はじめての医学系論文の探し方 - dl.itc.u ... · ⑤...
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2011.1- はじめての医学系論文の探し方 情報基盤センター学術情報リテラシー係
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例題1 高脂血症 に関する国内の論文を探す。
① 医中誌 Web (Ver.4)ログイン画面で、ログインボタンをクリック。 ② アドバンスドモードを選択。*検索対象年変更可 ③ 「新規検索」の検索語入力欄に 高脂血症 と入力し、検索ボタンをクリック。(適宜条件設定) ④ 検索結果の表示。(適宜、絞り込み検索等) ⑤ 文献番号をクリックすると、詳細画面が表示される。 ⑥ 本文を探すには「UT Article Link」等のアイコンをクリック。 ⑦ 画面右上の終了ボタンをクリックし、その後ログアウトボタンをクリックして終了。
はじめての医学系論文の探し方 【医中誌 Web の基本的な検索の流れ】
「ネットでアカデミック」p.22
医中誌 Web
③
入力した「高脂血症」で全項目を検索するだけでなく、
対応するシソーラス用語「脂質異常症」とその下位語 からも自動的に検索してくれる。 /TH⇒シソーラス用語(Thesaurus)を検索。 /AL⇒全項目(タイトル・抄録等)を検索。
【絞り込み検索画面】 (例: 原著論文、老人、合併症 などの条件を追加) 【注意】同じ項目内で条件を
複数選択⇒OR 検索 異なる項目間で条件を選択 ⇒AND 検索
p.6 参照
http://login.jamas.or.jp/enter.html
検索対象の 限定も可
検索対象年の変更
【同時アクセス 12】 い
【入力上の注意】 ・著者名は、姓と名前 の間にスペース不要
例) 大江和彦 ohekazuhiko ・フレーズ検索
例) “blood pressure”
検索履歴を掛け合わせて 新たな検索も可能(例: #1 AND #2)
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■補 足 <Pre 医中誌>データ
シソーラス用語などがまだ付与されていない、新しいデータ。タイトル、著者名、収録誌の情報、一部について
は抄録のみが表示。(最短で1ヶ月で掲載。正式なデータになるには4~6ヶ月程度要する。)
⑥
④
印刷、ダウンロード、メール送信、 クリップボード(一時保存&まとめ印刷)
⑤
文献管理ツールへデータを保存 (RefWorks、EndNote、EndNote Web)
検索結果一覧
【シソーラス用語】 論文の内容を表すキーワード。 専門スタッフがシソーラス(上位
語・下位語を整理した用語集)に
基づき、統一されたキーワードを
各論文に付与している。 これによって検索モレを防ぐこと
や、探したい主題の論文に絞り
込むことができる。(p.6 参照) *が付いたものは、メジャー統制
語。中心主題に付される。
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■補 足 【アイコンについて】
全文を入手するためには有料の場合もあるため、注意が必要。
■補 足 ボタンについて
・本文入手なアイコンが無かったら、UT Article Link アイコンをクリックしてください。 本文へのリンクが表示される場合もあります。 手順については、リーフレット「文献探しのヒント⑤」の p.4 をご覧ください。
東京大学 OPAC へのリンク。東大に冊子体の雑誌が所蔵されているか検索可能。
東京大学 UT Article Link ボタン。 電子ジャーナルへのリンクや、冊子体の所蔵等も確認可能。
メディカルオンラインデータベースへのリンク。 ・「FAX」⇒FAX で全文を入手可能。FAX 送信お申込画面に必要事項を入力し送信す
ると、記入した FAX 番号に全文が届く。(自宅の FAX でも OK) ・「PDF」⇒全文入手可能。
国立情報学研究所(NII)の論文情報提供データベース CiNii へのリンク。 「本文あり」⇒フルテキスト(PDF)を入手可能。雑誌によっては有料提供の場合もあり。
文献単位で PubMed とリンク。 一部の文献については、フルテキストの閲覧が可能場合もあり。
文献単位でオンラインジャーナルへリンク。 東大で契約している電子ジャーナルの場合、無料で入手可能。
文献単位でオンラインジャーナルへリンク。 東大で契約している電子ジャーナルの場合、無料で入手可能。
科学技術振興機構(JST)の電子アーカイブへのリンク。 フルテキスト(PDF)が入手可能。
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AND 検索 OR 検索 NOT 検索
① 複数検索語の掛け合わせ ② 検索対象の限定、絞り込み検索
・検索対象の限定・・・・出版年、論文の種類、研究デザイン等で限定ができます。 ・絞り込み検索・・・動物の種類、年齢、診断、治療、出版年、論文の種類等で絞り込みができます。
③ 検索項目を限定した検索
・検索語入力欄のプルダウンメニューで特定の項目を設定し、検索することが可能です。
・入力欄にタグをつけて検索することも可能です。
項目名 タグ 入力例 備考
大江和彦/au 著者名
/au
ohekazuhiko/au
所属機関 /in 東京大学/in 第一著者のみ
論文
タイトル /ti 糖尿病/ti
日本消化器外科学会雑誌/jn 収録誌名 /jn
日整会誌/jn 略称形も可(プルダウンメニューでも検索可)
統制語 (シソーラス)
/th リラクゼーション/th メジャー統制語は/mth
④ 履歴検索
・検索履歴の掛け合わせ検索が可能です。 例) #1 AND #2 ⑤ 完全一致検索
・[ ]を付けると完全一致検索が可能。不要なものがヒットするのを防ぎます。 ★完全一致の指定ができる項目は、 著者名、収録誌名、所属機関名、特集名のみです。
例) [内科]/jn 雑誌「内科」のみヒット
外科手術 not 内視鏡手術 胃癌 緩和ケア 胃癌 or 胃潰瘍
【 医中誌 Web の効果的な検索のために 】
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■ 自動的にではなく、自分でシソーラスを参照して検索に使う場合(シソーラス用語だけで検索する方法)
例題2 リラックス に関する論文をシソーラス用語を使って探す。
① 「▼候補語辞書の参照」でメニューから「シソーラス」を選択。キーワードを入力し参照ボタンをクリック。 ② 入力したことばから導き出された同義語と「見出し語」(=統制語。シソーラス用語)が表示される。 ③ 「シソーラス」ボタンをクリックすると、シソーラス用語の階層関係を確認できる。 ④ 適当なものを選んでチェックし、採用ボタンをクリックする。 ⑤ 「新規検索」の検索語入力欄にシソーラス用語が入る。検索ボタンをクリック。(以降は p.1参照)
■番外篇: こんな機能もあります 次の参考文献の雑誌タイトルの正式名称を調べる。
堀江義則, 石井裕正 : 重症型アルコール性肝炎の全国調査. 日消誌 99 : 1326-1333, 2002
①
③
⑤
②
④
対応するシソー
ラス用語へ誘導
階層(ツリー構造)
の表示
思いつくことばを入力
「リラックス」のシソーラス用語が
「リラクゼーション」であることが
わかる。
シソーラス用語が検索式に入る ので、検索ボタンをクリック。 ⇒シソーラス用語「リラクゼーション」
とその下位語「休息」が付与された
データを検索
ちょっと上級編【シソーラス用語を使った検索】
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例題3 stomach cancer(胃癌)についての英語論文を探す。
① 検索画面で検索語を入力。(必要に応じて、論理演算子(AND/OR/NOT)を半角大文字で入力。) ② Limits で適宜絞り込み条件を設定。 ③ Search ボタンをクリック。 ④ 検索結果一覧が表示される。(Display Settings で表示形式を「Abstract」などに適宜選択可能。) ⑤ 論文名をクリックすると詳細画面が開く。 ⑥ 本文を見るには、Full Text ボタンまたは「UT Article Link」ボタンをクリック。
「ネットでアカデミック」p.22
⑥
③
①
表示形式の設定
【PubMed の基本的な検索の流れ】
④
⑤
②
Limits(絞り込み)
の変更、解除
データベース側で付与 した MeSH 用語(シソーラス用語)
クリックすると、レビュー論文(総説)だけ
が見られる。
精度の高いフレーズ検索の場合は ””(ダブルクォーテーション)が必要。
例) “blood pressure” 殆どの場合は無くても自動的に検索。
著者名は「苗字 名前の頭文字(+ミドルネームの頭文字」 例) suzuki a
2002 年以降はフルネームでも検索可能 複数の検索語の掛け合わせ
例) growth hormone OR gh 論理演算子(AND、OR、NOT)は大文字
PubMed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib【東大専用入口】 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez
P
選択したデータの 保存・メール送信など ・File:データのダウンロード ・Clipboard:一時保存
(ブラウザの印刷機能で
まとめて印刷) ・E-Mail:メール送信
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肉腫?
癌腫? 癌 ?
悪性腫瘍?
■検索式の確認
シソーラス用語をマスターしよう
論文の内容を表すキーワード。専門スタッフがシソーラス(上位語・下位語を整理した用語集)に 基づいて、統制されたキーワードを各論文に付与している。 これによって検索漏れを防ぐことや、探したい主題の論文に絞り込むことができる。
例えば、ガンに関する論文を探したい 思いついたことばだけで検索すると そのことばが論文のタイトルや抄録等 に無ければ、ヒットしない。 検索モレが生じる・・
検索した後、どのような検索式が実行 されたかを Search details で確認できる。 必要なら修正して再検索。
入力した検索語(CABG)だけで検索 されいる。MeSH 用語を自動的に検索 しない場合もあるので注意。
【参考: CABG と入力して検索した場合】
MeSH=Medical Subject Headings 米国国立医学図書館作成のシソーラス。
MeSH Terms(シソーラス用語)
MeSH に基づいて付与された、論文の内容を表す キーワード。 自動マッピング機能により、適切なものがあれば、入力した検
索語だけでなく、MeSH Terms からも自動的に検索。
シソーラス用語(統制語) ◆上位語:腫瘍 (広義) ◆
◆下位語:乳癌 (狭義) :子宮癌 :肺癌 :皮膚癌
癌肉腫
ツリー構造 データベース提供側で各論文に シソーラス用語を付与 ↓ 検索モレの防止、多様な検索が可能に
悪性腫瘍
ひとつの概念に対して表現が 複数ある場合、表現を統一
精度の高い検索が
できる!
癌腫
シソーラス用語: 癌
論 文
入力した「stomach cancer」で 全項目を検索するだけでなく、 対応するシソーラス用語 「stomach neoplasms」からも 自動的に検索してくれる。
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AND 検索 OR 検索 NOT 検索
① 複数検索語の掛け合わせ
【参 考】 スペースでも AND 検索しますが、例えば egg allergy と入力するとフレーズとして検索します。 論理演算をしたい場合は、egg AND allergy と入力すると、指示が明確になります。
② 絞り込み
・Limits 機能を活用して条件を指定。文献タイプ、言語、動物・人間、性別、収録誌の種類、年齢等による 限定が可能です。
③ 検索項目を限定した検索
・特定の項目を対象に検索する場合は、タグをつけて検索します。 ★タグ検索は自動マッピング機能は働きません。
項目名 タグ 入力例 備考
shimizu t[au] smith re[au](ミドルネームあり)
smth r@[au](smith r だけをヒット) 著者 [au]
shimizu takao[au] 2002 年以降ならフルネームでも検索可
所属機関 [ad] university of Tokyo[ad] 第一著者のみ
論文
タイトル [ti] stomach cancer[ti]
british medical journal[ta] The は入れない 収録誌名 [ta]
bmj[ta] 略称形も可
出版年 [dp] 2010[dp] 2008:2010[dp] 2008/09:2010/03[dp]
出版タイプ [pt] review[pt]
MeSH [mh] stomach neoplasms[mh]
④ Advanced Search ・タグを知らなくても、プルダウンメーニューで検索項目を限定して検索することが可能です。 ・検索履歴の掛け合わせ検索が可能です。 例) #1 AND #2
⑤ 前方一致検索
・複数形のような語尾変化などに対応。★自動マッピング機能は働きません。 例) bacter* ⇒bacteria 、bacterium など bacterで始まるものを検索
*もっと詳しく知りたい方は、医学図書館作成のマニュアル「PubMed の使い方」をご覧ください。
⇒GACoS や医学図書館 HP に掲載
surgery NOT endoscope surgery
stomach cancer AND nutrition
stomach cancer OR stomach ulcer stomach cancer OR stomach ulcer
【 PubMed の効果的な検索のために 】
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① トップ画面において、「Search」のプルダウンメニューで検索対象を「MeSH」に選択。
(または More Resources で MeSH Database をクリック。) ② 検索語を入力し、Search ボタンをクリック。 ③ 検索結果の MeSH 用語一覧に適当なものがあれば、対応する Links から PubMed を選択して検索。
□1 ~□5 : MeSH 用語をクリックすると、上・下位語、関連語や Subheading(副標目)等が表示 されるので、適宜組み合わせをして検索することも可能。
対応する MeSH 用語へ誘導
選択した MeSH 用語の Subheadings(副標目)や ツリー構造の表示画面へ 組合せると、多様な検索が可能。
○①
○②
○③
Subheadings を複数選択した場合の検索方法
□1 MeSH 用語をクリック □2 Subheadings を複数選択
□3 画面右上の Sendto から、
「Search box with AND…」等で、 Subheadings をどのように組合わせるか選択
□4 画面上部に検索式が表示される (必要なら修正可)
□5 Search PubMed ボタンをクリック
□1
□3
□2
□4
□5
MeSH 用語の上位語・下位語表示 Stomach Neoplasms は最下位語と して位置づけられている。
選択した MeSH 用語 (例.Stomach Neoplasms) を 中 心 主 題 と す る 文 献 を
PubMed で検索
選択した MeSH 用語 (例.Stomach Neoplasms) で PubMed を検索
チェックを付けなければ 下位語も自動的に検索
ちょっと上級編【 MeSH 検索:シソーラス用語による検索 】
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■番外篇: こんな機能もあります 【参考】 CSLS search(PubMed に専門用語の日本語表示機能などを搭載した検索システム)
⇒http://www.csls.c.u-tokyo.ac.jp/csls-search (東京大学生命科学構造化センター)
臨床医学分野の文献を、目的の
テーマで短時間に検索するのに
便利です。 < アクセス > TOP⇒PubMed Tools ⇒Clinical Queries
雑誌の略称名から正式名称を
調べることができます。 < アクセス > TOP⇒More Resources ⇒Journals in NCBI Databases
例) 雑誌の略称名 「Mol Cancer Res」の 正式名称を調べる
① ②
③
①
②
③
この資料に関するお問合せ:東京大学情報基盤センター学術情報リテラシー係 TEL: 03-5841-2649(内線:22649) E-mail: [email protected]
論文情報(雑誌名、巻号等) から特定の論文をピンポイント
で探せます。 < アクセス > TOP⇒PubMed Tools ⇒Single Citation Matcher
例) J Allergy Clin Immunol 123(1) p.3 – 11
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