转基因生物安全性检测评估共享服务平台 ( 06dz22908 ) 实施方案及进展...
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转基因生物安全性检测评估共享服务平台 ( 06DZ22908 ) 实施方案及进展 梁婉琪 上海交通大学,上海食品药品监督所, 农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心(上海), 上海出入境检验检疫局,上海大学. 目录. 计划任务书实施方案. 专家论证意见扫描图片. 项目实施方案调整 ( 1 ). 原计划中的四个平台合并为一个平台. 样品检测服务平台. 转基因生物检测 新方法验证. 转基因生物 检测技术远程培训. 标准物质在线查询和订购平台. 转基因生物检测在线服务平台. 项目实施方案调整 ( 2 ). 风险交流 信息. +. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
转基因生物安全性检测评估共享服务平台( 06DZ22908 )
实施方案及进展
梁婉琪上海交通大学,上海食品药品监督所,
农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心(上海),上海出入境检验检疫局,上海大学
目录
计划任务书实施方案全球商业化转基因生物安全性评价和商业
化信息查询检索平台为政府、科研机构和社会公众提供服务
转基因生物检测在线技术服务平台 为上海乃至全国食品企业、政府监管提供服务;
新方法验证平台 为科研机构提供转基因生物检测方法验证服务;
转基因生物检测标准技术方法查询检索平台
服务科研机构、企业和社会公众
转基因生物检测技术标准培训平台 为政府、科研机构和企业技术人员提供远程技术培训
标准物质在线查询和订购平台 为中国乃至全球转基因生物检测机构提供标准物质服务
转基因生物安全性远程公众教育平台 提供转基因生物安全性教育服务
专家论证意见扫描图片
项目实施方案调整 ( 1 )
转基因生物检测在线服务平台
样品检测服务平台
转基因生物检测
新方法验证
转基因生物
检测技术远程培训
标准物质在线查询
和订购平台
项目实施方案调整 ( 2 )
转基因生物安全性风险交流与生物安全平台
转基因生物安全公众教育平台 + 风险交流信息
=原计划中的公共教育部分增加了风险交流信息
项目实施方案(调整后)
项目在执行过程中,将整个共享服务平台划分为 4 个子系统平台,首先独立建设单个独立的子平台,然后利用计算机数据库模块,将 4 个子平台连接成一个完整的转基因生物安全检测评估共享服务平台。
全球商业化转基因生物安全性评价和商业化信息查询检索平台 转基因生物检测技术标准方法查询检索平台 转基因生物检测在线服务平台 转基因生物安全性风险交流与公众教育平台
ENGL Rikilt数据交换共享 数据交换共享
全球商业化转基因生物安全
性评价,商业化信息检索平
台
转基因生物检测技术
标准方法查询检索平台
转基因生物检测
在线服务平台
转基因生物安全性
风险交流与公众教育平台
上海转基因生物安全性检测评估共享服务平台
普通大众相关科研机构、事业单位、企业
政府部门监管
服务对象:
项目调整后,总体结构图
示
平台提供已批准商业化的近 130种转基因植物种类、类型、主要商业化种植国家和地区、外源基因类型、外源插入载体整合情况和拷贝数、外源目的蛋白表达量、基因漂流风险、对非靶标生物影响、食品安全性评价等信息
全球商业化转基因生物安全性评价和商业化信息查询检索平台建设
数据库目前已录入:• 转基因品系共 129 条记录• 308 条插入基因信息• 30 常见基因来源、作用机理信息• 450 条商业化信息记录• 526 个各国审批文档• 51 个国家地区相关法规• 约 50 个品系包含详细的中文介绍,与环境安全性
评价信息• 检索界面已经完成,所有数据均可动态显示。
本平台已基本完成,调试中数据库地址: http://202.120.45.10:7500/database.php
下一步主要工作为:
• 数据的补充与完善,
• 发布到网上,请专家提出改进意见
数据库包含的转基因生物安全性评价和商业化信
息
基本界面
检索界面(已实现多种关键词
的联合检索)
Agbios界面
与 Agbios 的比较
平台数据库插入基因的信息
点击该基因,弹出的窗口
Agbios
较 Agbios 添加了插入元件的图示
较 Agbios 添加了大量插入基因、蛋白序列等相关信息
Agbios 关于插入基因及其表达产物的信息量较少
与 Agbios 的比较
平台数据库 Agbios
我们的数据库主要采用表格的形式,对食品安全性评价信息进行归类整理,增加了信息的条理性,更加直观、易读。
回到主结构示意图
目前检测方法主要分为核酸检测方法和蛋白质检测方法两类:其中以核酸为基础的检测方法涉及四个层次,即筛选、基因、构建和品系特异性PCR检测方法。
为了加强转基因检测方法的国际交流,本平台使用英语界面,收集了主要商业化转基因生物(大豆、玉米、油菜、棉花、马铃薯和番茄等)几乎所有公开发表的检测方法(包括文献、欧盟验证报告、中国及国际标准),并进行了详细的分类。
转基因生物检测技术标准方法查询检索平台建设
目前已基本完成,调试中
数据库已录入:• 250 对 PCR 引物信息,并进行了详尽的分类• 20 个内标准基因的基本信息• 34 条插入序列信息• 30 种蛋白检测方法• 70 条质粒信息(其中包括目前公开发表的 9 个标准分
子)• 85 条标准物质信息• 共涉及 110 篇文献• 所有功能已经实现,正在调试阶段,最后界面正在完善
中
Zein, zssIIb, hmga, Ivr1, Adh1, lec, BnACCg8, HMG I/Y, apx, lat52, sad1, sps, gos9, oriazain, UGP, hordein, acc1, PKABA1, waxy-D1, helianthinin, cruciferin, SAH7, fsACP
核酸方法
筛选特异性
基因特异性
构建特异性
品系特异性
定性
定量
chip
包括公开发表文献
欧盟验证报告
国家标准、 ISO 标准
数据库地址: http://202.120.45.10:7500/detect
基本界面
检索界面
插入元件图示
引物详细分类
标准分子信息
内标准基因及引物链接
蛋白检测方法
标准物质
自动生成的引物匹配图示
用户注册界面
网站针对普通注册用户的提
交界面
回到主结构示意图
会员服务平台总体结构:
• 平台内部信息检索功能平台内部信息检索功能• 样品检测服务样品检测服务• 新方法验证新方法验证• 检测技术培训检测技术培训• 标准分子服务标准分子服务• 相关的后台控制功能相关的后台控制功能
会员服务平台已经初步建设成功:• 网络平台调试环境已搭建好,使用 Tomcat +
MySQL + J2EE + Ajax• 目前正由上海大学派具有相关工作经验的专人负
责这一部分平台的搭建。
工作进展相关功能正在紧锣密鼓的开发之中……
• 网站架构使用 web 2.0 相关技术。• 大量使用开源组织的框架。其中使用的
struts , spring ,和 hibernate 框架,是这两年刚出现的,最新,最好的开源框架。
• 把最流行的计算机技术和我们的平台最好的结合起来。
会员服务平台主要包括:• 平台内部信息检索功能平台内部信息检索功能• 样品检测服务样品检测服务• 新方法验证新方法验证• 检测技术培训检测技术培训• 标准分子服务标准分子服务• 相关的后台控制功能相关的后台控制功能
平台内部信息检索功能平台内部信息检索功能• 利用各类互联网资源,丰富我们的平台。
在这里输入相关的文字就能检索
会员服务平台主要包括:
• 平台内部信息检索功能平台内部信息检索功能• 样品检测服务样品检测服务• 新方法验证新方法验证• 检测技术培训检测技术培训• 标准分子服务标准分子服务• 相关的后台控制功能相关的后台控制功能
样品检测服务样品检测服务• 已建立近 20种转基因生物检测技术方法• 服务上海及全国食品企业、政府监管部门。
样品检测服务(提供相关视频录像)样品检测服务(提供相关视频录像)
• 向社会各界介绍我们实验室的样品检测实 力与相关技术。并欢迎各界与我们交流合作。
• 正在制作检测方法的 DV ,届时可供大家下载,观看。
接收 (第一步 )
对照样品及网上提交相关数据
网上提交方法及相关数据
平台内部专业人员对该方法进行科学初次评估, 并建立相应文档 (第二步 )
平台组织人员对样品及方法进行检测验证(第三步 )
申请通过 协同试验(第四步 )
国外已通过多实验室验证的方法
可能需要进一步补充信息
申请者
可能需要进一步补充信息
平台为申请者提供一个项目专用账号
申请者可使用该账号查询验证实验进程
未通过重新提交申请
最终报告(第五步 )
申请未通过
书面形式
会员服务平台主要包括:• 平台内部信息检索功能平台内部信息检索功能• 样品检测服务样品检测服务• 新方法验证新方法验证• 检测技术培训检测技术培训• 标准分子服务标准分子服务• 相关的后台控制功能相关的后台控制功能
新方法验证服务新方法验证服务-------- 我们的优势我们的优势
• 与欧盟的密切合作关系• 申请单位价值 2000多万元的专业器材• 提供一套完成的 GMO 安全性检测方
法荧光定量 PCR仪( Rotorgene 3000 、 PE7300 、PE7000等)共计 6 台、 PCR超净工作台 12 台、水平电泳仪、垂直电泳仪、超低温冰箱、高速低温离心机 12套、组织培养系统 10套、样品研磨混合系统 6 套、小型温室 3 个、显微镜及成像系统 12 个、以及计算机和有关分析标准软件等转基因产品检测的设备
新方法验证服务新方法验证服务-------- 具体内容具体内容
• 可及时查看新方法验证进程• 每个合作单位都有自己的账户,可以提交他们的新方法。
• 我们实验室验证他们提交的方法。
• 并反馈验证结果。
会员服务平台主要包括:• 平台内部信息检索功能平台内部信息检索功能• 样品检测服务样品检测服务• 新方法验证新方法验证• 检测技术培训检测技术培训• 标准分子服务标准分子服务• 相关的后台控制功能相关的后台控制功能
检测技术在线或现场培训
• 在线下载我们实验室编写的, GMO 安全性和检测方法操作手册与流程。
• 在线浏览或下载欧盟的培训手册及相关视频• 欢迎各界同仁来实验室观摩、学习、交流
会员服务平台主要包括:• 平台内部信息检索功能平台内部信息检索功能• 样品检测服务样品检测服务• 新方法验证新方法验证• 检测技术培训检测技术培训• 标准分子服务标准分子服务• 相关的后台控制功能相关的后台控制功能
标准分子服务• 添置高档仪器,标准化制备标准分子。• 向全世界提供,我们实验室的标准分子信
息。并参与全球合作之中。
标准分子服务• 让公众检索我们已整理的标准分子• 可从我们平台直接获得免费产品目录• 如有需要,我们还能提供邮寄标准分子的
服务
标准分子详细信息
会员服务平台主要包括:• 新闻系统,暨公众教育新闻系统,暨公众教育• 平台内部信息检索功能平台内部信息检索功能• 样品检测服务样品检测服务• 新方法验证新方法验证• 检测技术在线或现场培训检测技术在线或现场培训• 标准分子服务标准分子服务• 相关的后台控制功能相关的后台控制功能
回到主结构示意图
风险交流与公众教育平台:
• 风险交流(新闻系统)风险交流(新闻系统)
• 公众教育公众教育
新闻系统新闻系统• GMO 的安全性,众所纷纭。• 科学引导,削除顾虑。
公众科普教育公众科普教育• 介绍上海 GMO 相关信息:• 全球转基因植物大规模商业化种植,大量涌入上海乃至全国市场,对我国农业发展和转基因产品安全管理构成了巨大挑战。
公众科普教育平台公众科普教育平台• 介绍世界各国及各个国际组织对 GMO 的态度:
Countries/Regions Type of Policy GM Content Threshold
Australia/New Zealand Mandatory 1%
China Mandatory n/a
Czech Mandatory 1%
European Union/UK Mandatory 0.9%
Hong Kong Mandatory 5%
Japan Mandatory 5%
Russia Mandatory 5%
Switzerland Mandatory2% or 3% depending on
different situations
Brazil (draft) Mandatory n/a
India (draft) Mandatory n/a
Israel (draft) Mandatory 1%
Malaysia (draft) Mandatory 3%
Korea (draft) Mandatory 3%
Taiwan (draft) Mandatory 5%
Thailand (draft) Mandatory 5%Canada Voluntary 5%USA Voluntary 5%
* Sources: International Service for the Acquisition of Agri-biotech Applications
(http://www.isaaa.org) and the United State Department of Agriculture
(http://www.fas.usda.gov)
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