www.yildiz.edu.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html

E mail

sdgunay@gmail.com

klasik moleküler dinamik simülasyon

Atomlar arası etkileşmeler

klasik moleküler dinamik simülasyon

Amaç: Katı ve sıvı fazlarda maddelerin moleküller arası etkileşmeleri

modellemek, termofiziksel özelliklerini, statik yapısını, transport özelliklerini ve faz geçişlerini klasik moleküler dinamik simülasyon ile incelemek.

Özellikler:1. Örgü Sabiti

2. Isı kapasitesi (Sabit hacim ve sabit basınç)

3. Bulk Modülü

4. Lineer Termal Genleşme

5. Lineer Termal Genleşme Katsayısı

6. Radyal Dağılım Fonksiyonu

7. Koordinasyon Sayısı

8. Ortalama Kare Yerdeğiştirme

9. Difüzyon Sabiti

10. Hız oto korelasyon Fonksiyonu

11. Stress oto korelasyon fonksiyonu

12. Kesme Viskozitesi

Simulasyon Kutusu

Krypton Kristal Yapısı

Sıvı Yapısı

• Krypton kütlesi• Örgü sabiti• Örgü pozisyonları• Erime sıcaklığı• Ve diğer özelliklerini bulun

• http://www.ccp5.ac.uk/moldy/moldy.html• moldy.pdf dosyasını indirin• moldy.tar.gz dosyasını indirin• tar.gz dosyasını açın

• Konsole ekranında

• derleme

• çalıştırmaNot : moldy komutunun başına ./ işaretini koyun‘Bulunduğun klasörde çalıştır’ anlamına gelir.

Konsole ve editor nasıl çalıştırılır

• http://www.yildiz.edu.tr/~sgunay/sfizik/sifirdanbasla/sfizik.html