2013/12/20

第27回統合DBミーティング Integrated MTG in NIBIO

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本日の予定 •  Sagace ‒  アクセス解析 ‒  進捗報告 ‒  Sagaceに追加するDBについて ‒  検索結果画面のDB毎の表記について

・医薬基盤研内のデータのRDF化 ‒  進捗報告

•  厚生労働科学研究成果データベース ‒  調査報告と分担について

•  分子生物学会年会 ‒  反省と今後の対策について

•  今後の予定　

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アクセス解析(11月） Google Update?

MEDALS メンテナンス

データベース順位 (11月）

1 特許 17600 2 医学・薬学予稿集全文データベース 2900 3 メルクマニュアル 2900 4 ゲノムネット医薬品データベース 2900 5 お薬110番（ハイパー薬辞典） 2400 6 医療情報サービスMINDS 2300 7 ここカラダ お薬辞典 2100 8 メルクマニュアル家庭版 1700 9 「健康食品」の素材情報データベース 1500 10 動物用医薬品データベース 1400

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進捗報告（開発版にて） •  追加予定のデータベースのインデックス作成完了 ‒  感染症の情報 ‒  感染症流行予測調査 ‒  感染症発生動向調査　週報 (IDWR) ‒  病原体検出マニュアル ‒  生物学的製剤基準 ‒  国際化学物質安全性カード ‒  薬剤分類情報閲覧システム ‒  PRIGEN ‒  薬事法 ‒  医師法

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進捗報告

• メタデータの対応 ‒ 文献と組織 (Organization)

• クローリングの自動化 6

検索結果画面のDB毎の表記について

• 現状のHyperEstraierだとDB毎の表記は可能だが，DB内のトップの一件しか抽出することが出来ない。 • 目的の機能の実装を試みると速度の大幅な低下が見込まれる • Apache Solrで可能かどうか調査中

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一件ずつ表記

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現状

Sagaceに追加するDBについて

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ファセット分類／ データベース名

CELLPEDIA (Repository database for current knowledge about human cells)

データベースの種類 その他のデータベース

生物種 ヒト

生体の階層 細胞・組織

分類 B

Sagaceに独自に追加するDBについて •  JAPIC ‒ 添付文書検索 ‒ 臨床試験情報検索

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医薬基盤研内のデータのRDF化

• 実験動物資源研究バンク ‒ 松田さんとMTG ‒ RDF化開始

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厚生労働科学研究成果データベースの調査について •  1エントリ1人調査 ‒ 1人55件程度

•  1エントリ2人調査 ‒ 1人120件程度

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分子生物学会の反省 　ブースについて • 事前準備の不足点 ‒ 各システムについての概要と背景の共有 ‒ ひと通りの操作やUse Caseの共有

• 当日対応について ‒ どのような点が難しいかを詳しく聞くことで機能の改良に活かせるのではないか

• シフトについて

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今後の予定 •  1月 ‒ 実験動物バンクのRDF化 ‒ 外部データベースとの連携 ‒  BioHackathon　国内版（1月27日～31日）

次回

•  1月23日（木）？

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