人类 y 染色体的遗传特性

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人类 Y 染色体的遗传特性. 周 作 民 南京医科大学 生殖医学江苏省重点实验室. 染色体的基本概念 一、正常人的染色体核型:   男性: 46,xy; 女性: 46,xx 二、染色体与遗传的关系:. Y 染色体的结构特点 一、体细胞的 Y 染色体分带 1. Y 染色体的形状指标: (1) 相对长度:即每一个染色体的长度与一套正   常的含有一个 X 染色体的单倍体染色体组长度 之比; (2) 着丝粒指数:用短臂的长度对染色体的长度 之比表示; (3) 臂比:用长臂与短臂的长度之比表示; - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: 人类 Y 染色体的遗传特性

人类人类 YY 染色体的遗传特性染色体的遗传特性

周 作 民周 作 民南京医科大学南京医科大学

生殖医学江苏省重点实验室生殖医学江苏省重点实验室

Page 2: 人类 Y 染色体的遗传特性

染色体的基本概念

一、正常人的染色体核型:  男性: 46,xy; 女性: 46,xx二、染色体与遗传的关系:

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Y 染色体的结构特点

一、体细胞的 Y染色体分带1. Y 染色体的形状指标:(1) 相对长度:即每一个染色体的长度与一套正  常的含有一个 X染色体的单倍体染色体组长度 之比;(2) 着丝粒指数:用短臂的长度对染色体的长度 之比表示;(3) 臂比:用长臂与短臂的长度之比表示;  其中又以相对长度和着丝粒指数较为重要。

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表1 染色体的相对长度和着丝粒指数染色体号码      相对长度     着丝粒指数1 8.44±0.433 48.36±1.1662 8.02±0.397 39.23±1.8243 6.83±0.315 46.95±1.5774 6.30±0.284 29.07±1.8675 6.08±0.305 29.25±1.6556 5.90±0.264 39.05±1.6557 5.36±0.271 39.05±1.771x 5.12±0.261 40.12±2.1178 4.93±0.261 34.08±1.9759 4.80±0.244 35.43±2.59910 4.59±0.221 33.95±2.24311 4.61±0.227 40.14±2.32812 4.66±0.212 30.16±2.33913 3.74±0.236 17.08±3.22714 3.56±0.229 18.74±3.59615 3.46±0.214 20.30±3.70216 3.36±0.183 41.33±2.7417 3.25±0.189 33.86±2.77118 2.93±0.164 30.93±3.04419 2.67±0.174 46.54±2.29920 2.56±0.165 45.45±2.52621 1.90±0.170 30.89±5.00222 2.04±0.182 30.48±4.932y 2.15±0.137 27.17±3.182

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2. Y 染色体的分带:  根据染色特性或功能,可对 Y 染色体进行区带划分。(1) 染色分带法:Y 染色体的短臂和长臂各只有一个区,Yp: Yp1: Yp11 Yq: Yq1: Yq11: Yq11.1 Yp12    Yq11.2: Yq11.21 Yp13:Yp13.1 Yq11.22 Yp13.2 Yq11.23 Yq12

(2)7 区分带法:  将 Y 染色体从短臂至长臂的非重组区域人为地分为 7 个区间( interval ), Yp 有 4 个区间,Yq 有 3 个区间 , Yq 的异染色质区为第 7 区,每个区间又可进一步细分,共可分为 43 个亚区间

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SRYZFYMIC2TP2

AMELYTPSY HY IL9R

AZFb(YRRM1)AZFdAZFc(DAZ)

GCYAZFa (USP9Y , DBY)

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二、精子染色体分析

1. 生精细胞染色体分析:实际分析的是处于分裂

阶段的生精细胞。

2. 体外受精后的染色体分析:将人精子与去透明

带仓鼠卵共同培养 , 诱导有丝分裂后则可进行

精子染色体的分析。

3. 用 FISH 方法也可对精子染色体进行单独分析。

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Y 染色体的基因组结构一、染色体的基因组:一、染色体的基因组:1. 1. 是人类细胞全套遗传物质,是维持人体正常功能的是人类细胞全套遗传物质,是维持人体正常功能的 最基本的一套染色体及其携带的全部遗传信息。最基本的一套染色体及其携带的全部遗传信息。2. 2. 单倍体人类基因组是由单倍体人类基因组是由 3.2×103.2×1099bpbp 的的 DNADNA 组成,细胞组成,细胞 核基因组中核基因组中 90%90% 左右的左右的 DNADNA 为程度不同的重复序列,为程度不同的重复序列, 10%10% 为单拷贝序列。为单拷贝序列。3. 3. 含有含有 55 ~~ 1010 万个左右的基因。万个左右的基因。二、人类基因组计划:构建每条染色体的遗传图谱、物理二、人类基因组计划:构建每条染色体的遗传图谱、物理  图谱和序列图谱。  图谱和序列图谱。  原计划  原计划 20032003 年完成人类基因组全部序列测定的目的,年完成人类基因组全部序列测定的目的,已于已于 20002000 年年 66 月提前完成。月提前完成。  进行  进行 YY 染色体基因组研究,包括序列测定的主要机构染色体基因组研究,包括序列测定的主要机构是是 Whitehead Institute/MITWhitehead Institute/MIT 。。

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1. 遗传图谱( Genetic map ):又称连锁图谱 linkage map )或遗传连锁图谱( genetic linkage map ):(1) 定义:指人类基因组内基因以及专一的多态性 DNA 标记位置的图谱。表示同一条染色体的任意两点 的相对距离和位置关系,因此遗传图谱只能显示 标记的相对距离,长度单位用厘摩 (centimorgan, cM) 表示, 1cM约等于 1000000碱基对的物理长度构。(2) 遗传图谱的意义:①基因定位②分离和克隆新基因

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2.物理图谱( Physical maps ):(1) 定义:物理图谱则是把特异的 DNA 片段按实际的物 理位置进行排序,因为人类基因组有 24种不同的 染色体( 23种常染色体和 X、 Y染色体),所以完 整的人类基因组图谱应该是 24种以线性结构形成 存在的 DNA 大分子物理图谱。(2) 基于 DNA 序列标签( sequence-tagged-site, STS ) 的物理图谱:① 定义: STS 为随机地从人类基因组上选择出来的长度 在 200 ~ 300bp 左右的特异性短序列。②来源:a. 随机位点序列b. 表达基因序列c. 遗传标记序列

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③研究现状:  目前全基因组中已知的 STS 达 3 万多个, Y 染色体上只有 376 个。  在 1995 年召开的第二届国际 Y 染色体基因图谱大会上,部分学者提出了在一些区域上的 STS 图谱,如在 Yp 的假性常染色质区列出了 60 个 STS ; AZFa区域图谱, Yq11.23 区域图谱等。

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YRRM1DYS7EDYS230DYS224DYS226DYS7CDYS233DYS232DYS1DYS236DYS237DYS238DYS240DYS239DYS247Z1

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(3)STS缺失图谱:   Vollrath   1992 年构建了 Y 染色体的 STS 缺失图谱,共列出 182 个 STS 片段,为今后寻找 Y 染色体功能基因创造了条件,近年来对于精子发生基因的研究多基于这一图谱。3. 序列图谱( sequence maps ):(1) 定义:将每条染色体的 DNA 序列测定出来,即为序     列图谱。(2) 序列图谱的构建的意义:①从 DNA 的序列中,可以直接推出基因的结构,包括启 动子、外显子、内显子等。②已知基因的定位。③基因起源的研究。

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Y 染色体基因相关信息数据库

国际上的四大生物信息中心:美国的国家生物技术信息中心( WCBT )美国的基因组序列数据库( GSDB)欧洲的分子生物实验室( EMBL)日本的 DNA 数据库( DDBJ)Y染色体的相关信息,从这些机构可以获得:The Cambridge (UK) server :

http//www.path.cam.ac.uk/The london server:

http//www.gene.ucl.ac.uk/Tcambridge (USA) server:  

http//www.genome.wi.mit.edu/

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  有关 Y 染色体上 STS 、 EST 、 CpG 和细胞遗传信息也可从以下综合数据库中获得:STS 数据库 (dbSTS) :   http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbSTSEST 数据库 (dbEST) :

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbESTCpG 岛数据库 (CpG island datebase)   

http://biomaster.uio.no/CpGdb.html细胞遗传图谱 (cytogenetic maps)

http://gdbwww.gdb.org/

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人类 Y 染色体的主要功能基因

Y 染色体基因的特点:1. 不是维持生命所必须的,但与男性的特异功能有关2. Y 染色体上 95% 为非重组区,多数为非等位基因。3. 基因的含量: Y 染色体上约含 5.9 万 Kb 的 DNA ,其 中 60 %位于其长臂( Yq )的异染色体区 Yq12 ;其短 臂( Yp )约含 1.3Kb DNA 。预测 Y 染色体上共有  7117 个基因;已克隆出的基因有 200 多个;真正被确 定的只有 50 多个。

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(一 ) 睾丸发生相关基因:1. H-Y 抗原基因:2. ZFY 基因:3. SRY 基因:( 二 ) 精子发生相关基因:1. 精子发生相关基因在 Y 染色体上的分布:   Y 染色体长臂三个区域内均存在 AZF ,分别称为 AZFa 、 AZFb 和 AZFc 。 1999 年, Kent-First 又提出了 AZFd 的概念,认为在该区域内也有精子发生基因的存在。

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(1) AZFa 的候选基因:   AZFa 位于 Yq11 或7区分法的第 5C/D 区中, 大小约 400-600Kb ,目前在 AZFa 区域中已发现 9 个基因,其中 UPS9Y 和 DBY 被认为是 AZFa 的重要候选成分。 ①USP9Y ( Ubiquitin-Specific Protease 9, Y chromosome ):原称为 DFFRY ( Drosophila fat factors related Y ),位于 Yq11 或 7 区分段法的 5C/D 区; 对无精子症和严重少精子症患者进行这些位点的检测,发现了缺失的病例,均表现为无精子症。发生率较低( 1/143 ~ 1/576 ) ; 已发现一例患者的 USP9Y 有 4 个碱基的丢失,伴有严重少精子症,提示 USP9Y 的点突变或缺失也可能是精子发生障碍的病因。

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②DBY ( DEAD/H box polypeptide, Y chromosome ):    位于 Yq11 或 5C/D 中,其 5' 端距 USP9Y 的3' 端约有 DBY 的缺失率为 4.6% ( 8/173 )。睾丸活检发现,单纯 DBY 缺失的 6 例患者中, 3 例表现为唯支持细胞综合症,另 3 例为生精阻滞。检测这些患者的父亲和兄弟,均未发现缺失情况。对小鼠体内 Dby 的缺失可导致小鼠精子发生障碍,证明了 DBY 对生精的重要性。

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(2) AZFb 的候选成分:   AZFb 位 Yq11.23 区域,主要候选成分为 RBM

( RNA binding motif )基因, RBM 是一组基因的总称,其共同特点是表达蛋白上带有 RNA 结合位点,认为这种蛋白参与 RNA 的形成、加工和翻译, RBM

在  Y 染色体上也有多个拷贝,其中部分是假基因,位于 Yq11.23 区域的 YRRM 被认为是 AZFb 的重要候选成分。

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(3) AZFc 的候选成分:   DAZ:   1995 年, Reijo 等人发现,已证明为 A

ZF 最重要的候选成分。(4) AZFd :   1999 年, Kent-First 等人提出;位于 AZFb 和AZFc 之间; 精子发生障碍患者中的缺失率达到 5% ,占 AZF 缺失总数 的 19.6% ,  至今为止尚未找到该区域内的 AZF 候选成分。

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(5) TSPY ( testis-specific protein, Y - edcoded ):   位于 Y 染色体短臂上;用 TSPY 的抗血清检测,显示 TPSY 主要出现于精原细胞阶段, TSPY 的作用是参与 DNA 的复制,也有报道, TSPY 的表达可出现于精子细胞阶段,可能参与精子的变态。 TPSY 的缺失可导致精子发生障碍,而在生精细胞肿瘤中, TS

PY 呈高表达,提示 TSPY 与胚胎性腺肿瘤也有相关性。

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2. AZF 缺失的发生率:从 2.7 - 55.5% ,多数在 13 -15% 。造成缺失率差异的原因:①病例选择,对于严格选择病例仅对不明原因的无精子 症或严重少精子症患者进行检测,则缺失率较高;②实验方法包括实验条件的好坏,影响到结果的可靠性;③检测不同的候选成分也会得出不同的缺失率,如仅检 测 DAZ 基因,则缺失率较高;④人种差异,如欧洲人有 YRRM2 基因,日本人则没有。

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3. AZF 缺失与睾丸病理的关系:  对 AZF 缺失伴精子发生障碍的患者进行睾丸活检,发现睾丸的病理改变与 AZF 丢失部位有明显的相关性:AZFa 缺失――唯支持细胞综合征或早期的生精阻滞。AZFb 缺失――生精阻滞,主要停留在精母细胞阶段。AZFc 缺失――生精小管内部分仅见支持细胞,部分        可见精原细胞、精母细胞、精子细 胞甚至精子。

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4. AZF 的传代问题:可以传代,而且不影响子代的 生长发育,但男性子代仍是 AZF 缺失患者。5. AZF 的检测方法:(1) 特异探针进行 Southern Blot

(2) FISH 方法(3) PCR 方法(4) 多重 PCR 方法