3. nukleinsavak · az él ılények a pirimidin nukleotidokat aszparaginsavból és glutamátból...
TRANSCRIPT
57
3. NUKLEINSAVAK
3.0. Bevezetés
Az élı szervezet jellemzı sajátossága az önreprodukció képessége, amivel faji és
egyedi sajátosságait utódaira átörökíti. Ehhez minden élılényben van egy nagy részben
állandó, az elızı generációtól kapott információkészlet, amit a dezoxiribonukleinsav (DNS)
molekula (retrovírusoknál a ribonukleinsav: RNS) tartalmaz. A nagyon egyszerő
szervezeteknél (egyes baktériumok, kékmoszatok) a sejtben egyetlen kettıs-szálú DNS
molekula található. A fejlettebb élılényeknél több kettıs szálból álló DNS molekula
(kromoszóma) található fıleg a setjmagban (pl. az Escherichia coli baktérium sejtmagjának
DNS-e 4,7 millió nukleotidpárt tartalmaz). A Human Genom Program, mely az ember teljes
genetikai információjának feltárására irányul, és a DNS láncunk (kinyújtva 2 m hosszú
molekula) mintegy hárommilliárd nukleotidjának sorrendjét határozza meg, várhatóan a
közeljövıben fejezıdik be.
3.1. Nukleinsavak szerkezete
A nukleinsavak három komponensbıl tevıdnek össze: cukor, nitrogén tartalmú
heterociklusos bázis és foszforsav. A cukorkomponens alapján a nukleinsavakat két részre
oszthatjuk:
1. Ribonukleinsavak (RNS), D-(-)-ribózt tartalmaznak.
2. Dezoxiribonukleinsavak (DNS), 2-dezoxi- D-ribózt tartalmaznak.
CHO
OH
OH
OH
CH2 OH
CHO
H
OH
OH
CH2 OH
D-(-)-ribóz(2R, 3R, 4R)
β-D-ribofuranóz 2-dezoxi-D-ribóz β-D-2-dezoxi-ribofuranóz
O OHCH2
OH OH
HO O OHCH2
OH H
HO
58
A nukleotidokban leggyakoribb hat bázis pirimidin és purin bázisokra osztható.
Pirimidin győrőt tartalmaz az uracil, a citozin és a timin. Purin váz található az adeninben, a
guaninban és a hipoxantinban.
N
N
N
N
OH
OH N
NH
O
O
H
N
N
NH2
OH N
NH
O
O
H
CH3
N
N
NH2
O
H
pirimidin uracil: 2,4-dihidroxipirimidin
citozin: 4-amino-2-hidroxipirimidin timin: 5-metiluracil
N
N
N
N
H
1
2
34
56 7
89
N
N
N
N
H
NH2
6
9
N
N
N
N
H
O
H2N
H6
2N
N
N
N
H
O
H6
purin: imidazo [4,5-d] pirimidin adenin: 6-aminopurin
guanin: 2-amino-6-hidroxipurin hipoxantin: 6-hidroxipurin
A ribonukleinsavakban a pirimidin bázisok közül uracil és citozin fordul elı. A
dezoxiribonukleinsavak timint és citozint tartalmaznak. A purin bázisok (adenin és guanin)
mindkét nukleinsavban azonosak.
59
A felsorolt bázisokon kívül még elıfordul az 5-metilcitozin (pl. növényi sejtekben)
és N-6-metiladenin (prokariota sejtekben).
A nukleinsavakban ismétlıdı monomer részeket nukleozidoknak hívjuk. A
nukleozidokat 3',5'-helyzetben foszforsav kapcsolja össze észter kötéssel (nukleotid
egységek, 3.1. és 3.2. ábra).
A nukleotid monofoszfátok pKa értéke 1 és 6 körüli, azaz vizes közegben a
foszforsav monoészter dianionként van jelen.
3.1. Ábra.
Ribonukleotidok
Az 3.1. és 3.2. ábrákban felsoroltakon kívül néhány nukleotid jelentıs szerepet
játszik metabolitikus folyamatokban (szabályozók), vagy energiaátvivı anyagok.
O NCH2
OH OH
O
NH
O
OP
OH
OH
OO NCH2
OH OH
O
N
NH2
OP
OH
OH
O
uridilsav (UMP)
[uridin: U]
pKa1= 1,0
pKa2= 6,4
pKa1= 0,8
pKa2= 6,3
pKa1= 0,9
pKa2= 6,1
pKa1= 0,7
pKa2= 6,1
citidilsav (CMP)[citidin: C]
[adenozin: A]
adenilsav (AMP)[guanozin: G]
guanilsav (GMP)
N
N
N
N
NH2
O
OH
OH
P O
OHOH
CH2 O
N
N
N
N
O
O
OH
OH
P O
OHOH
CH2 O
H
NH2
60
timidilsav (dTMP) 2-dezoxi-citidilsav (dCMP)
2-dezoxi-adenilsav (dAMP) 2-dezoxi-guanilsav (dGMP)
O NCH2
OH
O
NH
O
O
CH3
P O NCH2
OH
O
N
NH2
OP
P
N
N
N
N
NH2
O
OH
CH2 O
N
N
NH
N
O
NH2O
OH
CH2 OP
3.2. Ábra.
Dezoxiribonukleotidok
Adenozin-5'-trifoszfát (ATP): Élı szervezetek fı energiatároló és energiaátvivı
anyaga. Különösen sokat tartalmaznak az izmok. Vizes közegben 75%-ban teljesen
disszociált formában van (pKa1 = 2,5; pKa2 = 6,5) és a négy negatív töltést viselı
képzıdmény Mg-sóként stabilizálódik.
ATP
N
N
N
N
NH2
O
O
O
P O
O
O
P O
O
O
P O
OHOH
CH2 O
61
Az ATP enzimkatalizált hidrolízisénél egy foszforsav egység lehasadásával
adenozin-5'-difoszfát (ADP) keletkezik és 30 kJ/mol energia szabadul fel. A pirofoszfát
egység lehasadása is exoterm (35 kJ/mol).
Guanozin-5'-trifoszfát (GTP): Az ATP-hez hasonló energiaátvivı szerepet tölt be a
peptidszintézisekben.
GTP
OCH2
OH OH
OP
O
O
OO
O
O
P O
O
O
P
NH2
O
N
NH
N
N
Adenozin-3',5'-ciklofoszfát (cAMP): A sejtmembránhoz érkezı információk és
utasítások továbbítását (másodlagos hírvivı) és a sejten belüli információk továbbítását
végzi. A hormonális úton (elsıdleges hírvivı) érkezı információ a sejtfal G-fehérjéiben
konformációs változást okoz, ami kiváltja az ATP átalakulását cAMP-vé. Az utóbbi protein
kinázt aktiválva egy sor enzimet aktiválhat (pl. glikogén lebontása glükóz-1-foszfáttá).
Guanozin-3',5'-ciklofoszfát (cGMP): A cAMP-hez hasonló másodlagos hírvivı
szerepet tölt be. Elsısorban sejten belüli szabályozó szerepe van.
cAMP cGMP
O
O OH
O
P
O
O
NH2
O
N
NH
N
N
O
O OH
O
P
O
O
NH2
N
N
N
N
62
Inozin-5'-monofoszfát (IMP): A purin nukleotidok bioszintézisének intermedierje. Általában
nem halmozódik fel a sejtekben, gyorsan kétlépéses folyamatban AMP-vé vagy xantozin-5'-
monofoszfáton (XMP) keresztül GMP-vé alakul.
IMP XMP
OCH2
OH OH
OP
O
O
O
O
N
NH
N
N N
N
NH
N
O
H
O
O
O
O
P O
OHOH
CH2 O
3.2. Nukleinsavak bioszintézise
Az élılények a pirimidin nukleotidokat aszparaginsavból és glutamátból képezett
karbamoil-foszfátból építik fel enzimkatalizált reakciókkal (3.3. ábra).
A purinvázas nukleotidok biosztinézise foszforibozil-aminból és glicinbıl kiindulva
összetett reakciósorral történik. A 3.4. ábrán a purin egyes atomjainak eredetét tüntettük fel.
A polinukleotidokban a nukleozid egységek 3',5'-foszforsav-diészter kötésekkel
kapcsolódnak egymáshoz. A kötés kialakítása erısen endoterm folyamat (a szabadenergia
változás +25 kJ/mol), így energia közlését igényli. A szükséges energiát nukleozid-trifoszfát
(általában ATP) biztosítja. A folyamat alapreakciója:
(2 ADP → AMP + ATP)
Nukleozid-trifoszfát → nukleozid-monofoszfát + pirofoszfát (-30 kJ/mol)
(Polinukleotidlánc)n+nukleozid-monofoszfát→(Polinukleotidlánc)n+1+H2O (+25 kJ/mol)
A polinukleinsavak instabilis molekulák de hidrolízisük katalizátor nélkül lassú. A
gyomorban található enzimek nem bontják, de a hasnyálmirigy ribonukleáz és
dezoxiribonukleáz enzimjei oligonukleotiddá bontják a vékonybélben, majd tovább
hidrolizálódnak a foszfodiészteráz enzim (foszfatáz) hatására. Végülis 5'- és 3'-
63
mononukleotidokat kapunk, amelyek tovább hidrolizálódnak, és a képzıdött nukleozidok
szívódnak fel a béltraktusból.
2 ATP + HCO3 + glutaminNH2
C
OPO3
O2
aszpartát
2 ADP + Pi+ glutamát
NH2
CNO
CH
H
CH2
CO2
COHO
karbamoil-aszpartát
N
N
O
O CO2
H
HN
N
O
O CO2
H
H- H2O foszforibozil-pirofoszfát
dihidroorotát orotát
- CO2
orotidin-5'-monofoszfát uridin-5'-monofoszfát
2
O
OH OH
OO3P
H
CO2O
O
N
N
2
N
N
O
O
H
O3P O
OHOH
O
3.3. Ábra.
Pirimidin nukleotidok bioszintézise
N
CN
C
CC N
C
N
Gly
N - formil-THF10
N - formil-THF10
Glu
Glu
CO2
Asp
N
CN
C
CC N
C
N
3.4. Ábra.
A purin atomjainak eredete
3.3. Nukleinsavak szintézise
64
A polinukleinsavak felépítése két nukleozid egység közötti 3',5'-foszforsav-diészter
kötés kialakítását jelenti.
H
O B''
O
P O
N H
CH3
CH(CH3)2(CH3)2CH
ODMTrO
O
B'
C
CH2
ODMTr
O
C
NH
O
CH2
O
Si...
2
3
O
CH3O
O
DMTr
P
O
O
B''O
B'
O
Si...
O
CH3O
O
DMTr
P
O
O
B''O
B'
O
Si...
OI2
O
O
O
P
HO
O
B''O
B'
O H
O
O
O
B'
C
CH2
HO
O
C
N H
O
CH2
O
Si...
2
3
1.C l2CHCOOH
2. NH 4OH
Cl2CHCOOH
3.5. Ábra.
Polinukleinsavak szintézise
65
Ehhez a monomerek bázisainak funkciós csoportjait (pl. NH2) védeni kell, amit
általában benzoil- vagy izobutiril-csoportok segítségével végzünk. Ugyanígy védeni kell az
egyik nukleozid 5'-helyzetében a hidroxilcsoportot. amire a p,p'-dimetoxitritil-csoportot
(DMTr) alkalmazhatjuk. A másik nukleozid 3'-helyzetében a hidroxilcsoportot aktiválnunk
kell, amit a nagyon reakcióképes foszforamidit csoport kialakításával végezhetünk. Az
eljárást a leggyakrabban használt szilárd fázisú technikával mutatjuk be (3.5. ábra).
A szintézisben az 5'-helyzető hidroxilcsoporton védett nukleozidot észter kötéssel
szilikát mátrixhoz kötjük, majd enyhén savas kezeléssel a DMTr csoportot eltávolítjuk. Az
így kialakított 5'-helyzetben szabad nukleozid származékot reagáltatjuk a 3'-helyzetben
aktivált nukleoziddal. A képzıdött dinukleozid származékot jóddal oxidáljuk, majd a DMTr
védıcsoport eltávolítása után (savas kezelés) újabb aktivált nukleozidot kapcsolunk hozzá.
Az oxidációt minden kapcsolás után el kell végezni. A szintézis végén a védıcsoportokat
lúgos kezeléssel eltávolítjuk és a polinukleotidot ammónium-hidroxiddal a szilikátról
lehasítjuk.
3.4. A DNS szerkezete
A DNS molekula lineáris szerkezető két polinukleotid láncból álló kettıs hélix (P-
helix). Elsıdleges szerkezetük alatt a nukleotidok sorrendjét értjük. Ábrázolásukat mindíg az
5'-végnél kezdjük és az alábbi egyszerősített írásmódokat használhatjuk.
P P P P OH
T A C G
5'
3' 3'
5'
3'
5'
3'
5'
pdTdAdCdG pdT-dA-dC-dGvagy
Annak ellenére, hogy a különbözı DNS-ek bázisösszetétele széles határok között
változhat, az adenin és timin, illetıleg a citozin és guanin aránya 1:1. Ugyanis a kettıs
hélixben az egyik lánc adeninje a másik lánc timin bázisával, míg a citidin a másik lánc
guaninjával képez erıs hidrogén kötéseket. A DNS két fonalát (antiparallel láncok) ezek az
A-T ill. G-C bázispárok közötti hidrogénkötések tartják össze.
66
A bázispárok tárgyalt aránya miatt a DNS összetételére elég a GC arányt megadni.
Például, GC 40%-nál a bázisok mennyisége: 20%, G, 20%, C, 30%, A, és 30% T.
A két komplementer DNS szálnál a hidrogénkötéseken kívül további stabilitást jelent
a hélix belsejében a bázisok egymásra helyezése (csomagolási hatás). Ugyanakkor
destabilizációs hatást jelent a negatív töltéső foszforészter részek kölcsönös taszítása és a
hımozgás. Ezek a kettıs spirál gyors elválását és újraképzıdését váltják ki. Magasabb
hımérsékleten a molekulák hımozgását a gyenge kölcsönhatások nem tudják ellensúlyozni
és a két szál elválik egymástól (denaturálódás). A DNS denaturálódásának hımérséklete
annál magasabb (65-75oC), mennél nagyobb a GC tartalma (a G és C bázisok közötti
erısebb hidrogénkötések miatt).
G
C
C
G
A
T
T
A
3'
5'
5'
3'
0,282 nm
N
N
N
N
N H
H
cukorvázN
N
CH3
O
O
cukorváz
H0,291 nm
1,085 nm
A
T
A T
0,284 nm
0,292 nm
0,284 nm
G C
N
N
N
Ncukorváz
N
N
O cukorváz
O
N
N
HH
HH
H
1,085 nm
G
C
3.6. Ábra.
A bázispárok között kialakuló hidrogénhidak
67
A DNS denaturálódásának hımérséklete az oldat ionerısségétıl is függ. Alacsonyabb
sókoncentrációnál a negatív töltések kölcsönös taszítása erısebb.
A kettıs spirál modelljét Watson és Crick tárta fel. A kettıs spirálban a bázisok belül
vannak és a poláros hidrofil részek (dezoxiribóz és foszfordiészter) kívül helyezkednek el. A
spirál egy fordulata 3,4 nm-enként következik be, ami 10,5 bázist érint. A molekula
átmérıje 2 nm és a bázisok közötti távolság 0,34 nm. A bázispárok ugyanabban a síkban
helyezkednek el és közel merılegesek a spirál tengelyére.
Az eredeti hélixmodell késıbb módosult. A DNS leggyakoribb úgynevezett B-
formájában a bázisok nem pontosan merılegesek a hélix tengelyére. Az eltérés mintegy 6o
(3.7. ábra).
3.7. Ábra.
A DNS B-formája
(A második ábrán az egyik láncot zöld színnel jelöltük. A harmadik és negyedik ábrák a
különálló láncokat mutatják)
68
A bázisok a hélix tengelyéhez közel helyezkednek el, és a tengely átmegy a
hidrogénkötések között. A hélix külsı részén két különbözı mélységő vájat van. Híg
oldatokban a víz a kisebb vájatba beépül. A nagyobb vájat teszi lehetıvé, hogy a bázisok
más molekulák részére hozzáférhetık legyenek.
A DNS A-formáját alacsony víztartalomnál úgynevezett mikrokristályos állapotra
észlelték. Az A-formában a bázisok a hélix tengelyétıl távolabb helyezkednek el és erısen
hajlanak a tengely felé (3.8. ábra). Ebben a formában a két vájat közel azonos mérető.
3.8. Ábra.
A DNS A-formája
(A második ábrán az egyik láncot zöld színnel jelöltük. A harmadik és negyedik ábrák a
különálló láncokat mutatják)
A DNS Z-formájában a C1'-N kötésre a konformáció — az eddigiektıl eltérıen —
szin (3.9.ábra), és a spirál balmenető (M-hélix).
Egyes DNS molekulák győrős szerkezetőek, ami akkor alakulhat ki ha egy szál (vagy
mindkettı) a végénél foszforsav diészter kötésekkel van összekötve.
69
3.9. Ábra.
A DNS Z-formája
(A második ábrán az egyik láncot zöld színnel jelöltük. A harmadik és negyedik ábrák a
különálló láncokat mutatják)
3.5. RNS Szerkezete
Az RNS molekula szerkezete — hasonlóan a DNS-éhez — három szinten
tárgyalható. Elsıdleges (primer) szerkezeten itt is a molekula 3',5'-foszfodiészter kötésekkel
összekapcsolt bázisainak sorrendjét értjük.
P P P P OH
G A U C
OH OH OH OH
pGpApUpC
pG-A-U-C
70
Másodlagos (szekunder) szerkezet alatt az RNS lánc hidrogénkötésekkel
összekapcsolt részleteit és ezekkel kialakuló térbeli elrendezıdéseket értjük. Hidrogénhidak
uracil és adenin, valamint citozin és guanin bázisok között alakulhatnak ki.
U
A
98
76 5432
1
12 3
456
N
N
N
N
NH H
O
H
O
NN
O
OH
OO
OH
O
O
O5'
4'3'2'
1'
Gyakori az U-A párhoz harmadikként uracil kapcsolódása hidrogénkötésekkel és a
C-G párhoz citozin bázis kötıdése (3.10.ábra).
Az RNS molekulában nem találunk olyan mérvő rendezettséget, mint a DNS-ben
láttunk. Egy szálon belül vagy két szál között a hidrogénkötések csak molekularészeket
kapcsolnak össze.
Az RNS tercier strukturája alatt különálló másodlagos szerkezetelemek
kölcsönhatását értjük.
71
U-A-U
C-G-C
O
OH
OO
OO
O
HO
N N
O
H
O
HH N
N
N
N
NOH
O
N
N
OH
O
O
O
O
OH
OO
N N
N
O
H
H
H
H
H
N
O
N
N
N
N
H
H
H
O
N
N
N
OO
HO
O
O
O
O
OH
3.10. Ábra.
Hármas bázispárok RNS-ban
72
A leggyakoribb harmadlagos szerkezetrészletek:
kidudorodó
Hajtő hurok
Hajtő nyél
Kettıs szál
Egyszálú rész
belsı hurok elágazó
3.6. Genetikai információ
A fajra és egyedre jellemzı genetikai kód a DNS-ben tárolódik. A DNS egy darabja
(gén) valamilyen szerepő polipeptid szintézisét irányítja RNS molekulák közremőködésével.
A DNS-ben három nukleotid (kodon) kódol egy aminosavat, vagy stop és start jelet.
A négy nukleotidnak megfelelıen 43, azaz 64 triplett lehetséges. Közülük 61 kódol
aminosavat és három megálljt jelzı triplett (stopjelek). Mivel az aminosavakkal közvetlen
kapcsolatba az RNS hozható, a kódokat a DNS komplementerjére, az RNS-re szokás
megadni (3.1. táblázat). Látható, hogy egy-egy aminosavat több triplett is meghatároz.
73
Általában az elsı két nukleotid jellemzı az adott aminosavra, a haramadik változhat.
Például, a fenilalanin szintézisét kódoló két triplett az UUU és UUC. Az aminosav
szintézisét leállító három triplett (stopjelek) UAA, UAG és UGA. A szintézis indító kódja
AUG, ami egyúttal a metionin szintézisét is kódolja.
A genetikai kód univerzálisnak mondható. Eltérést csak a mitokondriális géneknél és
kloroplasztoknál találunk. Például az emlısök mitokondriumaiban az egyébként arginint
kódoló AGA és AGG triplettek stopjelek.
3.1. Táblázat. A három betős genetikai kód
5'-bázis Középsı bázis 3' bázis
U C A G
U UUU Phe UCU Ser UAU Tyr UGU Cys U
UUC Phe UCC Ser UAC Tye UGC Cys C
UUA Leu UCA Ser UAA Stop* UGA Stop* A
UUG Leu UCG Ser UAG Stop* UGG Trp G
C CUU Leu CCU Pro CAU His CGU Arg U
CUC Leu CCC Pro CAC His CGC Arg C
CUA Leu CCA Pro CAA Gin CGA Arg A
CUG Leu CCG Pro CAG Gin CGG Arg G
A AUU lle ACU Thr AAU Asn AGU Ser U
AUC lle ACC Thr AAC Asn AGC Ser C
AUA lle ACA Thr AAA Lzs AGA Arg A
AUG Met# ACG Thr AAG Lys AGG Arg G
G GUU Val GCU Ala GAU Asp GGU Gly U
GUC Val GCC Ala GAC Asp GGC Gly C
GUA Val GCA Ala GAA Glu GGA Gly A
GUG Val GCG Ala GAG Glu GGG Gly G
* Stopjelek
# Az AUG kodon indítójel és metionint is kódol
74
3.7. DNS replikáció
A DNS két ellentétes irányultságú polinukleotid láncból felépülı kettıs hélixe,
amelyeket komplementer bázispárok (A-T és G-C) közötti hidrogénhidak kötnek össze,
DNS-polimeráz enzimek és kofaktorok jelenlétében képes szétválni és megkettızıdni.
Korábban a szétváló két DNS fonalon szimultán DNS szintézist, azaz két új kettıs
hélix kialakulását tételezték fel (3.11. ábra).
Eredetiszál
Újszál
Eredetiszál
Újszál
3.11. Ábra.
DNS kettıs hélix replikációja
Késıbb kiderült, hogy az új polinukleotid lánc szintézise csak 5' → 3' irányban folyhat. Ebbıl
következıen csak az egyik szálon folyamatos a szintézis. A másik szálon a szintézis a szétválástól kifelé
szakaszosan halad és az így képzıdött kettıs hélix darabokat a DNS-ligáz enzim kapcsolja össze. Az eukariota
DNS replikációja még bonyolultabb, a kettıs hélix több szakaszán is egyszerre kezdıdik (úgynevezett
replikációs buborékok keletkeznek).
75
(A DNS-ben tárolt információ nem folyamatos. Az értelmes szakaszokat olyanok választják el,
amelyek nem íródnak át. A nem értelmezhetı DNS szakaszok szerepét még nem ismerjük, vagy nem is
értelmezhetıek.)
C
P
T
P
C
P
T
P
A
P
G
P
G
A
G
A
OH
T
OH
P P P
5'
3'
3'
5'
templát lánc új (növekvı lánc)
O A
OH
CH2
O P O
O
O
O G
O
CH2
O P O
O
O
O T
OH
CH2
O P O
O
O
O
O
O
O
O
O
nıvekvı DNS lánc
belépı dTTP
DNS-DNS komplex
késlekedı szál
vezetı szál
szülıi DNS
5'
3'
3'
5'
3'5'
3.12. Ábra.
DNS replikáció egyszerősített ábrája.
76
Az új DNS szál kezdı szakaszának szintézisét RNS-polimeráz enzimrendszer indítja, és a képzıdött
úgynevezett indító RNS-fonal folytatódik tovább dezoxiribonukleotidok hozzákapcsolásával. A lánc eleji RNS-
t késıbb egy nukleáz enzim kivágja.
A két szál szintézisét nem ugyanaz az enzim vezérli. A vezetı szál replikációját a
δ-DNS-polimeráz végzi. Az úgynevezett késlekedı szál szintézisét az α-DNS-polimeráz
irányítja (3.12. ábra). Az új nukleotid egység kapcsolása nukleozid-5'-trifoszfáton keresztül
történik a lánc szabad 3'-poziciójához kötött hidroxilcsoporton.
3.8. Transzkripció és transzláció
A sejtek anyagcseréjét irányító fehérjék szintézise a citoplazma riboszómáin történik.
Az ehhez szükséges információt az eukarióta sejtekben a sejtmag kromoszómáiban található
DNS adja. Az információt szállító szerepet a hírvivı ribonukleinsav (messenger RNS,
mRNS) tölti be.
A mRNS néhány ezer bázist tartalmaz és minden proteinre más és más szerkezető.
Rövid élettartalmú, felezési ideje néhány perc.
átirási buborék
RNS polimeráz
polimeráz iránya
m RNS
DNS szétválik
3'
5'
5'
3'
5'
RNS-DNS hélix(kb. 12 bázispár hosszú)
3.13. Ábra.
Genetikus információ átírása
Az információ átírását (transzkripció) az RNS-polimeráz enzimek végzik (3.13.
ábra). Ezek felismerik a DNS átírható szakaszait (exonok) és indítják a komplementer
bázisokat tartalmazó RNS bioszintézisét. Az RNS szintézise is csak 5' → 3' irányban
77
történhet és a mintaszállal antiparallel kell lennie, azaz az információ leolvasása 3' → 5'
irányban folyik.
Riboszómális ribonukleinsav (rRNS) a riboszómákban található. A riboszóma
szárazanyagra számítva mintegy 60% RNS-t és 40% fehérjét tartalmaz. Viszonylag stabilis,
mintegy 1500-3000 nukleotid egységet tartalmaz. A riboszomális RNS a sejtek RNS
tartalmának mintegy 90%-át adja. A mRNS a riboszóma speciális receptoraihoz kötıdve
elindítja a proteinszintézist, ami nagyrészt az rRNS-en történik. Transzláció alatt a mRNS
molekulában hozott genetikus információ alapján történı aminosavak sorba rendezıdését
értjük a fehérjeszintézis során.
A transzfer ribonukleinsavak (tRNS) az aminosavakat szállítják a proteinszintézishez
a riboszómákban. Az RNS-ek közül a legkisebb molekulatömegőek, általában 73-94
nukleotid egységet tartalmaznak. Minden aminosavnak legalább egy tRNS-e van.
3.14 Ábra.
tRNS szerkezete.
pG
A
G
A
A
A
C
G
G
U
U
U
U
C
G
A
U
C
A
C
A
U
A
C
C
C
U U C
A
G
C
Y
A
G
A
ΨΨΨΨ
C
m22G GGG
G
D
Gm22C
C
U U
A
G
G
m5C
G U
G
C
A G
A
A
D
G A
A
m7G
G
U C
T
G
mA
C C
ΨΨΨΨ
C
D-hurok TΨC-hurok
Antikodon-hurok
Aminosav kötıhely
78
O β
OHO
C O
C
NH3
O
O
O
OtRNS
H
R
3.15. Ábra.
tRNS-hez kötött aminosav
N
N
N
N
ribóz
O
H
NCH3
CH3N2,N2-dimetilguanozin (m22G)
N
N
N
N
N
ribóz
H CH2 CH CCH3
CH3
N
N
N
N
ribóz
O
HN
N
N
N
CH3
O
ribóz
N
N
N
N
ribóz
O
CH3Adenozin
Guanozin
N6-izopenteniladenozin (i6A) 1-metiladenozin (m1 A)
inozin (I) 1-metilguanozin (m1G)
3.16. Ábra.
Bázismódosulások a tRNS-ben.
79
5-metilcitidin (m5C)
Uridin
Citidin
N
NO
O
ribóz
CH3H
N N
O
O
ribóz
HH
N
NO
NH2
ribóz
CH3
N
NO
O
ribóz
H
N
NS
NH2
ribóz
N
NO
S
ribóz
H
ribotimidin dihidrouridin (D)
4-tiouridin (S4U)
2-tiocitidin (S2C)
pszeudouridin (Ψ)
3.16. Ábra.
(folytatás)
A tRNS egyszálú, de egyes szakaszai a molekulán belüli hidrogénkötésekkel hélixé
rendezıdnek (3.14. ábra). A lóhere alakú molekulában a szállítandó aminosav a 3'-láncvég
egyik szabad hidroxilcsoportjához kapcsolódik észterként (3.15 ábra).
A tRNS-ben az információ átírás után érdekes bázis módosulások jöhetnek létre.
Közülük a leggyakrabbakat a 3.16. ábra tartalmazza.
3.9. Mitokondriális DNS
Mitrokondriumok a soksejtő élılények minden sejtjének citoplazmájában elıforduló
kettıs membránnal határolt szervecskék, amelyek fontos szerepet töltenek be a sejtlégzésben
és energiatermelésben. A mitokondriumok is tartalmaznak DNS-t és annak szerepe ugyanaz
mint a sejtmagban található DNS-é: információ tároló és átörökítı anyag.
80
A mitokondriális DNS mind méretében mind szerkezetében jellegzetesen eltér a
sejtmag DNS-étıl. Például, az ember sejtjeinek magjában tárolt DNS kettıs hélix több
milliárd bázispárt tartalmazó lineáris óriásmolekula, ami néhány százezer gént tartalmaz.
Ezzel szemben az ember mitokondriális DNS-e (mtDNS) 16569 nukleotidpárt tartalmazó
cirkuláris molekula (supercoiled), ami 37 gént tartalmaz, és közülük csak 13 kódol fehérjét.
A többi gén 22 tRNS-t és két rRNS-t kódol, amelyek a mitokondrium saját
fehérjeszintéziséhez szükségesek.
A mitokondriumok információ átadásában (öröklés) jellegzetes eltérések találhatók a
sejtmagi örökléstıl. A kromoszómális DNS (genom) az ivarsejtekben egy, a szomatikus
sejtekben két példányban található. Ettıl eltérıen egy sejtben több száz mitokondrium lehet,
és mindegyik 5-10 DNS molekulát tartalmaz, ami sejtenként mintegy ezer DNS molekulát
jelent. A petesejtben több százezer mtDNS található, a spermiumban viszont csak néhány
száz. Ez utóbbiak a megtermékenyítés után elpusztulnak. Így az utódban a mitokondriális
gének csak az anyától származnak (bizonyos tulajdonságok csak anyai ágon öröklıdnek).
3.10. Mutációk
A faji és egyedi jellegzetességek átöröklıdése a genetikai anyag állandóságán és
pontos másolásán alapul. A DNS-lánc azonban nem teljesen stabilis és megkettızıdése
során is elıfordulnak hibák. Ezeket a hibákat a sejtek javító (repair) mechanizmusai
folyamatosan javítják. Ha a hiba csak az egyik láncon fordul elı, az a megkettızıdésig még
javítható, mert a komplementer lánc még tartalmazza a helyes információt. Amennyiben a
hibajavítás a megkettızıdésig nem következik be, úgy a hiba rögzítıdik és mutáció jön
létre.
A DNS-lánc sérülése hıhatásra, ionizáló sugárzásra, UV-fényre és kemikáliák
hatására is bekövetkezhet. Hıhatásra a purinbázisok (A, G) glikozidos kötése (C1'-N)
hasadhat és úgynevezett depurináció játszódik le. A hiba gyakorisága sejtenként naponta
több ezerre tehetı. Ritkább a bázisok dezaminálódása (oxidatív dezaminálódás), ami
hıhatáson kívül ionizáló sugárzás vagy alkilezıszerek hatására bekövetkezhet. A
dezaminálódás során az adeninbıl hipoxantin, a guaninból xantin és a citozinbıl uracil jön
létre. A tárgyalt hibákat nagyrészt a korrigáló rendszerek specifikus glikozidázai javítják,
amelyek az idegen bázisokat felismerik, és glikozidos kötésük hasításával eltávolítják.
81
Gyakran megtörténik egy DNS-láncon egymás mellett elıforduló timin bázisok
[2πs+ 2 πs] cikloaddíciója ultraibolya fény hatására.
N
N N
N
CH3CH3
H H
O
O
H
O
H
dR dR
O
hν
hν
NO
CH3
H
dR H
O
O
HdR
H
CH3
ON
A C T T G C
T G A A C G
A C T T G C
T G C GA A
A dimerizáció kisebb gyakorisággal a láncon szomszédos helyzetben elıforduló
citozin bázisok és timin-citozin bázispárok között is lejátszódhat. A hiba javításakor egy
specifikus endonunkleáz felismeri a dimereket és az elsı sérült nukleotid 5'-foszfátját és a
másik sérült nukleotid 3'-foszfátját hasítva eltávolítja a láncból, majd a hiányt a β-DNS-
polimeráz a komplementer láncnak megfelelı bázisokkal pótolja. A prokarióta sejtekben egy
úgynevezett fotoaktivált enzim segítségével elkerülhetı a sérült bázisok kivágása. Az enzim
fény hatására (λ < 400 nm) aktiválódik és hasítja a két bázis közötti kovalens kötéseket.
Számos vegyület okoz károsodást a genetikai anyagban. A kémiai mutagének közül a
salétromossav dezamináló hatású. Az alkilezıszerek (dimetil-szulfát, diazometán,
mustárgáz, nitrogénmustár) a DNS egy vagy több bázisát alkilezik. Például, a guaninból
metilezı szerekkel N7-metilguanidin és/vagy O-6-metilguanidin képzıdik.
Metilezıszerekkel szemben a DNS bázisai közül legaktívabb (nukleofilabb) a guanin N7-
poziciója, ezt követi az adenin N3-as helyzete, majd az N3-pozició következik a citozinban.
Az N-alkilezés fokozza a guanin savasságát, és a keto-enol tautomériát az enol-alak
irányába tolja el. A DNS-ben a guanin keto-alakja képez hidrogénkötéseket a komplementer
82
szál citozinjával. Az N7-alkilezett fıleg enol-alakban jelenlévı molekula viszont a másik
lánc timinjével alakít ki hidrogénkötéseket, ami a replikációnál hibás információt jelent.
N
N
N
N
dRH2N
O
Hmetilezıszer N
N
N
N
dRH2N
OH CH3
N7-metil-guanilsav
+ N
N
N
N
dRH2N
O CH3
O-6-metil-guanilsav
A metilezett guaninhoz hasonló úgynevezett bázisanalógok, amelyek a természetes
bázisokhoz hasonlóak, a DNS szintézis során beépülhetnek a láncba. Például, ilyen a
timinnel analóg 5-bróm és 5-fluoruracil, vagy az adeniné a 2-aminopurin.
N
N
O
XH
O
H
N
N
N
NH2NH
X = Br 5-brómuracil 2-aminopurin
X = F 5-fluoruracil
Rendkívül erıs mutagénitást (és karcinogén hatást) fejt ki a benzo[a]piréndiol-
epoxid, ami a guanin bázis aminocsoportjával reagálva megbontja a komplementer szálak
bázispárjai közötti hidrogén-kötéseket.
enzim
O2
benzo[a]pirén
O
HO
OHHO
OH
HO
NH
N
NN
N
O
dR
H
benzo[a]piréndiol-epoxid
83
3.11. RNS örökítıanyagú vírusok
A vírusok önálló életre alkalmatlan, csak fehérje burokba csomagolt genetikai
információt hordozó részecskék. Energiatermelı és fehérje szintetizáló rendszerük nincs, így
csak élılények sejtjeiben képesek genetikai anyagjaik megsokszorozására, azaz
szaporodásra. A gazdasejt reprodukciós rendszerét és enzimjeit felhasználva replikálódnak
és genetikai anyagjukat fehérjeburokba csomagolva juttatják ki a sejtbıl.
A vírusok genetikai anyaga (genomja) eltér a magasabbrendő szervezetekétıl.
Jelentıs részüknél ugyan DNS-t találunk, azonban az lehet egyszálú vagy kettısszálú,
lineáris vagy cirkuláris szerkezető, és csak néhány száz gént tartalmaznak. Például, a
polyomavírus kétszálú DNS-t tartalmaz és mindössze hat génnel rendelkezik.
A vírusok kisebb részének genetikai anyaga RNS. Leggyakoribbak az egyszálú RNS-
genomú vírusok. Közéjük tartozik az influenzavírus, a járványos gyermekbénulás vírusa
(poliovírus) és a száj- és körömfájás vírusa. Ezek replikációjához az RNS-függı RNS
polimeráz enzim szükséges, amit a vírus genomja kódol. A replikációkor az egyszálú RNS
szálról kettısszálú RNS képzıdik, majd az új szálról az eredeti szálak másolódnak és
kerülnek fehérjeburokba. Az eredeti RNS szál egyúttal a m-RNS szerepét is betölti, ami a
replikáz enzim szintézisét és a szükséges fehérjék felépítését is végzi. Mivel az RNS-
polimeráznak nincs hibajavító enzimje, a tisztán RNS-genomú vírusoknál gyakoriak a
mutációk.
A retrovírusok (RNS-tumorvírusok) olyan egyszálú RNS-vírusok, amelyek az RNS
átírását DNS-re irányító RNS-függı DNS-polimeráz enzimet (reverz transzkriptáz) is
kódolják, és azt a fehérjeburkon belül tartalmazzák. Közéjük tartozik a human
immundeficiencia vírus (AIDS vírus) is.
A retrovírusok szaporodásánál a vírus a felületén található glikoprotein tüskéivel a
sejt receptorához kötıdik, majd a vírus és a sejt membránja egyesül. A sejt belsejébe került
vírus RNS-rıl a reverz transzkriptáz DNS másolatot készít. A keletkezett DNS-RNS hibrid
RNS része lebontódik, és a DNS megkettızıdik. A kétszálú DNS bejut a sejt genetikai
anyagába és a sejt forrásait használva a vírus RNS-ét termeli.