2013/10/25

第25回統合DBミーティング Integrated DB MTG in NIBIO

本日の予定

•  Sagace ‒ アクセス解析 ‒ Sagaceに追加するDBについて ‒ 進捗報告

• 医薬基盤研内のデータのRDF化 ‒ 進捗報告

• 厚生労働科学研究成果データベース ‒ カタログ化について

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アクセス解析

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アクセスの傾向と今後の対策 •  全般的なアクセス数が減っている •  リピーターの割合はほとんど変わらない。 •  ただ，定期的に利用してくれているユーザーは存在する

•  リピーターを増やしたい（前回と同じ） ‒  DBごとの検索結果の提示でどのDBが本当に意義を感じる人が多いのかを調べる。

‒  厚労関係の文書系のDBを増やすので，それらの傾向を掴む。

‒  １つのDBを固定する検索機能の追加で様子を見たい。

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追加予定のDBについて

ファセット分類／データベース名

動物用医薬品データベース

副作用情報 データベース metabolomics.jp

データベースの種類

文献・用語集・辞書

文献・用語集・辞書 文献・用語集・辞書

生物種 動物 （ヒト以外）

動物 （ヒト以外） 植物，特定生物なし

生体の階層 化合物 化合物 その他の生体分子 分類 A A B

進捗報告 •  DBカタログのメタデータの反映

•  Gene Symbolのリンクを作成 •  RDFa Lite クローラーの作成（途中） ‒  http://sagace.nibio.go.jp/translation/rdfalite.php

•  インデックスの作成 ‒  医師法，薬事法，病原体検出マニュアル，生物学的製剤基準，薬事法

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医薬基盤研内のDBのRDF化

• 実験動物研究資源バンク ‒ 理研哺乳類統合データベースをもとにサンプルを作成中

• 希少疾病用医薬品 ‒ サンプル版は完成。新規データについてはダイナコムにRDFの出力を依頼。

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厚生労働科学研究成果データベースのカタログ化 •  2010年：162件 (5件調査済み），2011年：147件，2012年：201件 ‒ １人60件？（8人の場合）　

• 調査項目：DBの有無，カタログに収録済，NBDCID，DB名，URL，備考，調査済

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今後の予定 •  10月 ‒  生命医薬情報学連合大会

•  11月 ‒  実験動物バンクのRDF化 ‒  外部データベースとの連携

•  12月 ‒  分子生物学会

•  1月 ‒  BioHackathon　国内版

次回

•  11月19日（火）？