serveis cientificotècnics (sct) · 2018. 12. 17. · 2 anys 07/08 (prbb) • laboratoris comuns...

Serveis Cientificotècnics (SCT)26 de gener de 2009

2

ANYS 07/08 (PRBB)

• Laboratoris Comuns– Histologia, Microscòpia, Cultius “externs”, Cultius P2, Reveladora, Instal·lació Radioactiva

• Aparells d’utilització comuna– Ubicats en diferents laboratoris: identificador carbassa

• Centralització d’alguns serveis: – Esterilització, Criopreservació

• Posta en marxa de nous serveis:– Instal·lació i training plataforma de Microarrays

3

Direcció SCTMontserrat Torà

SecretariaJordi Manaut

QualitatXavier Palazón

Serveis d’Assessorament

PublicacióBiomèdicaMarta Pulido

AMIB (Metodologia i Bioestadística)

Sergi Mojal

Microarrays Lara Nonell

E.Puigdecanet

Criopreservació i Biobancs

Núria Somoza

EsterilitzacióMontserrat Hidalgo

Cultius i P2Xavier Mayol

Piedad Navarro

Laboratoris Comuns

Piedad Navarro

Histologia

Microscòpia

Cambra fosca i reveladora

Aparellscomuns

Instal·lacióRadioactiva

Mtorà/IHernàndez

InfraestructuresH. del Mar

Servei Patologia

Preparació Blocs d’Histologia

Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya

SKY (Cariotipatespectral)

Francesc Solé

MicrodissectorLasser

B. Bellosillo

Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta

ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT

4







Sergi Mojal


E.Puigdecanet


Núria Somoza



Piedad Navarro

Laboratoris Comuns

Piedad Navarro

Histologia

Microscòpia


Aparellscomuns


Mtorà/IHernàndez


Servei Patologia




Francesc Solé


B. Bellosillo



5

INSTAL·LACIÓ RADIOACTIVA

• Instal·lacions: cambra calenta (“hot lab”), 4 poiates radioactives en 4 laboratoris

• Accés restringit

• Formació a l’usuari

• Aplicatiu: comandes “on line”, registre i consum d’isòtops, usuaris, responsables, etc.

6

APLICATIU I.R.

7







Sergi Mojal


E.Puigdecanet


Núria Somoza



Piedad Navarro

Laboratoris Comuns

Piedad Navarro

Histologia

Microscòpia


Aparellscomuns


MTorà/IHernàndez


Servei Patologia




Francesc Solé


B. Bellosillo



8

ESTERILITZACIÓ

9

• Àrea de neteja:– Rentat i descontaminació del material volumètric (diari)– Neteja de laboratoris i equipaments

• Calendari programat: Col·laboració dels investigadors !!!– Emergències de neteja.

• Àrea d’esterilització:– Autoclavat de material volumètric (diari)– Servei d’autoclavat de solucions i tampons (diari)– Autoclavat de residus biològics

ESTERILITZACIÓ

Responsable: Montserrat Hidalgo

10







Sergi Mojal


E.Puigdecanet


Núria Somoza



Piedad Navarro

Laboratoris Comuns

Piedad Navarro

Histologia

Microscòpia


Aparellscomuns


Mtorà/IHernàndez


Servei Patologia




Francesc Solé


B. Bellosillo



11







Sergi Mojal


E.Puigdecanet


Núria Somoza



Piedad Navarro

Laboratoris Comuns

Piedad Navarro

Histologia

Microscòpia


Aparellscomuns


Mtorà/IHernàndez


Servei Patologia




Francesc Solé


B. Bellosillo



12







Sergi Mojal


E.Puigdecanet


Núria Somoza



Piedad Navarro

Laboratoris Comuns

Piedad Navarro

Histologia

Microscòpia


Aparellscomuns


Mtorà/IHernàndez


Servei Patologia




Francesc Solé


B. Bellosillo



13

ANY 2009

• Unificació i ampliació de Cultius

• Nova instal·lació de Criopreservació (biobancs) soterrani PRBB

• Posta en marxa del Servei de Microarrays (SAM)

• Programa de Gestió de la Qualitat del SCT

• Sessions SCT: Microarrays, Criopreservació, Cultius, Edició Mèdica,…

14

COMUNICACIÓ

• Rebre el feed back dels investigadors: iniciatives, propostes, necessitats,…

• Canalització de les propostes (des dels investigadors als SCT): a través dels Caps de Programa

• Informació als investigadors (des dels SCT als investigadors):

– General: a través dels Caps de Programa que n’han de fer difusió a les persones del seu grup Caps de grup investigadors i tècnics

– Específica: a través de llistats d’usuaris registrats a la I.R., Cultius, P2, etc.

15

SCT

CRIOPRESERVACIÓNúria Somoza

17

QUINS SERVEIS OFERIM?

CRIOPRESERVACIÓ

Monitoritzacióequips fred

Assignacióespais fred/

Gestió localitzaciómostres

Centralització /Repartiment gel sec

Assessorament

Transport mostres

Codificació/etiquetatmostres

BiobancsDispensació N2Len lleteres

18

MONITORITZACIÓ EQUIPS FRED

• Tots els equips estan monitoritzats mitjançant sondes externes i emissors RF (radiofreqüència).

• Les dades s’envien a un servidor on són emmagatzemades.

• Els grups interessats en tenir els registres ho poden sol·licitar per correu electrònic indicant l’equip de fred i la periodicitat en que ho volen rebre.

19

GRÀFIC DEL REGISTRES DE Tª D’UN CONGELADOR -80ºC

20

GESTIÓ DELS ESPAIS DE FRED

• Instal·lacions:– Cambra 4ºC, Cambres -20ºC, sales amb control d’accés per ultracongeladors, 2 contenidors

automàtics N2L.

• Gestió de l’espai :– Assignació espai– Ampliació espai– Nou equip fred

• Com gestionem l’espai?:– Comunicació de necessitats mitjançant el qüestionari de projectes de criopreservació– Aplicatiu criopreservació per assignar l’espai als diferents projectes

21

QÜESTIONARI PROJECTES CRIOPRESERVACIÓ

22

Gestió de l’espai

23

APLICATIU: GESTIÓ ESPAIS

24

Gestió localització mostres

25

APLICATIU: GESTIÓ LOCALITZACIÓ MOSTRES

26

Gel sec

• Centralització del gel sec que es rep en enviaments de reactius/mostres

• Repartiment als grups que ho demanin, sol·licitar-ho amb temps suficient

• Emplenat de lleteres amb N2L: sol·licitud mitjançant correu electrònic

• Obertura tancs per recollida/entrega de mostres: dimarts i dijous a les 12h

N2L

Altres serveis

27

ASSESSORAMENT

• Formació en prevenció de riscos associats a la manipulació N2L

• Transport de mostres biològiques

• Codificació i etiquetat

28

PERSPECTIVES 2009

• Noves instal·lacions: – Adequació d'àrea planta -2 dedicada a ultracongeladors per mostres biobancs.– Accés restringit

• Desplegament aplicatiu per gestionar localització mostres

*BOE número 159 de 4/7/2007 LEY 14/2007, de 3 de julio, de Investigación biomédica

29

QUI SOM I COM CONTACTAR?

• Núria Somoza:

Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona (despatx 121, costat hospital)Doctor Aiguader, 88 | 08003 BarcelonaTel. 933 [email protected]

SERVEI D’ANÀLISI DE MICROARRAYS (SAM)Lara Nonell

31

QUÈ ÉS I QUÈ FEM?

• Nou servei cientificotècnic de suport per a estudis d’investigacióbàsica, farmacogenòmica i, fins i tot, de diagnòstic

• Processat de microarrays utilitzant la plataforma tecnològica GeneChip d’Affymetrix

• Servei integrat per a estudis d’expressió gènica i de genòmica– Orientació en el disseny – Processat dels microarrays– Anàlisi de dades

• Servei prioritari a l’IMIM i PRBB però obert a altres institucions

32

Arrays humans disponibles• Human Exon 1.0 ST• GW Human SNP array 6.0

Possibilitat d’utilitzar microarrays d’altres tipus i espècies

APLICACIONS

• Arrays d’expressió– Descobriment de nous gens/biomarcadors involucrats en mecanismes complexos– Estudis de perfils d’expressió gènica, farmacogenòmica i toxicogenòmica– Classificació i models predictius de malalties complexes– Detecció de splicing alternatiu

• Arrays de SNPs– Detecció de guanys i pèrdues de regions genòmiques (cariotip molecular, LOH i UPD) – Determinació del nombre de còpies per a la detecció i diagnòstic de malalties genètiques – Genotipat de SNPs– Estudis de genètica poblacional i d’associació

• Aplicacions integrades

33

FUNCIONAMENT

Processat Laboratori

Assessorament

Sol·licitud entrevista

PressupostAprovaciópressupost

SI

NO

Anàlisi de dades

Resultats

34

QUI SOM I ON SOM?

• Responsable del serveiDra. Montse ToràEmail: [email protected]

• Responsable científicDr. Francesc SoléEmail: [email protected]

• Responsable de l’anàlisi de dadesLara NonellEmail: [email protected]

• Responsable de laboratoriEulàlia PuigdecanetEmail: [email protected]

• Despatx 166 (ext. 1577)• Laboratori 273.10.01

• Horari d’atencióDll.-DV.: 10-14hDj.: 15-18h

ÀREA DE CULTIUS CEL·LULARSXavier Mayol

36

ÀREA DE CULTIUS CEL·LULARS

280.01

280.02278P2

276274

en const

rucció

Cabines de bioseguretat 4 5 (2) 2 4 = 10 + 5

Incubadors CO2 4 6 (2) 2 4 = 10 + 6

Capacitat màxima 16-20 24-30 (?) 8-12 16-20 = 46 + 27(USUARIS)

37

• Preparació de medis de cultius.

• Test de micoplasma.

• Banc de línies cel·lulars.

SERVEIS

38




SERVEIS

39

• Comandes setmanals / quinzenals

• Medis freqüents D-MEM suplementats FBSRPMI Glutamina

PiruvatEstreptomicina + penicil·lina

• Lot homogeni de FBS ( 2 – 3 anys)

PREPARACIÓ DE MEDIS DE CULTIUS

40




SERVEIS

41

• Mycoplasma Detection PCR Kit ( Minerva – LabClinics ).

• 1 test / setmana.

TEST DE MICOPLASMA

42




SERVEIS

43

BANC DE LÍNIES CEL·LULARS

• Projecte dins la xarxa del FIS RTICCC ( 2004 ).

• 150 línies cel·lulars congelades en N2 líquid.

• Qualitat:– Passatges primerencs.– Origen i manteniment.– Micoplasma.

• Entrega de vials congelats 2 dies / setmana.

• 140 usuaris enregistrats.

44

WEB BANC DE LÍNES CEL·LULARS

• http://blc.imim.es

45

QUI SOM i ON SOM?

• Responsable: Xavier Mayol (Programa de Recerca de Càncer)

• Tècnic del servei: Piedad Navarro (SCT)

SERVEI D’ASSESSORAMENT BIOESTADÍSTIC (AMIB)Sergi Mojal

47

SERVEIS QUE S’OFEREIXEN

• Assessorament en el disseny de protocols

• Estimació de la grandària de la mostra

• Generació de llistes d'aleatorització

• Disseny, maneig i control de qualitat de bases de dades

• Anàlisis estadístiques amb programari SPSS, R o d’altres segons convingui

• Generació de gràfiques

• Assessorament en comunicacions i publicacions

48

EXEMPLE DE GRÀFIC

49

DADES DE CONTACTE

• Responsable Sergi Mojal

• Localització: despatx 160

• Tel. +34 93 316 06 34, extensió 1634

• Correu electrònic: [email protected]

SERVEI D’ASSESSORAMENT EN PUBLICACIONS BIOMÈDIQUESMarta Pulido

51

SERVEI INTEGRAL DE LA PUBLICACIÓN BIOMÉDICA QUE INCLOU TOTES LES ETAPES DEL PROCÉS DE PUBLICACIÓ

• Valoració de les possibilitats de publicació d'un manuscrit a la literatura internacional i nacional

• Traducció inversa i directa de texts biomèdics especialitzats en: espanyol, català i anglès

• Cerques bibliogràfiques

• Correcció editorial del text (editing)

• Assessorament i cerca de la revista adient

52


• Preparació de la versió final del manuscrit d'acord amb les normes de la revista

• Model de carta al director de la revista per tal de presentar el manuscrit

• Acompliment de formularis: conflictes d'interès, copyright, autoria, separates, etc.

• Valoració de les crítiques del peer review i cartes de resposta als revisors

• Recursos d'Internet i publicació d'articles biomèdics

53


• Comprovació de referències bibliogràfiques amb la font original

• Disseny de taules i figures

• Tramesa del manuscrit per Internet (sistemes tipus Manuscript Central)

• Llistes de comprovació segons el disseny de l’estudi (CONSORT, STROBE, etc.)

54

FUNCIONAMENT

• Divendres, de 8,30 a 17,00 hores

• Resta de dies contactar per correu electrònic o telefònicament al 93 2007189 y 607732221

55

• Dra. Marta Pulido

• IMIM, despatx 160

• Telèfon 93 3160604

• Correu electrònic:

• [email protected] y [email protected]

RESPONSABLE DEL SERVEI

EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT ALS SCTXavier Palazón

57

EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT DELS SCT

Quin sistema?Norma ISO 9001:2008

• Què és això?És un sistema que gestiona informació.La informació està continguda en registres (suport paper o electrònic)Els registres estan definits en uns documents que anomenem PNT

• Per a què serveix aquesta informació?Per saber si es treballa en les millors condicionsPer corregir i prevenir problemes Per millorar l’organitzacióPer millorar la prestació de serveis

58

• Què demana que facin els usuaris dels SCT- Col·laboració en el seguiment de la normativa establerta- Participació en els Grups de Millora que es crearan- Adaptació al canvi

EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT DELS SCT

59

QUÈ ÉS EL CICLE DE MILLORA CONTINUA?

Revisióde la direcció

Prestacióde servei

Medició, Anàlisii Millora

Planificació i Gestiódels recursos

USUARISCLIENTS

RequisitsNecessitats

USUARISCLIENTS

SatisfaccióNecessitats

TORN OBERT DE PREGUNTES

serveis cientificotècnics (sct) · 2018. 12. 17. · 2 anys 07/08 (prbb) • laboratoris comuns...

Documents