
0,0 0,5 1,0 1,5 2,0 2,5 3,00
20
40
60
80
100
mon
omer
%
t / h
25. ábra: A 103-Aoa-OT10-Cys dimerizációs próbája során felvett analitikai RP-HPLC
kromatogramokon a monomer mennyiségének fogyása az idő függvényében (körülmények:
Phenomenex Jupiter C18 oszlop, 300 Å, λ = 214 nm, grad: 0-80 B%, 35 perc)
338.5
412.8
481.3
577.3
663.6
+MS, 0.2-2.1min (#10-#106)
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
1.2
5x10Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
26. ábra: A dimerizációs próba során a dimerizálódott 103-Aoa-OT10-Cys konjugátum
tömegspektruma (Mav (számított)=2880,9)
[2M-2H+7H]7+
[2M-2H+6H]6+
[2M-2H+5H]5+
52
A peptidek, peptidszármazékok és konjugátumok homogenitását RP-HPLC-vel
jellemeztük, az előállított anyagok elsődleges szerkezetét tömegspektrometriával és
aminosavanalízissel igazoltuk (8. táblázat).
Szekvencia Mmo számított Mmo mérta Rt (perc)b Aminosavanalízis
GFLGC 494,2 494,2 24,1
G 2,16 [2]; F 1,10
[1]; L 1,06 [1]; C
0,68 [1]
Aoa-GFLGC 567,3 567,4 24,6
102-Aoa-GFLGC 778,6 778,7 32,5
Cf-GFLGCc 852,5 852,6 35,1 és 35,7
Aoa-OT10-Cys 1215,8 1216,0 - T 1,90 [2]; K 4,23 [4]; P 2,00 [2]; G
2,05 [2]; C 0,84 [1] 103-Aoa-OT10-Cys 1441,1 1441,0 20,1
a monoizotópos molekulatömeg, ESI-MS, Bruker Esquire 3000+
b analitikai RP-HPLC, Phenomenex Jupiter, C18, 4,6x250 mm, 5 µm, 300 Å, grad: 5-60 B%, 35 perc
c a Cf-GFLGC származék előállítása és kémiai jellemzésének leírása a 6.6. fejezetben található
8. táblázat: Az előállított konjugátumok analitikai jellemzései
53
6.3. ClAc-SAK előállítása
A SAK hordozó molekulák klóracetilezését ClAc-OPcp reagens segítségével valósítottam
meg (5.4. fejezet). Két különböző kiindulási SAK polimert használtam: (1) poli[Lys(Ser0,90-DL-
Ala2,60)], aminosavösszetétel: Ser : Ala : Lys = 0,90 : 2,60 : 1,00; (2) poli[Lys(Ser0,92-DL-
Ala2,89)], aminosavösszetétel: Ser : Ala : Lys = 0,92 : 2,89 : 1,00). Az előállított ClAc-SAK
vegyületek Schöniger-módszerrel [71] meghatározott klórtartalma: (1): 3,03% és (2): 1,17%
volt. Az alacsonyabb klórtartalmú vegyületet használtam fel a karboxifluorszcein származék
előállításához. A karboxifluoreszceint tartalmazó polimer esetében kis szubsztitúciófokra
törekedtünk, a vízoldhatóság megőrzése, valamint a karboxifluoreszcein okozta esetleges
citotoxicitás kivédése érdekében. Az előállított ClAc-SAK sematikus ábrája a 27. ábrán
látható.
27. ábra: Az előállított ClAc-SAK sematikus ábrája
6.4. A 103-Aoa-OT10-Cys-SAK előállítása
A 103-Aoa-OT10-Cys konjugátumot ClAc-SAK-hoz (aminosavösszetétel: Ser : Ala : Lys =
0,90 : 2,60 : 1,00; Schöniger-módszerrel meghatározott klórtartalom: 3,03%) kapcsoltuk
tioéterkötésen keresztül, az 5.5. fejezetnek megfelelően. A konjugátum (103-Aoa-OT10-Cys-
SAK) szubsztitúciófokát aminosavanalízissel meghatározva 10,1%-ot kaptunk. Az előállított
103-Aoa-OT10-Cys-SAK sematikus ábrája a 28. ábrán látható.
54
28. ábra: Az előállított 103-Aoa-OT10-SAK sematikus ábrája
6.5. A vegyületek, konjugátumok MIC és CFU értékei
A vizsgált vegyületek MIC és CFU értékeinek meghatározását az 5.6. fejezetben leírt
módon végeztük. A kapott értékeket a 9. táblázatban foglaltam össze. Az OT10 és a SAK
hordozó nem mutatott antituberkulotikus hatást.
Vegyület MICa
γγγγ (µµµµg/ml) MIC
(µµµµmol/dm3) CFUb
INH (kontroll) 0,16 1,17 12
102-es vegyület 1,00 4,36 3
103-as vegyület 0,50 2,06 3
102-Aoa-OT10c 6,90 30,1 10
102-Aoa-GFLGC n.a.d n.a.d n.a.d
103-Aoa-OT10-Cys 10,1 41,6 n.a.d
130-Aoa-OT10-Cys-SAK n.a.d n.a.d n.a.d
a minimális gátló koncentráció M. tuberculosis H37Rv baktériumtörzsön Sula táptalajban; hatóanyag tartalomra számítva b telepszám Löwenstein-Jensen szilárd táptalajon c előállításának körülményei nem szerepelnek a dolgozatban, a 102-es hatóanyag oximkötésen keresztül kapcsolódik az OT10 hordozóhoz d meghatározása folyamatban
9. táblázat: Az előállított konjugátumok minimális gátló koncentrációja (MIC) és telepszáma
(CFU) M. tuberculosis H37Rv baktériumtörzsön
55
6.6. Cf-GFLGC és Cf-GFLGC-SAK előállítása, és a kapott konjugátumok sejtekbe
történő bejutása
A sejtbejutás követése érdekében a GFLGC spacer N-terminálisára fluoreszcens
molekulát, 5(6)-karboxifluoreszceint kapcsoltam (29. ábra), így előállítva a Cf-GFLGC-t
(5.7.1. fejezet, 8. táblázat). A 30. ábra mutatja a tisztított peptid analitikai RP-HPLC
kromatogramját (a) és tömegspektrumát (b-e). A két frakció az 5(6)-karboxifluoreszcein két
izomere, tömegspektrumuk megegyezik.
29. ábra: 5(6)-karboxifluoreszcein reakciója aminocsoporttal
0 10 20 30 40
0
500
1000
1500
2000
2500
A (
220
nm)
t / min
Cf-GFLGC
a.
Rt1=35,1 perc
Rt2=35,7 perc
56
b.
d.
99.4 338.7
418.9
563.4
733.5
853.6
+MS, 0.1-0.5min (#6-#24)
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
1.25
6x10Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
99.4 298.0
418.9
563.4733.6
853.6
+MS, 0.0-0.2min (#3-#11)
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
3.0
6x10Intens.
200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 m/z
30. ábra: a. A tisztított Cf-GFLGC konjugátum analitikai RP-HPLC kromatogramja
(körülmények: Phenomenex Jupiter oszlop, C18, 300 Å, 0,5 mg/ml, λ = 220 nm, grad: 5-60
B%, 35 perc), b. Rt1-hez tartozó tömegspektrum (Mmo (számított)=852,5), c. izotópeloszlása, d.
Rt2-höz tartozó tömegspektrum (Mmo (számított)=852,5), e. izotópeloszlása
A ClAc-SAK-hoz (aminosavösszetétel: Ser : Ala : Lys = 0,92 : 2,89 : 1,00; Schöniger-
módszerrel meghatározott klórtartalom: 1,17%) a Cf-GFLGC fluroeszcensen jelölt peptidet
kapcsoltam tioéterkötés kialakításával (5.7.2. fejezet). Meghatároztuk a Cf-GFLGC-SAK
konjugátum Cf-tartalmát az 5.7.3. fejezetben leírt módon, a kapott érték: 6,1% (31. ábra).
853.6
854.6
855.6
856.6
+MS, 0.1-0.5min (#6-#24)
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
1.25
6x10Intens.
850 852 854 856 858 m/z
853.6
854.6
855.6
856.5
+MS, 0.0-0.2min (#3-#11)
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
3.0
6x10Intens.
850 852 854 856 858 860 m/z
[M+H]+
[M-H2O+2H]2+
[M+H]+
[M-H2O+2H]2+
c.
e.
57
0,000 0,004 0,008 0,012 0,0160
1000
2000
3000
4000
5000
6000
Csú
cs a
latti
terü
lete
k ös
szeg
e
cCf-GFLGC
/ mg/ml
31. ábra: A Cf-GFLGC-SAK konjugátum karboxifluoreszcein tartalmának meghatározására
szolgáló kalibráló egyenes (az egyenes egyenlete: y=113,83+342752,61x; R=0,99965)
A Cf-GFLGC peptidszármazék sejtekbe történő bejutását áramlási citométerrel vizsgáltuk
tripszinnel kezelt és kezeletlen MonoMac6 humán monocita sejtvonalakon (5.7.4. fejezet). A
tripszin eltávolítja a sejtfelszínhez kötődő struktúrákat, így az aspecifikusan kötődött Cf-
GFLGC peptidet is. A 32. ábra mutatja a Cf-GFLGC sejtbejutásának koncentrációfüggését,
amit a fluoreszcencia intenzitásának emelkedése jelez (a citometriás analízist megelőzően
nem történt tripszines kezelés a sejteken). A 33. ábra mutatja a tripszines kezelés nélküli és
a tripszinnel kezelt sejtek Cf-GFLGC felvételének összehasonlítását. Nem tapasztalható
jelentős különbség a tripszinnel kezelt és kezeletlen sejtek Cf-GFLGC felvételében, vagyis a
felvett Cf-GFLGC bekerül a sejtbe és nem a sejt felszínéhez kötődik aspecifikusan. A 34.
ábra a kezeletlen (kontroll) és a különböző koncentrációjú Cf-GFLGC peptiddel kezelt
sejtpopulációk fluoreszcencia intenzitás eloszlását mutatja be (tripszines kezelés nélkül). A
kontrollhoz viszonyítva az egyes görbék középértékének eltolódása mutatja a peptid
sejtekbe történő bejutásának koncentrációfüggését.
58
10-7 10-6 10-5 10-4 10-3
102
103
104
105
Flu
ores
zcen
cia
inte
nzitá
s
c (M)
32. ábra: A Cf-GFLGC peptidszármazék sejtbejutásának koncentrációfüggésének
meghatározása áramlási citometriával, tripszines kezelés nélkül
10-7 10-6 10-5 10-4 10-3
0,0
2,0x104
4,0x104
6,0x104
8,0x104
1,0x105
1,2x105
1,4x105 tripszin nélkültripszinnel
Flu
ores
zcen
cia
inte
nzitá
s
c (M)
33. ábra: A Cf-GFLGC peptidszármazék sejtbejutásának koncentrációfüggésének
meghatározása áramlási citometriával, tripszinnel nem kezelt (fekete négyzet) és tripszinnel
kezelt (piros kör) sejtek esetében
59
34. ábra: A különböző koncentrációjú Cf-GFLGC peptidszármazékkal (tripszin nélkül) kezelt
sejtpopulációk fluoreszcencia intenzitás eloszlása
A Cf-GFLGC-SAK sejtekbe történő bejutását is vizsgáltuk áramlási citométerrel
tripszinnel kezelt és kezeletlen sejteken (5.7.5. fejezet). A 35. ábra mutatja a Cf-GFLGC-SAK
sejtbejutásának koncentrációfüggését, amit a fluoreszcencia intenzitásának emelkedése
jelez. A 36. ábra mutatja a tripszines kezelés nélküli és a tripszinnel kezelt sejtek Cf-GFLGC-
SAK felvételének összehasonlítását. Minimális különbség tapasztalható a tripszinnel kezelt
és kezeletlen sejtek Cf-GFLGC-SAK felvételében. A különbség oka lehet az aspecifikus
kötődés. Annak tisztázása, hogy ez az eltérés jelenthet-e receptorhoz való kötődést, további
vizsgálatokat igényel (a felvétel időfüggésének vizsgálata, receptorspecifikus ellenanyaggal
való előkezelés, stb.). A 37. ábra a kezeletlen (kontroll) és a különböző koncentrációjú Cf-
GFLGC-SAK peptiddel kezelt sejtpopulációk fluoreszcencia intenzitás eloszlását mutatja be.
A kontrollhoz viszonyítva az egyes görbék középértékének eltolódása mutatja a peptid
sejtekbe történő felvételének koncentrációfüggését.
― kontroll ― 10-7 M ― 10-6 M ― 10-5 M ― 10-4 M ― 10-3 M
Fluoreszcencia intenzitás
Ese
mén
y / s
ejt
60
10-4 10-3 10-2102
103
Flu
ores
zcen
cia
inte
nzitá
s
c (M)
35. ábra: A Cf-GFLGC-SAK peptidszármazék sejtbejutásának koncentrációfüggésének
meghatározása áramlási citometriával, tripszines kezelés nélkül
10-4 10-3
0,0
5,0x102
1,0x103
1,5x103
2,0x103
2,5x103
3,0x103
3,5x103 tripszin nélkültripszinnel
Flu
ores
zcen
cia
inte
nzitá
s
c (M)
36. ábra: A Cf-GFLGC-SAK peptidszármazék sejtbejutásának koncentrációfüggésének
meghatározása áramlási citometriával, tripszinnel nem kezelt (fekete négyzet) és tripszinnel
kezelt (piros kör) sejtek esetében
61
37. ábra: A különböző koncentrációjú Cf-GFLGC-SAK peptidszármazékkal (tripszin nélkül)
kezelt sejtpopulációk fluoreszcencia intenzitás eloszlása
― kontroll ― 3,75x10-5 M ― 1,13x10-4 M ― 3,38x10-4 M ― 1,01x10-3 M ― 3,04x10-3 M
Fluoreszcencia intenzitás
Ese
mén
y / s
ejt
62
7. ÖSSZEFOGLALÁS
A tuberkulózis (tbc), a Mycobacterium tuberculosis okozta megbetegedés, világszerte az
egyik fő közegészségügyi probléma napjainkban. A tbc kezelése 6-12 hónapot vesz igénybe,
és a jelenleg alkalmazott antituberkulotikumok többségének számos mellékhatása ismert.
Dolgozatomban röviden ismertettem a betegséget okozó baktériumot és áttekintettem az
alkalmazott antituberkulotikumokat. A kezelés során jelentkező káros mellékhatások, és a
nagy dózisok alkalmazásának elkerüléséhez szükség van a hatóanyagok szelektív
célbajuttatására. Dolgozatomban bemutattam a fertőzött makrofágokba való szelektív
célbajuttatás egy lehetséges útját. Ismertettem a témához kapcsolódó szintetikus munkámat:
• Előállítottam szilárdfázisú peptidszintézissel a H-GFLGC-NH2 és a
H-[TKPKG]2C-NH2 (OT10-Cys) peptidamidokat.
• A H-GFLGC-NH2-hez és az OT10-Cys-hez Boc-aminooxiecetsavat kapcsoltam, majd
oximkötés kialakításával az Aoa-GFLGC-NH2-hez a 102-es jelű hatóanyagot, az Aoa-
OT10-Cys-hez a 103-as hatóanyagot konjugáltam.
• A 103-Aoa-OT10-Cys konjugátumban meghatároztam a cisztein oxidációs állapotát
NEM-reagens segítségével.
• Meghatároztam a 103-Aoa-OT10-Cys konjugátum dimerizációs sebességét.
• Előállítottam a ClAc-SAK hordozót a SAK polimer klóracetilezésével.
• Előállítottam a 103-Aoa-OT10-Cys-SAK konjugátumot a 103-Aoa-OT10-Cys és a ClAc-
SAK reakciójával tioéterkötésen keresztül.
• Meghatároztam a 102-es, a 103-as vegyületek minimális gátló koncentráció (MIC)
értékét és telepszámát (CFU). A konjugátumok MIC és CFU értékének meghatározása
folyamatban van.
• A H-GFLGC-NH2-hez fluoreszcens molekulát, az 5(6)-karboxifluoreszceint kapcsoltam.
Az Cf-GFLGC peptidszármazék sejtekbe történő bejutásának koncentrációfüggését
áramlási citométerrel határoztam meg.
• A ClAc-SAK-hoz a Cf-GFLGC fluoreszcensen jelölt peptidet kapcsoltam tioéterkötés
kialakításával. Az előállított Cf-GFLGC-SAK szubsztitúciófokát aminosavanalízis
adatok alapján határoztam meg A Cf-GFLGC-SAK sejtekbe történő bejutásának
koncentrációfüggését áramlási citométerrel történt mérések segítségével határoztam
meg.
• Az előállított konjugátumokat kémiailag jellemeztem aminosavanalízissel, RP-HPLC és
ESI-MS módszerek alkalmazásával.
63
Rövidítésjegyzék
A dolgozatban előforduló rövidítések, jelölések jegyzéke:
AcN acetonitril
AcOH ecetsav
Aoa- aminooxiacetil-
ATCC American Type Culture Collection (Global Bioresource Center)
Boc terc-butiloxikarbonil
BSA bovine serum albumin, marha szérum albumin
Bzl benzil
Cf 5(6)-karboxifluoreszcein
CFU colony forming unit, telepszám
ClAc-OPcp klórecetsav-pentaklórfenilészter
ClZ 2-klórbenziloxikarbonil
CS cikloszerin
DBU 1,8-diazabiciklo[5.4.0]undek-7-én
DCM diklórmetán
DIC N,N’-diizopropilkarbodiimid
DIEA N,N-diizopropiletilamin
DMF N,N-dimetilformamid
DMSO dimetilszulfoxid
DTT 1,4-DL-ditiotreitol
DUTPáz dezoxiuridin 5’-trifoszfát nukleotidohidroláz (EC 3.6.1.23)
EAK poli[Lys(Glui-DL-Alam)] (ahol i≅1, m≅2-4,)
ESI-MS electrospray ionisation mass spectrometry, electrospray ionizációs
tömegspektrometria
ETB etambutol
FACS fluorescent-activated cell sorter, áramlási citométer
Fmoc 9-fluorenilmetiloxikarbonil
FSC forward scatter, előre irányuló fényszórás
HCl hidrogén-klorid
HF hidrogén-fluorid
HIV human immunodeficiency virus, humán immundeficiencia vírus
HOBt 1-hidroxibenztriazol
INH izoniazid
KCN kálium-cianid
64
KLH keyhole lympet hemocyanin
LDL low density lipoprotein, kis sűrűségű lipoprotein
Mav átlag molekulatömeg
Mmo monoizotópos molekulatömeg
MBHA 4-metilbenzhidrilamin
MBSA maleilated bovine serum albumin, maleilezett marha szérum albumin
MDR-TB multi-drug resistant tuberculosis, multirezisztens tuberkulózis
4-MeBzl 4-metilbenzil
MIC minimal inhibitory concentration, minimális gátló koncentráció
MWCO molecular weight cut off, molekulatömeg szerinti áteresztőképesség
NaOAc nátrium-acetát
NEM N-etilmaleimid
NMP N-metilpirrolidon
OT10 [TKPKG]2, dituftsin származék
OVA ovalbumin, tojásalbumin
PAS p-aminoszalicilsav
PBS phosphate buffered saline, foszfát puffer
PPD purified protein derivative, tisztított fehérje keverék
PyBOP benztriazol-1-il-oxi-trisz-pirrolidino-foszfónium-hexafluorofoszfát
PZA pirazinamid
RAMP rifampicin
RP-HPLC revers phase high performance liquid chromatography, fordított fázisú
nagyhatékonyságú folyadékkromatográfia
RPMI-1640 Roswell Park Memorial Institute medium, szövettenyésztő oldat
Rt retention time, retenciós idő
SAK poli[Lys(Seri-DL-Alam)] (ahol i≅1, m≅2-4,)
SM sztreptomicin
SSC side scatter, oldalra irányuló fényszórás
tbc tuberkulózis
tBu terc-butil
TFA trifluorecetsav
TIS triizopropilszilán
TRIS 2-amino-2-hidroximetil-propán-1,3-diol
Trt tritil
XAK poli[Lys(Xi-DL-Alam)] (ahol m≈3,5, i≤1, és X: Glu vagy Ser)
XDR extensively drug resistant tuberculosis, extenzíven rezisztens
tuberkulózis
65
Irodalom
[1] R. Koch: Die Aetiologie der Tuberculose, 1882, Berliner Klinischen Wochenschrift, 19,
221-230.
[2] É. Ádám, F. D. Tóth, L. Emődy, L. Gergely, É. Gönczöl, E. Nagy, T. Pál, R. Pusztai, F.
Rozgonyi, B. Szabó: Orvosi mikrobiológia, 2003, Alliter Kiadói és Oktatásfejlesztői
Alapítvány
[3] Global tuberculosis control – epidemology, strategy, financing, 2009, WHO,
(WHO/HTM/TB/2009.411)
[4] TB/HIV Fact Sheet. WHO, 2008,
http://www.who.int/tb/challenges/hiv/tbhiv_facts08_en.pdf
[5] S. H. E. Kaufmann, S. K. Parida: Changing funding patterns in tuberculosis, 2007, Nature
Medicine, 13, 299-303.
[6] J. Jónás, K. Barsiné Fodor, P. Kiss, M. Péterfiné Tüfgyei, L. Nyári: A pulmonológiai
Intézmények 2004. évi epidemiológiai és működési adatai, 2005, Országos Korányi TBC
és Pulmonológiai Intézet
[7] I. M. Szabó: A bioszféra mikrobiológiája III., 1989, Akadémiai Kiadó, 1971-1972.
[8] S. T. Cole, R. Brosch, J. Parkhill, T. Garnier, C. Churcher, D. Harris, S. V. Gordon, K.
Eiglmeier, S. Gas, C. E. 3rd Barry, F. Tekaia, K. Badcock, D. Basham, D. Brown, T.
Chillingworth, R. Connor, R. Davies, K. Devlin, T. Feltwell, S. Gentles, N. Hamlin, S.
Holroyd, T. Hornsby, K. Jagels, A. Krogh, J. McLean, S. Moule, L. Murphy, K. Oliver, J.
Osborne, M. A. Quail, M. A. Rajandream, J. Rogers, S. Rutter, K. Seeger, J. Skelton, R.
Squares, S. Squares, J. E. Sulston, K. Taylor, S. Whitehead, B. G. Barrell: Deciphering
the biology of Mycobacterium tuberculosis from the complete genome sequence, 1998,
Nature, 393, 537-544.
[9] R. D. Fleischmann, D. Alland, J. A. Eisen, L. Carpenter, O. White, J. Peterson, R. DeBoy,
R. Dodson, M. Gwinn, D. Haft, E. Hickey, J. F. Kolonay, W. C. Nelson, L. A. Umayam, M.
Ermolaeva, S. L. Salzberg, A. Delcher, T. Utterback, J. Weidman, H. Khouri, J. Gill, A.
Mikula, W. Bishai, Jr W. R. Jacobs, J. C. Venter, C. M. Fraser: Whole-genome
comparison of Mycobacterium tuberculosis clinical and laboratory strains, 2002, Journal
of Bacteriology, 184, 5479-5490.
[10] J. C. Camus, M. J. Pryor, C. Medigue, S. T. Cole: Re-annotation of the genome
sequence of Mycobacterium tuberculosis H37Rv, 2002, Microbiology, 148, 2967- 2973.
[11] J. Collazos, J. Mayo, E. Martinez: The chemotherapy of tuberculosis – from the past to
the future, 1995, Respiratory Medicine, 89, 463-469.
[12] Y. L. Janin: Antituberculosis drugs: Ten years of research, 2007, Bioorganic & Medicinal
Chemistry, 15, 2479-2513.
66
[13] S. Egerszegi: A tuberculosis kezelésének aktuális problámái, 1995, Magyar Infektológiai
Társaság tudományos és továbbképző folyóirata, 2, 20-26.
[14] T. R. Frieden, T. R. Sterling, S. S. Munsiff, C. J. Watt, C. Dye: Tuberculosis, 2003,
Lancet 362, 887-899.
[15] I. M. Szabó: A bioszféra mikrobiológiája II., 1989, Akadémiai Kiadó, 927-933.
[16] H. Jatzkewitz: Peptamin (glycyl-L-leucyl-mescaline) bound to blood plasma expander
(polyvinylpyrrolidone) as a new depot form of a biologically active primary amine
(mescaline), 1955, Zeitschrift für Naturforschung, 10b, 27-31.
[17] E.F. Panarin, S.N. Ushakov: Synthesis of polymer salts and amidopenicillines, 1968,
Khim.- Pharm. Zhur., 2, 28-31.
[18] H. Ringsdorf: Structure and properties of pharmacologically active polymers, 1975,
Journal of Polymer Science, Polym. Symp., 51, 135-153.
[19] J. Kopecek, P. Rejmanova, J. Strohalm, K. Urlich, B. Rihova, V. Chytry, J. B. Lloyd, R.
Duncan: Synthetic polymeric drugs, 1991, US Patent 5,037,883
[20] P. Gottlieb, E. Hazum, E. Tzehoval, M. Feldman, S. Segal, M. Fridkin: Receptor-
mediated endocytosis of tuftsin by macrophage cells, 1984, Biochemical and Biophysical
Research Communications, 119, 203-211.
[21] N. J. Bumo, V. A. Najjar, J. Reichler: The characteristics of purified HL60 Tuftsin
receptors, 1990, Molecular and Cellular Biochemistry, 92, 77-84.
[22] P. R. Taylor, L. Martinez-Pomares, M. Stacey, H. H.Lin, G. D. Brown, S. Gordon:
Macrophage receptors and immune recognition, 2005, Annual Review of Immunology,
23, 901–944.
[23] S. M. Moghimia, A. R. Rajabi-Siahboomib: Recent advances in cellular, sub-cellular and
molecular targeting, 2000, Advanced Drug Delivery Reviews, 41, 129–133.
[24] J. L. Goldstein, Y. K. Ho, S. K. Basu, M. S. Brown: Binding site on macrophages that
mediates uptake and degradation of acetylated low density lipoprotein, producing
massive cholesterol deposition, 1979, Proceedings of the National Academy of Sciences
of the United States of America, 76, 333–337.
[25] M. Krieger, J. Herz: Structures and functions of multiligand lipoprotein receptors:
macrophage scavenger receptors and LDL receptor-related protein (LRP), 1994, Annual
Review of Biochemistry, 63, 601–637.
[26] N. Platt, R. Haworth, L. Darley, S. Gordon: The many roles of the class A macrophage
scavenger receptor, 2002, International Review of Cytology, 212, 1–40.
[27] S. Mukhopadhyay, S. Gordon: The role of scavenger receptors in pathogen recognition
and innate immunity, 2004, Immunobiology, 209, 39–49.
[28] K. J. Moore, M. W. Freeman: Scavenger receptors in atherosclerosis: beyond lipid
uptake, 2006, Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology, 26, 1702-1711.
67
[29] R. Szabó, L. Peiser, A. Plüddemann, Sz. Bősze, S. Heinsbroek, S. Gordon, F. Hudecz:
Uptake of branched polypeptides with poly[l-Lys] backbone by bone-marrow culture-
derived murine macrophages: the role of the class A scavenger receptor, 2005,
Bioconjugate Chemistry, 16, 1442-1450.
[30] R. Szabó, G. Mező, É. Pállinger, P. Kovács, L. Köhidai, Sz. Bősze, F. Hudecz: In vitro
cytotoxicity, chemotactic effect, and cellular uptake of branched polypeptides with poly[L-
Lys] backbone by J774 murine macrophage cell line, 2008, Bioconjugate Chemistry, 19,
1078-1086.
[31] V. A. Najjar: Tuftsin, a natural activator of phagocyte cells: an overview, 1983, Annals of
the New York Academy of Sciences, 419, 1–11.
[32] S. Khare, L. K. Bhutani, D. N. Rao: Quantitative assessment of tuftsin receptor
expression and second messenger during in vitro differentiation of peripheral blood
derived monocytes of leprosy patients, 1997, Molecular and Cellular Biochemistry, 171,
1-10.
[33] K. B. Bai, O. Láng, E. Orbán, R. Szabó, L. Köhidai, F. Hudecz, G. Mező: Design,
synthesis, and in vitro activity of novel drug delivery systems containing tuftsin
derivatives and methotrexate, 2008, Bioconjugate Chemistry, 19, 2260-2269.
[34] G. Mező, M. Manea, A. Jakab, B. Kapuvári, Sz. Bősze, G. Schlosser, M. Przybylski, F.
Hudecz: Synthesis and structural characterization of bioactive peptide conjugates using
thioeter linkage approaches, 2004, Journal of Peptide Science, 10, 701-713.
[35] J. Kopecek, P. Kopecková, T. Minko, Z.-R. Lu: HPMA copolymer-anticancer drug
conjugates: design, activity, and mechanism of action, 2000, European Journal of
Pharmaceutics and Biopharmaceutics, 50, 61-81.
[36] M. Sela: Chemical synthesis for the understanding of immune response phenomena and
for their medical application, 1980, In: C. Larrade, K. Wills, L. Oritz-Oritz, et al. eds.
Molecules, cells and parasites in immunology, New York, Academic Press, 215-228.
[37] M. Algamor, A. Ron, J. Bar-Tana: Chemotaxis in Tetrahymena thermophilia, 1981, Cell
Motility, 1, 261-268.
[38] G. Mező, J. Kajtár, I. Nagy, Zs. Majer, M. Szekerke, F. Hudecz: Carrier design: synthesis
and conformational studies of poly(L-lysine) based branched polypeptides with hydroxyl
groups in the side chains, 1997, Biopolymers, 42, 719-730.
[39] M. Fridkin, V. A. Najjar: Tuftsin: its chemistry, biology, and clinical potential, 1989,
Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology, 24, 1-40.
[40] C. M. Gupta, W. Haq: Tuftsin-bearing liposomes as antibiotic carriers in treatment of
macrophage infections, 2005, Methods in Enzymology, 391, 291-304.
68
[41] W. Zeng, S. Ghosh, M. Macris, J. Pagnon, D. C. Jackson: Assembly of synthetic peptide
vaccines by chemoselective ligation of epitopes: influence of different chemical linkages
and epitope orientations on biological activity, 2001, Vaccine, 19, 3843-3852.
[42] M. Manea, M. Przybylski, F. Hudecz, G. Mező: Design, structural, and immuno-analytical
properties of antigenic bioconjugates comprising a beta-amyloid-plaque specific epitope,
2008, Biopolymers, 90, 94–104.
[43] J. Shao, J. P. Tam: Unprotected peptides as building blocks for the synthesis of peptide
dendrimers with oxime, hydrazone, and thiazolidine linkages, 1995, Journal of the
American Chemical Society, 117, 3893–3899.
[44] I. P. Decostaire, D. Leliévre, H. Zhang, A. F. Delmas: Controlling the outcome of
overacylation of N-protected aminooxyacetic acid during the synthesis of an aminooxy-
peptide for chemical ligation, 2006, Tetrahedron Letters, 47, 7057–7060.
[45] C. Jiménez-Castells, B. G. de la Torre, R. G. Gallegoa, D. Andreua: Optimized synthesis
of aminooxy-peptides as glycoprobe precursors for surface-based sugar–protein
interaction studies, 2007, Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 17, 5155–5158.
[46] V. Duléry, O. Renaudet, P. Dumy: Ethoxyethylidene protecting group prevents N-
overacylation in aminooxy peptide synthesis, 2007, Tetrahedron, 63, 11952–11958.
[47] L. E. Canne, A. R. Ferré-D'Amaré, S. K. Burley, S. B. H. Kent: Total Chemical Synthesis
of a Unique Transcription Factor-Related Protein: cMyc –Max, 1995, Journal of the
American Chemical Society, 117, 2998-3007.
[48] K. Rose, W. Zeng, P.O. Regamey, I.V. Chernushevich, K. G. Standing, H. F. Gaertner:
Natural peptides as building blocks for the synthesis of large protein-like molecules with
hydrazone and oxime linkages, 1996, Bioconjutate Chemistry, 7, 552-556.
[49] S. Majumdar, S. K. Basu: Killing of intracellular Mycobacterium tuberculosis by receptor-
mediated drug delivery, 1991, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 35, 135-140.
[50] K. Horváti, G. Mező, N. Szabó, F. Hudecz, Sz. Bősze: Peptide conjugates of
therapeutically used antitubercular isoniazid – design, synthesis and antimycobacterial
effect, 2009, Journal of Peptide Science, 15, 385-391.
[51] A. F. Cunningham, C. L. Spreadbury: Mycobacterial stationary phase induced by low
oxygen tension: cell wall thickening and localization of the 16-kilodalton alphacrystallin
homolog, 1998, Journal of Bacteriology, 180, 801-808.
[52] K. Hill, C. B. Pénzes, B. G. Vértessy, Z. Szabadka, V. Grolmusz, É. Kiss: Amphiphilic
nature of new antitubercular drug candidates and their interaction with lipid monolayer,
2008, Progress in Colloid and Polymer Science, 135, 87–92.
[53] J. J. Irwin, B. K. Shoichet: ZINC − A free database of commercially available compounds
for virtual screening, 2005, Journal of Chemical Information and Modeling, 45, 177-182.
69
[54] C. M. Sassetti, D. H. Boyd, E. J. Rubin: Genes required for mycobacterial growth defined
by high density mutagenesis, 2003, Molecular Microbiology, 48, 77-84.
[55] G. Barany, N. Kneib-Cordonier, D. G. Mullen: Solid-phase peptide synthesis: a silver
anniversary report, 1987, International Journal of Peptide and Protein Research, 30, 705-
739.
[56] A. G. Grant: Principles and Practice of Solid-Phase Peptide Synthesis, 1992, Synthetic
peptides A User's Guide, Oxford, University Press, 88-96.
[57] L. A. Carpino, G. Y. Han: The fluorenylmethoxycarbonyl amino-protecting group, 1972,
Journal of Organic Chemistry, 37, 3404-3409.
[58] R. Newcomb, B. Szoke, A. Palma, G. Wang, X. Chen, W. Hopkins, R. Cong, J. Miller, L.
Urge, K. Tarczy-Hornoch, J. A. Loo, D. J. Dooley, L. Nadasdi, R. W. Tsien, J. Lemos, G.
Miljanich: Selective peptide antagonist of the class E calcium channel from the venom of
the tarantula Hysterocrates gigas, 1998, Biochemistry, 37, 15353-15362.
[59] A. K. Tickler, C. J. Barrow, J. D. Wade: Improved preparation of amyloid-beta peptides
using DBU as N alpha-Fmoc deprotection reagent, 2001, Journal of Peptide Science, 7,
488-494.
[60] J. D. Wade, J. Bedford, R. C. Sheppard, G. W. Tregear: DBU as an N alpha
deprotecting reagent for the fluorenylmethoxycarbonyl group in continuous flow solid-
phase peptide synthesis, 1991, Journal of Peptide Research, 4, 194-199.
[61] W. König, Eine neue Methode zur Synthese von Peptiden: Aktivierung der
Carboxylgruppe mit Dicyclohexylcarbodiimid unter Zusatz von 1-hydroxybenzotriazolen,
1970, Chemische Berichte, 103, 788-798.
[62] S. Mojsov, A. R. Mitchell, R. B. Merrifield: A quantitative evaluation of methods for
coupling asparagine, 1980, The Journal of Organic Chemistry, 45, 555-560.
[63] E. Kaiser, R. L. Colescott, C. D. Bossinger, P. I. Cook: Color test for detection of free
terminal amino groups in the solid-phase peptide synthesis of peptides, 1970, Analytical
Biochemistry, 34, 595-598.
[64] E. Kaiser, R. L. Colescott, C. D. Bossinger, D. B. Olser: Color test for terminal prolyl
residues in the solid-phase synthesis of peptides, 1980, Analytica Chimica Acta, 118,
149-151.
[65] K. Horváti, Sz. Bősze, F. Hudecz, H. Medzihradszky-Schweiger: A simple method for
monitoring the cysteine content in synthetic peptides, 2008, Journal of Peptide Science,
14, 838–844.
[66] T. S. Hawely, R. G. Hawely: Methods in molecular biology, Volume: 263 (2005): Flow
Cytometry Protocols, 2nd ed., Humana Press Inc., Totowa, NJ, Chapter 1, 1-33.
70
[67] J. M. Mullins: Overwiev of fluorochromes, From: Methods in Molecular Biology, Vol. 115:
Immunocytochemical Methods and Protocols, Edited by: L. C. Javois © Humana Press
Inc., Totowa, NJ, Chapter 14, 97-105.
[68] G. B. Wisdom: Conjugation of antibodies to fluorescein or rhodamine, From: Methods in
Molecular Biology, vol. 295: Immunochemical Protocols, Third Edition, Edited by: R.
Burns © Humana Press Inc., Totowa, NJ, Chapter 10, 131-134.
[69] S. Kei Lau, F. Zaccardo, M. Little, P. Banks: Nanomolar derivatizations with
5-carboxyfluorescein succinimidyl ester for fluorescence detection in capillary
electrophoresis, 1998, Journal of Chromatography A, 809, 203-210.
[70] Classic reactive fluorescent labeling dyes and their applications, ABD Bioquest, Inc., 923
Thompson Place, Sunnyvale, CA 94085. Tel: 408-733-1055; Technical Support:
http://abdbioquest.com/images/B1200d1
[71] W. Schöniger: Eine mikroanalitische Schnellbestimmung von Halogen in organishen
Substances, 1954, Mikrochlinica Acta, 1, 123-129.
[72] L. Sula: WHO cooperative studies on a simple culture techniques for the isolation of
mycobacteria: 1. Preparation, lyophilization and reconstitution of a simple semisynthetic
concentrated liquid medium; culture technique, growth pattern of different mycobacteria,
1963, Bulletin of the World Health Organization, 29, 589-606.
[73] L. Sula: WHO cooperative studies on a simple culture techniques for the isolation of
mycobacteria: 2. Comparison of the efficacy of lyophilized liquid medium with that of
Lowenstein-Jensen (L-J) medium, 1963, Bulletin of the World Health Organization, 29,
607-625.
[74] B. Lányi: Folyékony mycobacterium tenyésztésre alkalmas standard táptalaj,
Módszertani Útmutató, 1980, Budapest, Járványügyi és Klinikai Bakteriológia
[75] J. McFarland: Nephelometer: an instrument for estimating the number of bacteria in
suspensions used for calculating the opsonic index and for vaccines, 1907, Journal of
the American Medical Association, 14, 1176-1178.
[76] E. Löwenstein: Die Zachtung der Tuberkelbazillen aus dem stramenden Blute. Zentralb.,
1931, Bakteriol Parasitenkd. infektionskr. hyg. Abt. I orig., 120, 127.
[77] K. A. Jensen: Rinzuchtung und Typenbestimmung von Tuberkelbazillentamen. Zentralb.,
1932, Bakteriol Parasitenkd. infektionskr. hyg. Agt. I Orig., 125, 222.
71
Köszönetnyilvánítás
Köszönetet mondok Dr. Perczel András tanszékvezető egyetemi tanárnak, aki lehetővé
tette, hogy az ELTE Szerves Kémiai Tanszéken dolgozhassak.
Köszönöm Dr. Hudecz Ferencnek, az MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoport
vezetőjének, hogy lehetővé tette, hogy a kutatócsoportban folyó munkába bekapcsolódjak.
Köszönöm Dr. Horváti Kata tudományos munkatársnak és Dr. Bősze Szilvia tudományos
főmunkatársnak, témavezetőimnek, hogy segítségemre voltak a téma kidolgozásában és a
dolgozat elkészítésében.