sci finder与生物医药研究(北京)

SciFinder®: Part of the process™2006 Edition

SciFinder 与生物医药研究

秦亚宜 2006 年 6月 10日

CAS Representative


Agenda

• SciFinder 背景介绍

• SciFinder 如何协助生物医学研究

• 实例


CAS （化学文摘社）成立于 1907年


位于俄亥俄洲 Columbus ，毗邻俄亥俄州立大学

CAS 为美国化学会（ ACS ）的分支机构


目前有将近 1300 名员工

编目人员都有博士以上学历，都是各自领域的专家


CAS 的数据库是由科学家建构的

Divya Soares分子生物学 & 遗传学

Ph.D., Microbiology,

The Ohio State University

CAS Editorial Team represents:50 种语言150 个国家


CAS 主要产品


CA 80 小类• 应用化学和化学工程类• 仪器和设备• 单元操作和加工• 工业无机化学• 推进燃料和炸药• 矿物燃料，衍生物和相关产品• 电气化学，放射物和热能技术• 矿物学和地质化学• 提炼冶金学• 黑色金属和合金• 有色金属和合金• 陶瓷• 水泥、混凝土和相关材料• 空气污染和工业卫生• 废物整治和处理• 水• 香精油和化妆品• 药剂学• 药剂分析


• 合成高聚合物化学• 合成高聚合物物理属性• 塑胶生产和加工• 塑胶构成和使用• 合成人造橡胶和天然橡胶• 织物和纤维• 染料、有机色素、荧光发光剂，

照相感光剂• 涂层、墨水及其相关产品• 纤维素、木质素、纸张和其他木

制品• 工业碳水化合物• 工业有机化学、皮革、脂肪、和

石蜡• 表面活性物质和清洁剂

• 普通物理化学

• 表层化学和胶质

• 催化作用，反作用动力学，无机反应结构

• 相位平衡，化学平衡和溶液

• 热力学、热化学和热属性

• 原子能现象

• 原子能技术

• 电气化学

• 光、电子和质谱学，其他相关性质

• 放射化学，光化学，照相和复印程序

• 结晶学和透明水晶

• 电现象

• 磁力现象

• 无机化学制品和反应

• 无机分析化学

• 有机分析化学

高分子化学类物理化学、无机化学和分析化学类


• 药理学• 哺乳类生物激素• 生物化学遗传学• 毒物学• 农业化学生物标准• 普通生物化学• 酶• 放射性生物化学• 生化系统• 微生物、藻类、菌类生物化学• 植物生物化学• 非哺乳类生物化学• 哺乳类生物化学• 哺乳类病理生物化学• 免疫化学• 发酵和生物工业化学• 食品和饲料化学• 动物营养• 化肥、土壤和植物营养• 历史、教育和文献资料

• 普通有机化学• 物理有机化学• 脂肪族化合物• 脂环族化合物• 苯，及其衍生物，浓缩苯型化合

物• 生物分子及其合成模拟• 杂环化合物（一个杂环原子）• 杂环化合物（一个以上杂环原子

）• 有机金属和有机金属化合物• 萜烯• 生物碱• 类固醇• 碳水化合物• 氨基酸，缩氨酸，蛋白质

生物化学类有机化学类

CA 80 小类


SciFinder在生物医药研究中的应用

• SciFinder– 是一个世界上最大的科学文献数据库

• 文摘数据库• 物质和序列数据库• 反应数据库

– 在中国文献的收录数量方面， SciFinder 是其他任何一个数据库的两倍以上

– 有一个独特的检索界面，使查询者得到更好的检索结果

– 有一个独特的分析工具，帮助查询者及时找到自己真正需要的文献

内容

查询方式

分析功能


SciFinder

• SciFinder 包含以下 6 个数据库– CAplus ( 文献 )– Medline ( 文献 )– Registry ( 物质 )– CASREACT ( 反应 )– Chemcats ( 商来源业 )– Chemlist ( 管制品 ) reaction display

• 对于科学家和研究人员来说， SciFinder 是世界上最重要的信息检索工具。


CAplus 文献数据库

• 涵盖 CA 所有的内容，上百万条回溯到 1900年以前，超过 2500万条记录， 94 ％以上都有详细摘要信息；

• 来自 9500多种期刊（ 50多种语言， 150多个国家）， 50多个专利组织的专利信息。

• 需要注意，收录的文章涵盖了药理学如毒理、药物代谢， Structure-activity Relation(SAR)，制剂学、药物分析、药物合成和生产流程等内容

• 强大的分析统计与进阶检索功能

• 每天更新几千条最新记录


以 “ Pharmaceut” 作为主题词进行查询

要点：CAPLUS 几乎收录了以中文出版的制药方面的所有杂志


Medline 文献数据库

• SciFinder整个整合 Medline数据库；

• 约 1500万条记录

• 每周更新四次；

• 更多生命科学和医学的内容与 CAPlus的内容相得益彰，拓展了 SciFinder在生物医学研究中应用的广度和深度；


为什么我们重视物质 ?—— 物质在生物医药的各种信息中居于核心地

位

• 有时候我们会利用某种 “性质”来查找物质 – 查找从传统中医药中分离出来的物质

– 查找 bird flu virus （禽流感病毒）中的序列

– 查找具有形状记忆性能的高分子– 查找用于制备汽车刹车的物质

– 查找用于治疗 Alzheimer’s disease （老年性痴呆症）的物质

– 我们可以做到以上这些，只要利用 SciFinder 做一个主题 ( 作者 ) 检索并回溯记录

8. 利用 Get Related （获取相关） : 物质

9. Analyze/Refine （分析 /二次检索）物质


Registry 数据库

• CAS RNs 世界公的化学物注册系，认质统 CAS 出给物唯一的质 CAS RN；

• 2756万有机无机物质， 5730万核酸蛋白质序列

• 每天增加几千个物质

• 包含大量的物性数据和计算数据

• 图形化结构式

• 可以获得管制信息 (Chemlist)和商业来源(Chemcats)


物质合成－反应数据库 CASREACT

• 1060万条单步与多步反应

• 上溯至 1840年

• 每周更新近千条反应

• 包含来自专利中的反应信息

• 可以了解反应的产率，步数，溶剂，催化剂等信息

• 多样化的组合检索手段


最新进展！• Registry 数据库已经加入 19万条物质的谱图（红外、质谱和核磁）。

• 谱图可以通过物质检索获得


中国专利的收录速度为所有数据库之首

CAS 于 2006 年 5 月宣布：

• 中国专利在公布 14天后即被收录入 CAPlus中；

• 比其它数据库早 130天收录中国专利；

• 在 SF中可以找到最全面最新的中国专利的信息


为什么要使用 SciFinder






内容

查询方式

分析功能


多种检索途径


能够进行结构检索（精确、亚结构、相似性检索）


为什么要使用 SciFinder






内容

查询方式

分析功能


完善的后处理选项

用 Get related扩大检索结果


应用举例


需要注意：

仅运行 Blast进行同源比对是不够的 , 连接到与

此蛋白相关的文献和专利信息（全文或者摘要）

同样十分重要。

SciFinder能帮助您高效地查找到此类信息

实例 1：我想查找与乳癌相关的 RbAp46蛋白质；

并且想查看此蛋白质及其同源体的研究情况


首先选择 Explore中的 Explore Sequence


选择 Similar Sequences

注意：在 SciFinder中还可以用 Sequence Identifier查找相似序列


输入要检索的序列，并为检索结果起名


选择正确的比对类型


选择合适的参数，获得结果


序列比对结果部分分成 4部分，来帮助你更好的理解检索的结果


查看文摘并链接到全文


实例 2：

我想看看世界上对禽流感疫苗的研制情况。


选择主题检索


输入关键词得到答案集列表

vaccines for avian influenza or bird flue


获得 287 个结果（去除了 41 个重复结果）


后处理


分析：机构


分析：语言


分析：文献类型


精化：主题词

human


Get Related：拓展检索

此论文引用的文献

引用此论文的文献

此论文中出现的物质

此论文中涉及的反应

科技搜索引擎里与论文相关的研究动态


获取相关物质

还可以对获得的物质进行后处理


全景检索

• SciFinder中的全景检索－ Panaroma

可以将检索题目的研究现状可视化，

往往会带给我们提供新的启发


在最初的答案集中进行分析


SciFinder中有许多预先设定，方便检索


全景分析激发新的研究方向


总结：

• SciFinder中收录的内容不单是传统意义的化学内容，可用于生命科学、药学、物理学、环境学、医学；

• 通过 SF可查找：摘自细胞、科学、核酸研究、现代药品开发资料及其它知名期刊的科学信息 ;2 日内发布的与生物加工方法、蛋白质组技术、新遗传学工艺，及其它对现代药品开发至关重要的课题等相关的专利

• SF对中国专利收录最迅速；

• 在 SF 的 Registry 数据库中可以查到最广泛的化学和生物序列信息，并且能查找到物质的谱图

• SF 提供多种检索途径和完善的后处理工具；


SciFinder可以应用于生物医药研发的整个过程


SciFinder – 建立在科学思考方法之上

• 通常科学家希望获得他们不知道的信息

• 然而，如果科学家通过具体的问题进行检索，他们可能遗漏一些未知的重要信息

• 只有通过 SciFinder ，科学家可以 :– 进行广义检索

– 多种可能性的选择

– 轻松处理大量结果

– 利用后处理功能系统性地缩小答案范围（尤其是通过基于索引的后处理工具）

– 利用后处理功能（尤其是通过基于索引的后处理工具）

获取新的启示


SciFinder在全球

• 已经成为全球科学研究的一部分

• 90 家政府机构

• 3 ， 000 家企业研发机构

• 100 ， 000 名科研人员的桌面工具


SciFinder －科技创新的引领者

更多信息将不久通过 CAS中文网页呈现给您！

www.igroup.com.cn/cas

http://www.igroup.com.cn/cas


致谢

• 非常感谢丁香园论坛对举办此次活动的支持

• 希望能跟广大站友有机会继续交流


Thank You!

For more information please contact:

秦亚宜

CAS中国市场代表

联系方式

Email: [email protected]

Tel:010-82331971/72

Fax:010-82331961

北京知春路 1号学院国际大厦 1213室邮编 100083

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