rを研究でどう使うか: 迷信の伝播と人類学から (kashiwa.r#1)

第1回　Kashiwa.R

Rを研究でどう使うか？～迷信の伝播と人類学から～

2011.11.11田村光平

2011年11月14日月曜日

自己紹介

•名前：田村光平•所属：理学系研究科人類学大講座•住処：本郷キャンパス理学部2号館

2011年11月14日月曜日

2つの人類学

文化人類学 自然人類学

2011年11月14日月曜日

2つの人類学

文化人類学 自然人類学

こちら

2011年11月14日月曜日

生物学の立場からヒトを研究する

2011年11月14日月曜日

文化的適応ヒトの特性・拡散の要因

http://world-heritages.com/wh14/ryuukyuu.html

2011年11月14日月曜日

生物学の立場から文化を研究する

2011年11月14日月曜日

「受け継がれるモノ」は遺伝子だけじゃない

“Beyond DNA: integrating inclusive inheritance into an extended theory of evolution”

Danchin et al. 2011. Nature Reviews Genetics

2011年11月14日月曜日

文化進化

Boyd & Richerson (1985)

Cavalli-Sforza & Feldman (1981)

2011年11月14日月曜日

（生物）進化

t

集団中の遺伝的構成の時間変化2011年11月14日月曜日

文化進化

t

集団中の文化的構成の時間変化2011年11月14日月曜日

文化進化Boyd & Richerson

(1985)Cavalli-Sforza & Feldman

(1981)集団遺伝学の理論を文化に適用

2011年11月14日月曜日

例えばこんなトピックが

•遺伝子と文化の共進化

• 乳糖分解酵素と酪農文化

• セロトニン関連遺伝子と社会の志向

•言語系統学

• 言語の分岐年代から移住過程などを推測

•文化進化実験

• 伝言ゲームによってランダムな記号列に構造が

2011年11月14日月曜日

生物学の立場からみても文化は面白い！

2011年11月14日月曜日

文化的適応ヒトの特性・拡散の要因

http://world-heritages.com/wh14/ryuukyuu.html

2011年11月14日月曜日

文化的「非適応」非適応的行動が文化によって引き起こされる

http://www.telegraph.co.uk/news/worldnews/australiaandthepacific/papuanewguinea/4159654/Woman-burned-at-stake-after-being-accused-of-witchcraft.html

2011年11月14日月曜日

非適応的文化

• 儀式、呪術、迷信、人口転換...etc

• Boyd and Richerson (1985）、Richerson and Boyd (2005）、Ihara and Feldman (2004)、Ihara (2008)

2011年11月14日月曜日

なぜ非適応的文化を研究するのか？

•進化生物学の問題→なぜ自らの適応度を下げるのか？

•文化伝達の心理バイアスの理解

2011年11月14日月曜日

ヒツジとヤギも「育ての親」を好む

“Mothers determine sexual preferences”

Kendrick et al. 1998. Nature

2011年11月14日月曜日

丙午の迷信「丙午の女は夫を食い殺す」

http://jp.123rf.com/photo_7927160_the-vampire-women-bites-the-man.html2011年11月14日月曜日

丙午の迷信• ？？？　丙午の年には火事が多い

• 1682?　八百屋お七事件（江戸）

• 1686　井原西鶴『好色五人女』（大阪）

• 1704　紀海音『八百屋お七』（大阪）

• 1726　丙午の男女共に相手を殺す→人工流産の報告

• 1726~1786?　丙午の女は夫を食い殺す

2011年11月14日月曜日

丙午の出生減少

• 60年に一度の出生減少

• 1846年　13％（0~30%）

• 1906年　7%（0~15%）

• 1966年　25%（19~36%）

2011年11月14日月曜日

丙午出生減少の地域差

出生減少大

2011年11月14日月曜日

この地域差の要因は何か？

2011年11月14日月曜日

今日のメインはRなのであんまり詳しくやりません

2011年11月14日月曜日

仮説: 丙午の出生減少と方言の距離に関係がある？

2011年11月14日月曜日

方言間距離• 方言間の単語の共有度から計算• 各県について、ある単語を使っていれば１，いなければ０をコードし

てビット列を作成

• ハミング距離（文字列の違い）を計算

• データはLi and Hasegawa (2011)から（調査は1950~1970年代）

2011年11月14日月曜日

1966年丙午の出生減少と東京からの方言間距離の相関

※「とりあえず回帰」は良い習慣ではありません

2011年11月14日月曜日

とりあえず散布図> plot(x,y)

2011年11月14日月曜日

2011年11月14日月曜日

線とか引いてみる> abline(lm(y~x))

2011年11月14日月曜日

2011年11月14日月曜日

相関係数を求めてみる> cor.test(x,y)

2011年11月14日月曜日

出力

2011年11月14日月曜日

出生減少と方言間距離の相関

•相関係数: -0.497

• p値<0.001　→　偶然では起こりそうにない

2011年11月14日月曜日

単に距離が近いところに伝達しやすいだけでは？

2011年11月14日月曜日

東京からの地理的距離との相関をみてみる

2011年11月14日月曜日

出生減少と地理的距離の相関

•相関係数: -0.382

• p値<0.0089　→　偶然では起こりそうにない

…が、文化的距離との相関のほうがスコアが良い

2011年11月14日月曜日

単に値の大小以外で議論できないか？

2011年11月14日月曜日

モデル選択> stepAIC(lm(y~x1+x2))

2011年11月14日月曜日

出力

2011年11月14日月曜日

もう少し詳しく解析したい

2011年11月14日月曜日

因果関係を推測すると

•地理的な分布で方言のパターンが形成

•方言間の距離が出生減少に影響

地理的距離 方言間距離 出生減少

2011年11月14日月曜日

因果関係を推測すると

•地理的な分布で方言のパターンが形成

•方言間の距離が出生減少に影響

地理的距離 方言間距離 出生減少

これを統計的に表現したい

2011年11月14日月曜日

パス解析> library(sem)

2011年11月14日月曜日

入力

2011年11月14日月曜日

出力

2011年11月14日月曜日

よくわからん

2011年11月14日月曜日

結果をGraphvizにつっこむ

> path.diagram(ans, "data", ignore.double=FALSE, edge.labels="values", digits=3)

2011年11月14日月曜日

パス図

2011年11月14日月曜日

空間構造を取り入れたい

2011年11月14日月曜日

空間統計> library(spdep)

2011年11月14日月曜日

空間同時自己回帰ラグモデル

• Y = ρWY + βX + e

•隣接県の出生減少の仕方が似ている

2011年11月14日月曜日

空間統計

> result<-lagsarlm(y~x,listw=W) > summary(result)aaaaaaaaaaa

2011年11月14日月曜日

2011年11月14日月曜日

空間統計結果

•隣接県で出生減少の下がり方は似ている

•空間効果を入れても方言間距離の効果は有意

•空間効果をいれたモデルのほうが良い

2011年11月14日月曜日

シミュレーション

•出生減少と距離との相関→どのような伝達ネットワークでできやすい？

2011年11月14日月曜日

2つの文化伝達モデル完全グラフモデル 星型モデル

各県が文化伝達 東京が文化伝達

伝達確率が距離に依存2011年11月14日月曜日

2つの文化伝達モデル完全グラフモデル 星型モデル

各県が文化伝達 東京が文化伝達

申し訳ありませんが時間の関係上詳細は省略させて下さいm(_ _)m

2011年11月14日月曜日

結果：相関係数の分布完全グラフモデル 星型モデル

ggplot2で作図2011年11月14日月曜日

結果：相関係数の分布完全グラフモデル 星型モデル

ggplot2で作図

こんな感じでシミュレーション終了と同時にグラフが出ます

2011年11月14日月曜日

シミュレーションまとめ•相関係数が初期状態より大きくなるのは星型モデルのみ→伝達には中心地があった？

•シミュレーションもできる、ということが伝われば…

•データ出力→統計解析→グラフ作成まで一気にできて便利

2011年11月14日月曜日

まとめ：丙午編

•出生減少と方言間の距離に相関

•説明変数同士にも関係がありそう

•隣接県で出生減少が似ている

•伝達の中心地があった可能性

2011年11月14日月曜日

まとめ：R編•相関係数（cor.test()）

•モデル選択（stepAIC()）

•パス解析（library(sem)）

•空間統計（library(spdep)）

•シミュレーション

2011年11月14日月曜日

Rの良い所•なんでもできる•統計解析

•シミュレーション

•グラフ

•勉強用の資料が豊富

2011年11月14日月曜日

やりたいこと

どうやってやるか？

勉強

ここが一番大変

2011年11月14日月曜日

やりたいこと

どうやってやるか？

勉強

ここが一番大変ここのコストを削減していけると嬉しい

2011年11月14日月曜日

ご清聴ありがとうございました

2011年11月14日月曜日